Difference between revisions of "BGIOSGA036407"
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Revision as of 18:28, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA036407 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036407, complete gene. |
| LocusTag |
OS12G0238100 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA036407-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA036407-PA |
| Length |
11789 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:7137149..7148937 |
| Sequence Coding Region |
7148935..7148937,7148546..7148647),complement(7148364..7148414,7148164..7148269),complement(7146959..7147072 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:7137149..7148937 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:7137149..7148937 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCTTGAGAAAGGTGTGGATGGTTTATTTGATAGCTTTGCTAGGTTGGATTCCCGTATTTCTAGTGTTGGCCAAACAGCTGCCAAAATTGGTGATCATTTACAGAGTGCAGAATCCCAGAGGGAAACTGCTAGTCAGACAATAGATCTCATCAAGTATCTGATGGAGTTCAACAGCACACCAGGGGATCTTATGGAACTTTCTCCTTTATTTTCTGATGACAGTCGTGTTGCTGAGGCAGCTTCAATTGCACAGAAATTGCGTTCATTTGCCGAGGAGGATGTTGGTAGACATGGTGTACCATCAGCTGTTGGTTCTGCTAATGCAAGTCGTGGTTTGGAGGTTGCTGTTGCAAATCTTCAAGAGTATTGTAATGAATTGGAGAATAGATTGTTAGCTCGGTTTGATACTGCATCACAGAGGCGGGAGATGTCTACGATGGCAGAATGTGCTAAAATTTTGTCACAGTTCAACCGCGGAACCAGTGCTATGCAACATTATGTTGCAACACGGCCAATGTTTATTGATGTGGATATTATGAGCATTGATATTCAAGTTGTTCTTGGTGAGGAGGGGCCACAAGCTGACCACATTTGTATTGCAGAGGGCCTCTCTGTATTGTACAAGGAAATTGCAGATACTGTGAGGAGAGAAGCAACTACAATAATGGCTGTATTTCCTTCTCCAAATGAGGTCATGTCAATTCTTGTGCAGAGAGTTTTAGAACAAAGGGTAACAGCAATTCTTGATAAACTTCTTATTAAGCCCTCTCTTGCTAACTTACCTCCTATAGAAGAGGGTGGTCTTCTGCATTATCTCAGAGTTCTGGCGGTAGCATATGACAAGACAAAAGAACTTGCTAAAGAGTTGCAATCTATCGGTTGTGGGGATTTGGACATTGAAGGTCTCACTGAATCCATATTTGTTTCCCACAAAGATGAGTACACAGAATTTGAACAGGCATCACTCAGACAACAATACCAATCAAAGATGGCTGAATTGAGAGCTGAGGCCAAGCAGCAATCTGAGTCAACTGGCACAATTGGACGTTCAAATGGAGCGGCTGTGACTACATCACTTCAGCAGCAGATATCAGTTACTGTAGTGACTGAATTTGTTCGCTGGAATGAGGAAGCAATATCTAGATGCACACTGTTGTTTTCTCAGCCTGCTACTGTTGCAGCTAATGTGAGATCCATATTTGCATGCTTGCTTGATCAAGTAAGCCAATATTTGACTGAAGGGCTTGACCGTGCTAGAGAGAGTTTAAATCATGCAGCAACTCAACGGGATAGATATGTCATTGGAACAAGTGTTAGTAGAAGGGTTGCTACTGCTGCTGCTAATGCTGCAGAGGCGGCAGCTGCTGCAGGTGAGAGTAGCTTTAGATCCTTCATGATTGCTGTGCAGCGTTGTGCTAGCAGTGTGGCTATTCTTCAGCAGTACTTCTCAAATACTATATCTCGGCTCCTGCTGCCTGTGGATGGTGCCCACCCCTCAGCTTGTGAAGATATGGGATCAGCAGTATCTGTTGTTGAGGCTGCTGCCCACAAAGGACTGCTACAGTGTATTGATACCGTCATGTCTGAGGTTGAAAGATTGCTGTCTTCAGAACAGAAGGCTACAGATTATCGAACACCAGATGATGGAGCTGCACCGGATCATCGACCAACCAATGCTTGCATAAGAATTGTAGCCTATCTATCTCGTGTTCTCGAGGTTGCATTCAGTGCTCTAGAAGGTCTCAATAAACAGTCCTTTTTGACTGAGCTGGGAAATCGCTTGCATAAGGGGCTACTCAATCATTGGCAGAAGTTCACATTTAGTCCCAGTGGTGGGTTACGGCTGAAACGTGATATCACTGAGTACGGGGAATTCGTTCGTAGCTTCAATGCCCCATCGATAGATGAAAAGTTTGAACTGCTTGGAATCATGGCCAATGTATTCATCGTTGCTCCTGAAAGTCTAGCTTCCTTATTTGAAGGAACCCCCAGTATCCGGAAAGATGCCTTGCGGTTCATTCAACTCAGGGACGACTATAAGACAGCAAAAATCGCTTCCATGCTAAACAGTATCATGGCTGAATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MLEKGVDGLFDSFARLDSRISSVGQTAAKIGDHLQSAESQRETASQTIDLIKYLMEFNSTPGDLMELSPLFSDDSRVAEAASIAQKLRSFAEEDVGRHGVPSAVGSANASRGLEVAVANLQEYCNELENRLLARFDTASQRREMSTMAECAKILSQFNRGTSAMQHYVATRPMFIDVDIMSIDIQVVLGEEGPQADHICIAEGLSVLYKEIADTVRREATTIMAVFPSPNEVMSILVQRVLEQRVTAILDKLLIKPSLANLPPIEEGGLLHYLRVLAVAYDKTKELAKELQSIGCGDLDIEGLTESIFVSHKDEYTEFEQASLRQQYQSKMAELRAEAKQQSESTGTIGRSNGAAVTTSLQQQISVTVVTEFVRWNEEAISRCTLLFSQPATVAANVRSIFACLLDQVSQYLTEGLDRARESLNHAATQRDRYVIGTSVSRRVATAAANAAEAAAAAGESSFRSFMIAVQRCASSVAILQQYFSNTISRLLLPVDGAHPSACEDMGSAVSVVEAAAHKGLLQCIDTVMSEVERLLSSEQKATDYRTPDDGAAPDHRPTNACIRIVAYLSRVLEVAFSALEGLNKQSFLTELGNRLHKGLLNHWQKFTFSPSGGLRLKRDITEYGEFVRSFNAPSIDEKFELLGIMANVFIVAPESLASLFEGTPSIRKDALRFIQLRDDYKTAKIASMLNSIMAE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..3#291..392#524..574#669..774#1866..1979#2049..2140#6736..6904#6994..7070#7157..7255#7364..7454#9203..9288#9375..9551#9772..9825#9914..10042#10159..10251#10329..10475#10626..10723#10796..10880#11232..11290#11367..11465#11546..11629#11717..11789#ATGGTATTCCCGCTCTTGTAGCTACATTTTCCCATAGCCACATGAACCCTCTGAATTAGATTCCATTTTTTGATTGACCATGTTTTGTTCTATACCTTTGAGAAGAGTTGTTTTTAGGGGAGCATAATATGATATATTATAATGAAAGTTTTAAGCTCCATTCTGGAGGTAAGGACTGTTTATTAGTTGTAGCGCTGAAACATATTCCTGGGATATATTGTTGAACACTTGAACTACTAATTCTTGCTTATTTTTCATTTTCATTGTTCCTTTGTTTTTGTTTACTCCAGCTTGAGAAAGGTGTGGATGGTTTATTTGATAGCTTTGCTAGGTTGGATTCCCGTATTTCTAGTGTTGGCCAAACAGCTGCCAAAATTGGTGATCATTTACAGGTAATCTTCTCTTACTCAATATCTATGATTGCAATTGTTACATATACTCGCTGATCGTGACATTACTCTTTGATATAATTTATCGGAACTTGCTTAGTTTTCATACTGAACATTTGTTTTCTCATTTTTAGAGTGCAGAATCCCAGAGGGAAACTGCTAGTCAGACAATAGATCTCATCAAGGTAATGTAGTTGCTTGACATTACTAATGTTCTTTCGTCCAATACTTTTTCATGACCTGTGACCTCATTTTAAACAAAATATACTTCTTTTGCAGTATCTGATGGAGTTCAACAGCACACCAGGGGATCTTATGGAACTTTCTCCTTTATTTTCTGATGACAGTCGTGTTGCTGAGGCAGCTTCAATTGCACAGAAATTGCGTAAGCTCACAACATTTTTGTCTCACGGGATCAACACAATGTTTAGCTTACATTCTTTTCATACCCCTGTTACTGCATCTGTGTACAGATTCTGTTTGTTCCAGATACATGCCCTACTAATTTCATATATTTATGGAGTCGCATGTGTCTAATTTTTTTGATCAAAAGACAGTGGGGGAGGCCCCCACGGTATATATTATATAAGGAAAAAATATTTACAAAAGAAGAAACAAGATAAAAAGAAAAGGACTAAGCCGATTACAACTGATCAATCCATGATTGTACTAAAGGTCTGTTACTTTCCTTGAGTCTATTAAATGTAGGCTCAAATCAGACTTCAAAATCTTCACCCAATTAGAAACAGAGGGCTGTATGCCTTGGAAAATTAGCCCATTTCTTTCTTTCCAAATACTCCAAGCAGCAAGCAGGAACAGCTCCATGAAACATCGATGTGGGAATGAAGAACGTTGTGTTTGTAGCATTTGATGGAACTCCAATGAAGTATCCCAACACCAGCCCAGTCTATTCCAACAAGCTTTACTGAAATCACATTTACTCTGTCCATGAATAAGAGCCAGCTAAAAACTTTTATTTTCATGTTAACCTTACTCTGCCAGATCCATTTAAAAGTAGAAGGGGGTGACAAGGACCAAAAATTGAGCTTATAGAAATGCTGCGAAGTGTATTTTGGAGACCCCCAAATATATAACCAAGAATCATTGGATTCCAGGAGAGTGATAGACTGATTATCAAGCCTGTGTCTAATTTTTATGAGGTCTTTTAATATGGTAGTATGGTACCTTACTACTGCTTGAAACAACAATGGTTAATGTAATGACTTCAGCTGCCGTGAAAATATATTCTGCTCCTTCTGATGGGCATCACAGTTATGATTATGTGCAGTCAATTGTATATGTTAAATCTGTAAAACATATATATTTTTTGGCTGTAGAGCTGGAGAGCACAGCTATTATTGATTTTTGAAGGAGAACTCCTTCAAGCTTCAAATAGTTGATTTACTATTTGGTTTTGGGCCCAGCATGTTCTTTCATAATATGATGTTTAACGGTTTGCATGTTTTGTTAATGTAGGTTCATTTGCCGAGGAGGATGTTGGTAGACATGGTGTACCATCAGCTGTTGGTTCTGCTAATGCAAGTCGTGGTTTGGAGGTTGCTGTTGCAAATCTTCAAGAGTATTGTAATGGTCAGTTCACTTTTAGCCTCTGTGTTACTAGTTTGTTGAATCTAGTTTTGAATGATCATCTTTATTCAGAATTGGAGAATAGATTGTTAGCTCGGTTTGATACTGCATCACAGAGGCGGGAGATGTCTACGATGGCAGAATGTGCTAAAATTTTGTCACAGGTGTGTATTCTGTGCATAGGACATGATAGTATTTGTCTCGTTCTCAGGTTTTCTTCTTGAAAGAAAAAACATCAATTTCATTCCATTACAATGGAGGTCTACTAGTATAGGACTATTAGAGAGAGCAAGGTTAACACAATGGTCACTGTTCTTCTTTTGCAACTTTTCTTTCAGGTGCAAAACAACAACTTACAATATTCAAATAAAAAATGGGCTAGACAGACAGTTTTGATTTTTTAGATAACTAGGAAGGAAGCCCTCGCAGATGTGTGGGCAATTTATTTTTTGTTTATATAAAAAAAATACTGAAAAAAGTCATATATCATCATATTAACTATAAGAACAATAGATTACCTCATAAACTTACCATAAAAGAAGGAAATATTTATACCGTGAAATAGACCATATGGTTTGATATAGTAAATGATAGTGTCTATCATATTCAAACAAAAATCACTTTGTTTTGGTTATATGTAAACTTACCTATCATCATCCTTTGCAACAATGATGTTTTATTTTTCCCTTATATTTTTTTCTTAAATTTCCTCCTATTTATTGGAGCATCACATGACATCTTACAAGTGTTTGTAGAAGTATAAGAACTCTATTGCTCATACTCACAATCTACTTGTAGTCAACTATTGTTTGTTGTGATTTTGTGACATCCTCTACTTATCTATCATTTTTTTGTTAATGGGTTCCCACTTAGAATCATCCTATATCTTCGGTGCTTGATGACGCATGTGCTTACTGGATGTCAACTGATTACTAAGTGCATTGTGCATGGATGTATCATAAACAATATAACTTGACGATTGTTGACACTGGTTTGTATATAGAACTTATTACATAGGATTTATCGGGGACATACGATTGATATATTATACTATTCTTGATTCACAAAGTATATTATATACTACATATTTAGTTTTAGTGCATAAGTAATAAATTTATGGTTAAGTTCTAAAGTGCTTATTGGAGTGCCTACTTCGTTATTTACCATGACCACGTTTACCGAATTGCTAAATGGTGCGTATTTTACAAAATATTTTTTATTATAGAAATTTTGTAAAAATACAAGTAACTCCATTTTCAAGCTTCTATAATACTCGATTAATCTTGTGCTAATGACTTGTGTCTTTTCGTGTGCCCTGTATAAGCTAAGTTAATGAGCTAGATCAAACGAAGGCTAAGTGGGAGAAAAGGGATATTGAGATGGTGTCAAATGAATATATTTGATCTTCAATTTTCTAATAATATATGAATAGAGTAAACACATAATACATAAAAATATATTTATGATAAATTTAGTAACATCCTTTTGCCATATCAGTATTTTTTACAATAGAGAGTTAGTAATTTTTGAAATTCTACACACACTTGAAGTTGTTTTTATTTTGGAAAATGTAAGTCTAATTTAACTATAACATAATCTATACTTTTAATTTATCTATACTTTTTTATGGGTGTTTCAATGACATGCGCCTAATTTGAATATAACTCAAAATAGCATATATTTTTACAACTTAAAGCATAGTTAATATTAGTTTGAATTACTAGTTTGGTTTTCCATCTAATCTAAATGATGAGAAGAAGAAAAAAGAAAAAAAAAGGATGTGGGACCCGGCGTGTGTACGTACTGTACATAGGAATAGCTGTGTATGTACTCTACGTAGGTACCTACTTTTGTTAAGAAGGAATACCTACATACCAACGTGCATGTATATTGGCCGGTAGTGGCATTACGATGTGGGCCTTTTAACAGATAAATTTAATTAGTACTTTTTAAGATAGATCTAATAGTTGAAAATAATGGGTCCACCAGATTAAATGCAAACCGATTGGTCGGATGTTTTGCTTTTTTTTATACATTTTCTATGATTTATTAGAGTGCCACATGGCGATCTATGAGCATTTATATGGTACTAGTGACGGATTATAAGCGTTTGTAGAAAGTTTATCCTCTTGATTACTTTTTCTCCCTTTTTCTCTTTATGAAAATATTTGCAACAATAATTTTTAAATAACCACAACCTTCTAAATTTTATATTTATTTGTAACAATATATTTTAACTCGTCATAATTTTTAACTTTTAAATGATACACTCGTTTTTTTATCTATTTAGACCATTGTGTTATTTATGATAAAAATCACAATTAGAATTTATACGTATGTTATCTACTTCACTCGTAAAATGTATATTCTTCTAAGTTCTATTCAATCCATGTCATTCAAACGTATATGAAAAATTATAATAAGAAAGTGACTGTATATTATTTCATCCAGTACCACTTCACTTGCATGCATAAACAAAATAGATGGTGACTATATATTGTTAGATCGACTTTTTAAAGTCTATTTTCAAAGAAGAATGCCCGCGCAGCTGAAAACATATATTTTCAAATCATATATTTTTGTTGTACGTTTTTTTACCATATTTGTGGGGTAATAAGTTTTGTTTTTCTACTATAGAAAATACTATTTTTAAAAAAACATCTATTTTTGTCTACTGACGGATAGCATACATGCATTTTTTTTCTAGTGAACTGTACCTTTTTAATATTTTTTATCATACGTACGTACGTTTTTTAAATAAAC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