Difference between revisions of "BGIOSGA025025"
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Revision as of 16:55, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA025025 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025025, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1123_C12.101 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA025025-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA025025-PA |
| Length |
14090 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:637088..651177 |
| Sequence Coding Region |
637088..637320,637400..637524,641397..641533,641630..641735,641828..642078 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:637088..651177 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:637088..651177 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACCCCGGCCGAGGCGGACGCCGGAGGGCCGGCTTCGAGCGCGCCTGCCGCCTGCCCAACACCGTCCACTCCGAGATCGCCTCCGCGCTCCCGCTCCCCACGCTCCCGCTCAACCTCGGCGCCGGCCTCCTCGACGACGACGACCCCCTCGCCGACCCCGACCGCCCCGACATGATCATGCAGGCCGCCAACATCGCCCGCATCCTCGCCGACACCGACGTCTCCCACCTGGGCTTCACGGAGGCGGACAACGTCGAGACGGACCCCAGCCAGTGCTCCTGGCTCTGGAGGGAGGTGCTCAAGCATAACCCCGACGCCTTCACCATCAAACCCCGCCCTCTCCCGCCTTCCCAAGATCCCCTTGAAGGCCAAGAAAATCAAAATCAGGAGCATGAGAAGCATTTTGCGCATGTTGCGCCAAACTTTAATAGCATGCGAAAGGACCATGGATTTCCTCGGGATGACCCTATCCCACATAGCGAGCATCTTAATAATGATCTAACACAAGATCCAGTTGCTTCAAAGAAGCCAAAAGTTAGGAAGAAAGAAATCCATAATTCTGCTTCAAGTTCTGACCCTAGCATTCCTAATAGTCAAGAAGTTATCGCCAACTTCTGTGAGATGGTAGAAGATTTCTGTGGAAGAGTAGAAATTCCTGATGATGCAGATGGTGATGAGTGGCTATCAATTCCACTGAATGATGCTAAAGTTCTTGTAAATGAAATCACATTTGTTCGGTCAAAAAAGATTTTGCATGAGATTCCGATGGATACACTTACAAGGCTATTACATGTGATAGACCGTCAGATCCGGTGTTCTCAAGGTTTATCAATAGATGTGAAGGAAAATGCTGATGCTGCAGATGCTGAACCCTTGGTTTTCTCTGCTTTGGAGTCCATTCATGCAGCATTAGCTATAATGACCCACCATGACATGCCAAAGCAGCTGTATCGAGAAGAACTTATTGAGAGAATTCTTGATTTCTCACGACATCAGATCATTGATTGTATGGCTGCAAGTAACCCAACCTTTCGAGCTCTTTACAAACCAGCTGAAAAAGTCACAAATGATGGGGATGAGGATGAAGAAGTCATGGGAAATGGACCAGCTAACAAAAGGAGGCGTACTGCTAATTTAAGCATGAGAAAATCTTCTACAAACAAGACATACTTGGTTGATGAAACACTTGTTCTTCTTCGTAAGCTACAGTTTTCAAAAAATGCTATTAGAACTTACCATCTAGCAGATGAAGAACATAAGCAAATCCAGATGATAACAGCATTGTTAGTTCACCTGGTTCAGTTCAGTGCAAATGTTCCTGATGGTTTAAAGGGAACGGTGAACTGGAGCACTATTGTTGATGCATCGATAGACGCTAGTTATCCAATCAAATGCTATGAAGCAGCAACGGAGGCTTGCTGCCTTTTTTGGACCAATGTGCTTCAACGTTTCACTGCTGCTAAATCTCAGGATATGTCGGAAGCCAAAGGGATTATAGATAATCTTGTGCAGGACTTGCTAACTATACTAAATTTGCCTGAGTATCCAGCTGCTGCCCCAGTACTTGAGGTTCTCTGTGTGTTGCTGCTTCAAAATGCTGGATTGAAATCAAAGGACACCTCTGCTCGCTGTTTTGCTATTGATCTTCTTGGTGGTATTGCATCAAGGTTGAAACGTGATTCGGTTATCTGTAGCAAGGAGAAGCTTTGGATATTGCAAGAACTCACTGATACTGAAAGTGATGGCTCGAAAATCTTAAAGAATAAATGCTGTATTTGTCTTGGTGGAAGAGATTGTGTGGGTGCTGTTAGTCAGGAAAACCTACAGTGTGATTATGCCTGTCCATTATGCTTTTGCAAACGGCAGCTCAGTGTGTTACAGTCATATTATGAGTTGCAAAATAAAGAGAATGGCAAAAGAAATGCTGCCTCTCATCGGAAGAAATCCACTGTACCTGATGAGGTGACAGCTGTGGATATTGTTCAACAAATACTTTTGACTTATATCCAGGAAGGTGGTCCACAAGATGATGGAAATTTGTTTACACGATGGTTCTATCTCTGCATGTGGTACAAAGATGATCCACATTCTCAAGAGAAGATCATCTACTATCTTGCCAGACTGAAAACTAAAGACATTCTGCGGGATTCTGGCAATGGTTTGGTATTATCCAGAGATTGGGCTAAGAAAATTTGTTTGGCACTTGGCCAGAAGAACTCATTTTCTAGAGGGTTCGATAAAATCCTTTCCCTCCTTTTGGCTAGCTTGAGAGAAAATTCTCCTGTAATAAGAGCAAAGGCCTTGCGTGCAGTCAGCAGTATAGTCGAAGCTGATCCTGAGGTGTTGGGTGACAAACGTGTCCAGTCTGCTGTTGAAGGAAGGTTTTGTGACTCAGCTATTTCTGTCCGTGAAGCTGCGCTTGAGCTTGTGGGTAGACACATTGCTTCACATCCTGATGTCGGCCTGAAGTATATTGAGAAAGTGGCTGAGCGGATAAAGGACACAGGAGTAAGTGTTCGCAAACGTGCGATCAAAATCATCCGCGATCTGTGTGCTTCAAATCCAAACACGGACACTACTCGTGCCTTTGTGGAGATAATTTCTCGTGTTAATGACGAGGAGTCTAGTGTACAGGATCTTGTATGCAAAACATTTTATGAGCTATGGTTTGAAGAACCAACTGGGAGTCATAAGCACTTGGTTGCTGATGGTAGTTCAGTTCCTATGGAGATTGCAGTAAAGACCGAACAAATTGTTGACATGTTGAGAAAGATGCCCAATCACCTACCCCTCATTACCATTGTAAAGCGCAACTTGGCTCTTGATTTCCTTCCACAGTCAGCTAAGGCCACAGGCATTAACTCATCATTTATGGCATCTCTAAGAAAGCGTTGTGAGTTGATATGTAAGCGCTTGTTGGAAAGAATACTGCAGGTGGAAGAGGGAGCTGCTAGTGAGACTGAAGTCCATGCACTTCCTTATGTTCTTGCCTTGCAAGCATTTTGCATTGTTGATCCCACCCTCTGCACTCCTGCAACTCAACCTTTTCAGTTTGTTGAAACACTTCAACCATACCTTAAGAAGCAGGTTGACAATAAATCAACAGCCCAGTTGCTTGAAAGTATAATTTTTGTAATTGATGCTGTTCTTCCACTCATATGGAAGCCACCACAATCTGTGGTAATAGAGCTAGAGCAGGATCTGAAGCAGATGATTGTTCGACACTCCTTTTTGACAGTTGTGCATGCCTGTATCAAGTGCCTTTGCGCCCTTAGCAAAGCAGCAGATAGAGGGCCAAGGTTATTGGAATACCTTGTAAACATTTTTTACAAGCATCTGTCGGGTTCTAACTCTTCTAATTCTGATAGTCAGCTTTTGGGCCGATCATTGTTTTGTCTTGGACTGCTCCTTAGGTATGGTTCTCAACTCATGGCAGCATCCGAAAATCAACTTGATTTCCCAAAGATTATCAGCTTGCTGAAGAAGGAATATCTTCTCAAGGATGATTTCAGCTTGAAGGTTCGAGGTTTGCAGGCTTTGGGATACATACTTATTGCAAAGCCTGATTTTATGCTACGTAAAGATATCTCAACCCTAATAGAGTCATCATTGTCTTCTGTTGTTGATTATAGATTAAAGATTCAAGGATTGCAGAACCTTTTTGAGTATCTACGTGATGCGGAAAGCCAGCTCAATGCAGAGAGTACTGGCAAGCCTACACCCAATGCAACAAACGGTGGAAGTGAAGTGCCTGTTGCTGCAGGTGCTGGAGATACTAACATATGCGGTGGTATTATCCAATTATATTGGAATTCTATTCTTGAAAGATGCTTGGATATAAATGATCAAGTCCGTCAAACTGCACTAAAGATTGTTGAAATTGTTCTCCGCCAGGGTTTGGTTCACCCCATTACTTGTGTTCCACACCTTATAGCACTAGAAACTGACCCACTGGAGGGGAACTCAAAGTTGGCTCATCATCTGCTAATGAATATGAATGAAAAGTACCCTTCATTTTTTGAAAGCCGGTTAGGTGATGGCCTGCAGATGTCATTTCGATTTTTCGAGTCCACAATCAGCAATCATGATATGGTGGCCACAAACATGAAATCTAATCCAATTGCGTTTGTTAAACCTGGGATATCTCGAATATACCGCCTCATCCGTGCAAACCGGAATTCCAGGAACAAATTTGTACACTCAATAGTCCGTAAATTTGAGGGTGATAACCGCAGTTACCCCACAATTAGCTTTCTCATGTACTGTGCTGAAGTTCTTGCGTCTCTCCCATTCACAAGCCCTGATGAGCCACTTTACTTGATATATGATATAAATCGGGTTATTCAATTAAGAGCTGGAGCAGTTGAGGCAAATTTGAAAAATTGGACTTCCATGTATCAGCAGCAAGAAATGGTGGGTATGCCAAGAGACACTGGTGATGTTATGCATGAGCCTGGGGGATGCTCTGACCAAAATTTGGTTGATGTCTCTCAAATGATGCTTGGCAATACATGCAGCACGCCAGTTGTTAACATGGCCAAACTTCAGGAGGATTGCCATGGCGCGATAGCCCTGCAGCTCCTTCTCAAGCTGAAGAGACATCTGAAAACTGTCTATAGTTTAACCGATGCCCGGTGTCAGGCATTTTCTTTGAAGGATCCACCAAAATCTGGCGAAACAATCTCCAAGCAGAATATCCCATTGAACATTAGTAATACCAACACCAGTTTGCCGAGCTGCCCGCAGGATGCAGCACGTGTATACCAGGATTTCAAGACAGTGCTGCGAGAAGACACCGTGGACTACGGGATGTACACCGTTTCGGCCCAGAAAAAACGTCCGACTCCAAGAAGCTCGTCGAGAGTAAGAAGACCGGCGGCTGTTACAAGAGGCCGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGATGAGGACACCGATGACGAAGATTGGACTGGTGGTGGAGCAAGAGTGCTGGACTTCAGCGCTCAGGGTGGGCGAGTAACAAGGCAGAGGGTCCAAGTCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDPGRGGRRRAGFERACRLPNTVHSEIASALPLPTLPLNLGAGLLDDDDPLADPDRPDMIMQAANIARILADTDVSHLGFTEADNVETDPSQCSWLWREVLKHNPDAFTIKPRPLPPSQDPLEGQENQNQEHEKHFAHVAPNFNSMRKDHGFPRDDPIPHSEHLNNDLTQDPVASKKPKVRKKEIHNSASSSDPSIPNSQEVIANFCEMVEDFCGRVEIPDDADGDEWLSIPLNDAKVLVNEITFVRSKKILHEIPMDTLTRLLHVIDRQIRCSQGLSIDVKENADAADAEPLVFSALESIHAALAIMTHHDMPKQLYREELIERILDFSRHQIIDCMAASNPTFRALYKPAEKVTNDGDEDEEVMGNGPANKRRRTANLSMRKSSTNKTYLVDETLVLLRKLQFSKNAIRTYHLADEEHKQIQMITALLVHLVQFSANVPDGLKGTVNWSTIVDASIDASYPIKCYEAATEACCLFWTNVLQRFTAAKSQDMSEAKGIIDNLVQDLLTILNLPEYPAAAPVLEVLCVLLLQNAGLKSKDTSARCFAIDLLGGIASRLKRDSVICSKEKLWILQELTDTESDGSKILKNKCCICLGGRDCVGAVSQENLQCDYACPLCFCKRQLSVLQSYYELQNKENGKRNAASHRKKSTVPDEVTAVDIVQQILLTYIQEGGPQDDGNLFTRWFYLCMWYKDDPHSQEKIIYYLARLKTKDILRDSGNGLVLSRDWAKKICLALGQKNSFSRGFDKILSLLLASLRENSPVIRAKALRAVSSIVEADPEVLGDKRVQSAVEGRFCDSAISVREAALELVGRHIASHPDVGLKYIEKVAERIKDTGVSVRKRAIKIIRDLCASNPNTDTTRAFVEIISRVNDEESSVQDLVCKTFYELWFEEPTGSHKHLVADGSSVPMEIAVKTEQIVDMLRKMPNHLPLITIVKRNLALDFLPQSAKATGINSSFMASLRKRCELICKRLLERILQVEEGAASETEVHALPYVLALQAFCIVDPTLCTPATQPFQFVETLQPYLKKQVDNKSTAQLLESIIFVIDAVLPLIWKPPQSVVIELEQDLKQMIVRHSFLTVVHACIKCLCALSKAADRGPRLLEYLVNIFYKHLSGSNSSNSDSQLLGRSLFCLGLLLRYGSQLMAASENQLDFPKIISLLKKEYLLKDDFSLKVRGLQALGYILIAKPDFMLRKDISTLIESSLSSVVDYRLKIQGLQNLFEYLRDAESQLNAESTGKPTPNATNGGSEVPVAAGAGDTNICGGIIQLYWNSILERCLDINDQVRQTALKIVEIVLRQGLVHPITCVPHLIALETDPLEGNSKLAHHLLMNMNEKYPSFFESRLGDGLQMSFRFFESTISNHDMVATNMKSNPIAFVKPGISRIYRLIRANRNSRNKFVHSIVRKFEGDNRSYPTISFLMYCAEVLASLPFTSPDEPLYLIYDINRVIQLRAGAVEANLKNWTSMYQQQEMVGMPRDTGDVMHEPGGCSDQNLVDVSQMMLGNTCSTPVVNMAKLQEDCHGAIALQLLLKLKRHLKTVYSLTDARCQAFSLKDPPKSGETISKQNIPLNISNTNTSLPSCPQDAARVYQDFKTVLREDTVDYGMYTVSAQKKRPTPRSSSRVRRPAAVTRGRGGGGGGGDEDTDDEDWTGGGARVLDFSAQGGRVTRQRVQV</aaseq> |
| Gene Sequence |
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