Difference between revisions of "BGIOSGA026354"

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA026354

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA026354, complete gene.

LocusTag

OsI_27267

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA026354-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA026354-PA

Length

12689

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:26253910..26266598

Sequence Coding Region

26253910..26254042,26254178..26254260,26254907..26254964,26255572..26255621,26255698..26255759
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,26265347..26266000,26266425..26266598

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:26253910..26266598 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:26253910..26266598 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCCGCCGCCGCCTCCTCCTCCTCGCCGCCGGGGACCGCCTCCCCGGTGCTCAGCGTGCGGATCGTCTCCCTCGACTACTACATGGCGCCGCCCCTCCCCGGATTCGACTTCTCCTACAGCCACTTCCACGGCGGAGAGGTGGAGGAGGTGCCGGTGATCAGGATCTACGGCTCCACCCCCGCGGGGCAGAAGACTTGCCTCCACATCCATCGGGTCCTTCCATTTCTGTATGTACCTTGCAAAGAGGACCTTCTTCATAACGTCGAAAAAGGTAATTCATTTATATCTGGTCTATTGAGTGATCTTGAGAAAGCTTTGCAGATTCGCAGCTCATCAAAAAAGAAGCATGTGCATGGATGTACCCTTGTTCGAGCAAAAAAGTTATATTATCCTCATGAAGTTTCTCGAGCTGCAGCCCATCTATTGGATGGTGCTGTTCTTAATAGAGTATTCCAACCTTATGAGTCCCACATTCCATATCTTCTTCACTTTTTGATTGACTACAACTTGTATGGAATGGGCTATGTACATGTTACAGACTTCAAGTTCCGCCCTCCATTGCCAGATGATTTTCATCCAAAGTCATCTCTTCACAGCAAGGTGGACTGCTCCACTGAATCAGGGCATAAGGTACATCCGGATAATGTCGCAATTAGAAAACCGACAATCTGGATATCTTCAACAGTACCACATTCTTTAATACTGGCTAGTTCAGCCACTTCCCATTGCATGGAAGGAACAAATTGGAACGTCACTAATCGACATAGTTCTTTGATGCTTGAAGCTGACTCGAGAATAGAAGGCATCCTAAATGAAAAGTATAAGATGTACACTTCCCTTTCACAAGCTACAGCAGATAGCAAAATAGTTCGGTCACTTTTATCAATTTGGGAGGAACTCGAGCACTTAAGATTGTTGGAGGAAGCAAAACCTGTTGATATGGGCAGACCTTTGCGGGATTCTGTTCTTAGAAGTTTTCTTCATGGAATTAAATATGAGACTGCCCTTTCTATGCTATGTCCAAAGGAGGAAGTGTCCTATCACAGAGTTCCAACCATGGAAGAATCTGAAAAGCTCGAAGAATGCTTAAAATCATTGAATGATATTATTGGGACTATCACATTTTCACAGAATGACTACTGTTCTATTATTGATAGTGATATTTCTGCGGGCACTCAACAGGAGAACCAGATCACAAATGTTCTGTGTTTAGAGCCATCGGAAGAGGGAAACACTCAGTGCCCAGTGTCATCATCTGCTGCTCAAAGAACATCATCTCAATTATTTGAAGAACATGAAAAGCTTGTGGATGCTGAAGCTCTTGGCCTTCTAAGCTGGCTGGCCTCCTCACAAGCTGCAGAAGAACCAACAACTGATGATGAGTTGGTCAATGAAGCCATTCTTAGCCCTTTATTTTCCAAGAAGTCCATTGCAGTTGCCTTAGAGTCTGCACAGCTGGATTTTGATGGTGCTTCTCAGCAGGAGTGCCAGGATATTCTTGATTCAATTGGACCTGTGATTGGAGAAGAACAACCAAATGATCAAATGTCCTACCGCAGTTCTGTAAGGCTCGGTGAGAGTAGTTCCCTGAGCAATAGTATTCCGCAGATTGATGGGTCATCTGATGAAAACAAGGAAGTTCCACAAGAAGATGGTAAGTATAAAATCGACAGGAAAAGGGCTGGATTGCCTAGTTATTCATCTCCTCAAAGTAGTTCAAAAGCCAGTAAGCGTGGAGGAAATGAACTTCTCTGGGGCTCTTTGCCACTTTCCATTAAAAAGAGATCAGATTTGAATGCTGATGGTCATTCAGGTGGTGCGATGCCTACTGAGAAGGTGCTAAGTGCTTCTTTCATGAGTGGAACTGGAAAGAACTCCCATGCTAACCCAGATAACACTGAGAGGGGATCTTCTAGTCCAACAGGTGAACATGACCCATTGTGTGATTCTGTGAGAGATTTGATGAGGAGGAGGAGGAGATCTTTTCGGTCTGAACAATCAGAAGTTGGTAATTCTGGAGATGCAGCATACATCGTTCGTAAAGAGAATGAAATTGTGAATTCTGAGCGACTAGAATTGCATGATATATCCAGTGACCTTTCAAATTCAGAAATGTATTATTCTGGCAGTGAATATTTGCAGATGACCTTTGCACGGAAGCCTCCAATGAAGAATGAAGTATTATGTTTGGAGGGCTCTTCAGCAGGTAGTGAGCTGCCTCAATCTTCCAAACTGGGATTTGCCGATATCCCTCCGTTTTTTAATCAGACCGCTGAAGAGAATAAGCAGAATGAATCATTTCAACGCATGGGAAGTTCATGGGATACATTGGGTGTTCCAACTCATTTCCAAAATGATGGATCAGCCTTATATTTGCTGACACATGCATTTTCGCCACCATCCACTGTAGCCGTGGGCCAGTGGCTAACCCAACAATCTTGTTCTGTTAGTGTCTCTGGTATAGGTCATTCCAACTATGGCGAGAAAGTGTCTGTTGATCAGGAGGGAGCAAACAATTCTACTCTTTCACCATATATGGGAGGTCCTGCTTTGATGGATGATTCTCCTGCATCTAAAATGGCTTTGGAGCATAGCATTACGACATTTCCTGATGATACAGTTATGATAGAACCAGATCTTTCCAACCAAGAAATTAAAAATCTGGCTGATTGGCATGACTTTTCCCAGATCTCTGGTGGAGATGAGAAGGATAAACTTACACCTCTCAGTCAAATTGGATTCTGTGATCCTGCTAGTATTGGTGGCGGACAGCAACTGACTATAATTAGCATAGAGGTAATAACAGAAAGCAGAGGAGAGCTGCGTCCTGATCCACGATTTGATGCCATCAATGCTGTATCGCTGGCCGTTGAGGATGATGCTGACAATACTATTGAAGTTCATGTGCTTATACGTGGAAACAATGACAGTTCACACAGGAGGAGAAACCTGGATGGAGTTTCCGGTTGTGACGTAAATGTATTTCCTGGAGAGAGGGAACTTTTGAACCATCTTATTAATGCAATATGTTCAATTGATCCAGATATTATAGTTGGATGGGAGATTCAGTTAGGATCTTTAGGATTCCTTGCTGAAAGAGCTGCTCATCTGGGTATAGGCTTACTGAAAAGAATTTCAAGGACACCACCGCATCAGATGAAACATCCACCTATGAACCCAGTGGACGAATCTAGTCAGGAGCTTCCTGGAGCATCTTCAGCTGATGATGTTATTGATGATGCCAGTGAAAACAATTGGAGTCATGCTCATGCTAGTGGTATACATGTTGATGGACGAATCATACTGAACTTATGGCGTCTCATGCGTGCAGAAGTTAAACTTAATAATTACTCCCTCGAGGCTGTAGCTAATGAAGTCTTGAGGAGGAAGGTACCATTAGTACCAACTAAGATATTGAATCGATGGTTTGCAACAGGTTCTGGACGAGGAAGATATCGATGCATAGAATATGTTAATAAGAGATCTTCTCTCAACCTTGAAATATTAAATCAACTTGACCTGGTAAACCGGACATCTGAACTTGCCCGTGTATTTGGTATTGATTTCTTCTCTGTTCTTTCTCGAGGTTCTCAGTTTCGTGTTGAATCTATGCTCTTGAGATTGGTTCATACACAAAACTACCTTGCAATTTCCCCTGGAAATCAACAGGTTGCTTCTCAGCCAGCCATGGAATGCTTGCCACTTGTAATGGAACCAGAGTCAGCTTTCTACTCTGACCCAGTTGTTGTATTGGATTTTCAATCCCTTTATCCCTCCATGATAATAGCATATAACTTATGTTATTCCACATGCTTGGGTAAAGTTTTCCCGTCAAAGTCAAGTGTACTTGGTGTCAGCTCATATTCAGCAGATCCACAGAAAATTGCTGACCTGAAAAATCAGCTGCTGCTGACTCCAAATGGTGTCCTGTACGTGCAACCTGAGGTCAGGAAAGGTGTGCTTCCTCGCCTTCTCGAAGAGATACTATCAACAAGAATTATGGTGAAGAAAGCAATGAAAAAGCTGTCTGCATCTCAGAAGGTTCTGCAGCGGATTTTTAATGCACGCCAACTTGCTCTGAAGCTGATAGCTAATGTAACATATGGTTACACAGCTGCTGGATTCAGTGGTCGTATGCCCTGTGCAGAGATTGCAGACAGCATTGTTCAGTGTGGCCGTAGAACACTTGAAACAGCTATATCATTCGTTAACCAGCACCCTTTGTGGAAAGCTAGAGTTGTATATGGTGATACTGACAGCATGTTTGTTCTTCTAAAAGGGCGCTCTAGGGAAGAAGCATTTCGAATAGGAAAGGAGATCGCCTCTTCAATAACTGCAATGAATCCGGATCCAGTCACATTGAAGTTTGAGAAAGTCTATCACCCATGTTTTCTTCTTACGAAAAAAAGATATGTTGGGTATAGCTACGAGAGTCCTGAACAGAAAGAGCCCATCTTTGATGCAAAGGGAATTGAAACAGTGCGGAGAGATACATGCCCAGCAGTTGCAAAGATTTTAGAGCAATCTATTAGAATAATGTTTGAAGAACAAGACTTAGCCAAAGTTAGGTCATATTTGGAGCGTCAATGGACACGGATACTATCAGGGAAAATTTCTATTCAAGATTTCGTTTTTGCTAAGGAGGTTCGCCTAGGTACTTATAGTGCAAGGGCTTCCTCGCTGCCACCCGCAGCAATTGTTGCAACAAAAGCAATTCTATCTGATCCTAGGGCAGAACCTCGCTATGGGGAGAGAGTGCCATATGTTGTAATCCATGGAGAACCAGGTGCTCGGCTTGTAGATATGGTTATTGATCCTTATGGCCTGCTAGAAGTTGGATCTCCATATAGATTAAATGCACTATATTACATAACCAAACAGATAATCCCTGCATTGCAACGTGTTTTTGGACTCGTTGGTGCTGACCTGAATAAGTGGTTTAATGAGATGCCTCGCCCAATAAGGGAAACACTTGCTAAACGACAGTC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Protein Sequence

<aaseq>MAAAASSSSPPGTASPVLSVRIVSLDYYMAPPLPGFDFSYSHFHGGEVEEVPVIRIYGSTPAGQKTCLHIHRVLPFLYVPCKEDLLHNVEKGNSFISGLLSDLEKALQIRSSSKKKHVHGCTLVRAKKLYYPHEVSRAAAHLLDGAVLNRVFQPYESHIPYLLHFLIDYNLYGMGYVHVTDFKFRPPLPDDFHPKSSLHSKVDCSTESGHKVHPDNVAIRKPTIWISSTVPHSLILASSATSHCMEGTNWNVTNRHSSLMLEADSRIEGILNEKYKMYTSLSQATADSKIVRSLLSIWEELEHLRLLEEAKPVDMGRPLRDSVLRSFLHGIKYETALSMLCPKEEVSYHRVPTMEESEKLEECLKSLNDIIGTITFSQNDYCSIIDSDISAGTQQENQITNVLCLEPSEEGNTQCPVSSSAAQRTSSQLFEEHEKLVDAEALGLLSWLASSQAAEEPTTDDELVNEAILSPLFSKKSIAVALESAQLDFDGASQQECQDILDSIGPVIGEEQPNDQMSYRSSVRLGESSSLSNSIPQIDGSSDENKEVPQEDGKYKIDRKRAGLPSYSSPQSSSKASKRGGNELLWGSLPLSIKKRSDLNADGHSGGAMPTEKVLSASFMSGTGKNSHANPDNTERGSSSPTGEHDPLCDSVRDLMRRRRRSFRSEQSEVGNSGDAAYIVRKENEIVNSERLELHDISSDLSNSEMYYSGSEYLQMTFARKPPMKNEVLCLEGSSAGSELPQSSKLGFADIPPFFNQTAEENKQNESFQRMGSSWDTLGVPTHFQNDGSALYLLTHAFSPPSTVAVGQWLTQQSCSVSVSGIGHSNYGEKVSVDQEGANNSTLSPYMGGPALMDDSPASKMALEHSITTFPDDTVMIEPDLSNQEIKNLADWHDFSQISGGDEKDKLTPLSQIGFCDPASIGGGQQLTIISIEVITESRGELRPDPRFDAINAVSLAVEDDADNTIEVHVLIRGNNDSSHRRRNLDGVSGCDVNVFPGERELLNHLINAICSIDPDIIVGWEIQLGSLGFLAERAAHLGIGLLKRISRTPPHQMKHPPMNPVDESSQELPGASSADDVIDDASENNWSHAHASGIHVDGRIILNLWRLMRAEVKLNNYSLEAVANEVLRRKVPLVPTKILNRWFATGSGRGRYRCIEYVNKRSSLNLEILNQLDLVNRTSELARVFGIDFFSVLSRGSQFRVESMLLRLVHTQNYLAISPGNQQVASQPAMECLPLVMEPESAFYSDPVVVLDFQSLYPSMIIAYNLCYSTCLGKVFPSKSSVLGVSSYSADPQKIADLKNQLLLTPNGVLYVQPEVRKGVLPRLLEEILSTRIMVKKAMKKLSASQKVLQRIFNARQLALKLIANVTYGYTAAGFSGRMPCAEIADSIVQCGRRTLETAISFVNQHPLWKARVVYGDTDSMFVLLKGRSREEAFRIGKEIASSITAMNPDPVTLKFEKVYHPCFLLTKKRYVGYSYESPEQKEPIFDAKGIETVRRDTCPAVAKILEQSIRIMFEEQDLAKVRSYLERQWTRILSGKISIQDFVFAKEVRLGTYSARASSLPPAAIVATKAILSDPRAEPRYGERVPYVVIHGEPGARLVDMVIDPYGLLEVGSPYRLNALYYITKQIIPALQRVFGLVGADLNKWFNEMPRPIRETLAKRQSASGHGSFSRLGLNKKGVGKGSRIDTYYMSSHCIICGEIIQGSDTFCNNCLRNEAVVGTIVAGRTSKLEREIQHLAAICGHCGGADWIVESGIKCISLACPVFFERRKIQRELRGVSESAIEAGYYPFCCPELF</aaseq>

Gene Sequence

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