Difference between revisions of "BGIOSGA019510"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA019510

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA019510, complete gene.

LocusTag

OS05G0264200

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA019510-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA019510-PA

Length

9861

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:11877930..11887790

Sequence Coding Region

11877930..11878138,11879099..11879333,11879496..11879665,11881387..11881529,11881653..11881830
,11882504..11883071,11884064..11884176,11885584..11885827,11887563..11887790

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:11877930..11887790 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGATGATGAACCGGACGCGGGATCTGCTGATGGAGGGGTTCGAGGGCCTCGTGCGGGAGGGCTCCTTCACCTGGGGCCTCCCCCGCCGCGGGGCTTCGCCGGTGGGCGACGGCGATGACCCCGACAGCTCGTCCTCCTCCGGCAAGCAGGCCTCCGTCTCCGGCCTCTCCCCCAAGGCCAACGCCGTCGTCTCTCGATGCGCCCGGGTACTTGGTACTTCCACGGATGAGCTTCGATATGACTTTGATATGCAAGCATCTGATTCCATAAAGCAGCAAATAAATTATGCAAGAAATTTTTTGGAATATTGTTGTTTGAGGGCACTTGCACAGGCCTCACAAATTGCAGGGTATCTTTCTGACAAAAGCTTTCGTCGCCTGAATTTTGATATGATGCTAGCTTGGGAGGTTCCCTCTTCTTCAAGCCAGCTCACTGTTAAGGTTGAAGTAGAGAGCACAGTCAGTTTAGAGGCTTTTTCAAGAATAGCACCTGCAATTCCAACAATCACTGATGTGGTAACATGTTCAAATCTATTTGATGTACTTTCATCATCAAGTGGAGGCCGGCTTACATTTCCAGTATATGATAAGTACCTTACAGGATTGGACAGAGCGATTAAGAAAATGAAAGGACAATCCGAGTCCTCGCTATTATCTGGCCAGCGGTCTCAGAGAGGAGAAAGGATTGTAGAAATAGATGGAACATTGACGACTCAACCAGTACTTGAACATGTTAGGATTTCGACATGGCCAGGAAGGTTAACACTTACTGATCATGCTCTTTACTTCGAAGCACTTCGGGTTGTGACCTATGATAAGCCTAAAGCTTATGAGCTTGCTGAAGATCTAAAGCAGTCTGTTAAACCTGAGCTGACTGGTCCATGGGGCTCACGGCTATTTGACAAAGCTGTTATGTATAAATCAGCAACTTTAACAGAACCAGTGATCTTAGAATTTCCAGAGTTGGCTGGCCACTTTCGTCGTGACTATTGGCTGGCCATTATATCAGAAATTCTTTGTGTCCACAGATTTGTTAGGAAGTTTGACATAAGTGGAATTGACAAAGAGGAAACAATTTTGAAAGCTGTACTAAGCATTCTGCGGCTACAAGCTATTGAAGAGTTAGCCATTCCAGTTTCTAATCGATTCGAGTCTCTTTTGATGTTTAATCTATGTGACAAACTTCCTGGAGGTGATGTAATACTTGAAACACTAGCTGGTTCTATATCATTGAGAAGATCAGCTCAAGTTAACCAACCTGGCATTAGCAGTGCAAGGCATTCAATGTCCCCATTTACTGTTCTGTCGAATCTTGGAGTGGTATCACCAATTAATAAGGGTGAGAGACTCTTTGTTGGCGAGATAGTTGTTGGGGAAATGAGTGCCTTGCAGAAGGTAGTTACTGAGTCAATGAACAACTATAAGAAGGTTGAATTGGCCCAAGCCACAGTTGATGGAGTCAAAGTTGATGGCCTAGATACAAACTTGGCAGTGATGAAGGAATTGCTATCTCCCGTAAGTGAGCTATGGAGGTTTTTGGTGTTGCTGGCATCTTGGGATGAGCCGATTAAGTCCATGGTATTTTGCTTTTCATCGTCTTATATCATTATCAGGGGGTGGTTAGTCTATTTTCTTGTTTTGGTGCTCTTGTTTTCGGCAACTTTCATGTTCTTTACAAGACTAACTAGCCATGTAAATCCAATGATGGAGGTCAAAGTGACATCTCCACCTCCAATGAACACGATGGAGCAGCTCTTAGCTGTTCAAAATGCTATTTCCAAAGTTGAAGAGCTTGTTCAGGATGCAAATATTGTTCTTCTGAAGATTAGAGCTTTATTGTTGGCTTCTCCCTCCCAGGCCACTGATAAAACTATACTTGCGTTGGTAGTGATGGCTCTGAGCCTTGCAATCGTGCCCACAAGGTTGCTTGTCCTGATGATGTTTCTAGAGGTATTCACGAACCACTCCCCACCTAGGAGAGCAAGCACAGAAAGGTGGACCAGAAGGTTAAGAGAGTGGTGGTTCAGCATTCCTGCAGCTCCAGTAGTCGTGGAGAAGGATAAAGAAGACAAGAAAACAAAATAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAMMNRTRDLLMEGFEGLVREGSFTWGLPRRGASPVGDGDDPDSSSSSGKQASVSGLSPKANAVVSRCARVLGTSTDELRYDFDMQASDSIKQQINYARNFLEYCCLRALAQASQIAGYLSDKSFRRLNFDMMLAWEVPSSSSQLTVKVEVESTVSLEAFSRIAPAIPTITDVVTCSNLFDVLSSSSGGRLTFPVYDKYLTGLDRAIKKMKGQSESSLLSGQRSQRGERIVEIDGTLTTQPVLEHVRISTWPGRLTLTDHALYFEALRVVTYDKPKAYELAEDLKQSVKPELTGPWGSRLFDKAVMYKSATLTEPVILEFPELAGHFRRDYWLAIISEILCVHRFVRKFDISGIDKEETILKAVLSILRLQAIEELAIPVSNRFESLLMFNLCDKLPGGDVILETLAGSISLRRSAQVNQPGISSARHSMSPFTVLSNLGVVSPINKGERLFVGEIVVGEMSALQKVVTESMNNYKKVELAQATVDGVKVDGLDTNLAVMKELLSPVSELWRFLVLLASWDEPIKSMVFCFSSSYIIIRGWLVYFLVLVLLFSATFMFFTRLTSHVNPMMEVKVTSPPPMNTMEQLLAVQNAISKVEELVQDANIVLLKIRALLLASPSQATDKTILALVVMALSLAIVPTRLLVLMMFLEVFTNHSPPRRASTERWTRRLREWWFSIPAAPVVVEKDKEDKKTK</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..209#1170..1404#1567..1736#3458..3600#3724..3901#4575..5142#6135..6247#7655..7898#9634..9861#ATGGCGATGATGAACCGGACGCGGGATCTGCTGATGGAGGGGTTCGAGGGCCTCGTGCGGGAGGGCTCCTTCACCTGGGGCCTCCCCCGCCGCGGGGCTTCGCCGGTGGGCGACGGCGATGACCCCGACAGCTCGTCCTCCTCCGGCAAGCAGGCCTCCGTCTCCGGCCTCTCCCCCAAGGCCAACGCCGTCGTCTCTCGATGCGCCCGGTAATGACCTAGACACATGGGTGAGACAATTGCCTTCTACTGAAATTTTGCCTCGCCTTCGGGATTTCTTGGGTTTCTAGGGAAGGGAAATGCTCTGGGACGAAGCATTTTGTTTCTGATATACTAGGTTAATTGAATGGAAAGCCACTGCGTTGGATGTGACAATTCTTAGAAAATCTGCAAATAAGTGGTTGTTCGGTGGCTTTATCAGCAACCAATATTACATTGCATATGTTTGAAGATCGATTATTATAATATGTAGTGCTCAGGATGTGCAGTAGGGCCTATGAGTTCGTGTTTGATCTGAATGGGTTTGGTTTATGATGTCCAAAGTCCAGACATGAACTGTTGTGTGCAATGTAGTTCGTTGCGTCCATTGTATACTTGTTCCAAGGGAATTCTAATATAGAATCAAAACCATAGCTGTTTAAGATCTCCCTAAACTGGGTTTTTGTTAAGATATCTGGATGTTGGTAAATGAATAACTTGTGTGAGCTAATATAGTTTATGTCCTTTGAGAACGATCTGTAATTCTTTTATTAGCTTGATTGGAAACATGTTGATGAGCATCCTGCTTCACGGAACCAATATGATGTTGTTTGCATTTGCTACTGTTCTGTTAAGCTAATAGGCATAATTATGTAATACTCCATCCGTCCCAAAATATGAAATTTTATATAATTAGTATTTTCATTGTTATTTGATGATAAAACATGAATAATACTTTATGTGCGACTTATCTTTTTAAATTTTTTCATATTTTTTTCAAATAAAACGGACGGTCAAAACTTGTACACGGAAATGCATAAATAAACTTATTTTGGGATGGAGGGAGTATTAGTTATTCAAAATCTCTATGTCATGTAAAATCAATTCCCTTTTCATGCAAAAACATATGTAATACCAGTTTTTCTTTAATTAGGTGCTGAACTTATGCCTTTTGTGTTAATTACATTTCAGGGTACTTGGTACTTCCACGGATGAGCTTCGATATGACTTTGATATGCAAGCATCTGATTCCATAAAGCAGCAAATAAATTATGCAAGAAATTTTTTGGAATATTGTTGTTTGAGGGCACTTGCACAGGCCTCACAAATTGCAGGGTATCTTTCTGACAAAAGCTTTCGTCGCCTGAATTTTGATATGATGCTAGCTTGGGAGGTTCCCTCTTCTTCAAGCCAGCTCACTGTTAAGGTTACAATTTTCTTTTCTTTACTTGCTTAAATAGTTTTCTTTTGTTCACACCTTATATAATTTGTTAGCGTTGCATTAATAAATTTTCCCAGGTTACTTCCTCGTATTAAGGGCTTTTAAGAATCTTTCTACATATTGAATTTCATCTCCTTTCCCTTGCAGGTTGAAGTAGAGAGCACAGTCAGTTTAGAGGCTTTTTCAAGAATAGCACCTGCAATTCCAACAATCACTGATGTGGTAACATGTTCAAATCTATTTGATGTACTTTCATCATCAAGTGGAGGCCGGCTTACATTTCCAGTATATGATAAGTACCTTACAGGATTGGACAGGTCACTTTCTCTACTGGTCTGTCCATTCAATTTTATTTGTTCATGTTTTCGTTATTTACACATGGTTAGCAATAGACAGTGACGAACTGCCTTTTTTAATTTCATATCAGCAGAATAAACAAATTGAATGTTATGGAAGTTCTCTTGATGAAATGTCTACCACTAGTAATATATAATTTATCTGACAAATCTAAATAGTTACTATATGCCTCTTAGTTGTCAAAGATTGAATGCTTGTAAGCAAATGTTGTAAACTGATGTCCTTTTGAGAATACGGGGAGGCAGGGAGTATTACTTACCATAATTATCATACACATTGACTTATACTTTCTCTTTTGCTTACCTTCCAATCGTACATATAGAACTTAGATTTACATGGCGCGGTGTAGCAGAAACAACTAGTTTCTTGTCCCATGATGAATATTTTTTTCCAAAATGAAATGCTTCTCTTCAGTGCTTATTCTTATCAGGGATAAGCGGATAATCCACTTTCTTGATTTAATATAGTGAAAATTTGGGCAACCATTATAGGTCTATAGCTCTTCATTTCTAGATGTTTAACCTGCTGTTACAACCTTACAATAGATGCCATTATCTTCCTACTTTGCACTGAGAAGTATATCACCTGTTTGAGTTAAGATTGATGTAGTAGATCCCCTTCTTAACTACTCCCTCCATAGAAAATTATAGGGCGTATTTCCTCAAGCCCTCTGTTGAAGATTATAGAAACACACATACTTCCCAATCCATATTTTGTTGGTAATTTTCCCATAGTTCCCATACTTAAAGAGGCCTGTATGCTTGCATGCAGTTAGATTTTAGTGTGGTGATGCATTAATACCGTGCATGCAACTAGAGTAAATGGAGGTATTTAGATAAAATAGTTGGCTTCCTCGGTCTATGAGCCCCAAAACTATATGCCGTACAATTTTCTAGGGAGGGAGTACCCTTTTACATGGTCAAAGTTGTACCTGCTAAGAGCAAGTTTAATAATATAGCGCACTACTAGCTCCAATTCATTTATAGCCAATCTAATAGACAATTCATAAAATAATTGCTTACTATACTATTAATATATGGTCCCACCTGTCATACACACATTACGTCTTGGAGTCCGTACTGCAGCTGGCTACAGATCTGTAGCCCGCTGCTCTTCTCTCTTATCTTTTATCTCATTAAAATATGTCTGTAGCTAGCTAATATTCTACTATTGTTCCTGCTCTAATACAGTGACCAGGGTGTAATGTTTGTGGTACCATAGTATGTAAACAATATTGGAGAATGAATAAATGCCCTATGCTGCATAAAATTATATAGGCATGTACATAGATTCTACAATCAAGTTCAATGGTTCAATAGCAGGCAGGTTATCTGATTGTTGAATATCTTTACATCCTTGTTCATCTAGAGATACCATTATATTTCCATCAGTTAATATACATAACCTACTAGTTTGTACTTTGAATTTAGAATCAGTGTCTGTAGTAGGATAATAATTGGGATTCCTTCAAAACATTAACCATTTCTTCATGCTTTACCATTGTTAAAGGTAGACCTGACATAAATGCATGGGGATATGGTATAGCATATTTGCCAATTTTTGTTACCAAAATAAGTTCAGTTATGCTCCTTTTTCTGAAGGTAGGGTATGCAAGCATATAACTTTCTGTTGGATCTTGTTTCATAAAGTCAGGACTGAGAGTATGTTTTATCTCATGTAGAGCGATTAAGAAAATGAAAGGACAATCCGAGTCCTCGCTATTATCTGGCCAGCGGTCTCAGAGAGGAGAAAGGATTGTAGAAATAGATGGAACATTGACGACTCAACCAGTACTTGAACATGTTAGGATTTCGACATGGCCAGGTATGTCTAGTTTTCTCAGTGAGGAGAAACGATTTCTTGTTGTTTACATGCTGGCATGTTTTTTTAACTTGCCTTGTTACGGTTTTATATCACTGGGTTTCAGCTTTTCCTTTGCTGGCACAGGAAGGTTAACACTTACTGATCATGCTCTTTACTTCGAAGCACTTCGGGTTGTGACCTATGATAAGCCTAAAGCTTATGAGCTTGCTGAAGATCTAAAGCAGTCTGTTAAACCTGAGCTGACTGGTCCATGGGGCTCACGGCTATTTGACAAAGCTGTTATGTATAAATCAGCAACTTTGTAAGTTCTTTCACACGTAGCAAAGCTAATAAGCAATAGAGTACATCTATACTACTAAAAATGTCAGTAGTGGTGGTGTCCATTCTGCAACACCACCCCTACCACTGATATGTAGGCCCAATAATCTATAGTATTACACCAACCTCCAATGAGTCCTCTCCTGTTTCGCTGTTGGTTTATCTTAAACTTTGAAATCACCTACTTATTCACTCTACACTACAAATGTCAGTAGTGGTGGTGTCTGTTCTGTCACACTACCCCTACCACTGATATTTACGCCCCACAATCCATAGTATTACACCAACCTCCAACTAGTCCTCTCCCATTTCACTGATGGTTTATCTTAAACTTCGAACTCATCTACTTATTCAATTAGGAAAAACATAAAAGTGTTAATTTGACTAAATATGTGCCTAATTGACTTAATAAGCTAGAAACTGAATTCCTTTTCCGTTGCAACGCACAGGTTCTTGGCCAGTAAACGTAATAGCTGATTCCTATAGTGGTATTTTGCTAATTAGTTTTAATTTACAAGTCATTGCTATCCATTCCTTTTTATTCGGAGATAGTAGCAACATGTATCCCTATAACCTTATATCTTTATGACTAGCACATAGATTTGCTCTTATTACCTTTAGTTACATGTTTTTTCTTTTTGTTAATGCAAATGCAGAACAGAACCAGTGATCTTAGAATTTCCAGAGTTGGCTGGCCACTTTCGTCGTGACTATTGGCTGGCCATTATATCAGAAATTCTTTGTGTCCACAGATTTGTTAGGAAGTTTGACATAAGTGGAATTGACAAAGAGGAAACAATTTTGAAAGCTGTACTAAGCATTCTGCGGCTACAAGCTATTGAAGAGTTAGCCATTCCAGTTTCTAATCGATTCGAGTCTCTTTTGATGTTTAATCTATGTGACAAACTTCCTGGAGGTGATGTAATACTTGAAACACTAGCTGGTTCTATATCATTGAGAAGATCAGCTCAAG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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA019510