Difference between revisions of "BGIOSGA036295"
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Revision as of 18:27, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA036295 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036295, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_38151 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA036295-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA036295-PA |
| Length |
17590 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:10920958..10938547 |
| Sequence Coding Region |
10938269..10938547,10937415..10937510,10937220..10937332,10936412..10936478,10936144..10936236 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:10920958..10938547 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:10920958..10938547 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCGCCTCGCGGGGGCCGCCGCTTCTAGGGTTCCGAGCCCTCGCGCTCGCGCTGCTGCTCGCGATCCTCCTCTTGCTCGGCTGCTCCGCCGCCGCCGCGTATGCGGGGGCGGAGGGGGTGCTGAGGCAGGTGGTTGGGAGGAGGGGCGACGACGGTGGTGGTGGGAACTTCTTCGAGCCGTTCAACGTGACGTACGACCACCGCGCGGTGCTCATCGGTGGGAAGCGGAGGATGCTCGTCTCCGCGGGGCTGCACTACCCGCGCGCCACACCCGAGATGTGGCCTAGTTTAATTGCAAAGTTCAAGGAGGGTGGCGCAGATGTAATTGAGACCTATGTCTTTTGGAATGGCCATGAGCCAGCCAAAGGTCAGTATTACTTTGAAGAAAGATTTGATCTTGTGAAATTTGCGAAGCTGGTTGCCGCCGAAGGTCTATTTCTTTTTCTTCGTATCGGCCCATATGCTTGTGCAGAATGGAATTTCGGTGGTTTCCCAGTTTGGTTACGTGACATCCCTGGCATAGAATTCCGAACTGACAATGAACCATTCAAGGCTGAAATGCAGACTTTCGTGACAAAAATTGTCACTTTAATGAAAGAGGAGAAACTTTATTCTTGGCAAGGTGGTCCCATTATATTACAACAGATTGAAAACGAGTATGGGAATATTCAAGGAAATTATGGCCAAGCAGGGAAGAGATATATGCAATGGGCCGCTCAGATGGCAATTGGGCTTGACACTGGCATTCCTTGGGTGATGTGCAGGCAGACTGATGCTCCAGAAGAAATTATCGATACATGCAATGCATTTTATTGCGATGGTTTCAAGCCAAATTCTTACAATAAACCAACAATATGGACTGAAGATTGGGATGGATGGTATGCTGATTGGGGTGGAGCATTACCTCACAGGCCAGCTGAAGACAGTGCTTTTGCTGTTGCTCGTTTCTACCAAAGAGGTGGAAGCTTACAAAATTATTACATGTACTTTGGTGGAACAAATTTTGCACGGACAGCTGGTGGTCCACTTCAGATAACAAGCTACGATTATGATGCTCCAATCGATGAGTATGGTATATTAAGGCAGCCTAAGTGGGGGCATCTGAAAGATCTACACACTGCTATCAAACTTTGTGAGCCAGCTCTTATTGCAGTGGTTGGCTCACCTCAATATATAAAGTTAGGATCAATGCAAGAGGCACATGTATATTCCACTGGAGAAGTCCATACAAATGGAAGCATGGCAGGAAATGCACAGATTTGCTCAGCTTTTCTTGCCAATATTGATGAACATAAATATGCATCAGTCTGGATCTTTGGTAAATCTTATAGTCTACCACCATGGTCTGTGAGCATACTACCAGATTGCGAAAATGTGGCCTTCAATACTGCACGGATTGGTGCACAGACTTCAGTTTTTACTGTAGAATCTGGGTCTCCCAGTCGTTCAAGTAGACATAAGCCTAGTATCCTCTCACTTACATCTGGAGGTCCGTATCTCTCAAGTACTTGGTGGACTTCTAAAGAGACTATTGGTACTTGGGGTGGAAACAATTTTGCTGTTCAGGGAATATTAGAGCACTTGAACGTAACGAAGGACATATCTGACTACTTGTGGTATACTACCAGGGTAAATATTTCTGATGCAGACGTTGCATTCTGGAGTTCGAAAGGGGTTCTTCCTTCACTAACAATAGATAAAATTCGTGATGTAGCTCGTGTATTTGTAAATGGCAAGCTTGCAGGCAGTCAAGTTGGTCACTGGGTCTCACTGAAACAACCGATTCAATTGGTTGAAGGGCTTAATGAGTTGACATTACTTTCAGAGATTGTTGGCTTGCAGAACTATGGTGCTTTCTTGGAGAAAGATGGAGCTGGATTTAGAGGTCAAGTAACACTCACTGGCTTGTCAGATGGGGACGTTGACCTAACTAATTCCCTTTGGACATATCAGGTCGGCTTGAAAGGCGAGTTTTCTATGATTTATGCTCCAGAGAAGCAGGGATGTGCTGGGTGGAGTCGCATGCAGAAGGACAGTGTACAGCCTTTCACTTGGTACAAGAATATATGTAATCAGTCTGTAGGAGACACTATTAAGTTCATGCATGCTTATTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAASRGPPLLGFRALALALLLAILLLLGCSAAAAYAGAEGVLRQVVGRRGDDGGGGNFFEPFNVTYDHRAVLIGGKRRMLVSAGLHYPRATPEMWPSLIAKFKEGGADVIETYVFWNGHEPAKGQYYFEERFDLVKFAKLVAAEGLFLFLRIGPYACAEWNFGGFPVWLRDIPGIEFRTDNEPFKAEMQTFVTKIVTLMKEEKLYSWQGGPIILQQIENEYGNIQGNYGQAGKRYMQWAAQMAIGLDTGIPWVMCRQTDAPEEIIDTCNAFYCDGFKPNSYNKPTIWTEDWDGWYADWGGALPHRPAEDSAFAVARFYQRGGSLQNYYMYFGGTNFARTAGGPLQITSYDYDAPIDEYGILRQPKWGHLKDLHTAIKLCEPALIAVVGSPQYIKLGSMQEAHVYSTGEVHTNGSMAGNAQICSAFLANIDEHKYASVWIFGKSYSLPPWSVSILPDCENVAFNTARIGAQTSVFTVESGSPSRSSRHKPSILSLTSGGPYLSSTWWTSKETIGTWGGNNFAVQGILEHLNVTKDISDYLWYTTRVNISDADVAFWSSKGVLPSLTIDKIRDVARVFVNGKLAGSQVGHWVSLKQPIQLVEGLNELTLLSEIVGLQNYGAFLEKDGAGFRGQVTLTGLSDGDVDLTNSLWTYQVGLKGEFSMIYAPEKQGCAGWSRMQKDSVQPFTWYKNICNQSVGDTIKFMHAY</aaseq> |
| Gene Sequence |
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