Difference between revisions of "BGIOSGA024057"
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Revision as of 16:50, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA024057 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024057, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1019_E02.24 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA024057-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA024057-PA |
| Length |
15462 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:20980236..20995697 |
| Sequence Coding Region |
20995485..20995697,20995299..20995374,20993858..20993925,20992617..20992708,20992459..20992532 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:20980236..20995697 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:20980236..20995697 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGGTTCGAGGCCAGCGCGCGAGACGACGACCGACGCCCCCGCCGAGCCGTCGTCCGACGGCGCGGTCGCGGCCGCACCCTCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGGCGACGCGGAGATCACCAGGCCCCGCAACGACAAGCGCGGGTACCGCCGCGTCGTGCTCCCCAACGCCCTCGAGTGCCTCCTCGTCAGCGACCCCGACACCGACAAGGCGGCGGCGTCGATGAATGTCTCGGTGGGCTACTTCTGCGATCCCGAGAGGCTCCCTGGCCTTGCACATTTCCTTGAGCATATGCTTTTCTATGCTAGCGAGAAATACCCTGTGGAAGACGATTACTCAAAGTATATTGCAGAGCATGGTGGTTCAACCAACGCCTTCACATCTCGTGAACGTACAAACTTTTATTTTGATGTGAACAATAGTTGCCTGGATGATGCTTTGGATAGGTTTGCACAATTTTTTATAAAGCCATTGATCTCACCCGATGCAACTCTAAGGGAAATTAATGCTGTTGACTCTGAAAATAAGAAAAACTTGTTGTCAGATCCTTTGCGAATGAGTCAGCTCCAGAAACATTTTTGCTCGGAGAGCCATCCATATCACAAGTTTAGCACTGGAAACCTGGACACTTTGCTGGTTAATCCAAATAAGGAAGGATTGGACACACTGGAAGAGCTTATTAAATTTTATAATTCACATTACTCAGCTAATTTGATGCAACTTGTTGTGTATGGCAAAGAGAGTCTTGACAACCTTCAAAATCTTGTTGAAAATAAGTTCTCTGATGTCAGGAATACTGGAAGGGAAAGTTTTTCCTTTCATGGTCATCCATGTTCAAGTGAACATCTCCAGATCATTGTTAAAGCGGTTCCCATAAAAGAAGGCCACACTTTGAGAATACAGTGGCCAATCACCCCAAATATTCAGCACTATAAGGAAGGGCCTTGCAAGTATGTGAGTCGTCTAGTTGGCCATGAAGGAGAGGGGTCTCTATTTTACGTGCTAAAAAATTTAGGATGGGCTATGAGTTTGTATGCATGGGAAGGTGACTGGAGTTATGAGTTTTCATTCTTCAATGTTGTTATACAGCTCACAGATGTAGGCTATGAGCACATGGAGGACATTATTGGACTGTTATTCCGATACATAGCATTGCTCCAGACCTCTGGAACTCGTCAGTGGATTTTTGATGAGCTTGTAGCTATTTCTGAGATGGGATTCCACTACCGAGACAAGAGTCCTCCTATCCATTATGTTGTCAATATTTCCTCAAACATGCAGATCTTTCCGCCGGAAGATTGGCTGATTGCATCATCTGTGCCATCAAAGTTTTCTCCAGATGCTATTCAGAATATATTAAATGACTTGACTCCAGATAATGCTAGAATATTCTGGGAATCAAAAAAGTTTGAAGGGCAGACAAACTTAACAGAGCCTTGGTATGGTACATCATATTCAGTTGAAGCAGTCACTCCTTCCATCATACAGAAATGGGTAAATATGGCTCCCATGGAAGATTTGCACATTCCAAAACCTAATATCTTCATTCCAAGTGATCTTTCATTGAAAAATGTTGAGGAAAAGGGAAGTTTTCCTTGTATGCTTAGGAAAACAATGTTTTCAAGAGTATGGTATAAGCCTGATACAATGTTCTTCACACCCAAGGCCTACGTCAAGATGGATTTCCACTGTCCACTGTCCAATAGCTCTCCTGAATCGACAGTTCTTACTGATATGTTCACGAGGTTGATAATGGATTATTTGAATGATTTTGCTTATGATGCTCAAATTGCTGGTCTTTACTACTTTATTAGGCCAAGTGACACTGGATTTCAGATAACTATGGTCGGTTATAATGACAAAATGAGAACCCTTCTGGATACTGTCATTGGAAAAATTGCTGAGTTTGAAGTGAAGGTTGACCGTTTTGCTGTTATAAAGGAAACTATAATAAAGGACTACGAGAATTTCAAATTTCGACAACCATATGAGCAGGCATTTTACTATTGTTCATTAATATTAGAGGAACAAACTTGGGCATGGGATGAAAAACTTGCTGCAGTTTCTCATATTGAAGCAAGCGATCTACAGATTTTTTTGCCTCGTCTTCTGGGCAAGACATTTATTGAATGCTATTTTGCTGGGAACATGGAACCGGGTGAAGCAAAAAGTGTTATACAGCATGTTGAAGACACCTTATTCAATGCACCCATCAGTTTCTGCAAAGCATTACCCCCATCACAGCATCTTACAAAGCGAATTGTAAAACTTGAAAGGGGTTGGAGGTATTATTATCCAGCATTGTGCCTAAATCACCAGGATGAAAAAAATTCTTCCATCCTGCATTATATTCAGATTCATCAGGATGATCTCAAACAAAATGTTCTACTTCAATTGCTTGCTCTTGTTGCTAAGCAACCCGCTTTTCACCAATTGCGTTCAGTTGAGCAACTTGGCTACATAACAGTGCTTACACAAAGAAATGATTCAGGTGTTCGGGGATTGCAATTCATAATTCAGTCAACCGTGAAGGATCCATCAAACCTGGATGACAGAGTGGAAGCTTTTCTTAATATGTTTGAAGGGACTCTATACCAAATGCCTGATGAAGAGTTCAAGAGCAACGTGAATGCTCTCATTGACATGAAGCTGGAGAAATACAAGAATATAAGAGAGGAATCAGCGTTCTTCTGGAAAGAAATTTCGGAAGGAACTCTGAAATTTGATAGAAAAGAGGCGGAGGTTGCTGCACTGAGGGATCTCAATAAAGAGGAGTTGATTGAGTTCTTCAATAATCATGTCAAAGTTAATGCACCACAAAAGAAAATTCTTAGCATTCAAGTTTACGGCGGTCTCCATTCCTCCGAGTACGAAAAGATAGTTCACGATGAGCCACAGCCGCACTCGTATCAAATAACCGATATATTCAGCTTCAGGAGGTCGAGACCTTTATACGGTTCATTCAAGGGAGGTGTTGGTCAGATGAAGCTATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGSRPARETTTDAPAEPSSDGAVAAAPSAAAAAEGDAEITRPRNDKRGYRRVVLPNALECLLVSDPDTDKAAASMNVSVGYFCDPERLPGLAHFLEHMLFYASEKYPVEDDYSKYIAEHGGSTNAFTSRERTNFYFDVNNSCLDDALDRFAQFFIKPLISPDATLREINAVDSENKKNLLSDPLRMSQLQKHFCSESHPYHKFSTGNLDTLLVNPNKEGLDTLEELIKFYNSHYSANLMQLVVYGKESLDNLQNLVENKFSDVRNTGRESFSFHGHPCSSEHLQIIVKAVPIKEGHTLRIQWPITPNIQHYKEGPCKYVSRLVGHEGEGSLFYVLKNLGWAMSLYAWEGDWSYEFSFFNVVIQLTDVGYEHMEDIIGLLFRYIALLQTSGTRQWIFDELVAISEMGFHYRDKSPPIHYVVNISSNMQIFPPEDWLIASSVPSKFSPDAIQNILNDLTPDNARIFWESKKFEGQTNLTEPWYGTSYSVEAVTPSIIQKWVNMAPMEDLHIPKPNIFIPSDLSLKNVEEKGSFPCMLRKTMFSRVWYKPDTMFFTPKAYVKMDFHCPLSNSSPESTVLTDMFTRLIMDYLNDFAYDAQIAGLYYFIRPSDTGFQITMVGYNDKMRTLLDTVIGKIAEFEVKVDRFAVIKETIIKDYENFKFRQPYEQAFYYCSLILEEQTWAWDEKLAAVSHIEASDLQIFLPRLLGKTFIECYFAGNMEPGEAKSVIQHVEDTLFNAPISFCKALPPSQHLTKRIVKLERGWRYYYPALCLNHQDEKNSSILHYIQIHQDDLKQNVLLQLLALVAKQPAFHQLRSVEQLGYITVLTQRNDSGVRGLQFIIQSTVKDPSNLDDRVEAFLNMFEGTLYQMPDEEFKSNVNALIDMKLEKYKNIREESAFFWKEISEGTLKFDRKEAEVAALRDLNKEELIEFFNNHVKVNAPQKKILSIQVYGGLHSSEYEKIVHDEPQPHSYQITDIFSFRRSRPLYGSFKGGVGQMKL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..213#324..399#1773..1840#2990..3081#3166..3239#3328..3371#3769..3820#4977..5099#5201..5313#5435..5597#6723..6815#7094..7179#7840..7926#9662..9765#10669..10771#10858..10953#11025..11214#11508..11569#13180..13284#13694..13895#13999..14210#14387..14511#14657..14708#14783..14869#15017..15139#15211..15462#ATGGCGGGTTCGAGGCCAGCGCGCGAGACGACGACCGACGCCCCCGCCGAGCCGTCGTCCGACGGCGCGGTCGCGGCCGCACCCTCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGGCGACGCGGAGATCACCAGGCCCCGCAACGACAAGCGCGGGTACCGCCGCGTCGTGCTCCCCAACGCCCTCGAGTGCCTCCTCGTCAGCGACCCCGACACCGACAAGGTCTCCGTGCTTTCGCTGGCTCCTTCGATCGGGGATGTGCCGGGGGTTTTGGTGCCTGCCTCCTGGGTTTTTGGCTTGAATGGGTGAATCCCGGCTTTGTTTGTTTGCAGGCGGCGGCGTCGATGAATGTCTCGGTGGGCTACTTCTGCGATCCCGAGAGGCTCCCTGGCCTTGCACATTTCCTTGGTGAGCTTCCTGTTTTGACTTGTTGCGTAAAACCTCTGAGAAATTAGTAATCGTGGATGCTATGATTTTCTTTTTTTGTTGGCTTGAACGGATGCTAGTATGATTTCCGTTGTAGTTAGCTGCTTCCGTTTAAGTGGCTCTCACTGTACATGATGTTAGTAATGATAATCTCAGTGCGTTCGGGCCTTGATGCCTATGCAATTGATCTCTATCATCTCCATGCATTTCCGTTGCAGTGTCAGGCCTGCTATTAGCCTACCACTACAATTTTGCTGGCTTTTTACACCAAGCTGTTTGAGGTTGTGGCTTGGTTCTGTTACAATATGTACATGTCCCTTTTTAGTTGTTTAATTGTTGAATTGATAATGTAATAAAGATGAAGAAGGTCGAAATTTAGGTATGCATATTTTTCTCACAGCCCCTGTCACATAGAAAATATGCAAGGAAAATATACTTTTTCATATATTTTTTTGGATAAGTAAAATATGTGCACAAATATATGCAAAACATCTGAAAATGAATTTCCAGCATCATGCTGAGTATCTCTGGATGAGAAGATTAAAACAAGTATAGCATGGCCAGGAAAATATACAGATGATTGATTCACATGTGCAACTCAATGTATCAATTCAGTATCAATATCTCCTGATAGGTGCTGTCAGAATATCCAGCTAATAAGCGACAATGGCCCATACCTTCAAAGGTATATGAGCTAATCATTTACTTGATTAATCTGCAAAGATGTCAAAGCCCACATGTGAAAGGGCATTAAGAGAAAAATACAGTTGGGCCTTAAAATGGCTTACTTATCTGAAACTCACGGGTTCATTGAAGGATCAGATGTTTCAGAAATTTTATTCGTGATTGAAACTATTATACTAATATTGTAATACATATACATGCTATATTGCCTCTGTATTGAAATGGATGGCATATATTAATAGGAGGTTCATTTCGACACCAGAGTGCTTCGAACATATTATTTGGATACTTAAGGTGATTGTAAAAATCTAAGGAGACACTGTTATTCAATTAGAAAATTAATTTACTCACTAGTCATTGTAACTATTTTTCCTTGGACAGATAAAGTAAGCACAACTTTCTTGTGTCACTGTGTCATGCTATCGATGTGCTTAGTGTATGTTTAATTTGCCTTGTTTTGTATGTTGCTCTTTTATATATTTTCTAGTGTGTACCTTTAAAGAGTTTTAATGCATCACCAGGCACTGTTCAAACCTCATTGAATTGTTTTTTTATCTTGGTTGGATTGTACTATCGCATGTAGAGAGCTTCATGGCATGTGTTTTGCAGTAATTAACATGTATGTGTCTCTGTATTGTTTGATTCACTTATGCTTGGTTCTTCTTTTATAGAGCATATGCTTTTCTATGCTAGCGAGAAATACCCTGTGGAAGACGATTACTCAAAGTATATTGCAGAGGTATGTATGGCCAATTTCTTATCTGTTCTGTTAATTTGAAGAGGACATTTGTAAGTGATCTTGATTTGTCGTGGTCAATAATTTGTTAGATCGAACTAAAATTGATCTCAAAACTTAATCTAAATGCTTCAGAACAATTGGAAGGACAATTGAACTTCAGCATACTGTATTCTTTGCAAAACGTCCAGTCTACGTTCAATTTACTGGCAATGACTAGAGACTTGTACCACATTTTGGGGGTTCTTGGATGCTTCCTGTTATGCCAATAGATGCCACTTGTTTGGTTTTATATTTATAGTACTTTAAGCAGAGTGCGATTAGAGAAATTCAGTATCTGTAGAGCTAATCTAGTTTAATTTTTTTAATCATGGTTACTGCCCTTTTGCCCCTAGAGTACCAGTTGTCAGTTGGTAACAGTATAATAGGCACACGTAGCTATAGTATCCAGCTTGTGACTTGTGAGTAAACTCATATATTTACTGCTGCGAGTTTGCGGTGGTGCACCAGTGCTTACAGTGGCAGAGTGAGAGTGGTTCAACACTAATGATGCACGAGTGGCTTAATCCATATGGGACCAATTTGAAGCTTAATAAGTAAAATGCCCCAAATACAAGTACTTACTTCCTCCGTCCCAAGATGTAGCTATTTCTAGCACAGTATCTTGTCCCAAAATGAAGCTATTTTTTTCACCTACCTCCTCCTCTCAACTAATCACAACCATTCTTCTTCACCTACTTTCTCTTTTCAACCAACCACACACTTCCTCCAATCATTCTCACCTACTTTCTTAATACCGTGCCAACCTAAAAAATACCTACATTTTGGGACAGAGGAAGTATCATATAGACTGTACAATCATTGGGTAGGCCAAGTTTGGCCCCAATGAAGCTCTGTACCTTCAGTGCTTCAAGCCTTGAACCATGGGTTCCTCCAATGTTATGCTGCTACTGGAGATTTGCAAGCAGAGGTTTAGCCTTTTAAATTATTAACAATACTAATTGGGAAAACCAAATCGTCTGGCTGGCCTCTGATATAGTTAAAGAATAGGGGGCATAATTGTTCATAAATTCATATAAAGAATATCATGGTTTTTAAGTTTTCTTCTCTACTTTGAAATCATCAATTGTGTGATATGGATGTTTCTTTTAGCATGGTGGTTCAACCAACGCCTTCACATCTCGTGAACGTACAAACTTTTATTTTGATGTGAACAATAGTTGCCTGGATGATGCTTTGGATAGGTACCTTCTACTGCTTTCTTTCTTTTCACCTTTGTTCTTATTTTGCAGAATCTGATTCATTTTGCTTCTCGTCTGTTGTTTTAGGTTTGCACAATTTTTTATAAAGCCATTGATCTCACCCGATGCAACTCTAAGGGAAATTAATGCTGTTGACTCTGGTATATATTGCTTCTCTCTTATCTGGAACTGACATTTCTGCTGAGAGAATTAACTTCTAATTTCTGTCTTTTTTTTCTTCACCTGCAGAAAATAAGAAAAACTTGTTGTCAGATCCTTTGCGAATGAGTCAGGTACCTTTATCTTAGAAAAACATCAACGCAGTGGAATATTTTCTGTTATAGTTGAATGGTATCATACTCATATTCTATTTTGATTTTGGGATAAATCTATATTACACCCCTTACTTTATAGGGTTTATCTAAAAATCACACTTTAACTAACAAAAGTATAAAACCGACTAAAAATATCCCATCCCCCCAAATTAAAGAGCAATGCAACCCAGCTCTGATAGTGGTTTTGACATCTAAATCTATGTTTCTACCTAATTTAATTATATTTTACATTTCTTCTTGAGCGGTGTAATATGATTTTTTTTTATTTATTACAATTGTTTCTGTCAAATTCATTTATGTTACCATGCTCTTTCATGCTATAATAATTTCATTGTCTATAATCTTTTGGTTTCAGCTCCAGAAACATTTTTGCTCGGAGAGCCATCCATATCACAAGTTTAGCACTGGTGTGTGTTTTAGTCATCATTTCATTTTCTTGTAGTGTCTGACGTTGCAACTATATGCTTGGTACCATGTTTCTATCTTCATTTTATAGCCACAACTCACAAGTGTTGCATGCTGAAGTCAAGAATTCGTTTTGTAATGTTGCAGAAAATATCCATGTCATATGAACTTCTGAGTTTAAGTTTTTAACTAGTTGAATGCATTTATATTGCCCATGATGGGGAAAAAATACTCACCATATATCCTTCCAAATTCCAAAAGGAAAAAGGCTGCATTTGTAAACCTGATGGTCCATTTGTTTTATGGTATTCTCAATCTTCATGATGGATTCTCTTCATTTGTGGTTTATTCTGTCATCCAAGGCTCACACACATCTTTTCTTGAAGTTCTTCTGTATTGATATTGATCCATGTGGGCCATGAGGATCATTTGAAAAAACACTGATTTCACAAATGAAACAATAGCATATGAAGGACATAGAAACACGTAAAATTGTGCCTTTGTCAGTCAAATGTTTTGCATCCCCCCTTGTGTCGGCCCATGCCTTCCAGCACAACCTAACTAAGATTACTCGGCATCTAGCTGATCTTTCTCAGCACCACCTATCGTATCCCTTTTTTTATTTGGTGGTGAGGCATGGTAGTTATATGAATGGACAAAGGTTGTGATGAATGAGCAAAGATTGTGCAACTCTTAGATCTGGCAAATACACCTCTATTTTTCTAACCCATCAAGTCCCTCTCTTGGCGAGGACCACATAGGCTCGAACAAGCACTGAATTCACAAGTTTGTACATGAAGTACTTTGACATTTCTTATACTTTGAGAATAATTGATGCCTGCCCTCTGATTCTACTTTATTCTG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