Difference between revisions of "BGIOSGA025553"
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Revision as of 16:57, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA025553 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025553, complete gene. |
| LocusTag |
P0492E07.115 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA025553-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA025553-PA |
| Length |
12506 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:11902326..11914831 |
| Sequence Coding Region |
11902326..11902430,11902573..11902674,11904504..11904554,11905386..11905506,11906792..11906910 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:11902326..11914831 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:11902326..11914831 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGCTGATCTCGGGGATGGTGATGGGGATGGTGGTCGGCGTCGCGCTTATGGCCGGGTGGAGCCGTGTGATGCAGCGGCGCAGCAGGAAGCGCATCGCTAAGGCTGCGGATATCAAGGTCCTTGGGTCTCTCGGTAGGGACGATCTCAAGAAGCTGTGCGGCGACAATTTCCCCGAGTGGATATCCTTCCCGCAGTATGAGCAGGTGAAATGGCTGAACAAGCATCTCAGCAAACTCTGGCCTTTCGTTGATCAAGCTGCCACTGCAGTAGTCAAGGAATCTGTTGAGCCACTGCTAGATGATTATCGACCTCCAGGAATAAAATCTCTGAAGTTCAGCAAATTCTCTCTTGGAACTGTTTCACCAAAGATAGAAGGTATTCGCATTCAAAATATTCAGCCAGGCCAAATTATAATGGATATAGATCTTCGTTGGGGTGGTGATCCAAGCATAATCCTTGCTGTTGATGCTGTTGTTGCATCACTTCCTATTCAGCTCAAAGATCTTCAAGTCTACACCATTGTCCGTGTTGTATTTCAACTATCAGAGGAGATCCCTTGCATCTCTGCTGTTGTTGTTGCTCTTCTTGCAGAGCCAGAGCCGAAAATACAATACACTTTGAAGGCTATTGGAGGAAGTCTGACCGCTGTTCCAGGACTCTCCGACATGATTGATGACACTGTCAATTCAATTGTTTCTGACATGCTCAAGTGGCCACACAGGCTTGTTGTTCCACTTGGTGTCAATGTTGATACAAGTGAGCTGGAGCTTAAACCTCAGGGAAGACTTACTGTTACTGTAGTAAAAGCAACTTCATTGAAGAATAAGGAGTTGATTGGTAAATCAGATCCATATGTGATACTATATGTGCGTCCAATGTTCAAGGTCAAAACAAAAGTCATAGATGATAACCTAAATCCTGAATGGAATGAAACATTCCCTCTGATTGTTGAAGACAAAGAAACCCAGTCTGTCATTTTTGAGGTATATGATGAAGACAGACTTCAGCAAGACAAAAAGCTTGGTGTAGCTAAACTAGCAGTGAACAGTCTTCAACCTGAGGCTACCAGTGAAATCACTTTGAAACTTCAGCAATCACTAGATTCTCTTAAAATTAAGGACACCAAGGATAGAGGAACATTACATCTTCAGGTCACATATCACCCATTTTCAAAGGAAGAACAGATGGAAGCCCTAGAGTCTGAAAAGAGAGCTATCGAGGAGAGAAAGCGACTCAAGGAGGCTGGGGTTATTGGTAGTACAATGGATGCTCTTGGTGGTGCTGCTTCACTAGTTGGTTCTGGTGTTGGACTTGTGGGCACTGGCATTGTCGGCGGGGTTGGACTTGTTGGATCAGGAATTGGTGCTGGTGTTGGGCTTGTTGGTTCGGGTGTTGGGCTTGTTGGTTCGGGTATTGGCGCTGTCGGCAGCGGCCTCGGTAAAGCTGGGAAATTCATGGGCAAGACTGTGGCCGGGCCTTTCAGTATGTCCCGGAAGAACGGTAGCAGCTCAACTGCTCCCCAGGCTGAACAACCTTCTGCGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGLISGMVMGMVVGVALMAGWSRVMQRRSRKRIAKAADIKVLGSLGRDDLKKLCGDNFPEWISFPQYEQVKWLNKHLSKLWPFVDQAATAVVKESVEPLLDDYRPPGIKSLKFSKFSLGTVSPKIEGIRIQNIQPGQIIMDIDLRWGGDPSIILAVDAVVASLPIQLKDLQVYTIVRVVFQLSEEIPCISAVVVALLAEPEPKIQYTLKAIGGSLTAVPGLSDMIDDTVNSIVSDMLKWPHRLVVPLGVNVDTSELELKPQGRLTVTVVKATSLKNKELIGKSDPYVILYVRPMFKVKTKVIDDNLNPEWNETFPLIVEDKETQSVIFEVYDEDRLQQDKKLGVAKLAVNSLQPEATSEITLKLQQSLDSLKIKDTKDRGTLHLQVTYHPFSKEEQMEALESEKRAIEERKRLKEAGVIGSTMDALGGAASLVGSGVGLVGTGIVGGVGLVGSGIGAGVGLVGSGVGLVGSGIGAVGSGLGKAGKFMGKTVAGPFSMSRKNGSSSTAPQAEQPSA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..105#248..349#2179..2229#3061..3181#4467..4585#4683..4781#5392..5472#5553..5635#6885..7110#9979..10146#12114..12506#ATGGGGCTGATCTCGGGGATGGTGATGGGGATGGTGGTCGGCGTCGCGCTTATGGCCGGGTGGAGCCGTGTGATGCAGCGGCGCAGCAGGAAGCGCATCGCTAAGGTTCGTGTTTCGGGTGCGCGTGGTGGTGATGCTTCGCCTGGATTGCTCCTTGTTTCTGCGTATAAGGCTAGGGTGATGGTCGTTTAATTTTCGCGGTCGAGGTTTTGATTTTTGTTTAGTTTTTCCGAAACTTTTTCTACAGGCTGCGGATATCAAGGTCCTTGGGTCTCTCGGTAGGGACGATCTCAAGAAGCTGTGCGGCGACAATTTCCCCGAGTGGATATCCTTCCCGCAGTATGAGCAGGTTTGTGGTGATTCCTCCGAAATGTTCCTAGTCTTATTTTTGTTCTTGTCTGTGTAAAGTGTAAACTACTACCCGATGTCCTCAAATGATGACGTTTTAGAATGGGAAGAACTGATATTGAGTTTGTGACACCGAAAGTTTGCGCCGTTTCTGTTCTTCACCAAAAATTTAATACAGCATAAGCATGGTAGTACTGGGTCTGTGTTCTTGCTAGATGATTTTCTGGGTCATAGTTAGCGCAGTTGGATGGAAATGGTATAAAAAGGAGCTTTGCAAATTTTTTGGTGATATTGAAGTGAGCTTTCGATGGTTACATAACTCTTGGATTCAGTTTCATGGAACCAAATTTTCCTTGAGAATGCATGCACCGTGCTGTCAGATCTTGAAACCTCAACTTGTTAACATATGCAAAATTATTAAGATTTGATTTGTAGAAATGACATTAATAGATTTGCCATAAAAATACTTTCATGCAGTTGCTCTTTAAATAATTTTCATGAATATGTCATTAGAGAAAAAAAAAGATCATATATGCTGAGTCCATGTCTTGGAAGTCAAGTAAAGAAAAATAATGAATGGAACACAATTTATAATCTAACCTTTTAACCCCTTCATTCACAAGTGGAAAATTGTAGTAGTTTGCATGATGACTTGTTTCTGTGCTAGTTTTGAAACTACAAGATCAAAGCCAAAGGTAGGTCTGGACGTCTGGTGCAATTCTTTTTAAGAAGCAGAGATCTCAAAAACAAAGTAGTGCTATAGAGGGTCAAGATGGGTACATAGATATATAGAATGTTTGTGGACTTGGCATGCTGGGGCAAGAGAGGAAAGGGACCTGGTTGGCTTTAAACGGGCTGTTGGGCTGGGGTTAACTGCAGAATACTATAGTGTGGTGGCTGGCTGGATGTACTTCTGGCCCATATCTGTTCTCGCATTCTTCTTCTTTTCGCATCGCCTTACGCCTTACCGCTAAGGTTGGGTTGGGTCGCCTTACATCGCCTTAACAGCCCATCTCAGCAACTAAGGCTGCCCTTGGGAGGATTGGTAAGTGCTGTAGCCCTTTGGTGGTCAGCAACATGCGGAGGCAGCTGCTAGAGTAGGACAGTAGGTTGTAAGGGATTTGGCTTAGTTTGACCAAAATAGATGCATTCATTTTGAGTTCAGAAACTATTGGCAATGTTGAGGATTGTTGATTGGTGATTCACATCATAGTATGCTTGCATGATGGATTGAGATTGACAGGCTTCAATCTTCGCAATTTAGTTAGCATTGCTACTTTGTATTTACCCCAAAAGAGGTGACAGCTTAATCAACCCAATGGTGAAATTTCGAGTAAACACTAGCCGAAATTCTCATATCCATCATATGGCTGTACTACCAACTGAACACTAGTGAATCAAGGTGGTATAAACTACACCTAATACAAACCTAACCAAATGAAATAGACCTTTATCTTCATAAAAGACCTTTAGCTGGCTATACTTATTGTAATTTGTAAGCTTGTGAAAAAGTTAACTGTGGTGAACATGAACATCATTACATTGACAGGATGTTTCATTTGTTTAGTTTTCTTGCAATTTATTACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGGGATTTTGGTTGATTTGACATATCCTAGTACATGAATCTGGACAGACACATCCTAGTACAACGAAGCTGGAAAAACCGTCTGTCCAGATTAATGTGCTGGCAATATTCGTATTGTAATCCAAATACCCATCATAAAGGGACACTTCTTGATGCTTATTGAGTTATCCTTATCCATTGTACTATGGACAATGACTATTTTACCCACAATTTTGATTTCTACAGGTGAAATGGCTGAACAAGCATCTCAGCAAACTCTGGCCTTTCGTTGATCAAGTAAGACAAATGTTTGTTAAATCTCTAGGCTCTAGCCAACTGATAATAATGTAAAGTATGCTGTTAGTTTGGCAGTCCTACAGCCCCCGTTTGCTGACAACTATGGTATTTTCTTGTAGAAATTTTTATTCGTTCCTTTGATTACAAAAAAAATTCATTCCTATGTGTATGCTATTCCAGCAAACTTCCTAATTGTTATTTGTTAATAGCTTTCTTTGTCTTTAACACTGGCATTTCTTTGAGAGTTTTAGTTCATATTGTTGCCTGACTATTGGCTCTCTTTGAGAGTTTTGTGTAATAAGTGGCTGTAGCTTCTTTGAAGTAAAGGCCGGAATTTATATTCCATTATCTAAACAAAAACACCGGCATTTCCGCGCGCACGCGCGGGGGGGGGGGGGGGTATAATTCATGTTGATCTTTTTGTGTATTGTAATGCTACTCCTAACTGCAGGTTCTAAAGGTTATACATTTTAACTTAAATATTGATCATCTCAATCATCCTGTCACTTTCATTCAAAGTGATATGCCATTTTCTATTTATACAAATTGTGCTTGGTTTTTGAAGATATATCAAGATACGCTTCATCAGTATAGCGTTGAAAGCATACCTCTATCAAGTTATCTTAACATTTTCCACTAGTATGCACAATGTCCTAATCCTTTTAATTGTGGTAAATATGTACAATTGTGTTAATAAAGATAGGACTTATTTCTTTGTTTTATTCTGCCCCAATCTCATTCTCCAAGTTATTTTTTTTCTTAAAAGTATGTACTATGTTTTGGTAGATTTTAGTTCTTCTGGGGGCTACTAAACTTTTAGTTCCATTTCAGGCTGCCACTGCAGTAGTCAAGGAATCTGTTGAGCCACTGCTAGATGATTATCGACCTCCAGGAATAAAATCTCTGAAGTTCAGCAAATTCTCTCTTGGAACTGTTTCACCAAAGATAGAAGGTTTTCCTATTATAACCTCCACGTTCTGCACTATTTATCTGATTTTTACTCTGTTGTATGCCTCCTGTCTGGGTTCTGAATTAGAGAATTCCTACAGTGAGAATAACAATCTTTGCATCTGATGTATGTAAACCAAGAACTACACCCAGTGGTAATAGTGACTGGTGACATGCCTTAGGAGTATTTCATTAGATGGTTTTAATTGCAGGAACTGACCATCGTGACTACTAAATACAAGTTCATCCTTTTGTTTTGTGATTTGTGAATCTGACGATACACTCTTTGCGACCTCTGAGTGACTATTTTCTATGTAGATTGACCAACATTACCAAGTTGACACTTTATGTTAACATCGGTCGATGCAAACTGTCAGTCAATAATTGATTAATTGAGTCCATTTCTTTACGTATTTATGGAGGGAAAATTTTCAAAATGGCATGAGTACCCCTGATAACTTGATGTGAAAAAGCTTCAGATAGGATTTGTCGAGAGAGACAAACTCGTCAAATAGATGTGATATGGAAAGAAAATTTTGGCACAAAACAATGCAGATTGGTGTAGGTTAAAAAACACAAAATATGCCATTTTACCCTTCCTAACTGATAGCCAGCTAACAAGCAAGGTTACTTTGCCTACTAATTACTAAATACCAATTATGTTTTGGCCATCATCTTCGCAGTTTTATGTGTTTGCTGGTAATTTCTTCTTTACTATTGTCATGTACTCATGTGCCAACTGCCAATGTTGGCATGGGCCCTGGATGTGTAGTGCAGTGTGTAGTTACTGCTCATATGAAAAGTACATCGTCTTATGATTAGGCATGGGTTTGTTACTTCATAATCTAGCTCTTAGGTTGTTTGGTATCTTTCCAGTAGTTAGGCAAGTTATTATTTAAATTGATCATATCTATAATTGCTAGGGGAGCGGGAGTCCTCTATATAAGAGGTAGGTGAGTCCGCTATATAAGAGGTTTCTTGCAAGTATTGGCATCAAGCAAGAATAAACAAGTCTCTAGTCTCTATAGTTTCCCCCCTGCCCTTGTGGTATAGTTGCATCCATGCGATTGTCATTTCAATTGCTTCAGGCCTCCAGGGGACGGTCTTATGTACATTCTCCAAACAATGCTCATTAAATAAATGCTAATTACCTGATGTTACCTTTATGTATATTATGCATGAGTTCTTTCTTAGGGATGCCCCACTAAGCTATGTTTTGTTTAGCATCTTGATCATGTTAATGCAATACTAAATAACTGAGACATCACGTTTTGTCATGTTGTGTAAAGGTATTCGCATTCAAAATATTCAGCCAGGCCAAATTATAATGGATATAGATCTTCGTTGGGGTGGTGATCCAAGCATAATCCTTGCTGTTGATGCTGTTGTTGCATCACTTCCTATTCAGGTTTTACTATTTCTTTGTTCTTTTCAGTGATTAATTCTTACAGAAGTAAATCTCTCTTGAACTAGTCATGATATCATCTTTGCCAACCATCTCACAGCTCAAAGATCTTCAAGTCTACACCATTGTCCGTGTTGTATTTCAACTATCAGAGGAGATCCCTTGCATCTCTGCTGTTGTTGTTGCTCTTCTTGCAGAGGTATACATCTACAAAAAATGATTTATCTTTCTATTTCAAAGGAGATTTTTTTTCTAAGACAATACAGGAGATCTGCATGTCTAAGCA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