Difference between revisions of "Os09g0359500"
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Revision as of 20:57, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0359500 |
|---|---|
| Description |
Protein kinase-like domain containing protein |
| Version |
NM_001069508.1 GI:115478758 GeneID:4346841 |
| Length |
12216 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0359500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:12269080..12281295 |
| Sequence Coding Region |
12279174..12279401,12279503..12279629,12280210..12280278,12280393..12280582,12280771..12281134 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaatgctccagtaagtgaaaaatatcactgggatcatctggaaaaaaatgaaaaccgccaattcacctacgaggagctggagaagtttacaaataacttccaacgattaattggacaaggaggctttgggtgcgtgtatcatggttgtttagaagaccatactgaggttgctgtgaagatccattccgaaaattcacggcatgggtttagtgagtttttagccgaggttcagagcttgtcaaaggtccatcacaaaaatctagtttctttggttggctactgctcagagaaggctcatttagcattggtttacgagtatatgtctgggggcactctttttgatcatctaagagataaaactggtgtgggcgaatccttgaattgggcatcgcgtgtgcgaattctgctagaagctgcacaaggcctagattatctgcacacaggatgcaacaggccaataattcaccgtgatgtgaaaacaagcaatattctcttgggtcaaaatctacaggctaaaatagcagattttgggctttctaaagtttatgttagcgacacgcagactcacatgtcagccacggccgctggatcaatgggctatattgacccagagtactatctaactggtagaattacggagagcagtgatatttacagcttcggtgttgttcttttagaggtagtcacgggtgagcgtccgataatacaaggccagggccacatcatccaacgtataaaaatgaaagttgtggcgggtgacatcagctccattgctgatgcgcggctcagaggcgactacgatgtcaactccatatggaaggtggtggaaattgccatgctgtgcacagaacctgtcgctgctcaaaggccaacgatggcaagcgtggttgcagaactgaaggacagtttagtgccagatccaccaccacatcatgccgtcgctatgtcgcctacatttggtccgtcggcaagatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MNAPVSEKYHWDHLEKNENRQFTYEELEKFTNNFQRLIGQGGFG CVYHGCLEDHTEVAVKIHSENSRHGFSEFLAEVQSLSKVHHKNLVSLVGYCSEKAHLA LVYEYMSGGTLFDHLRDKTGVGESLNWASRVRILLEAAQGLDYLHTGCNRPIIHRDVK TSNILLGQNLQAKIADFGLSKVYVSDTQTHMSATAAGSMGYIDPEYYLTGRITESSDI YSFGVVLLEVVTGERPIIQGQGHIIQRIKMKVVAGDISSIADARLRGDYDVNSIWKVV EIAMLCTEPVAAQRPTMASVVAELKDSLVPDPPPHHAVAMSPTFGPSAR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>10095..10322#10424..10550#11131..11199#11314..11503#11692..12055#atacaatgagttgggccatttgcatgtgaagcgatccagttttagctaattaagcacggctcggctgccgacgatggccttcatcgtgcctttcttcgcggcattcgtgttagcagtgtctccggcggtcggacagcggccaggttattttgtttctctttcgatcagtccattcatatagaatagacgaatagtagttagatcgaatgatggaaaattaattcctgtacaaaatactcaattagcagaacatgagagatatttgtacgtttgtaattaaacgcggcgtttctcagttcatttgggcttcatatatacatatatatattcatctcttctctccgtgcatatatatatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatgcaggtttcttgagcatcgactgtgggctagaggccaactatagcggcggatacaccgacgacggaaattacggcatcgcgtacgtacccgacggcgcatacgtcgatggaggaaagaacggcagggtcgacgccgccgagtatgagagcgagaatatgcgcgccgaccagaccctacggagttttccctccggcgtgcggaactgctacacgctgcccaccgtcgctggtgccaagtacctggttcgggtggtggctgtctacggcaactacgacggcaagaacagctcgtcgacgttgcagttcgacctgcatctcggagtaaactactggaaaaccgtatttcccgactttcccgacgcgtacgtagtacacgaggcgttgttcgtggcgtggggaaaccaggcgccggtgtgccttgtgaacactggtcagggtacgccgttcgttaacagggttgagctgaggccactcgaggatgcgctctatccggaccacgtcaaggccaaccagtctatgaacacgtatcgacgttacaccatggggaccataaatattgcgtatgttaacgttctttaaatttcatgacagtattgttagttctataaatatatgtgcatgaaaccttttgtccactgtagtataaatcatttaggagatagtagtggtatattattggtcataattaaagcaatataaaaaatgcccgtgtgttgcaacgggtaaaaacatttttggaatgctatacatcaagtggagccgtaggtccccgatccccccatcaaatccggccaaatcctccgcatcaaatccagtcaaatctttctcaatctttaaaaaaaattttgaggggtaacaatctttaaaattggttgagggtttttatacacttgttccccttttcatttttattaaaatcagagagacaaaactcggggtaaaaacaataatttttaaaaggagattaaattcaatgaattaaagcggagttaaaagggaaaatcatgaggaaaatggtgagggagtagtgggaaattgatttttggcaatcaattggagaagggaacacatacggaggtagatcaacgtggcggcgacgttagtgtttggccgcgcgacgaaaaaaacatggcacaaatccttattgagtgtggaaaaatgcaactaaaaaaacagcaactaagaaaaaacatatgaaaaagcttggaaaaaaggcctagaaaaaagtgaaaaagcagatggaaaaaaaagcagaaaaaaagacggaccaaaaacagaaaaaaaaaggaaaaaagaaaaagggtgaaaaaggacggaaagaaaaaaaaaagcccaatacacattttttttccggttttctccatccgatttgttttttcgtccgattggtttttctgcacgcggtttttttcccccgttttttttcacgcggtttagattggttttcttgcacgtggtttttttcctggattttttccacgcggttttttccatccgatcagttttttagtttgagtggtttttttcgcagccttttttggcgacagagaaaaaaaaggaaaactgacccaaaaaaaaggaaaaaacggcgaaaaagaaaaaaaagacggacaaatttttttttaaggaaaccttgcgtattttttaattaggtatagatatagatataactaacttctgaaaatggaaacggagctgtacgtatgatctttccttgtgttgggaagcgtgtcgtacagtctaggtgcccatcgtttgacttatttccaaataaggcttattttcaaataagccaaaacggcttatgaggaaataaaaatgaatttgtagttcaaacttttataaatgtgttcttcgtgacttaaaagctaatgttaaaacagaagctacgatgaaaatatctcaaaatcaatctcaaaattaagcttgaaaattcaaattttggctttttctttagctgattaggccatttgatgggagccataaaatttcaatcctaatttataacattgcttggtatattcatcccatttggaaaataatagccatgtaagttgttagatattgttctggtaaatgaaaaaaaaaacagtggtatagaaggataatagaaaccagtcaattaacaaatatattgtctagtgtaattgtactgttactacgtatattcaatctgcccaaaagtataagggtaccatctttgtaagattattaaggacggagtgaaaaaacctataatgccttcttactaaacaagggcttaccgacgagtcgaaggatgattggggttagtttggatgcaaaacaaattaatgaggatcgatgtttcgatgaagaaagtaatactgtgaacaaatttgtggagggagtatttagagtgcaccacttacatcatacgtatatacctacgaagtaagagggcgtggaatatacttattctcatccacccattaattctttttatctattatatatattcttctattaaccctagtcttgctagcattactgatttatcttgactttccaatgttatataggtatccttccgatccatacgatcggtactggtgggcagaggacagtaacccaatgtggggttatcttaactccaaacgggacatccagccggaatccatcacggaggtgccctccgcggtactccaaaaggccgtccaagtggctgggaacggcaggatgctcaacattacatgggaaggcaacacgcccgatctccaggtcacggtgtttctgcatttcgctgacttccagaaaagccagccccgtcagttcaacatctacttcaacagctatgacaagccgtatctgtacagcccatcatacctggccgctggggtcgtctacagccccagttggtatggtgagagcgatggagagttcaatgtcactcttgtggccactgccaagtccgtgctgctgccgatgctcaatgcatacgagatctacacccccatcaagcataaaactcccatgactttttccaaagacggtaagaaagctgcaaatctcaaatgcacaaccacacatatagaacatattgctacatgaattaactggattaagatcctctgcaatcaaatatgtatggtgcctagctttgtcactgacatatgggcctagggatcatcgggcccatatgtcagtgacaaagtccttcggctgcagaggatcctgatccaacttgcatccactgtaggtatcaccgttgaacggttgaagaatactgattaagttttaggttacatattatgtccatataattggttatgaccgtggagcaatggactcaatacacaagagatcaaatcatgatatggtcgtgtgtgttcatacacggtacaaaggcaggaaattattctttcttcgtaaaaaaggagagaattgaatagtctctctctctcttaaaaaaagtagactcaatttgttgttccatgttgtgttcacaagcattttagtttaactagcatggtggactgtgcatattacatggctaacataattatattatattattctcacataatacttcctccgttttatattataagtaactttgacttttttttcttaatgaattttttttatgtttggtcaattttatagaaaaaaatatagtagcattttcaacgccaaacaaaaatattattcaaaatatattcaatattacatttaatgaaacttatttgatgttctagctattgctattttttaaaaaaattcagtcaaacctaattaagtttgactataaaaaagtcaaaacgacttataatataaaatggagggagtagcatacatatactttcatattttattattaaaatatattaaaatgtaacataattttaaattatatactaacctaaccaaactaaccaatgtgtaatattcatattatattatatataagagataattattattttttatttatttgtgaactttatttatttttaaattgtagtcctgtattcataaggactctcactccaccttcaatattttttattttttaattgcaaatttcatttattttaaaattgtattttaatatggaatttagactttttccaatattcctttttaattcataattttagttatttttaaattgtattctatatataatctataatctagattgttctcccaatcttccttattttttaacttcaaattttggttatttctaaattgtatttcgagtaaatttcataaaactacatatacttagcacattctatcacaaaactatagatttaagaaattatttcacaaaactacatttagtgtctacgtttatcacaaaactacagatactttgcataatacatcacaaaactacagatttaatatcttcatttatcacaaaactacaagtttagtgtcttcatatcacaaaactacatgttttagcattgttaaaacctgtagttttgtgataatagagtcactaaactagtagttttgtgataaaaga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