Difference between revisions of "BGIOSGA036417"
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Revision as of 18:28, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA036417 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036417, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_37894 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA036417-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA036417-PA |
| Length |
13741 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:6860082..6873822 |
| Sequence Coding Region |
6873794..6873822,6873460..6873724),complement(6873131..6873234,6872860..6872986),complement(6872086..6872159 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:6860082..6873822 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:6860082..6873822 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCCAGAGGCCCAGAGATGGGGGAGTCGGATCCGCACGCGGCGGCGGTGCTCCGTGATGGCGACGGCAGCGGGGGACGGCGGTGCTCGGCGACGGCGGAGCGAGGCGAAAAGGCGGAAGTGGCGTTGCTCAGCGACGGCGACGGCGGTGGTGGTGGCGGAGGTGGCGGTGCCGCGAAGGGGAGGCGGAGGCGGAGGCAGAAGCGCGGCGCGAGCCGACGGGGACGACGATGGCGACGGAGCAAGGGGAAGGCGGCGGCGGCGGAGGTGGACGGGGCCGCGGCGGCGCAGAAACGTGAAGAGTTTTCTCCCAGCGTTCGTCCAGCGAACGCCACTTACATTTATCGAATTTCTCCCCCAGAATTCGCAATCCCCATCGGCGACCACAGCAACAGGATGAAGCTGGTACAAAGGGAGGCGGAGAAGCTGGCGCTGCACAATGCAGGGTTTTTGGCCCAGAAGCGCCTCGCACGGGGGCTCCGCCTCAACTACACGGAGGCCGTCGCGCTCATCGCCGCCCAGATTCTTGAGTTTGTTCGTGATGGAGACAGAACTGTGACAGACTTGATGGACTTAGGAAAACAACTGCTGGGAAGGAGGCAAGTTCTTCCAGCTGTTCCACACCTTTTAGAAACTGTACAGGTTGAAGGAACATTTATGGATGGAACAAAACTAATTACTGTACATGATCCTATTTCTTCTGATGATGGAAATTTGGAGCTAGCACTGCATGGTTCTTTCCTCCCAGTACCTTCACTTGAAAAGTTTTCTTCGGTTGGTGTGGACGACTTTCCTGGCGAAGTACGTTTTTGCTCTGGTCACATAGTCCTCAATCTTCATCGCAGGGCTTTAACTCTGAAGGTTGTTAACAAGGCAGACAGACCTATTCAGATTGGGAGTCATTACCACTTCATAGAGGCCAATCCATACCTTGTTTTTGATAGACAAAGAGCTTATGGCATGAGACTGAACATACCAGCTGGCACAGCTGTCCGTTTTGAGCCAGGGGATGCAAAAACGGTTACACTTGTAAGCATTGGTGGTCGTAAAGTGATCAGGGGTGGAAATGGAATTGCTGATGGTGCTGTCAACAGATCTCAGCTTAATGAGGTAATGGAAAAGGTTATTGCAAATGGTTTTGGGCATGAAGATTATCCAGATTCAAGTGAAGGTATTATTGGTGATGGCACACATGACTACAGTGTTGATCATGAGAAATATGCAAGCATGTATGGGCCTACAACTGGTGACAAGATTAGACTTGGTGACACTGACCTTTTTGCGGAGATTGAAAAGGACTATGCCATCTATGGTGATGAGTGCATATTTGGAGGCGGAAAGGTTCTACGTGACGGAATGGGACAGTCGGCAGGGTATCCAGCCTCAGATTGCCTGGACACAGTTGTAACAAATGCTGTTGTGATTGACTATACAGGAATATACAAAGCTGACATTGGTATAAATGGTGGACTTATCGTTGCTATTGGGAAGGCTGGAAACCCTGATGTCATGGACATGGATGGTGTTAATGAAGAGATGATTGTGGGGGTTAATACTGAAGTTATTGCTGCTGAAGGCATGATTGTTACTGCTGGTGGAATTGATTGCCATGTTCACTTCATATGCCCTCAATTGGCAGAAGAGGCAATTGCAAGTGGCATCACAACATTGGTGGGAGGTGGAACTGGACCAGCACATGGAACTTGTGCCACAACTTGCACCCCTTCACCATCTCACATGAAACTAATGCTACAGTCCACTGATGAATTACCAATCAATATGGGATTCACAGGCAAGGGAAATACTACAAAACCTGATGGATTGGCTGAGATCATTAAGGCAGGAGCAATGGGCTTAAAGTTGCATGAAGATTGGGGAAGCACCCCAGCTGCGATAGATAACTGTTTATCTGTCGCAGAAGCTTTTGATATCCAGGTAAATATCCACACAGACACCTTAAATGAGTCAGGCTGTGTGGAGCATACAATTGCCGCATTTAAAGATAGGACAATACATACATATCATAGTGAAGGAGCAGGTGGTGGTCATGCTCCAGACATTATCAAAGTATGTGGAGTGAAAAATGTGTTACCCTCTTCAACAAATCCAACTCGGCCATTTACTTTGAACACTGTAGATGAGCACCTTGATATGCTGATGGTCTGCCATCACCTCGATAGAAATATCCCAGAAGATGTAGCATTTGCCGAGTCTAGAATTCGAGCTGAAACAATAGCTGCTGAGGATATCTTGCATGACATGGGAGCAATCAGTATCATATCATCCGATTCGCAGGCTATGGGGCGCATTGGAGAGAGATTATTCATCAATTGCCCTAATAATGTCAGGGTACCTTGTAAGTGCGAGGTGATTACTCGGACATGGCAAACTGCAAATAAGATGAAGAGACAGAGAGGTAGATTACCTATATCCAGTTCCCCCGATGCTGCAGAGGACAATGACAATTTCCGGATAAGAAGATACATAGCTAAATACACCATAAATCCTGCTATAGTGAATGGCTTTTCTGATTTTGTTGGCTCTGTTGAGGTGGGAAAATTAGCTGACCTTGTTATTTGGAAACCTTCTTTCTTTGGAGCAAAACCAGAAATGGTTATAAAGGGTGGTGCTATTGCATGCGCTAATATGGGTGATCCAAATGCTAGCATTCCAACACCTGAACCGGTTATGATGCGACCTATGTTTGGTGCATTTGGAGGGGCTGGAAGTGCCAACTCTATAGCATTTGTGAGCAAGGCTGCTAAAGAAGCTGGCGTTGCAGTGCAGTACAAGCTGGGAAAGAGGGTGGAAGCTGTAGGTCGCGTTCGTGGTTTGACAAAGCTGAATATGAAGCTAAACGATGCACTTCCGAAAATTGATGTCGATCCTGAAACCTACACGGTTACTGCTGATGGAGAGGTTTTGAGATGTCAACCAACACCCACAGTACCACTATCTCGGAATTACTTCCTCTTTTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAARGPEMGESDPHAAAVLRDGDGSGGRRCSATAERGEKAEVALLSDGDGGGGGGGGGAAKGRRRRRQKRGASRRGRRWRRSKGKAAAAEVDGAAAAQKREEFSPSVRPANATYIYRISPPEFAIPIGDHSNRMKLVQREAEKLALHNAGFLAQKRLARGLRLNYTEAVALIAAQILEFVRDGDRTVTDLMDLGKQLLGRRQVLPAVPHLLETVQVEGTFMDGTKLITVHDPISSDDGNLELALHGSFLPVPSLEKFSSVGVDDFPGEVRFCSGHIVLNLHRRALTLKVVNKADRPIQIGSHYHFIEANPYLVFDRQRAYGMRLNIPAGTAVRFEPGDAKTVTLVSIGGRKVIRGGNGIADGAVNRSQLNEVMEKVIANGFGHEDYPDSSEGIIGDGTHDYSVDHEKYASMYGPTTGDKIRLGDTDLFAEIEKDYAIYGDECIFGGGKVLRDGMGQSAGYPASDCLDTVVTNAVVIDYTGIYKADIGINGGLIVAIGKAGNPDVMDMDGVNEEMIVGVNTEVIAAEGMIVTAGGIDCHVHFICPQLAEEAIASGITTLVGGGTGPAHGTCATTCTPSPSHMKLMLQSTDELPINMGFTGKGNTTKPDGLAEIIKAGAMGLKLHEDWGSTPAAIDNCLSVAEAFDIQVNIHTDTLNESGCVEHTIAAFKDRTIHTYHSEGAGGGHAPDIIKVCGVKNVLPSSTNPTRPFTLNTVDEHLDMLMVCHHLDRNIPEDVAFAESRIRAETIAAEDILHDMGAISIISSDSQAMGRIGERLFINCPNNVRVPCKCEVITRTWQTANKMKRQRGRLPISSSPDAAEDNDNFRIRRYIAKYTINPAIVNGFSDFVGSVEVGKLADLVIWKPSFFGAKPEMVIKGGAIACANMGDPNASIPTPEPVMMRPMFGAFGGAGSANSIAFVSKAAKEAGVAVQYKLGKRVEAVGRVRGLTKLNMKLNDALPKIDVDPETYTVTADGEVLRCQPTPTVPLSRNYFLF</aaseq> |
| Gene Sequence |
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