Difference between revisions of "BGIOSGA023784"
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Revision as of 16:48, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA023784 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA023784, complete gene. |
| LocusTag |
OSGOG |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA023784-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA023784-PA |
| Length |
14430 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:25714355..25728784 |
| Sequence Coding Region |
25728536..25728784,25727493..25727805,25726535..25726977,25726285..25726416,25725656..25725754 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:25714355..25728784 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:25714355..25728784 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCACGCTCCCACGTGCGTCGGCGGCGGCGGCGCCGTCGCCAGCCGCGGCGCTGCTCCCGCTCCCGCGCGCCGCGCCGCTGCTGGCGGGGCGCGCGGCGGCGCGCTCCGCGGCGCGGAGGCTCAGGGCTAGGGGGACAAGGGCGCCGCCGCTCGCGGCCGCGCGGCGCGGGTGGGGAGGCGTCTCCCCGCGCGCGGTGCTCGACCTGCCACGACGACGGGAGGCCGCGGAGAAGCCCGCGCAGAAGGCTGCAGATTTGAATGAAATCTTATCAGAACGTGGTGCTTGTGGTGTTGGATTTGTCGCAAACTTGAAAAATGAGCCTTCATTCAATATTGTCCGGGATGCCCTTGTGGCTCTTGGCTGCATGGAGCACCGTGGTGGTTGTGGAGCGGACAATGACTCCGGTGACGGTTCAGGACTGATGAGTGGTATCCCGTGGGACTTGTTCAATGACTGGGCCAACAAGCAAGGGCTTGCTCCCCTGGACAGAACAAATACAGGTGTAGGAATGGTTTTTCTTCCACAAGACGAGAATTCCATGGAAGAAGCCAAAGCTGTTGTTGCCAAGGTATTCACTGACGAAGGCCTTGAGGTTCTTGGCTGGAGAACTGTTCCTTTTAATGTATCAGTGGTAGGTCGCTATGCAAAAGAAACCATGCCTAATATACAACAGATATTTGTGAAAGTTGCAAAAGAAGATAATGCTGATGACATAGAGAGAGAGTTGTACATCTGCCGGAAGCTGATAGAGCGGGCCACAAAATCTGCTAGTTGGGCAGATGAACTTTATTTCTGTTCTTTGTCAAGCAGAACTATAGTCTACAAGGGGATGCTTCGATCTGAGATTCTTGGGCAATTCTATTTGGACCTTCAGAATGAACTCTACAAATCACCTTTTGCCATATACCATCGAAGATACAGTACCAATACAAGCCCTAGATGGCCTCTTGCTCAACCTATGAGGTTACTTGGACACAATGGAGAGATTAATACAATACAGGGGAACTTGAACTGGATGCGATCAAGGGAAGCCACACTACAATCTCCTGTATGGCGTGGGCGTGAGCATGAAATACGTCCATTTGGTGATCCTAAAGCATCTGATTCAGCAAACCTTGACAGTACTGCTGAATTACTGCTAAGAAGTGGCAGAAGTCCTGCTGAAGCTATGATGATTCTCGTTCCTGAGGCATACAAGAACCATCCTACATTGTCAATAAAATATCCTGAGGTAATCGACTTCTATGACTACTATAAAGGTCAAATGGAGGCTTGGGATGGACCCGCTTTGCTCTTATTTAGTGATGGAAGGACAGTAGGAGCATGTCTTGATCGAAATGGTCTCCGCCCAGCACGCTATTGGAGAACATCTGATGATTTTGTTTATGTTGCATCTGAGGTTGGTGTTATACCAATGGATGAGTCAAAGGTAGTAATGAAAGGAAGATTGGGTCCTGGAATGATGATAACGGTTGACCTACAAACTGGCCAGGTGCTTGAAAACACAGAAGTGAAGAAAAGTGTGGCTTCAGCGAACCCCTATGGATCCTGGTTGCAGCAAAGTACACGTTCAATAAAGCCTGTCAACTTCCAGTCATCTGTTGCTATGGACAATGAAACGGTCCTGAGACACCAGCAGGCCTTTGGATATTCCAGTGAAGATGTTCAAATGGTAATTGAAACAATGGCTTCACAAGGCAAGGAACCAACATTTTGTATGGGTGACGACATTCCATTAGCTGTGTTGTCACAAAAGCCACACATGTTATTTGATTATTTCAAACAGCGATTTGCACAAGTTACAAATCCTGCTATTGATCCCCTCAGAGAAGGTTTGGTTATGTCTCTTGAAGTCAATATTGGTAAACGGCGCAATATCTTGGAAGTTGGCCCTGAAAATGCTGATCAGGTTACCCTATCAAGTCCTGTGCTTAATGAAGGTGAACTAGAATCACTTTTGAATGACTCAAAACTGAAGCCTAAAGTACTCTCGACATACTTCGACATCCGTAAAGGTCTAGATGGTTCCCTTGATAAGGCTATTAAGGTTCTTTGTGATGAAGCTGATGCTGCTGTGCGGAATGGTTCTCAACTTCTTGTGCTTTCTGATCGTTCTGAAGCACTCGAACCAACTCGCCCTGCCATCCCGATACTTCTAGCTGTTGGTGCCATCCACCAGCATTTGATTCAAAATGGTCTTCGGATGTCTGCTTCCATTGTTGCTGATACTGCTCAGTGTTTTAGCACCCATCAGTTTGCTTGCTTGATCGGATATGGAGCCAGTGCTGTATGTCCGTATCTGGCACTAGAAACGTGCCGACAATGGAGGCTGAGCAACAAAACTGTTAATTTGATGCGAAATGGGAAGATGCCCACGGTGACCATTGAGCAGGCCCAAAGAAACTTTATCAAGGCAGTAAAATCTGGCCTACTCAAGATTCTTTCAAAAATGGGAATATCATTGCTCTCAAGTTATTGTGGAGCCCAGATCTTCGAAATTTATGGCCTTGGTCAAGAGGTTGTTGATCTCGCCTTCTGTGGAAGTGTATCGAAAATTGGAGGTCTCACCCTTGATGAGCTGGGTAGAGAAACATTATCATTCTGGGTGAAGGCGTTCTCAGAAGATACTGCGAAGAGGCTAGAGAACTTTGGATTCATTCAATCCAGACCTGGAGGTGAATATCACGCAAATAATCCTGAGATGTCAAAGCTGCTGCACAAAGCAGTTCGTGAAAAAAGTGACAATGCATACACCGTCTACCAACAACATCTTGCAAGCCGTCCTGTCAATGTTCTTCGAGATCTTCTAGAGTTGAAGAGTGATCGTGCCCCTATTCCTATCGGCAAAGTTGAGCCTGCAACCTCCATCGTTGAGCGATTTTGTACAGGTGGAATGTCCCTTGGAGCTATTTCCAGAGAAACACATGAAGCTATTGCAATTGCAATGAATAGAATAGGTGGGAAATCTAACTCCGGAGAAGGTGGTGAGGACCCAATCCGCTGGAGTCCCCTTGCAGATGTAGAGGATGGGTATTCTCCAACACTTCCTCATCTCAAGGGTCTACAGAATGGAGACACTGCCACAAGTGCCATTAAGCAGGTTGCATCTGGGCGCTTTGGGGTTACACCAACATTTTTAGTAAATGCTGAACAAATTGAGATAAAGATTGCACAAGGGGCAAAGCCTGGTGAAGGGGGCCAACTTCCGGGGAAAAAAGTCAGTGCATACATTGCTCGGCTGAGAAACTCCAAACCTGGAGTTCCTCTCATATCCCCACCACCGCACCATGACATCTATTCAATCGAGGATCTAGCACAGTTAATTTATGATCTTCATCAGATCAATCCAAAAGCGAAGGTATCTGTAAAGCTTGTAGCTGAAGCAGGAATTGGAACTGTAGCTTCTGGAGTATCCAAAGGAAACGCAGACATAATTCAGATATCAGGTCATGATGGTGGCACTGGAGCTAGCCCAATTAGTTCAATCAAGCATGCTGGGGGTCCTTGGGAACTTGGTCTTTCAGAAACACACCAGACACTTATTCAAAATGGATTGAGAGAGAGGGTAGTACTTAGGGTGGATGGTGGATTCAGAAGTGGCCTAGATGTCCTTATGGCTGCTGCCATGGGTGCGGATGAATATGGTTTTGGTTCTGTGGCTATGATAGCTACTGGATGTGTCATGGCACGCATTTGCCACACAAACAATTGCCCAGTTGGAGTTGCTAGTCAGAGAGAAGAACTTCGTGCTAGGTTTCCTGGTGTTCCTGGTGATCTTGTAAACTACTTCCTCTTTGTTGCAGAAGAGGTACGAGCGACATTGGCCCAATTGGGTTTTGAAAAGCTCGATGATATAATTGGGCGAACAGATTTACTTAAAGCAAAGCATGTCTCTTTGGTGAAAACACAGCACATTGACCTCAAATACCTCTTATCGAGTGCTGGATTACCCAAATGGAGTAGCTCTCAGATAAGGAGTCAAGACGTCCACAGTAATGGCCCTGTTCTTGACGAGACAATCCTCGCCGATCCTGATATATCCGATGCGATTGAGAATGAGAAGGAGGTTTCCAAGACATTTCCAATTTACAATGTTGACAGGGCTGTCTGTGGTCGAGTAGCAGGTGTCATTGCCAAGAAGTATGGTGACACAGGATTTGCAGGCCAGCTCAACATTACGTTTACTGGAAGCGCAGGGCAGTCCTTTGGATGTTTTCTAACTCCTGGAATGAATATTCGGCTAATTGGAGAGGCCAACGATTATGTGGGAAAGGGTATGGCTGGTGGAGAGCTGGTTGTAGTTCCTGTAGAAAAAACAGGATTTGTTCCTGAGGATGCTGCTATAGTTGGTAACACTTGTCTGTATGGAGCTACTGGTGGTCAGGTATTTGTGAGAGGCAAAACAGGTGAAAGATTTGCAGTTAGAAACTCCCTTGGTCAAGCAGTGGTTGAGGGCACTGGAGATCATTGCTGTGAGTACATGACTGGTGGCTGTGTAGTTGTACTTGGCAAAGTTGGGAGGAATGTTGCAGCTGGAATGACGGGTGGCCTTGCCTATATTCTAGATGAGGATGATACACTCGTCCCAAAGGTTAACAAGGAGATTGTGAAGATGCAGAGAGTGAATGCTCCAGCCGGGCAGATGCAGCTGAAGGGCTTGATTGAGGCTTACGTTGAAAAAACAGGCAGCGAGAAAGGTGCCACAATTTTGAGAGAATGGGAGGCATATCTGCCACTCTTCTGGCAACTGGTACCACCAAGTGAAGAAGACTCTCCTGAAGCTTGTGCCGAGTTTGAAAGAGTACTTGCCAAGCAAGCAACAACAGTACAATCGGCGAAGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATLPRASAAAAPSPAAALLPLPRAAPLLAGRAAARSAARRLRARGTRAPPLAAARRGWGGVSPRAVLDLPRRREAAEKPAQKAADLNEILSERGACGVGFVANLKNEPSFNIVRDALVALGCMEHRGGCGADNDSGDGSGLMSGIPWDLFNDWANKQGLAPLDRTNTGVGMVFLPQDENSMEEAKAVVAKVFTDEGLEVLGWRTVPFNVSVVGRYAKETMPNIQQIFVKVAKEDNADDIERELYICRKLIERATKSASWADELYFCSLSSRTIVYKGMLRSEILGQFYLDLQNELYKSPFAIYHRRYSTNTSPRWPLAQPMRLLGHNGEINTIQGNLNWMRSREATLQSPVWRGREHEIRPFGDPKASDSANLDSTAELLLRSGRSPAEAMMILVPEAYKNHPTLSIKYPEVIDFYDYYKGQMEAWDGPALLLFSDGRTVGACLDRNGLRPARYWRTSDDFVYVASEVGVIPMDESKVVMKGRLGPGMMITVDLQTGQVLENTEVKKSVASANPYGSWLQQSTRSIKPVNFQSSVAMDNETVLRHQQAFGYSSEDVQMVIETMASQGKEPTFCMGDDIPLAVLSQKPHMLFDYFKQRFAQVTNPAIDPLREGLVMSLEVNIGKRRNILEVGPENADQVTLSSPVLNEGELESLLNDSKLKPKVLSTYFDIRKGLDGSLDKAIKVLCDEADAAVRNGSQLLVLSDRSEALEPTRPAIPILLAVGAIHQHLIQNGLRMSASIVADTAQCFSTHQFACLIGYGASAVCPYLALETCRQWRLSNKTVNLMRNGKMPTVTIEQAQRNFIKAVKSGLLKILSKMGISLLSSYCGAQIFEIYGLGQEVVDLAFCGSVSKIGGLTLDELGRETLSFWVKAFSEDTAKRLENFGFIQSRPGGEYHANNPEMSKLLHKAVREKSDNAYTVYQQHLASRPVNVLRDLLELKSDRAPIPIGKVEPATSIVERFCTGGMSLGAISRETHEAIAIAMNRIGGKSNSGEGGEDPIRWSPLADVEDGYSPTLPHLKGLQNGDTATSAIKQVASGRFGVTPTFLVNAEQIEIKIAQGAKPGEGGQLPGKKVSAYIARLRNSKPGVPLISPPPHHDIYSIEDLAQLIYDLHQINPKAKVSVKLVAEAGIGTVASGVSKGNADIIQISGHDGGTGASPISSIKHAGGPWELGLSETHQTLIQNGLRERVVLRVDGGFRSGLDVLMAAAMGADEYGFGSVAMIATGCVMARICHTNNCPVGVASQREELRARFPGVPGDLVNYFLFVAEEVRATLAQLGFEKLDDIIGRTDLLKAKHVSLVKTQHIDLKYLLSSAGLPKWSSSQIRSQDVHSNGPVLDETILADPDISDAIENEKEVSKTFPIYNVDRAVCGRVAGVIAKKYGDTGFAGQLNITFTGSAGQSFGCFLTPGMNIRLIGEANDYVGKGMAGGELVVVPVEKTGFVPEDAAIVGNTCLYGATGGQVFVRGKTGERFAVRNSLGQAVVEGTGDHCCEYMTGGCVVVLGKVGRNVAAGMTGGLAYILDEDDTLVPKVNKEIVKMQRVNAPAGQMQLKGLIEAYVEKTGSEKGATILREWEAYLPLFWQLVPPSEEDSPEACAEFERVLAKQATTVQSAK</aaseq> |
| Gene Sequence |
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