Difference between revisions of "BGIOSGA036337"
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Revision as of 18:27, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA036337 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036337, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_38056 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA036337-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA036337-PA |
| Length |
16837 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:9292564..9309400 |
| Sequence Coding Region |
9309327..9309400,9307965..9308616),complement(9307006..9307065,9305383..9305469),complement(9305112..9305243 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:9292564..9309400 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:9292564..9309400 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGCTCCCTGGCGGCGCGGCTTCGCGTGCCGCGGGGAATCCGCGGCCTCGGCGCCAGAGAGGTGATATCTTAACAAAGGAGAAAAAGAGAAGAGATTCTTCAAAGCAGCCATTGGTGCATCTCCAGGTTTGTCTAGAGCACCAGGTTAAGTTTGGTGAGCATGTAGGCATTATCGGTTCCACAAAGGAGCTTGGTTCATGGGAGGAGCAGGTTGAACTGGAATGGACTACAAATGGTTGGGTCTGCCAGCTTAAGCTCCCTGGAGAAACACTTGTGGAGTTTAAATTTGTTATATTTTTGGTGGGAGGAAAAGATAAAATATGGGAAGATGGTAATAACCGTGTTGTTGAGCTGCCGAAGGATGGTAAGTTTGATATAGTATGCCACTGGAATAGAACAGAAGAGCCATTAGAACTTTTAGGAACACCAAAGTTTGAGTTGGTCGGAGAAGCTGAAAAGAATACTGGCGAGGATGCTTCAGCATCTGTAACTTTTGCACCTGAAAAAGTTCAAGATATTTCAGTTGTTGAGAATGGTGATCTAGCATCAGAGGCCGAGTCAAGCAAATTTGTTGGGCAATGGCAAGGAAGTAAAACTGTTTTCATGAGATCAAATGAGCATCTGAATAAGGAGGCTGATAGGATGTGGGATACAACTGGGCTTGATGGAATAGCACTGAAACTGGTGGAGGGCGATAAAGCATCCAGGAACTGGTGGCGGAAGGAATGTACCCTTTGCTCAGATCCAGCCTCAAAGGCATTGAGCTATAATGCCTCAGTGCTGTTAGAGGTTGTTCGCGGGATTTTGTCAGAATCTTTTGATGACCAGAGTCGTCTGGGGGCCCTTGTATACTCAGCTATTTATCTGAAGTGGATTTATACAGGTCAGATATCGTGCTTTGAAGATGGTGGCCACCATCGGCCTAACAAACATGCTGAGATATCGAGGCAAATATTCCGTGAACTTGAAATGACGTATTATGGGAAAACCACATCAGCCAAGGATGTTCTCGTGATTCGCAAAATTCATCCCTTTTTACCTTCATTTAAGTCAGAGTTTACAGCCTCTGTCCCTCTAACACGAATTCGTGATATTGCTCACCGGAATGACATCCCACATGATCTCAAGCAAGAAATCAAGCATACTATACAAAACAAACTTCATCGTAATGCTGGACCTGAGGATCTTATTGCTACAGAAGTCATGCTTGCTAGGATTACTAAGACCCCTGGAGAATACAGTGAATCATTTGTTGAACAATTCACGATATTTTATAGCGAACTAAAAGATTTCTTCAATGCTGGCAGCCTATTTGAGCAACTGGAGTCCATCAAGGAATCTCTGAACGAGTCAGGCTTAGAAGTTCTCTCATCCTTTGTGGAAACCAAAAGGAGTTTGGACCAAGTGGATCATGCAGAAGATTTGGATAAAAATGATACCATTCAAATTTTGATGACTACCTTGCAATCATTATCTTCTCTAAGATCGGTTCTAATGAAGGGCCTTGAAAGTGGCCTTAGAAATGATGCGCCTGATAATGCTATAGCAATGCGACAAAAGTGGCGCCTTTGTGAAATTAGTCTTGAGGATTATTCATTTGTTCTGTTAAGCAGATTCATCAATACTCTTGAAGCCTTAGGTGGATCAGCTTCACTTGCAAAGGATGTAGCTAGAAATACTACTCTATGGGATACTACTCTTGATGCCCTTGTCATTGGCATCAATCAAGTTAGCTTTTCAGGTTGGAAAACAGATGAATGTATTGCCATAGGGAATGAGATTCTTTCCTGGAAGCAAAAAGGTCTATCTGAAAGTGAAGGTTGTGAAGATGGGAAATATATTTGGTCACTAAGACTTAAAGCTACACTGGATAGAGCACGGAGATTAACGGAAGAGTACTCTGAAGCACTTCTTTCTATATTCCCTGAAAAAGTAATGGTTATTGGGAAAGCCCTTGGAATACCAGATAACAGTGTGAGAACTTACACAGAGGCAGAAATTCGTGCTGGCATTGTTTTTCAGGTATCTAAACTATGCACAGTACTTCAGAAAGCAATTCGAGAAGTACTTGGATCAACTGGCTGGGATGTTCTTGTTCCTGGAGTGGCCCATGGAACTCTGATGCGGGTGGAAAGAATTCTTCCTGGATCATTACCTTCATCTGTCAAAGAACCTGTGGTTCTAATTGTAAATAAGGCTGATGGAGATGAAGAGGTCAAAGCTGCTGGGGATAATATAGTTGGTGTTATTCTTCTTCAGGAACTACCTCACCTTTCACATCTTGGTGTTAGAGCTCGTCAAGAGAAAGTTGTATTTGTAACTTGTGAATATGATGACACAGTTACAGATGTGTATTTGCTTGAGGGAAAATATATCAGATTAGAAGCATCATCCATCAATGTCAATCTCTCAATAGTTTCAGAAAAAAATGACAATGCTATCTCTACAGAACCAAATAGTACAGGGAATCCATTTCAACAGAAACTCCAAAATGAATTCTCTCTACCATCGGATATCGAGATGCCACTGCAAATGTCTAAGCAAAAAAGCAAATCAGGAGTGAATGGTAGTTTTGCTGCTCTCGAGCTTTCAGAAGCTTCAGTGGAATCAGCTGGTGCAAAAGCTGCTGCATGCAGAACTCTTTCTGTTCTTGCTTCATTGTCTAATAAAGTCTATAGTGATCAAGGAGTTCCAGCAGCCTTTAGAGTCCCTTCTGGTGCTGTGATACCATTTGGATCAATGGAGGATGCGCTCAAGAAAAGTGGATCACTGGAATCCTATACAAGCCTTCTAGAAAAGATTGAAACAGCCAAAGTCGAAAATGGTGAAGTTGATAGCCTGGCGTTGGAGCTACAAGCAATAATTTCACATCTTTCCCCATCGGAGGAGACTATTATATTTCTCAAAAGAATCTTCCCACAGGATGTCCGGTTGATTGTTAGATCTAGTGCTAATGTGGAGGATTTGGCTGGTATGTCAGCTGCTGGTCTCTATGATTCAATTCCCAATGTCAGTCTCATGGACCCATGTGCCTTTGGAGCTGCGGTTGGGAAGGTTTGGGCTTCTTTATACACAAGGAGAGCCATCCTAAGCCGTCGAGCCGCTGGTGTTTATCAGAGAGACGCGACAATGGCTGTTCTTGTCCAAGAAATACTGCAGCCAGATCTCTCCTTCGTGCTTCATACTGTTTGCCCCGCTGACCATGACCCCAAGGTTGTCCAGGCTGAGGTCGCCCCTGGGCTGGGTGAAACGCTTGCTTCAGGAACCCGTGGCACCCCGTGGAGGCTGTCATGTAACAAATTCGATGGAAAAGTTGCCACTCTTGCCTTTTCAAATTTCAGTGAGGAGATGGTGGTGCACAACTCTGGTCCTGCCAATGGAGAAGTAATTCGTCTTACTGTTGATTACAGCAAGAAGCCATTGTCGGTTGATACAACCTTTAGGAAGCAGTTTGGTCAGCGACTGGCTGCGATTGGCCAGTATCTGGAGCAGAAGTTCGGGAGTGCACAGGATGTGGAAGGTTGCCTGGTTGGGAAAGATATTTTTATAGTGCAAAGCAGGCCACAGCCATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MALPGGAASRAAGNPRPRRQRGDILTKEKKRRDSSKQPLVHLQVCLEHQVKFGEHVGIIGSTKELGSWEEQVELEWTTNGWVCQLKLPGETLVEFKFVIFLVGGKDKIWEDGNNRVVELPKDGKFDIVCHWNRTEEPLELLGTPKFELVGEAEKNTGEDASASVTFAPEKVQDISVVENGDLASEAESSKFVGQWQGSKTVFMRSNEHLNKEADRMWDTTGLDGIALKLVEGDKASRNWWRKECTLCSDPASKALSYNASVLLEVVRGILSESFDDQSRLGALVYSAIYLKWIYTGQISCFEDGGHHRPNKHAEISRQIFRELEMTYYGKTTSAKDVLVIRKIHPFLPSFKSEFTASVPLTRIRDIAHRNDIPHDLKQEIKHTIQNKLHRNAGPEDLIATEVMLARITKTPGEYSESFVEQFTIFYSELKDFFNAGSLFEQLESIKESLNESGLEVLSSFVETKRSLDQVDHAEDLDKNDTIQILMTTLQSLSSLRSVLMKGLESGLRNDAPDNAIAMRQKWRLCEISLEDYSFVLLSRFINTLEALGGSASLAKDVARNTTLWDTTLDALVIGINQVSFSGWKTDECIAIGNEILSWKQKGLSESEGCEDGKYIWSLRLKATLDRARRLTEEYSEALLSIFPEKVMVIGKALGIPDNSVRTYTEAEIRAGIVFQVSKLCTVLQKAIREVLGSTGWDVLVPGVAHGTLMRVERILPGSLPSSVKEPVVLIVNKADGDEEVKAAGDNIVGVILLQELPHLSHLGVRARQEKVVFVTCEYDDTVTDVYLLEGKYIRLEASSINVNLSIVSEKNDNAISTEPNSTGNPFQQKLQNEFSLPSDIEMPLQMSKQKSKSGVNGSFAALELSEASVESAGAKAAACRTLSVLASLSNKVYSDQGVPAAFRVPSGAVIPFGSMEDALKKSGSLESYTSLLEKIETAKVENGEVDSLALELQAIISHLSPSEETIIFLKRIFPQDVRLIVRSSANVEDLAGMSAAGLYDSIPNVSLMDPCAFGAAVGKVWASLYTRRAILSRRAAGVYQRDATMAVLVQEILQPDLSFVLHTVCPADHDPKVVQAEVAPGLGETLASGTRGTPWRLSCNKFDGKVATLAFSNFSEEMVVHNSGPANGEVIRLTVDYSKKPLSVDTTFRKQFGQRLAAIGQYLEQKFGSAQDVEGCLVGKDIFIVQSRPQP</aaseq> |
| Gene Sequence |
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