Difference between revisions of "BGIOSGA024302"
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Revision as of 16:51, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA024302 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024302, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_26014 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA024302-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA024302-PA |
| Length |
17904 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:16102237..16120140 |
| Sequence Coding Region |
16120047..16120140,16118808..16118918,16109618..16109710,16106865..16107014,16106070..16106128 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:16102237..16120140 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:16102237..16120140 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCAGTGTCTGAGGAGAAGAAGGAGATGCAAGACCCCAGGACACAGGCCATAGCATCCACCATTAGAGTTGTGCCCAACTTCCCTAAGCCAGGAATAATGTTCCAAGATATCACGACCCTACTTCTAAATCCCCCTGTGTTCAAGGACACCATCGACTTGTTCGTTGAACGGTACACTGGCAAAGGCATCTCCGTTGTTGCTGGGGTCGAAGCTAGAGGGTTTATTTTCGGTCCTCCCATAGCGCTCGCTATTGGTGCAAAATTTATCCCACTAAGAAAACCTAACAAACTTCCAGGTGAGGTGATGTCAAAGGAGTACGAGCTGGAGTATGGCGCCGACTGCTTGGAAATGCACGTCGGCGCGGTACAGCCCAGCGAGCGAGCGCTCGTCGTCGACGACCTCGTCGCCACCGGCGGCACGCTCTGTGCCGCCATCGTCTTGCTTGAGCGTGCTGGTGCAGAAGTGGTGGAGTGTGCATGTGTGATTGAGCTCCCGGAACTGAAGGCCACAGAAAGTGTGGCAAGCCACACATGTCTAACATTACCTAAAGGTCGTGAGAGGCTCAATGGGAAGCCACTGTACGTTCTGGTGGAGTCTCACTCCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAVSEEKKEMQDPRTQAIASTIRVVPNFPKPGIMFQDITTLLLNPPVFKDTIDLFVERYTGKGISVVAGVEARGFIFGPPIALAIGAKFIPLRKPNKLPGEVMSKEYELEYGADCLEMHVGAVQPSERALVVDDLVATGGTLCAAIVLLERAGAEVVECACVIELPELKATESVASHTCLTLPKGRERLNGKPLYVLVESHS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..94#1223..1333#10431..10523#13127..13276#14013..14071#15583..15627#17848..17904#ATGGCAGTGTCTGAGGAGAAGAAGGAGATGCAAGACCCCAGGACACAGGCCATAGCATCCACCATTAGAGTTGTGCCCAACTTCCCTAAGCCAGGTTCTCTCTCCTCTCTTGCTTGTTGTTTTTTAGCTTAATTATTCTTGCATCCTCTCTTGCTTTACTGTGATTTCGAGCTTAGTTCTTGCATGTCTCGCTAGTTAATTCATGTGGTTTTCTAGCTCTGTCTTCTTGTTTTGAAACCGAACGATGTTATTTCTTTTGAGTATAAATATTTTTCAGAAGTATTATGTATCAACTGGTTGGCTTCTTCTTTCTGATCCTTTTTTTCAGCATATATGTGCTCATAATCTCATATATACATGTGCAATAGGGGCTGCAATTCTGTAAAGAATATTGACCTTGGGGGTTGCCTTTAATTTCAAGTGCCAAAATCTGTGTTTCCTTGCAAAGGTCCCCACTGGTACTATTGATCCTTGCCTCGTTGGTTCTTTCCTTCCTTTTTTTGTTTATTGGTTCTGAACCCAAAAACTTTCATGAATATAGCTTGTTTCTTGTGTGACTTTATCATGAGCTTTTTGCAGCTTGTAACCTATAACCAAATTTCTCACATTACTACAATTTATAGGCATGCACATGCATGGTTTGAGCATGCACATTTACCACAAAATATTGTTGTTGCGAACTGATCTTCCTTTATTTTTAAAATTATTTTTCCTGCTATATTATGTCATGAAGACATATTTAATCTTCCTATTGAGGTGAAACTCTCACTCTATTCAAAAGGCTAATTATGTGGATATTTCGATAAGCGCATCCATCGTGATGATGAAGGTGGTGTGAGCAAAATGTTGTGTATTCGAGACATTATGATTTTCCCTTTAGAAGTCTTTTCCCACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTGGTTGGTATCAGTTTAATTTGAGCACGCGTGCGCGCGCGCTCTCTCTCTCTGCATTTTTCTCAACACACATCTCATCTTCCCTTGCCCGCCCAAATTTAATTTATAGAATTCCCACAAATACTTTGGAAGAGTTTTGTGGCAATTATTTTTTTCTAGAAAAAAAATCTATTGACTAGATCTGCGAATTAAATCAATGACACATCCCTGCAGAAGAAAAGGTCTATGCAATACCTTTTTTTTCAGGTTCTTTCATAATATTTGTTTTTCTTGATGAAATGTGCAGGAATAATGTTCCAAGATATCACGACCCTACTTCTAAATCCCCCTGTGTTCAAGGACACCATCGACTTGTTCGTTGAACGGTACACTGGCAAAGGCATCTCCGTTGTTGCTGGTAACATATAATTGTTTTGTTTTTTATCTCAAAAAATTGAAAAAATCAAGATTTATTTGAACTTGTGCGCTTTGTTTATTCAAGTACTCCATCCGTCCCTTAATTAATATAAGGGATTTTGATATTTTGCTTGCACTGTTTTAATCACTCGTCTTATTAAAAAAAAATTGTGCAAATATAAAAACGAAAAGTTGTGCTTAAAGTACTTTGAGTAATAAAGTAAGTCACAAATAAAATAAATAATAGTTTTAATTTTTTAATAAGACGAATGTTCAAACAGTACAAAGTAAAATGTCAAAATCTCTTATATTAAGGGACGGAGGGAGTAGTAACTAATCTGATCTTTATCTCAAAAAAATATCAGATCTTATCAAATCCATTGAAATATATAATTTATTTTTTTAATACTAAGTCAGAGTTATTATTTATGAAGATCCAAATATAGTTAATTAAAAGCGTGACTTTGACAGGCACACGATGGGTCGATTGAAAATCTAGCCAAGTTGTACAGTACAATATCTTTTACTTGTCGTTTTTTATACTGACCCGGCCTCCAATAATACATACTCTTAACCGTTAATTACCTACTTATTACTGTAGAAAATCGGTAAAGTTCAGTAGTATCGAAGTAATTTCATGGAAAAATCTAATGACATGATTTTCATTTGTCGATTCCAAAAAAAATGCTAAGTCAATTTAATTTATAAGATTAACGAAAATAATTCTAAAATGACAAATAAATTAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGTGTGTGTGAGATCAGAGCGAGAGAGATTATTCGTATGAGGAGTGTCACAGTCAAATGTACAGAGAAATGAAGAATAATGCAGCAGTAGTAATTGACTACAAAACAGGAGGTTTGGCCTCTCTATCTGACCCTTTTGTAAAGTTCGAAGGCTTCCAGATGATATGACAAAAATATTTGCCTTTCCCTCCACTTGTTTGTGCCTGTTGGACAAATATTTTGAGATCATATATATGTGCATGACAATTGGACATTTGAGTCAGCTACCAGTATAGATTGGTATATAGGCATATATGGAAGTTTGAGGCACTAACTATGAAAAATATACATAAATTGGATTTGATTAGGTGACTTGTCAAATATTCATGGTCCTGTCATGTTCATTGGATTGGATCCTCCACCACATAAAAAAGCTTCAACTAGAACCAAAAGGTAATTAGATATGCACATCAACAAAACTAAACCATTGAACATAACTCTATAATACACACCTCCAACAACTAATACACATATGTCAATTCATTTAGGAGTGGTCATTTCATTCCACTATTACCCATAGCCTGTAGGAGTTCACTTTATACACCTGGCACTGTCATACCCCTAGCTATCTTGTTCTTTACAAACTTCAATAGTCAGTACTCACAAAGAAAAAAAACTACTAGTCAGTTAAAAAAATACTTTGCGTCAATTGTTAAAGTTTAGGTCGATAATAGAAACCATTTAGGTAGGTAGGCCGTGCGCATATGTTGCTTTAGTCCACCATCCCTTTTGTGTGCATCCGTGTATATGATCAATTGTGTATGTCAAAACTTTTGGGTATGCCCTCTTTCCTTATCACTTCACCCATGACGACATATGCACATGCGCATAGGTCAATTGAGGTGTACTTTCCTTTCTCTATGTACGCCTCAATTGACCTATATAGTGTGGAAATAGACATCTTTATTCTAAGGCGCCCACCATGCCATACACATATTCGATCTCTCATGTCAGCTTACTAGGTCATACTAATATATTCTCTTGGTTGTCACTAACATAGCCTACGTCACTGCACTATGGCGTATCACGGGTAATTGTGATGCTACCAAATTTTGAGATGGGGAGAGGATAGCTGATGGCTATTGAAATGTGACCACAATTTAATTTAGAAAAAAAAAATGGGGATTTGATGTCTTACCACTCTTTAGATTGGAGATTTTATGGTTTTCCTCACACATCATTTATTGACTCATATGTCTCCACATGTGATTTTCACAGGGTGATAGGTGGCAATCTAAAGAGGAGGAATTCAATCCATTGGAAAACATTCCTATGAAATTAAAGTTTTCAGATGTAGCATTGCTTCAAAGTAATTTCATAGGATATAAAATTCCTCCATGATTTGGAGAAATTGTAGCATAATTAAGGTCTAACATAATGTTCACAAATACCTTTGATTAAAATTCATAGGCACCTTCTTAATTTTCTTTCTCCCTAATAAATCTAGATACATACTTTTAAATTTATTGTAATTTTCTTATCAGGTTCTCCCTCTGTCCCAAAATATTCTGAAAATTGGGATGGATGGGATGTATTCTAGTACTACAGATCTGGTCATACTTGTCTAGATTTATAGTACTAGGATACGTCATATCCAACCAAAATATCTTATATTTAGGGACAGAGAGAGTATCAAACAACTACTTTGTGCAATTCCAACACTGCTCCTGTGATTTTCCTATTTCTAGTATGGTGTTTCTATATATCTTGCATCTCAAAGGAACCCTCGGTTTATTTCTCGGGCCAATATCATCCCAGGCACTTTATTTATGCCAAAATACATGTGTGGCTTATTAACTATACTGTCTATTCTCGAATAATTTTTATGGTTGATTATTACCATCTCATGTTGTGTTATATTTATAACAATACATACTTCAATAATCTATACCAATATAAAATGCATGAGTTTTTAATTAATGCTATAAATATAGGGTTGATACAATTAATCCTGACCTTCACTTTGATTCGATGTCATGACTCGGATTTAGAGTTAGATCCTTGCCCCCAAGTTCCTCCTAACTTAACTAATTCACCATGAATTATATTTTCGAGGTCATCAAATATATCTTAATTACTTCTATTTCTCGGTGTTTGTATGAGCAACATGATTCCACAATATTGTCTAATGAATCATATTAGAGTAAACTTGCATTGGGTGAACATCATCTCTATTTACTAGTGGCATGTGTTGCACTGTAACGCTCCGCTTTTCGTGAGGCGTTAAAAACTAACTCGGCAAAATCCTAATTGTGAAAATTTTCGTTCTTTGTGTGAGAGTCTAAGTTGTGCCAAGGATCCCAATTTAATCCCGTTGTTCCCTCTCATCGAAATCAAAAATCCTCCCCCTCATCCAAATTCCTCTTCCGATTCGAGTCTCTGAAATCAAATTCTGAAATTCAAATCCTTCCTTTGAATCCTCGCCAAATACTTCTACGAATCCAGAATTATTCAAATCCCGCCTCGAATCCTTTCCTTGACTCCACCCTATGTTCCCGAGAACAAATACCCAAGTATTCCTTTTGAATCTTTTCCATGACTTCTCCTTGAGTTTCCCCTGATACATCCCTAAACCCTCGAGTTTGAATATCAAATTTGAATTCGAATCCAAACCCTAAATCTCTCCAATTCTATCCAAATCAGTTTTTCTCTGTAAAAGTCTACTTTACCTCCCTGTGTTTTTGGATGGGCCGATTCTCCTCCCCCGGCCCATCTCCCCTCCCAGCCCATCATCTTTCCCCCCCTCGCACGTGCGTTGCACGCATGCGAGCC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