Difference between revisions of "BGIOSGA024056"
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Revision as of 16:50, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA024056 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024056, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1019_E02.25 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA024056-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA024056-PA |
| Length |
15846 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:20998471..21014316 |
| Sequence Coding Region |
21014125..21014316,21013932..21014007,21012166..21012233,21011427..21011518,21011269..21011342 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:20998471..21014316 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:20998471..21014316 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATTCGACTTCGAGGCCCCCGGAGACCGACGCCCCCGCCGAGGCGGTCCCACCGGCGGCGGCGGCGGCGCCGGCGGCGAAGGGCGATGTGGAGATCACCAGGCCACGCAACGACAAGCGCGGGTACCGCCGCGTCGTGCTCCCCAACGACCTCGAGTGCCTCCTCGTCAGCGACCCCGACACCGACAAGGCGGCTGCGTCGATGAACGTGTCGGTGGGCTACTTCTGCGATCCCGAGGGGCTCGAGGGGCTCGCGCACTTCCTTGAGCATATGCTATTCTATGCTAGTGAGAAATATCCTATAGAAGACAGTTACTCAAAGTATATTACAGAGCATGGTGGTTCAACCAATGCCTTCACAACTTGTGAACATACAAACTTCTTTTTTGATGTGAACCATGATTGCCTCGATGATGCTTTGGACAGGTTTGCACAATTCTTCATAAAGCCATTACTGTCAGCCGATGCAACTCTTAGGGAGATAAAAGCTGTTGACTCTGAAAATCAGAAAAACTTATTATCAGATCCTTGGCGAATGAACCAGCTTCAGAACCATATTTCCTTGGAGAGCCATCCATATCACAAGTTTGGCACTGGAAATTGGGACACTTTGGAGGTTAAACCAAAGGAGAAGGGATTGGACACAAGGCTTGAGCTTATTAAATTTTATGATTCACACTACTCAGCCAACTTGATGCAGCTTGTTGTGTATGGGAAAGAGAGTCTTGACAATCTACAAACTCTTGTTGAAAATAAGTTTTGTGGTGTCAAGAATACTGGAAGGGAACGATTTTCCTTTCCTGGTCATCCGTGTTCAAGTGAACACCTACAGGTCCTTGTTAAAGCAGTTCCCATTAAACAAGGCCATACTTTGAGAATACTATGGCCAATCACCCCAAATATTCGACATTACAAGGAAGGTCCTTGCAAGTATGTGAGTCATCTAATTGGCCATGAAGGAGAGGGGTCTCTGTTTTATGTCCTAAAAAAGTTAGGTTGGGCTATGAGTTTGGAAGCAGGGGAAGGTGATTGGAGTTATGAGTTTTCTTTCTTCAGTGTTGTCATAAAGCTCACTGATGTAGGCCATGAGCACATGGAGGATATTGTTGGACTGTTGTTCAGATACATAACATTACTTCAGACCTCTGGCACTCCGAAGTGGATTTTTGATGAGCTTCAAACTATTTGTGAGACAGGATTCCACTATCGAGACAAGAGTCCTCCTATCCATTATGTTGCCAATATTTCCTCAAACATGCAGATCTATCCGCCGGAAGATTGGCTGATTGCATCGTCTGTGCCATCAAAATTTTCCCCAGATGCTATTCAGGGTATATTAAATGAGTTGACTCCTGATAATGTTAGGATATTCTGGGAGTCCAAAAAATTTGAAGGGCAAACAAACTTAACAGAGCCGTGGTATGGTACATCATATTCTGTGGAAGCAGTTCCTCCATCCATTATACAGAAATGGGTAGAGAAAGCTCCCGTGGAAGATTTGCACATGCCAAAACCTAATATCTTCCTTCCAAGTGATCTTTCATTGAAAAATGCCGAGAAGGCAAGTTTTCCTTGTATGTTGAGGAAAACACTGTTTTCCAGAGTGTGGTATAAACCTGATACAATGTTCTTCACACCCAAGGCCTATATCAAGATGGATTTCCACTGTCCACTGTCCCGTAGCTCTCCTGAATCATCAGTTCTTACTGATGTATTCACAAGGTTGCTCATGGATTATTTAAATGATTATGCTTATGATGCTCAAGTTGCTGGTCTTTATTACGGTGTTAGGCCAAATGACACTGGTTTTCAGATAACCATGGTTGGCTACAATGACAAAATGAGAACTCTTTTGGAGACTGTTATTGGGAAAATTGCTGAGTTTGAAGTTAAGGCTGACCGTTTTTCTGTGATAAAGGAAACTATAACAAAGGAGTATGAGAATTTCAAATTTCGGCAACCATATCAGCAAGCTTTCTACTATTGTTCATTGATATTAGAGGAGCAAACGTGGGCATGGGATGAAGAACTTGCTGCAGTATCTCAAATTGAAGCTAGCGATCTAGAGAAGTTTTTGCCTCATCTGCTGGGGAAAACATTTATTGAGAGCTACTTTGCTGGGAACATGGAACCGGGTGCGGTAAAAGGTGTTATGCAGCATGTTGAAGACATCTTATTCAATGCACCTGTCAGTCTGTGCAAAGCATTACTCTCATCACAGCATCTTACAAAGCGAATTGTAAAGCTTGAAAGGGGTTTGAGGTATTATTATCCAGCATTATGCCTAAATCACCAGGATGAAAATTCTTGCCTTCTGCATTATATTCAGATTCATCAGGATGATCTCAAAAAAAATGTTTTACTTCAGTTGCTTGCTCTTGTTGCTAAGCAACCAGCTTTTCACCAATTACGTTCAGTTGAGCAACTTGGCTACATAACACTGCTTAGACAAAAAAATGATTCAGGTGTCCGTGGTTTGCAATTTATAATCCAGTCAACCGTGAAGGATCCAGCCAACTTGGATGCTAGAGTTGAAGCTTTCCTTACGATGTTTGAAGGAACTCTATACCAAATGCCTGATACAGAATTCAAGAGTAACGTGAACGCTCTCATTGACATGAAGTTGGAGAAATACAAGAATATAAGAGAGGAATCAGCTTTCTTCTGGGGAGAGATTTCTGAAGGAACTCTGAAATTTGATCGAAAAGAAGTGGAGGTTGCTGCACTGAGGGATCTTAAGAAAGAGGAGTTGATAGAGTTCTTCAACAATCATGTCAAAGTTAATGCACCACAAAAGAAGATACTCAGTATTCAAGTTTACGGCGGTCTCCATTCCTCGGAGTACGAAAAGATAGTCCACGACGAGCCACAACCAAATTCCTATCAAATAACAGATATATTCAGCTTCAGGAGGTCGAGACCTTTATATGGTTCATACAAGGGAGGTGTTGGTCAGATGAAGCTATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDSTSRPPETDAPAEAVPPAAAAAPAAKGDVEITRPRNDKRGYRRVVLPNDLECLLVSDPDTDKAAASMNVSVGYFCDPEGLEGLAHFLEHMLFYASEKYPIEDSYSKYITEHGGSTNAFTTCEHTNFFFDVNHDCLDDALDRFAQFFIKPLLSADATLREIKAVDSENQKNLLSDPWRMNQLQNHISLESHPYHKFGTGNWDTLEVKPKEKGLDTRLELIKFYDSHYSANLMQLVVYGKESLDNLQTLVENKFCGVKNTGRERFSFPGHPCSSEHLQVLVKAVPIKQGHTLRILWPITPNIRHYKEGPCKYVSHLIGHEGEGSLFYVLKKLGWAMSLEAGEGDWSYEFSFFSVVIKLTDVGHEHMEDIVGLLFRYITLLQTSGTPKWIFDELQTICETGFHYRDKSPPIHYVANISSNMQIYPPEDWLIASSVPSKFSPDAIQGILNELTPDNVRIFWESKKFEGQTNLTEPWYGTSYSVEAVPPSIIQKWVEKAPVEDLHMPKPNIFLPSDLSLKNAEKASFPCMLRKTLFSRVWYKPDTMFFTPKAYIKMDFHCPLSRSSPESSVLTDVFTRLLMDYLNDYAYDAQVAGLYYGVRPNDTGFQITMVGYNDKMRTLLETVIGKIAEFEVKADRFSVIKETITKEYENFKFRQPYQQAFYYCSLILEEQTWAWDEELAAVSQIEASDLEKFLPHLLGKTFIESYFAGNMEPGAVKGVMQHVEDILFNAPVSLCKALLSSQHLTKRIVKLERGLRYYYPALCLNHQDENSCLLHYIQIHQDDLKKNVLLQLLALVAKQPAFHQLRSVEQLGYITLLRQKNDSGVRGLQFIIQSTVKDPANLDARVEAFLTMFEGTLYQMPDTEFKSNVNALIDMKLEKYKNIREESAFFWGEISEGTLKFDRKEVEVAALRDLKKEELIEFFNNHVKVNAPQKKILSIQVYGGLHSSEYEKIVHDEPQPNSYQITDIFSFRRSRPLYGSYKGGVGQMKL</aaseq> |
| Gene Sequence |
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