Difference between revisions of "BGIOSGA036294"
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Revision as of 18:27, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA036294 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036294, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_38153 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA036294-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA036294-PA |
| Length |
13161 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:10953720..10966880 |
| Sequence Coding Region |
10966017..10966880,10964939..10965160,10964758..10964832,10964559..10964657,10963999..10964110 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:10953720..10966880 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:10953720..10966880 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGTCGCCGTCGCGGCCGCCGCCGCCCTTCGCGCCGCAAAACCCTACCCCTGCCCCCAACCCGGCCGCTTCCTCCCTCCCGGCGTCCTTCTCAAACCTCCACGTTTCCCGCGCGCCCCCGCCCTTCGCGCCGCCCGGGGGGAATGGCCCCGTGCCCTCGTCGATCCGCGCGCCGCAGGCACCGCCCCCCGGTGCGAGACCGTTCCCCGGGAGCCCGCCTCCCCCGTCGCAGCCGCCGCCGCCGTTCGCGCGGCCCGCGGCGCCGGTGCAGCAGCAACCTCCTCCCTTCGGTGGCCCGCCCGGAGTGATGCCTTCGCAGCCGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGGCCTGCCTTCGGTGGTCCGCCGTCCGGTGCCCCGCCTGCGCAGGCGCAGCGGACGCCCTTCGGAGGGCCGCCCTCGGCGATGTCGCAGGGTCCGCTGCCATTCGGTGGCCCGCCCGCGGCGGTGGCGTCGCATCCTCCTCCTTTCGGTGGACCGCCTGTGGCGGCGGCGCAGCCTCCCCCATTTGGCAGGCCTCCGTCTGCAGCAGCAGCAGGTCAATCGGCTCCGCTGGGTGGGGCTCTGTTTGCAGCGGCACAGCCACCTCCATTCGGCGGGCCACCTGGGGCAGCGCCGCAGCCGGCGCCCACTGGTGGGTTGAGGACGCCGTATGGAGGGCCACCGGCGCCATCGCAGCAGGTTCCGTTTGGTGGAGCACCACAGTGGCCAGGAACACATCCTCCGCCTTTTGGGGCTCAGGCTGCGCCGTCGTCCCAGCCACCTCCGTTCATGGGGGTGCCAGGGAATGCTCCGCCATTCAGGCCTCCGGGTTGGCAAGGGCAAGCACGACCAGGAGCTATGTCTGCTGGTATGCAGCTAATGCCTGGCGGCATGCTGCCCAATGCTCTAGGACAAGGGATGCCGTCCACACCCTCAATGCCATATTCTCCACATGCTGGAGCCCAGGTCTCTACCCCATCCAAAATTGATCCTAATCAAATACCACGTCCAATGCCTGAGACGTCAGTTGTCATTTTTGAGACCCGGCAAGGTGGCCAAGCAGCTGTTCCACCGGCTGCGTCCAGTGAATTTATTGTCAAGGATACAGGTAACTGCAATCCACGTTTGATGCGGTGCACCTTAAATCAGATACCATGTACAGGAGATATCTTGACAACATCAGCAATGCCATTGGCCTTGATGGTGCAACCTTTTGCACTTCCTCATCCTTCCGAGGAGCCTATCCAGCTTGTGGACTTCGGAGGGATGGGACCTATTAGGTGTTCACGCTGCAAAGCATACATAAATCCTTTCATGCGATTCATTGATCAAGGGAAGCATTTTGTCTGTAACTTATGTGGGTTTAGCAATGATACTCCAAGGGAGTACTTGTGCAACTTAGGTCCTGATGGTAGGCGACGCGATGCTGATGACAGGCCTGAATTATGTAGGGGAACAGTTGAATTCATCGCCTCCAAGGAATTTCTGGTTCGTGATCCAATGCCAGCTGTGTATTTTTTCCTCATTGATGTCTCCATGAATGCCATACAGACTGGTGCAACAGCTGCAGCTTGCAGTGCAATTTCCCAGGCTCTTTCGGACCTTCCTGAAGGTCCTCGAACAATGGTTGGGATTGCCACATTTGATTCCGCTATTCATTTCTACAGTCTTAAACGTGATCAGCAACAGCCTTTGATGCTTATTGTTCCAGACATCCAAGATGTGTACACTCCACTTCAGACTGACCTGATTCTCCCGATTTCTGAGTGCCGTGAGAATTTGGAGCAATTACTGGAGAGCATCCCTAACATGTTCGAGAACAATAGGGTCGCTGATTCAGCATTTGGGGCAGCTATGAAGGCCAGTTTCCTTGCTATGAAGTCTACTGGTGGAAAACTACTCGTGTTCCAGTCAGTACTACCATCAGTTGGAATTGGTTCATTATCTGCCAGGGAAGCTGAAGGTAGATCAAATATTTCCACTGGAGATAAGGAAGCACATAAGCTCCTGCAGCCTGTTGATAAGACTCTGAAGACGATGGCACTAGAATTTGCAGAGTATCAAGTTTGTGTGGATGTGTTCCTTACTACACAATCATATGTAGATATTTCTTCTATATCAGTTGTTCCTAGTACCACTGGTGGCCGGGTGTACCATTATTATCCATTTTCTGCCCTTTCTGATCCAGCCAAGCTGTTCAATGATCTCAGATGGAATTTCAGTAGACCCCAGGGATTTGAGGCTGTCATGCGTGTGAGGTGCAGTCAAGGACTTCAAGTTCAAGACTATTCTGGCAACTTCTGCCGGCGTGTTCCTACTGATATTGATCTCCCTGCGATTGACTCGGACAAAACCATAATGGTCACCTTTAAGCATGATGACAAATTGCAGGAGAATTCAGAATGTGCTTTCCAGTGTGCACTTCTTTACACGACGGTATATGGACAAAGAAGGATACGGGTCATAAACCTCTCACTTTCATGCACAAATGTGCTCAGCAACCTTTTCCGATATGCTGATCTGGAAACACAGTTTACCTATGTTGTGAAGCAAGCCGCAAATGCCATTCCATCAACACCTCTATCCCAAGTTAGGGACCAAGTGACAAGCACATGCATCAATATACTCCAGTCTTACCGAAAACATTGTGCATCTGTAAGTTCTTCGGGACAATTGATTCTTCCTGAGGCTCTAAAGCTCCTGCCTTTGTATACGCTAGCATTAATTAAAAGTGTTGGATTGAGGACTGATGGGAGATTGGATGATCGGTCCTATTGGGTGTCAACTGTCTCTTCAATTTCTGTGTTACTAGCCATTCCATTGGTGTTCCCTAGGATGATTGCCCTCCATGATCTTGCGTCAAGGAGTGATGATGATTCCCTTATACCAAACCCCCTTACACTCAATAGTGAGAATACGCTTGATTTTGGAATTTATTTGTTGGAAAATGGTGAGGATGGTTTTGTTTATGTCGGAAATGCAGTAAACCCTGCCACCCTTGAGCAAATATTTGGTGTTTCATCTTTGGCTGGAGTACCAAATCAGTTGGTATTGGAGCAATATGATAACGAACTTTCCAGGAAAGTAAATGAAGTGGTGAATGAAATAAGGCGACAGAGATGCTCCTATTTGAGATTGAGACTATGCAAACATGGGGACCCATCTGGAGATTTCTTCCGCTCACTATTGGTCGAAGACAAGGCACCTGGTGGCCTTTCTTATGTAGAGTTCCTTGTACATGTTCATAGGCAAATCCAAAGCAAGATGACCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASPSRPPPPFAPQNPTPAPNPAASSLPASFSNLHVSRAPPPFAPPGGNGPVPSSIRAPQAPPPGARPFPGSPPPPSQPPPPFARPAAPVQQQPPPFGGPPGVMPSQPLQQQQQQQQQRPAFGGPPSGAPPAQAQRTPFGGPPSAMSQGPLPFGGPPAAVASHPPPFGGPPVAAAQPPPFGRPPSAAAAGQSAPLGGALFAAAQPPPFGGPPGAAPQPAPTGGLRTPYGGPPAPSQQVPFGGAPQWPGTHPPPFGAQAAPSSQPPPFMGVPGNAPPFRPPGWQGQARPGAMSAGMQLMPGGMLPNALGQGMPSTPSMPYSPHAGAQVSTPSKIDPNQIPRPMPETSVVIFETRQGGQAAVPPAASSEFIVKDTGNCNPRLMRCTLNQIPCTGDILTTSAMPLALMVQPFALPHPSEEPIQLVDFGGMGPIRCSRCKAYINPFMRFIDQGKHFVCNLCGFSNDTPREYLCNLGPDGRRRDADDRPELCRGTVEFIASKEFLVRDPMPAVYFFLIDVSMNAIQTGATAAACSAISQALSDLPEGPRTMVGIATFDSAIHFYSLKRDQQQPLMLIVPDIQDVYTPLQTDLILPISECRENLEQLLESIPNMFENNRVADSAFGAAMKASFLAMKSTGGKLLVFQSVLPSVGIGSLSAREAEGRSNISTGDKEAHKLLQPVDKTLKTMALEFAEYQVCVDVFLTTQSYVDISSISVVPSTTGGRVYHYYPFSALSDPAKLFNDLRWNFSRPQGFEAVMRVRCSQGLQVQDYSGNFCRRVPTDIDLPAIDSDKTIMVTFKHDDKLQENSECAFQCALLYTTVYGQRRIRVINLSLSCTNVLSNLFRYADLETQFTYVVKQAANAIPSTPLSQVRDQVTSTCINILQSYRKHCASVSSSGQLILPEALKLLPLYTLALIKSVGLRTDGRLDDRSYWVSTVSSISVLLAIPLVFPRMIALHDLASRSDDDSLIPNPLTLNSENTLDFGIYLLENGEDGFVYVGNAVNPATLEQIFGVSSLAGVPNQLVLEQYDNELSRKVNEVVNEIRRQRCSYLRLRLCKHGDPSGDFFRSLLVEDKAPGGLSYVEFLVHVHRQIQSKMT</aaseq> |
| Gene Sequence |
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