Difference between revisions of "BGIOSGA024320"
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Revision as of 16:51, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA024320 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024320, complete gene. |
| LocusTag |
OS07G0476200 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA024320-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA024320-PA |
| Length |
16968 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:15633603..15650570 |
| Sequence Coding Region |
15650495..15650570,15649091..15649490,15647485..15647599,15646807..15646873,15646480..15646671 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:15633603..15650570 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:15633603..15650570 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCGTCTGCTCATCGCGGGGCTCGAGAGCCTCTCCTTCCTTCAGAGCTCGAGATCAAGATATGATGGAAAGCTGGGTTTGTTCATGTTTGAGCCATGCTGGGTGGTAATTTCTGGTGAGACCGGCCGTCGGTGCTCGGTGCATGGTAGCTGGGAAGCAGTTGACACAAGGGCTCCCTCGAGCCTCGAAGGCTCCTACACCGTCCATGCTCCTAAACACACCCAATTCCACACATCCAACAAAAACACTCTTTCAAGGGACCGACCCCTCCGCTTGTGGCTGTGGCCGTTGTGCCGTGGCGTGAGCTTGGCTATCGACACGCAGATAACACTACGATATGTCCACCATAGTGTCTCCACCAAGGCCCTCGCTATGTTCAACAGGTGGTCATCACGCGTTGTCATCCGAGCATCTGGCCATGTTGCCAGCATTAGGGCCAAGGGTCTCGGCCAACGCCACCTCGATAGCTTATGGAGGGCGACGGAGGAGGAGGTGCGGGTGGCGCTGGACCAGCTCCCCGCCGACGCCTCCGACATCCTCGACATCCTGAAGGCCGAGCAGGCCCCGCTCCACCTATGGCTCATCATCGCGAGAGAATACTTCAAGCAAGGAAAGATAGATCAGTTCCGACAGATTCTAGAGGAAGGATCAGGGCCAGAAATTGATGAATATTATGCTGATGTGAAATATGAGAGAATAGCTATCCTTAATGCTTTGGGCGCTTTCCATACTTTCCTGGGGAAGGTTGAGAGAGCACAACAGAAGGAAGTCCATTTCAAAGAAGCAACTCAATGCTACAATAGGGCATCAAGGATAGATGAAACTGAACCTTCAACATGGATCGGAAGAGGTCAACTCTGTGTGGTCAAGCACGATTTGCAAATGGCATCTGATTCATTCAAGATTGTATTGGATGAAGATGGAAGCAATTTTCCAGCTTTACTTGGTCAGTTGGACCCTGAAAATATTGATGCTTTAGTAGCACTGGCAATCATGGACTTGCAAACAAATGAAGCTGGTGGAATTCGCAGAGGAATGGAGAAAATGAGAAGAGCTTTTGAAATTTATCCTTATTGCACATTGGCACTCAACCACCTAGCAAACCATTATTTCTTTACTGGCCAGCATTTTGTGGTTGAACAACTGACGGAGACTGCTCTCTCTTCAAGTAATCATGGACTGCTGAAATCACATGCTTTCTATAACTTAGCCAGATCGTACCACAGTAAGGGTGATATTGAGACTGCTGGAAGGTATTATATGGCATCTGTCAATGAAATCAGTAAGCCACAGGACTTTGTGTTGCCATTCTTTGGACTTGGTCAGATACAATTAAAATTTGCAGACTACAAAAGTTCATTAGCTAGCTTTGAGAAAGTGTTGGAGGTGCACCCAGAAAATTGTGAAAGTTTAAAGGCTATTGGGCACATATATGCAAAGTCAGGTGAGAATGACAAAGCTATAGAAACCTTCAAGAAGGTTACCCGGATTGATCCAAAAGATCATCAGGCATTTATGGAACTAGGTGAATTATTGGTACAATCTGATTGGGCTACTGCTATGGAATACTTAAAAACAGTAAGGCTATTCACTTCGCTAGAAGTTTATTCTGTTAGCCTGTATCAGATTCTACCTTGGATTTCACAGGCTCGGAATCTCCTAAAGAAGTCAGGAGAGAAAATACCCATTGAATTGCTCAATGGAATTGGACTACTTCATTTTGAGAAGGGAGAGCTTGAGATGGCTGAACAAAGTTTTAAGGAAGCACTTGGAGATGGCTTTTGGGTTTCAATTATAGATGGCAGTGTAGGTAGCTCCGTGGTTAACTGGAGTATTCAGTATAGGGACCAGAGTTTTTTTCAACAACTTGAAGAAGAGGGAACACCTCTTGAATTACCTTGGGATAAGGTCACTACATTGTTTAACTATGCAAGATTGTTTGAAGAGCTCCATGATACTGTGAAAGCCAGTCTCTTTTACCGCCTCATTATTTTCAAGTATCCAGACTACATTGATACTTATCTTAGGTTAGCAGCTATTGCAAAAGAAAAAAACAATCTCCAACTGAGCATTGAGCTGATAGGTGATGCTCTAAAGATAGATGATAAGTATCCAAATGCACTTTCTATGCTTGGAAGTCTTGAACTCCAAGGTGATGAAACCTGGCTTACTGCAAAGGAGCATTTCCGTGAAGCTAAAGATGCTTCTGAGGGAAAAGACACATACTCTATGCTTCAATTGGGGAACTGGAATTACTTTGCTGCTAATCGCCCTGAGAAAAAGGCCCCAAAATTTGAGGCCACTCATAGGGAGAAAGCCAAGGAACTGTATTCAAATGTACTAAAGCAGCACCGTGGTAATATGTTTGCTGCAAATGGTATTGGGATCTTATATGCTGAGAAAGCCCAATGGGATATTGCCAAGGAGTTATTTACACAGGTACATGAAGCTGCTTCAGGAAGTATATTTGTCCAGATGCCTGATGTATGGATAAATTTGGCTCATATATATTTTGCTCAAGGTTTTTTTCAGCAAGCTGTGAAAATGTACCAAAACTGCCTGCGGAAGTTCTTCTACAACACAGATGCAACTATACTTCTATATCTTGCCCGGACACACTACGAAGCTGAACAATGGCAAGACTGCAGGAAAACATTGCTGAGAGCTATTCATTTGGCTCCATCAAATTATTTATTGCGATTCAATGTAGGTGTTTCGATGCAGAAATTCTCAGCTTCGACTCTACAGAAGACAAAACGAACAGTTGATGAAGTTCGTGCGACGGTCTCTGAGCTTCAGAATGCTATTAGAGTATTCAGTCTATTGTCTGTTGCATCTACATACCATTCCCATGGTTTTGATGAGAGAAAAATAGAAACTCATATTGAGTACTGCAAACATTTGCTTGATGCTGCTAAGGTTCATCGTGATGCAGCTGAGCAGGCTGAGCAGCAGAATAAGCAAAAAATGGAAGTTGCTCGACAAATTGCTTTGGCTGATGAAGCTCGCCGCAAGGCTGAAGAACAGAGGAAGGCCCAGTTAGAAAGAAGGAAGCAAGAGGACGAGCTAAAGCAAGTAATGCAACAGGAGCAACACTTTGAGCGTGTCAAGGAGCAATGGAAAACCTCAAGTAACACTCCTGGCAAGAGAAAAGATAGGTCTAAGCATGAAGATGAAGAGGGGGGAAGTGAAAAGAGGAGGAAGAAGGGTGGTAGGAGAAGGAAGGATCAGAAGACAAAGGCACACTATGGGGAAGAGGAAGAAGACGAATATAGAGATGAACCAGAAGCAGAAGATGATTATGCAAACACGGCGAGGAGTAACGATGGTGGCGATTCAGAGAGAGCCCCAGGTCACCTTCTTGCTGCTGCAGGTCTTGAAGATTCTGATGCTGAAGAAGATGACATGGGACACCCTCAATCTGCCATAGAACGGAAGAGACGAGCCTGGTCAGAATCTGAGGATGATGAGCCAGTGCAGAGGCCAGTGCAACCTAGCGCAGGCGAGAACGATCTGAGTGATTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRLLIAGLESLSFLQSSRSRYDGKLGLFMFEPCWVVISGETGRRCSVHGSWEAVDTRAPSSLEGSYTVHAPKHTQFHTSNKNTLSRDRPLRLWLWPLCRGVSLAIDTQITLRYVHHSVSTKALAMFNRWSSRVVIRASGHVASIRAKGLGQRHLDSLWRATEEEVRVALDQLPADASDILDILKAEQAPLHLWLIIAREYFKQGKIDQFRQILEEGSGPEIDEYYADVKYERIAILNALGAFHTFLGKVERAQQKEVHFKEATQCYNRASRIDETEPSTWIGRGQLCVVKHDLQMASDSFKIVLDEDGSNFPALLGQLDPENIDALVALAIMDLQTNEAGGIRRGMEKMRRAFEIYPYCTLALNHLANHYFFTGQHFVVEQLTETALSSSNHGLLKSHAFYNLARSYHSKGDIETAGRYYMASVNEISKPQDFVLPFFGLGQIQLKFADYKSSLASFEKVLEVHPENCESLKAIGHIYAKSGENDKAIETFKKVTRIDPKDHQAFMELGELLVQSDWATAMEYLKTVRLFTSLEVYSVSLYQILPWISQARNLLKKSGEKIPIELLNGIGLLHFEKGELEMAEQSFKEALGDGFWVSIIDGSVGSSVVNWSIQYRDQSFFQQLEEEGTPLELPWDKVTTLFNYARLFEELHDTVKASLFYRLIIFKYPDYIDTYLRLAAIAKEKNNLQLSIELIGDALKIDDKYPNALSMLGSLELQGDETWLTAKEHFREAKDASEGKDTYSMLQLGNWNYFAANRPEKKAPKFEATHREKAKELYSNVLKQHRGNMFAANGIGILYAEKAQWDIAKELFTQVHEAASGSIFVQMPDVWINLAHIYFAQGFFQQAVKMYQNCLRKFFYNTDATILLYLARTHYEAEQWQDCRKTLLRAIHLAPSNYLLRFNVGVSMQKFSASTLQKTKRTVDEVRATVSELQNAIRVFSLLSVASTYHSHGFDERKIETHIEYCKHLLDAAKVHRDAAEQAEQQNKQKMEVARQIALADEARRKAEEQRKAQLERRKQEDELKQVMQQEQHFERVKEQWKTSSNTPGKRKDRSKHEDEEGGSEKRRKKGGRRRKDQKTKAHYGEEEEDEYRDEPEAEDDYANTARSNDGGDSERAPGHLLAAAGLEDSDAEEDDMGHPQSAIERKRRAWSESEDDEPVQRPVQPSAGENDLSD</aaseq> |
| Gene Sequence |
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