Difference between revisions of "BGIOSGA025655"
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Revision as of 16:58, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA025655 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025655, complete gene. |
| LocusTag |
P0473C09.107 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA025655-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA025655-PA |
| Length |
11681 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:14871438..14883118 |
| Sequence Coding Region |
14871438..14871828,14871955..14872142,14872816..14872839,14873412..14873513,14873769..14873859 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:14871438..14883118 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:14871438..14883118 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGATCTCCACCTGGAGCACGCGCCTCCTCCTCTCCCCCTCCGCCTCCGCCTCGAGCCATAGACCTAACCCTACCCGCCGCCTCGCCTTCCCCTCCCCCATCTCCGGCTCCACCCGCGGCGGCGTCCACGCCCTCCGGCGCGGCCCCGGCCGCCAGGCTCCCCGCGCCTACATCTCCGCGCCGGCGTCCGGCCCCGACGCCTACCCGTCCCCGGCCCTCGACGCCGCGGCGGCGGCGGCGGACGTCGCCGCGGCCATCGCCTCCTCGGACGCCGTCACGTGGGCGGGGGTCTGGGCCCTCCTGTCGCCGCACAGGGCCCGCATCGCGGTCTCCCTCGCGGCGCTCCTCGCGTGCACCACCTGCACCCTCTCCATGCCGCTCTTCTCAGGGAGGTTCTTCGAGACGCTGATAGGAAGGGGCTCCGAACCCCTGTGGAGGCTGCTGTCCAAAATCGCCGTGCTGTATACGCTGGAGCCCATATTTACAATCGTATTCGTGATCAACATGACCGTGATCTGGGAGAAGGTGATGGCGAGGCTCCGGAGCCAAATATTTCGCAGGATTCTAATCCAGAAGATGGTATTCTTTGATCGTCACAAGGTTGGCGAGTTGACTGGTTTGTTGACATCTGATTTGGGTACTTTGAAGAGTGTCGTAAGTGACAACATATCAAGGGATCGTGGGCTAAGGGCACTCTCTGAGATCACCGGTACACTTTGTATACTTTTCACATTATCCACTGAGCTAGCTCCTGTACTAGGACTCCTAATGGTCTCTGTCTCCGTGCTAGTTGCTCTTTTCAAGAGGTCAACTGTTCCCACATTTAAATCTTATGGAATTGTCCAAGCACGTATATCAGACACTGCATCAGAAACATTTTCAGCTATTCGTACTGTTAGGTCATTTGGGGGTGAAAAACGACAAATTTCTATGTTTGACAATTTGGCACTTGCTTTCCAGAATAGTGGCACAAAACTAGGCGTGCTGAAATCTGCCAACGAGTCATTGACTCGGGTGGTAGTCTATGTTTCCCTAATGGCACTTTATGTTCTTGGTGGAAGCAAGGTTAATGCGGGAAAATTGTCTGTTGGAACCATGGCATCTTTTATTGGTTACACATTCACACTGACATTCGCTGTTCAAGGAGCTGTTAATACTCTTGGTGATCTACGTGGGACATTTGCTTCTGTAGAAAGAATAAATTCTATTCTATCAGCAGAGGACATTGATGATTCACTTGCATATGGTTTAGCCAAAGAACTAGAAGATTCAAATGGTGCAGTGCACGAAAATGGCACTGCTAACAAACATTACATGTCAGCACTAAAATCATCAAGCAGCTGTAGTAATCTTGCCTGGTCTGGTGACATTCACCTAGAAGGTGTCCACTTTTCTTACCCACTGAGATCTGATGTGGAGATCTTAAATGGGCTTGATCTTACAATTGAGTGTGGAAAAATTACAGCACTTGTTGGACCTAGTGGTGCTGGAAAAAGCACAGTGGTGCAACTTCTTGCACGGTACTATGAGCCAACTCATGGTCGCATCACTGTGGCTGGGGAAGACATCCGTGTATTTGATAAAAGAGAATGGTCTCGAGTTGTATCCTTAGTGAATCAGGACCCTGTCCTATTCTCAGTTTCTGTCGGAGAAAACATCGCTTATGGTCTTCCGGATGATGTTGTTTCCAAGGATGAGATAATAAAAGCCGCTAAAGCTGCCAATGCTCATGAATTCATTGTCTCTCTTCCACAGGGCTATGACACACTTGTTGGTGAACGTGGCAGCCTCCTAAGTGGGGGACAGAGACAGAGAATTGCTATTGCTCGTGCTCTTCTGAAAAACTCTCCTATTCTAATACTTGATGAGGCTACCAGTGCACTTGATACGACCAGTGAACGGCTTGTACAGGAAGCTCTCAATCACTTGATGAAGGGAAGGACTTCTCTGGTGATCGCGCACAGATTGAGCACCGTGCAAAATGCGCATCAAATCGCTGTCTGCTCAGATGGCAAGATAGCAGAACTTGGGACTCATGCTGAACTGGTTGCTAGCGGTGGCCGATATGCGTCACTTGTTGGTACACAGAGGCTCGCATTTGAGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAISTWSTRLLLSPSASASSHRPNPTRRLAFPSPISGSTRGGVHALRRGPGRQAPRAYISAPASGPDAYPSPALDAAAAAADVAAAIASSDAVTWAGVWALLSPHRARIAVSLAALLACTTCTLSMPLFSGRFFETLIGRGSEPLWRLLSKIAVLYTLEPIFTIVFVINMTVIWEKVMARLRSQIFRRILIQKMVFFDRHKVGELTGLLTSDLGTLKSVVSDNISRDRGLRALSEITGTLCILFTLSTELAPVLGLLMVSVSVLVALFKRSTVPTFKSYGIVQARISDTASETFSAIRTVRSFGGEKRQISMFDNLALAFQNSGTKLGVLKSANESLTRVVVYVSLMALYVLGGSKVNAGKLSVGTMASFIGYTFTLTFAVQGAVNTLGDLRGTFASVERINSILSAEDIDDSLAYGLAKELEDSNGAVHENGTANKHYMSALKSSSSCSNLAWSGDIHLEGVHFSYPLRSDVEILNGLDLTIECGKITALVGPSGAGKSTVVQLLARYYEPTHGRITVAGEDIRVFDKREWSRVVSLVNQDPVLFSVSVGENIAYGLPDDVVSKDEIIKAAKAANAHEFIVSLPQGYDTLVGERGSLLSGGQRQRIAIARALLKNSPILILDEATSALDTTSERLVQEALNHLMKGRTSLVIAHRLSTVQNAHQIAVCSDGKIAELGTHAELVASGGRYASLVGTQRLAFE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..391#518..705#1379..1402#1975..2076#2332..2422#3194..3294#3429..3479#5112..5240#6256..6318#6412..6655#8112..8260#8339..8428#8827..8961#9063..9119#9563..9619#11445..11681#ATGGCGATCTCCACCTGGAGCACGCGCCTCCTCCTCTCCCCCTCCGCCTCCGCCTCGAGCCATAGACCTAACCCTACCCGCCGCCTCGCCTTCCCCTCCCCCATCTCCGGCTCCACCCGCGGCGGCGTCCACGCCCTCCGGCGCGGCCCCGGCCGCCAGGCTCCCCGCGCCTACATCTCCGCGCCGGCGTCCGGCCCCGACGCCTACCCGTCCCCGGCCCTCGACGCCGCGGCGGCGGCGGCGGACGTCGCCGCGGCCATCGCCTCCTCGGACGCCGTCACGTGGGCGGGGGTCTGGGCCCTCCTGTCGCCGCACAGGGCCCGCATCGCGGTCTCCCTCGCGGCGCTCCTCGCGTGCACCACCTGCACCCTCTCCATGCCGCTCTTCTCAGGTTGGTTAGGTTGGGGTGGTTGGTTCAGGGCACACACACGCCTCTTGCGCGCTGATGCTGGTTTGGTTGTGAGATGTGTGATGTGATGTGATGTGATGTGGGCGTGTGGCTTGGTTTGGATGGCAGGGAGGTTCTTCGAGACGCTGATAGGAAGGGGCTCCGAACCCCTGTGGAGGCTGCTGTCCAAAATCGCCGTGCTGTATACGCTGGAGCCCATATTTACAATCGTATTCGTGATCAACATGACCGTGATCTGGGAGAAGGTGATGGCGAGGCTCCGGAGCCAAATATTTCGCAGGATTCTAATCCAGAAGGTAATTTTGCTTTAGCTCATTAGCTGTGTAACGGTTGCATTGCACCTACAAGTATTTACAGTAGCAATTACAATTGCCAGACTTGGGGTAAAAAGATGTTGGGTTATTCCATATGATCGCCTAAGTTCTGTTTGCTCATTGGGTATGCAGCTGCTTCAATCATGTCCAAATAACTAATTTTAGGCATGGTTGCGCTTACACACGAGTCCTTTGCTACTACTGTATCATTTGTATGATGAATAAGTTAAAAGCTGCTAAGTGGGTAGCAACTTAGTTCATATGCTTGTTTTTGGATTGTTTACAAATTATGCCCACATTAGTTTTAATACCATTATGAAATTATTCATCCCATTCTATTACCAGGTTGCATCAACACTTAGTAGGTTTTACTAGGGTGAAGTTGTTCGTTGAGGTCTCCTATGCTTTGCACATTGTACATTAATGAAATATGAAGGACTAGGGACATACTGTGTGGAGTTAACGTAGGTAGTACTAATGCATCGTGAAAATATTTTTTTTTATTGTGCATGATTGTGTAGCCTTGAGGGGCGATAATGCACTGCTTCTTCATCTTAGCAATTTGGCATTCACCAACATGGTTATATCAGTTTTCATTAGTCATTTCATAGTTTATGTTGATAATGAATGATTTATTCTGTTTGGTTGTTTGCAGATGGTATTCTTTGATCGTCACAAGGTACCGACTACCAGTATACCACATTCATATTAAATTGTCACAATTAGTTAGAGAAACATAACTTCATTTGTAAGATATTGTTCCTACTAAATTGAAAATCTTTGTATTTTTATGTTCAGTGTCTGTATTCAAGTTTTCAAATCATCCAACACGGATTTTGCTTTGTGAAAAATATAGTTGAGCAATGTAGATAGGTAGCTTGGTAAGCCACTTTTTCCTTCTTCCATTATGGAAGGCATGTAATTAATGTTGGGTTAGGGTTATGCAAAAAAAAATGTTGGGTTAGGGTGTGTGGATAGTGATAACAGTGAAAGATTTACTTCTAGGTTAAAAAATAACTAGATCTAATTCAATTTACCAAGAAAAATGGTGGCTATGATCAGTGTATTATGCATTATCTGAATTAGTAAAGCAGTCATTGTTTAGCTTGGTCTGTTATACAAGTTATAGAGAATTTTCTTTCATACCAAAGTACATTTTTTTCTGAAAATTATGCAAATGAAAGGATACACTGTTCTATGTTGCTTCAAAAATTTTACGAATAAAAGAACCTTACTATCATTTGATGGCAGGTTGGCGAGTTGACTGGTTTGTTGACATCTGATTTGGGTACTTTGAAGAGTGTCGTAAGTGACAACATATCAAGGGATCGTGGGCTAAGGGCACTCTCTGAGGCAAGAAACTTTACACTATGAGAATGTAAGCTTGATACTGCTAATGGCCTAGAATTTGCGCTATACAATCACTGAATCACATATTCTCTCTGTGCTATTAGCAATGCTTTCAAAAATACTGACATCTCGAAGCATTATTGACCAGTTAGTCCATTTATATCATATACTTGATTATTTGGAAATCATGCCATTACCTGTAAGGTCAATTATCTCAGCATCTTCTAAAGCAGTTTTTCCTCTTTTCTTTTTCTCCAGATCACCGGTACACTTTGTATACTTTTCACATTATCCACTGAGCTAGCTCCTGTACTAGGACTCCTAATGGTCTCTGTCTCCGTGCTAGTTGGTAATTATCCAAATGATGACTGATGCCATTTACTATTCATTATTCTCTATATCACATGTCTTTAAGCGTAGAATGACTTTCAATCTTTCATCATCCTGAGGTCCATCATATGTTCTAGAAACAAGCTGATTTGTGGTAAATATCACACATTAGTTTTGTCAGGTCCTTACCGTGGAAGCTGGTCCCTCATGTCTTATACGTTTCTAGTTAGCTGTTGATAATGAATTGGGCCTAAATTTAATCATCACACTTGATTTTTTATTTCTCTGTGAAATATATGGGTGCTATGCTGAACCATCCCTGGTATTTTGCTAATGCAAAATAGAAGTCCTATTTAGGAATTTGCATGAGTGGAATGATATTGAATTATTGATTTGGGAGCTTTTGATGCAAATGTCCATAATGTTATTTTTTAGTTTGAAGTAATTGATTAGACATATTTGAGATGATACAGAACTTTGCAAATAAGAAATAATACCTTTTTTACTGGCTCGTAAAGTTTCACCTTTTGCTCTGCTTTTATTTCTTTTCTTAGATCATTGCCGCGGATATTTCCTTCATGTTATTCTTGAACTTATATATGTTCGATGTTGTTTGATTATAGTATTTTACAATTTCATTGAGTGATTTGTCTTCCAAATATATTTTTGTCTTGAAGGATTAACATAGTGTGGCCTTCTAAAAAGATATTATTTACTGAAGTAGTGTTGGCAGTTGTATGTCAATTTTCAAAAGCATTTATGATCTGACAAGCTATTTTTATTAAATCAGCTCTTTTCAAGAGGTCAACTGTTCCCACATTTAAATCTTATGGAATTGTCCAAGCACGTATATCAGACACTGCATCAGAAACATTTTCAGCTATTCGTACTGTGAGTATTTTTTCGTCAGAATTGTATACTTCCTTGAAATACTTGCATTAATAGATTTTATCTCCTTTATTCTGTTAAATACCAGTCCACATACTTGGGGGTTATCCTTATTTTAGTCAAAAATACATTTGCAGGTTAGGTCATTTGGGGGTGAAAAACGACAAATTTCTATGTTTGACAATTTGGTAAGTCTTATGGCCTTTCACCTATGCACTTCTCGGGCCATCCATTAGAATATTACTCTCATTGTTCATTTCTCTATTACGTAGAAGGAAATGTGTCATTCTACCAATCGTTATTTATATTAACTGGAGATTTGTAAAACTCCACATTAATCCTAGGAGGTAAAACGATGATAAATCCCCACTATGTAAAATAAAAGGGTAGATATGCCCACATTAATTGGAAAAAGAGAGAGAGAGAACATCATATCCATCCAAGTTATTGCACAGACATCATGAAGCGTTAATTTGACTTATGTGTTATTGTAGTATTGTACTGGTCCCCATATAATGTGTTGAAAAATGTCCAAGTCTTTATCTGATTTGGATTTGGCAGATTCTGGAATGAAGGCCACATGTCTAACATACACTAATAGAAAAGCATTTGTAAAGTAGCTAACTATGTTATTTTCTTTCCTACAATTTAGTCTACTATATATGTTATAGACACAATACAAGAAAGGGTTACACATTTGTTCTTGAGGGCTAAATTTTTTTATATCAATTGGTGGAAAAGAGAGATTTACATCGTCTTTTGTTGTGAGCCCAAATTATAACTATGCATATTTCATGTTAGATTAATAATAATGAATTCCATGTTTTGCTCAGCTAATAATACTAACCTATACCAAAAAGTCAAATAGTTTACAACAAAATCAGACTACTTTATGTATTTGAGTAGAGTTATGATGGGTGGCTCTAAATTCTCTAAACCTGTTTGGTTTGCTCTCCATGCATAGTCACATATCCACAAGCTTGATAATAGTTTCTTTTTATGTTTTTTCAACATATTTTCTTCAAATTTTTAAACAAACTCTTCAAATACCTCTTATTAAAAATAAATCTTTTGGCAGCTTTGCTAGCAAATGTTTACATGCTATGAACCATGGTGTGGCAACAGTGACTTGCCACACCAACGTAAGTGCTGTGCCCAAATCCTTGCCAAGCCATTGTTTTTTAATCCTTGGCATTTTATGTGGCCATAAGTTTCAGTCTGGAAATAAGTTTCAAGAGGGTTTTGACAATTACATTCAAAAAAAGTACAAAAAGTAATAAAAATTTGATGATACTTATCAGTCATGACCTGCACTTACTACACCCATGAATCAATGCACAAGCTGTAGTGCCGCACCACGATCCAGTAAGGCATGATGTGGCATAACTTGGCATGGTTGCTAAGTGCTTGCTAGCTGTGTTGTCTGACCATGGTAATGCGTGCCGCTGCCAATTTGTGCTTACTATAAAAGGATCTTGAAACTGTAGATTTAATGCCATAAAAATTTAATGCATCTTGTCTAT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