Difference between revisions of "BGIOSGA025152"
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Revision as of 16:55, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA025152 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025152, complete gene. |
| LocusTag |
OS07G0148800 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA025152-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA025152-PA |
| Length |
13666 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:2503523..2517188 |
| Sequence Coding Region |
2503523..2504212,2504311..2504376,2504569..2504634,2504760..2504831,2504912..2504977 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:2503523..2517188 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:2503523..2517188 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAAGCACCACCGGAGACCTCAAAGCCGGCGGAGGCTAAACCGTCAAAGACCCGGCTGTCTGCGCCCACCGGCAGGTTTGCATTGGGGACAGCTTCTTCAATCAAGAAGCGGACTGATGTTGCTCCCTCAGCCGAGTTGGGGATGTCAAGGTCATCGTTGACGAAGTCTACCTCGTCTATGAATGCTGCTCCAGTTCAGAGAAGAAGCAGCACAGGAAGTGCGGGGAAGCAACAGGATAATGGGAGCTCAGTTGTTGCTAAGAAAGCTAGTCCTTCTCTGTCAGATGGGGTGAAGAAGAGTAAACCAGTGACAGCCTCCATGGTCAGCTCAAAATCATCACTGGAAAAGAAGTCATCTGTGCAGTCTGAGAGGGCCAAGGTGGATGCGATGAAGAAGCCTGCTGTTAAGTCATCACCAATTTCTACTCTGAAGAAAGTCCCATCACTGACAGAGAACTCCAGCAGTAGCGCTAGCAGCAGCTTCAGGAGAGCAGCCTCAAATGCTACTCTCAACTCACCACGGTCACCTTCAGTGACAAGCAGCGTCACGAAAAAAGTGGGTTCTCGGACATCGTCGATGGACAAGGGTTCTTCCATGCCTATTCGGAAGAAGAGCTCGACTGCTGATAGCCGTGATTCACGGTTTATGATGCTGCCCCAGGTGGATTTGAAGGCTAGTGATGAAGTGAGACTTGATTCAAGAGGTCATAGGGTACGAACTCTGAAGCAGTTGAGATTAACACCTGTACTTGAATTTGTTTATCTCAGGGACAATCGTCTATCAAGTTTGGAGGGTATTGAGATTCTCAAAGGGGTTAAGGTTCTTGACTTGAGTTTTAATGAATTTAAGCTCCCTGGGTTTGAGCCCCTTGAGAATTGCAAACTTCTCCAGCAACTTTATCTCGCTGGAAATCAAATAACATCCCTTGCTACCCTTCCCGAGCTTCCTAACTTGGAGTTTCTCTCTGTTGCTCAAAATAGGTTGAAATCACTCTGTATGGCTAGTCAGCCTCGACTTCAAGTACTAGCAGCCAGCAGAAACAAAATATCAGTTTTGAAGGGATTTCCGCATTTGCCTTCTCTGGAGCATTTACGTGTTGAGGATAATCCACTTCTTGAGATGCCACACTTGGAGGCTGCTTCTATTCTGCTTGTAGGCCCTACCTTGAAAAAGTTCAATGACCGGGATCTGAACCCCGGTGAGGCTGAAGTTGCGAAGCAATATCCTGCTCATACAGCTATTTGCATTCGTGATGGTTGGGAATTTTGCTCTCCTGAACTTGCTGCTGATTCAACATTTTCCTTCCTACTTGAGCAATGGAAGAATAAGTTGCCGCAAGATTTGATAGTGAAGAAAGCTCATGTTGACCATCCATTTGAAGAAGATCCCTGTCATTGCCATTTTAGCTTCACAAATCAGTGTGATGAGGGTGAACTAGTCCTCAAATATCAGTGGTTTATAGGTGACAAGACACCAACTGATTTTGTGCCTCTTCCTGAAGAATTAAGTGAGGTATACTGGCCAAAGCGTGAAGATGTTGGAAGATGTCTGAAAGTTGAGTGCACTCCAATATTGAATGATGCTGAATTCCCGCCCATCTTTGCTGTTTCCTTACCTGTTTCTCCAGGTACTGGTTGTCCAAAGGTCATCAATCTGACGGTCCATGGTGATTTGGTGGAAGGAAATGTACTCAGGGGTGTTCCTGAGATTGCCTGGTGTGGTGGGATGCCAGGAAAAGGTGTTGCAAGTTGGTTAAGGAGAAGATGGAACGGCAATGCTGTTGTAATAGATGGAGCTGACAGGATGGAATATCAGCTAACCCTAGATGATATCGATTCAAGTTTGGTATTTATGTACACCCCTGTTACAGAAGATGGTGTTAAGGGAGAGCCCCAATGTACAATGACAGATTTTGTAAAGGCTGCCACACCATCAGTCAGCAGTGTACATGTTGTGGGAGACATTGTTGAAGATAACACAATCAAAGGGAATGGAAAGTATTTTGGTGGCAAAGAGGGATTAAGCAAATTCCTCTGGTTTAGAGAGAAGGAAAATGGGTATGACCATATGAGCCATACTGCCATTAGTTTGTCATCTTTGAGTATTGATAAAACACCTTTATGTGAATTTCTTCTAGTGCTATCAAATAGCACGGAGTACACGCTAACAAAGGAGGATGTGGGTCGGCCCCTCAAATTTGTATATGTTCCCATCAACCTTGAAGGTCAGGAGGGTGAAGCTGCTTATGCTATGACAGATGCAGTTAAGAAAGCACCTCCAAAAGTCTTGGATTTGAAGATAGTTGGGGAAGCAAGAGAAGGAAGCAAGGTGTCTGCTACTGCTACTGTCAAAGGTGGCACTGAAGGGTTCAGCAGGGTTCAATGGTTCATAGGATCTTCATCCAAATTTTTAAATGAGAATGAACTCAGAGTCCTCACTACATCTAAAGTTTCTAAGACATTCCGCATTCCTCTCAGTGCTGTTGGATATTATATTGTTGCAAAGTTTACCCCCATGGCACCTGATGGTGAAACTGGTGAACCAGCCTATGCTGTGTCTGCTGATGTTGTGGAAATGCTACCACCCAGCCTGAATTTTTTGACAGTCACTGGTGAATTCTCAGAGGGCCAAATGTTGACAGCATCATATGGTTACATTGGGGGACATGAAGGCGATAGTTTATATAGTTGGCATCTTCATGAGACTGAGGATGATGAAGGCAGTCTGGTTTCAGAGGCATCAGGTCTGCTACAATACCAAGTTACAAAGGAAGCTGTTGGAAAGTTCCTTTCTTTCAAATGCATACCTATTAGGAATGATGGTATACTTGGTGAGCCAAGAGTTTTCACAGGAAAGGACAGAGTCACACCAGGAAGGCCAACAATACTTTCTCTTGAACTAACTGGTGAGGCCATTGAGGGGACCACAATGGTTGCCAGCAGAAGATATTGGGGAGGAGAAGAAGGGGAGACCATATTCCGTTGGATATTGACTAGTTCAGATGGATCACAAAAAGAAATTGAAGGGGCTGCAAGTTCATCATACACCTTGAACTGTAATGATATTGGCTTTTACATATCTGTCTTGTGTGAGCCTGTTAGAAGTGATGGAGTTCATGGTTCTTTGGTGTCAACAGAAGAGTCTGGTCCTATCTTACCTGGACCACCTACATGCTTATCTCTTGAGTTAGCTGGCCCTATGGTTGAAGGTGGCTGTTTGACCTTTCATGCTGAGTATACAGGAGGTTTCAAGGGAGACTGCATCCAAGAATGGTTCAGATTACATTCTGATGGCAGCAAAGAGAAATTGTCTACTGATGAATGTCTAGATCTTACTCTAGACGATGTTGATTCGCGCATTGAGCTTATATTCACACCTGTACGAGATGATGGATCACAAGGGTCACCTAAGAGTGTTCTATCGGATACAATTCTACCTGGGGACCCCAAGGGTGTTGATCTTGTTCTACCAGAGTGTTTTCAAGACAATGAAATTTCTCCAATCAAAACCTACTTTGGTGGTAAGGAAGGCACTGGAAAATATACATGGTACCGAACTAAAGAGAAGCTTGACAACTTGGAGGCTGATCTGGTGGCTTCATGTTCTGAAGTTGGAGTAAATTTGATGTACAAACCTTCGTTAGATGATGTTGGCTTCTACTTGATTCTTCACTGGGTTCCTGCACGATATGATGGAGAGATCGGTGACCCGTTGGTGGCTGTTACCAGTGACCCTGTCATGGCAGCATTTCCATCTGTTTCGGATGTTCACTTGAAGCAGAAAAGTTCATTGTTGTATAGCGGAACAGGAGTCTATTATGGTGGATATGAGGGGTCAAGCTTGTATAAGTGGTACAGGGAATCTAGTGATGGAACCAGGCATTGTATAGATGGTGCTGATTTAATTATATATGAAGTGACAGATGCAGATTATAGCTGCCGTCTACTGTTTGGGTACATTCCCGTTCGTTCTGATGGGATCATTGGAGAAGAAAGGCTCTCTGAGCCATCTGATATAATTCTCCCTGAACGACTTAAAATCGAGGCACTCTCTTTCAAGGGAAATCAGGTTGAGAGAGAGACACTGACTGTTCTTGAACAAATTCCAAGCACTGCAGTTCAACAACATCTATGGAGTAACTACAAGAAAGAGATAACATATCAATGGTTTGCTTCCAGTGGATCTGAAGTGGATCAGACTTTTGAGCCACTGGCTAACCAGTGCTCTCGCTCATACAAAGCACGTTTCGAAGATATTGGCCGATGCCTGAAATGTGAATGCTCAGTCTCTGATGTATTTGGACGATCCAGCGAATTGATATCCATTGTGACTGCTCCGATCTTACCAGGAAAACCTAAAATTGAAAAACTGGAGATTGAAGGAAGAGGTTTCCACACTAACCTGTATGCTGTTCGGGGTACCTATTCTGGAGGCAAAGAAGGCAAGAGCAAAATCCAATGGCTCAGGTCTATGGTTGGAAGCCCAGATCTTATCTCTATACCTGGCGAAATTGGAAGAACATATGAAGCCAATGTTGATGATGTAGGTTATAGACTTGTTATCATTTATACACCTGTGAGAGAGGATGGAGTTGAGGGACAACCTATCTCTGCTTCAACGGAGCCAATTGCAGTTGAGCCTGAAATTTACAAGGAGGTGAAGCAGAAGCTTGATGATGGATCTGTCAAGTTTGAGGTTTTGTGTGACAAGGACAGAACACCAAAAAAGGCACAAGTGATGGGACATTTGGAGCGAAGAATTTTAGAAGTGAATAGGAAGAGGATCAAAGTTGTAAAGCCTGGATCCAAGGCATCATTCCCAACTACAGAAGTGCGAGGAACATATGTTCCACCCTTCCATGTTGAGCTATATCGCAACGATCAGCACCGCTTCAAGATTGTTGTTGATGGTGAGAGCGAAGTTGACTTGATGGTGCAAACTCGGCACATGCGAGACGTCATCATTCTGGTGATTAGAGGTCTTGCTCAAAAGTTCAACAGCACATCTCTCAACTCACTCCTCAAGATAGAAGCATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEAPPETSKPAEAKPSKTRLSAPTGRFALGTASSIKKRTDVAPSAELGMSRSSLTKSTSSMNAAPVQRRSSTGSAGKQQDNGSSVVAKKASPSLSDGVKKSKPVTASMVSSKSSLEKKSSVQSERAKVDAMKKPAVKSSPISTLKKVPSLTENSSSSASSSFRRAASNATLNSPRSPSVTSSVTKKVGSRTSSMDKGSSMPIRKKSSTADSRDSRFMMLPQVDLKASDEVRLDSRGHRVRTLKQLRLTPVLEFVYLRDNRLSSLEGIEILKGVKVLDLSFNEFKLPGFEPLENCKLLQQLYLAGNQITSLATLPELPNLEFLSVAQNRLKSLCMASQPRLQVLAASRNKISVLKGFPHLPSLEHLRVEDNPLLEMPHLEAASILLVGPTLKKFNDRDLNPGEAEVAKQYPAHTAICIRDGWEFCSPELAADSTFSFLLEQWKNKLPQDLIVKKAHVDHPFEEDPCHCHFSFTNQCDEGELVLKYQWFIGDKTPTDFVPLPEELSEVYWPKREDVGRCLKVECTPILNDAEFPPIFAVSLPVSPGTGCPKVINLTVHGDLVEGNVLRGVPEIAWCGGMPGKGVASWLRRRWNGNAVVIDGADRMEYQLTLDDIDSSLVFMYTPVTEDGVKGEPQCTMTDFVKAATPSVSSVHVVGDIVEDNTIKGNGKYFGGKEGLSKFLWFREKENGYDHMSHTAISLSSLSIDKTPLCEFLLVLSNSTEYTLTKEDVGRPLKFVYVPINLEGQEGEAAYAMTDAVKKAPPKVLDLKIVGEAREGSKVSATATVKGGTEGFSRVQWFIGSSSKFLNENELRVLTTSKVSKTFRIPLSAVGYYIVAKFTPMAPDGETGEPAYAVSADVVEMLPPSLNFLTVTGEFSEGQMLTASYGYIGGHEGDSLYSWHLHETEDDEGSLVSEASGLLQYQVTKEAVGKFLSFKCIPIRNDGILGEPRVFTGKDRVTPGRPTILSLELTGEAIEGTTMVASRRYWGGEEGETIFRWILTSSDGSQKEIEGAASSSYTLNCNDIGFYISVLCEPVRSDGVHGSLVSTEESGPILPGPPTCLSLELAGPMVEGGCLTFHAEYTGGFKGDCIQEWFRLHSDGSKEKLSTDECLDLTLDDVDSRIELIFTPVRDDGSQGSPKSVLSDTILPGDPKGVDLVLPECFQDNEISPIKTYFGGKEGTGKYTWYRTKEKLDNLEADLVASCSEVGVNLMYKPSLDDVGFYLILHWVPARYDGEIGDPLVAVTSDPVMAAFPSVSDVHLKQKSSLLYSGTGVYYGGYEGSSLYKWYRESSDGTRHCIDGADLIIYEVTDADYSCRLLFGYIPVRSDGIIGEERLSEPSDIILPERLKIEALSFKGNQVERETLTVLEQIPSTAVQQHLWSNYKKEITYQWFASSGSEVDQTFEPLANQCSRSYKARFEDIGRCLKCECSVSDVFGRSSELISIVTAPILPGKPKIEKLEIEGRGFHTNLYAVRGTYSGGKEGKSKIQWLRSMVGSPDLISIPGEIGRTYEANVDDVGYRLVIIYTPVREDGVEGQPISASTEPIAVEPEIYKEVKQKLDDGSVKFEVLCDKDRTPKKAQVMGHLERRILEVNRKRIKVVKPGSKASFPTTEVRGTYVPPFHVELYRNDQHRFKIVVDGESEVDLMVQTRHMRDVIILVIRGLAQKFNSTSLNSLLKIEA</aaseq> |
| Gene Sequence |
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