Difference between revisions of "BGIOSGA024446"

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA024446

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024446, complete gene.

LocusTag

OsI_25697

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA024446-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA024446-PA

Length

18195

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:11273424..11291618

Sequence Coding Region

11291373..11291618,11291197..11291282,11290077..11290178,11289062..11289168,11288867..11288967
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Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:11273424..11291618 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:11273424..11291618 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGTGGACCCCGCGCCATGGCGGCGTCGACCCGCGGCGGGCGGCGGAGGAGGAGGCGCCGCGGAGGCCGCGCTCGTGCTGCTCGCCCTGGCGGCGCTCTACGGCGCCATGTCCCTCGTCGCCTACCGCGTCATCCACATGCGCCACGTCGCCCCCCTGGGCGCCGACGCGCCGCTCGGGGACTTCTCCGAGGGACGCGTGCTCCACCACCTCCGCTGCCTCTCCGTCGACATCCCCGGCCGCCAGGAGGGGAGCCCGGGGCTGGAGGCCGCGGCGCGGTACATCAAGGGGCAGCTCGAGGAGCTCGCCGCGCGCGCGGGGCCGGAGTACAGAATAGAGGTTGAGGAATCACTTGTTAGTGGCTCGTTCAGCATGAGGTTTTTGCGCCACAGAGTAACTCTAACATACAGGAATCACAAGAATATTGTTATGAGGATTTCATCAAATGTTTCAGAAGATCAGGATCTAGCCTTCTTGGTGAATGGACATTTTGACAGTCCACTTGGATCTCCTGGTGCAGCTGACTGTGGTTCTTGTGTTGCATCTATGCTTGAGTTATCAAGGCTCATCATTGATTCTGGGTGGGTTCCTTCTCAACCGGTGATTTTTCTATTCAACGGAGCTGAAGAACTTTTCCTTTTGGGTTCACATGGTTTCATAAAGACACATAAATGGAACAACACGATTGGTGCCTTTATTAATATCGAAGCTTCTGGAAGCGGCGGTGCTGATTTAGTTTGTCAATCTGGACCTGGATCTTGGCCTTCTCGTATTTATGCTCAGACTGCGAAGTATCCTATGGCAAACAGTGTTGCTCAGGATATGTTTGGAATAATCCCAGGTGATACAGATTATAGGATATTTGCTGAAGACATTACAAACATTCCAGGACTTGATATTATCTTTGTTCTGGGTGGTTATTTTTACCATACTTCATATGATACTGTGGAAAACTTGCTTCCTGGAAGTATTCAAGCACGTGGAGAAAATTTATTCAACCTTGTGAAGGCTTTTACAAATTCTCCCATGCTGTTGAAAGAGAATAAGCGATCTAATGAAGCTGCTATGCCTATAAAGGATGATTTGAGAGCTATCTTTTTTGATTACTTGACTTGGTTCATGGTTATTTATCCCCGTGGTGTCTCTTTGGTTCTCCACAGTCTTCCAGTAGCCATTTTCCTGCTTGCACCACTATTCCTGACGTCTCCAAACATTACCTTGATGTCATGGTCTCTGACTGTTCTGGATTTAATGAGAGGAATGCTGCTTCATGCATTTGGTGCCATCCTTGCAATAGTCATTCCTGCTGTGGCTGCAGCTGCCTGTGCTTTGCGGGCTTGGGTTAGCTGGTTTGCTCACCCTTATTTGGCATTCCTTATGTTTGTTCCAACTTCATTAGCTGGTCTATTTCTCCCGAGGATTGTATGGGGATTATCAGAGCAAGCACATTTTTGGGGTGCTTTCGGGCTCTATTCCTTAATAACTTTGGTTTACATGCTAGCTGGCCTGAGTGGAGGTTTTCTAACATTCTTCATTTCCATGTCGATGCTTCTTGGGCGTTTTATCTGTAGCATTAGTCGGAAACATTGGAACAAACAATCACCAAAGTTGTTGGTTGGTTATGTGGTACCTATGATCCCATGTCTCCTTTATTGTCTTTACTATGGTGGTTTCCTTATCCAGTTCTTGATTGAGAAGATGGGAATGATGGGATCTCTCCCAAAACCATACGGATATTTTGTAGCTGATGTCATTGTTGGGTCAGTAGTTGGATTGGTCGTGGGATGGTGTTTTGGTCCAGTAACACCTATTGCTAGTCGATGGCTGGCCAAAACCTCCATCCTCCATGGCTTGTTACAAGTTACAGTGGTTGGTTTGGCGATCTCATCACAACTGTTTCCTTACAGCACTGGAGCACCTAAAAGAGTTGTTCTTCAACACACCTTTGTTACAGATGCTAATAGTATTGTGGAGTCACACTATGGTTTCTCTGTGGTTGATGCTAATTCATTGGAGTTTCTTTTCAATAATGCGCCTGAGGCAGCAAAATGGCTGAAGGATAACTCACTATTATCTTTTGAAGAAAAGTATCACTCCGACAGAAGTTCATGGTTGGCACTATATCCTGTCAATTTCTTGTTCTCTGGGAGCTTAAAGTTTCCTTCAGAAAATGAAGAGATTAGAAAACATTACCAGCATTTCCCCCAGATGGTTATTCAGAAGACCTCGAGTAATAATGGGCACCGGAGGATGCATCTTGAGCTTTCACTTGGTTCATTATCGGAGATTTGGACCTCTGTGCTTAATATTACTGGACCACTATCAAATTGGTCCTTTTCTGATATGACACTTCCAGATCCTCAAAGTTTTAGTGGCGGGCCACCATCATATATATGCAGACTTAGTGGAGAAAGCCACGAGAATTGGTCTTTCTGGTTGGAGGCGAACTCTTCTGAACCTTTGAGAATCGATGTAGCTGTACTTGACCAGTATCTCCTTGATCGTACAAGGAAACTGAAGAGTCTCTTCCCAAGTTGGGCAGACATTACAGCCTTCACAACATTTTTCTCAACTTATCACTTATAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MVDPAPWRRRPAAGGGGGGAAEAALVLLALAALYGAMSLVAYRVIHMRHVAPLGADAPLGDFSEGRVLHHLRCLSVDIPGRQEGSPGLEAAARYIKGQLEELAARAGPEYRIEVEESLVSGSFSMRFLRHRVTLTYRNHKNIVMRISSNVSEDQDLAFLVNGHFDSPLGSPGAADCGSCVASMLELSRLIIDSGWVPSQPVIFLFNGAEELFLLGSHGFIKTHKWNNTIGAFINIEASGSGGADLVCQSGPGSWPSRIYAQTAKYPMANSVAQDMFGIIPGDTDYRIFAEDITNIPGLDIIFVLGGYFYHTSYDTVENLLPGSIQARGENLFNLVKAFTNSPMLLKENKRSNEAAMPIKDDLRAIFFDYLTWFMVIYPRGVSLVLHSLPVAIFLLAPLFLTSPNITLMSWSLTVLDLMRGMLLHAFGAILAIVIPAVAAAACALRAWVSWFAHPYLAFLMFVPTSLAGLFLPRIVWGLSEQAHFWGAFGLYSLITLVYMLAGLSGGFLTFFISMSMLLGRFICSISRKHWNKQSPKLLVGYVVPMIPCLLYCLYYGGFLIQFLIEKMGMMGSLPKPYGYFVADVIVGSVVGLVVGWCFGPVTPIASRWLAKTSILHGLLQVTVVGLAISSQLFPYSTGAPKRVVLQHTFVTDANSIVESHYGFSVVDANSLEFLFNNAPEAAKWLKDNSLLSFEEKYHSDRSSWLALYPVNFLFSGSLKFPSENEEIRKHYQHFPQMVIQKTSSNNGHRRMHLELSLGSLSEIWTSVLNITGPLSNWSFSDMTLPDPQSFSGGPPSYICRLSGESHENWSFWLEANSSEPLRIDVAVLDQYLLDRTRKLKSLFPSWADITAFTTFFSTYHL</aaseq>

Gene Sequence

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