Difference between revisions of "BGIOSGA037256"
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Revision as of 18:33, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA037256 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA037256, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_38041 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA037256-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA037256-PA |
| Length |
18147 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:9072373..9090519 |
| Sequence Coding Region |
9072373..9072408,9072506..9072801,9072896..9073052,9073162..9073229,9073386..9074256 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:9072373..9090519 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:9072373..9090519 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGTCGGGCTCCTCTCGAGCCAACATCGACCAGTTCTTCCCGGCCAAGAAGAGGAGGCCCTCGTCGCGCAAGGACGAGCCGCCGTCCGGGAGCCCGAGGGGCGCCAAGGGGTCCCTGGAGGGGTACCTTGTCCGTTCCCCTTCAACCGCGGCGGCGGCCTCGTTGGACTCGCCGAGGGGTGGTGGGGACGCGGCGGGCGCCAGGAGGAGCCTCTCCGCGGCGATGGATGTCGATGTCGGCCATCCCGCCACGGCGGTGGCGACAGATGAGGGGGATTTTGAGCTGAAGAGGTTTGCGATGGAGTTCTTGTCATTGTCCCATTACTGCAGTGTTATCCCTTCTGTCATGGGTGGTGCTAGCAATGGCGAAGCGGGCAAGCAGCAGAAGAGGAGTGCGATCCAGTCGTTCTTGGCTCCTTGTAGCAATGCATCTGCCAAGAAGCAGCGCGTTGCTCACTCTGGGGACTTGGAAGCTCTAAAGGTTGTTGATGTAGGTCATAAAACCCCCTTCCGGGAAAAATGTGGCACTCAATACGGTGGCCCAGAGGCTTGGAGCTTTACCCCAAATACTGGACAGAAAAGGGTTGGATTTTCAACAGCACCAGGGGCTGGGGAAACACCGATGTCTGTATCCACGAACTCTCTGATTTCACCCGGGGAGGAATTCTGGAATGCAGCAATTGAATTTGCTGATGGCATTTCTGCTCGGGCTGAGAAGGGTCCTGGAAGGCCTGAGTGTGATGCGGATGACAAGTCATCCTGTGCAGTTGCATTGTGCTCTAAGATTCTTCCCAGATCCGGAAATGGTGGTTCTGACCATGAAAACACAGTAGGAAGCAATGAGACAAAGCAAATGGACAGATCTTCATATAAAGAAGAACCAGTGGCAGCAAATAATCATCATGTAAACAGCTCTCCGTTGCCTGTGAAGCATTTGGACTTTTTTCATGAGGATGAAATTCAAGTTCCAGGCCTGAAAATTGAAGAAAAAGGTGGTGCTGTAGATCTGAGTCCAAAGAGTCAAATGAAGAACAGAGAAAATCTCACGCATTCTGTAGATAACGTGAATAAAAGTACTTTTGACATGCACATAGATTCTTCAGCTACGATTCATGATGAGTGTCTGTCCAAGTTAACAACAGAAGGGAAAAATCATCCAACAAGAGTGGGTGACAGTGGTTCTTGTCTGACTAGAAGAGACCTCAATCAACTGATCTATAGTGAGGATAAGCTGCTTACTGCGTATTCAGATCATGGCAAGCCTAGCAAAGATTGTACAAATAAATTTGCATCCCAAGAAATGGAAGCCAACACTCCTACTAGTTCTGTTCCCCAAAAGGACCACTCAAAGCTGTCAAGTTGGCTTCCCCCTGAGCTCTGTGCTATATACATGAAAAAGGGTATTCCAGAGCTGTATCCTTGGCAGGTGGAATGTTTACTTGTGGAAGGTGTCTTGGAGAAACGCAATCTTGTTTATTGTGCATCTACAAGTGCTGGTAAAAGTTTTGTTGCTGAAATTCTAATGTTGAGACGGATATTGTTCAGTGGAAAGATGGCAATCCTTGTACTTCCCTATGTGTCAATATGTGCTGAAAAGGCTGAACATCTTGAGCAACTTCTTGAGCCGCTAGGAAGACATGTTCGAAGCTTCTATGGAAATCAGGGGGGAGGGTCACTTCCTAAGGATACATCAGTTGCTGTATGTACCATAGAGAAGGCCAATTCTTTGGTAAACAAGTTGTTGGAGGAAGGCCGTCTTTCTGAACTTGGCATAATAGTAATAGATGAGCTTCATATGGTTGGTGACCAACACCGAGGATATCTTTTGGAGCTGATGCTGACAAAGCTTAGGTATGCAGCTGGTGAAGGGAATTCAGAATCATCAAGTGGAGAAATCTCAGGTTCTAGCAGTGGGAAGATGGATGCAACTCATGGATTGCAGATTATTGGTATGAGTGCTACTATGCCCAATGTTGCAGCTGTAGCTGATTGGCTTCAAGCTGCACTTTACCAAACAGAATTTCGACCTGTTCCGCTGGAGGAATTTATTAAAGTCGGTAATCAGGTCTTTGATAAAGATATGAATGTTGTTCGCGTGCTTCCAAAAGTAGCTGATCTTGGCGGTAAGGATCCAGACCATATTGTTGAGTTGTGCAATGAGGTTGTTCAGCAGGGGCATTCTGTTCTTTTGTTTTGCTCCAGCCGGAAAGGCTGTGAATCAACTGCAAGACATGTTGCCAAGTTTTTGAAAGTGGCTTCTGTTGGATCAAGTGACGTTGGCTCAGAATTTCCAGATGCTACATTTGCAGTTGAAGCCTTGAAGAGGAGCCCTTCTGGGTTAGATCCTGTATTAGAAGAGACCCTTCCCTCTGGAGTTGCATACCATCATGCTGGTTTAACGGTTGAGGAGAGGGAGATTGTGGAAACATGTTACCGTAAAGGTCTTGTCAGAGTTTTGGCTGCCACTTCAACTTTAGCTGCTGGTGTTAACTTGCCTGCCAGACGAGTAATATTTAGGCAACCTAGGATAGGTCGTGACTTCATTGATGGAACTCGGTACAAGCAAATGTCTGGTCGTGCTGGTAGAACTGGCATAGATACAAAGGGAGAGAGTATACTTGTATGCAAGCCTGAAGAGGTCAAGAGGATTACAGGTATTCTTAGAAGTAACTGTACTCCCTTGGAGTCTTGCCTCTCAGAAGATAAAAATGGAATGACTCATGCAATCATGGAGGTTGTTGCTGGTGGAATTGTGCAAACTGCAAGTGATATCCATCGATATGTGAGGTGTACGCTGCTTAACTCTACTAAACCTTTTGAGGATGTTGTGAAGTCAGCTCAGGACTCCCTTCGTTGGTTATGCCATAAAAGGTTTCTTGAGTGGAATAATGAAACTAAAATATACTCTACTACTCCACTTGGGCTAGCAGCTTTTGGCAGTTCACTTAATCCTGAGGAATCGTTGGTCGTGCTGGATGATCTTTCAAGGGCAAGAGAAGGCTTTGTTCTGGCATGTGATTTGCATTTGGTTTACCTGGTAACCCCGATAAATGTAGATGTCGAACCTGATTGGGAATTGTACTATGAGAGGTTCATGCAACTTACTTCTCTTGAGCAGTCAGTTGGCAACCGGGTTGGAGTAATAGAACCATTTTTGATGCACATGGCTCATGGGGCTGCAATGCCTGTTCGTGGAAAACCTCAGCGTGCTGGTATCCGCAACAGGTCACCAACACGAGGTTCTGGTGGAAATGCACTTATTAATGAGCAGGCACTTCGAGTTTCTAAGCGCTTTTATGTGGCCTTGATGTTGTCAAGGCTTGCTCAGGAAATTCCTGTCACAGATGTTTGTGAGGCATTCAAAGTTGCAAGAGGTATGATTCAAGCTTTACAGGAAAATGCTGGCAGGTTTGCTTCAATGGTTTCTGTGTTTTGTCAGAGACTTGGTTGGCATGATTTAGAAGGCCTTGTTGCTAAGTTCCAAAACCGAGTCTGTTTTGGAGTTAGAGCAGAGATTGCGGAACTTACATCAATTCCATTTGTCAAGGGTTCACGTGCAAGGGCTCTTTATAAGTCTGGTTTGCGTACTCCTGTTGCCATTGCTGAAGCATCTATTCCTGAAATTGCAAAAGCTCTTTTTGAATCTTCTACTTGGTCTGGCCAAGGTGATTCTGGTTTACGCCGAATGCAATTGGGTATTGCCAAGAAGATAAAAAATGGAGCTCGAAAAATTGTTCTTGAGGAGGCAGAAGCAGCTAGAGTAGCAGCATTCTCAGCTTTCAAGTCACTTGGTGTACAAGTTCCTCAGTTTACTACACCTCTACTCCCAACTATCGATGAACCCCCAACTCGAGATAGCATGGTTTCTGTTGGCAGAGGTCAAGCTAGTGATGATACAAATAACTGCTTCAGTTATGGTTCTCAAAGGGCTTCTACAGAGAGAACTTTAGGGAACGATATGCACCCTGGTTCTTCCATACAAATAACAGAGAGTGCAAGAATAGTGAATAATGCCAACATCGTTGTCCAAGTAGCATCACCTTTCTCCATAGAAACTAAATTAAGCAGCAGAAATGTGGCTGACAAAGGCCCTGTTAATGCATATAATTTCCCAGGAGGGTTTGACAGTTTTCTTGATCAATGGTCTACTGTTAGTGAGTTTTCTTTTGATCTTCATTATGTCAAGAAGTCAATTAAATCATCTTCAACCTATTTCGATATTCTTGGTTTGGCTGTCTGTTGGGAAAATTCACCTGTTTACTACTGCAACTTTCCGAAAGACCTAATGATGGCTGGTAGCAATGACTCCATTGAAATGTGGGACGAACTAACGAGAAGATGGAACAGAGTAATCGAAATTATGCGACAAAACAGTGTCAAAAAAATGACCTGGAATTTAAAGTTCCAGATTCAAGCATTGAAGTATCCCTGTGTTTCTTGTCAACGGCTCTCTAGACTTCATCTTGACTACAAAATGTTGAAGAATGTTGAAGTCCTCGACAACTTGTATGTTTTCCTACAACCAGTTTCTGTCCACAGTGGATTGGACATATGCTTGGTGGCATGGGTTCTCTGGCCTGATGAGGAAAGTAAAACAGTGCCAAATCTTGAGAAGACACGGGCATTGTGTTCTGTTTTGAGGAAATTACTTGTTTCTCAAAATCTCAATGATTTACTCGAAACAATTGAGGGCCCATTGGTAAATGTTCTTGCTGATATGGAACTTTGGGGAATTGGTGCTGACATGGATGCATGTCTCCGTGCGAGGCATATCATAATAAGAAAGCTGAAAGAACTAGAGAAAGAAGCTTATAAATTAGCTGGCAAGAGCTTCTCACTAAATGCAACTGCTGACATCGCTGACGTTCTTTATACACACTTAAAACTGCCAGTTCCAAAAGGTTGTGGGAAAGGAAAATTGCATCCTAGCACTGACAAGCAGTCCTTGGACCATCTAAGGGATCAACATCCAATTATATCTGTAATTAA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| Protein Sequence |
<aaseq>MASGSSRANIDQFFPAKKRRPSSRKDEPPSGSPRGAKGSLEGYLVRSPSTAAAASLDSPRGGGDAAGARRSLSAAMDVDVGHPATAVATDEGDFELKRFAMEFLSLSHYCSVIPSVMGGASNGEAGKQQKRSAIQSFLAPCSNASAKKQRVAHSGDLEALKVVDVGHKTPFREKCGTQYGGPEAWSFTPNTGQKRVGFSTAPGAGETPMSVSTNSLISPGEEFWNAAIEFADGISARAEKGPGRPECDADDKSSCAVALCSKILPRSGNGGSDHENTVGSNETKQMDRSSYKEEPVAANNHHVNSSPLPVKHLDFFHEDEIQVPGLKIEEKGGAVDLSPKSQMKNRENLTHSVDNVNKSTFDMHIDSSATIHDECLSKLTTEGKNHPTRVGDSGSCLTRRDLNQLIYSEDKLLTAYSDHGKPSKDCTNKFASQEMEANTPTSSVPQKDHSKLSSWLPPELCAIYMKKGIPELYPWQVECLLVEGVLEKRNLVYCASTSAGKSFVAEILMLRRILFSGKMAILVLPYVSICAEKAEHLEQLLEPLGRHVRSFYGNQGGGSLPKDTSVAVCTIEKANSLVNKLLEEGRLSELGIIVIDELHMVGDQHRGYLLELMLTKLRYAAGEGNSESSSGEISGSSSGKMDATHGLQIIGMSATMPNVAAVADWLQAALYQTEFRPVPLEEFIKVGNQVFDKDMNVVRVLPKVADLGGKDPDHIVELCNEVVQQGHSVLLFCSSRKGCESTARHVAKFLKVASVGSSDVGSEFPDATFAVEALKRSPSGLDPVLEETLPSGVAYHHAGLTVEEREIVETCYRKGLVRVLAATSTLAAGVNLPARRVIFRQPRIGRDFIDGTRYKQMSGRAGRTGIDTKGESILVCKPEEVKRITGILRSNCTPLESCLSEDKNGMTHAIMEVVAGGIVQTASDIHRYVRCTLLNSTKPFEDVVKSAQDSLRWLCHKRFLEWNNETKIYSTTPLGLAAFGSSLNPEESLVVLDDLSRAREGFVLACDLHLVYLVTPINVDVEPDWELYYERFMQLTSLEQSVGNRVGVIEPFLMHMAHGAAMPVRGKPQRAGIRNRSPTRGSGGNALINEQALRVSKRFYVALMLSRLAQEIPVTDVCEAFKVARGMIQALQENAGRFASMVSVFCQRLGWHDLEGLVAKFQNRVCFGVRAEIAELTSIPFVKGSRARALYKSGLRTPVAIAEASIPEIAKALFESSTWSGQGDSGLRRMQLGIAKKIKNGARKIVLEEAEAARVAAFSAFKSLGVQVPQFTTPLLPTIDEPPTRDSMVSVGRGQASDDTNNCFSYGSQRASTERTLGNDMHPGSSIQITESARIVNNANIVVQVASPFSIETKLSSRNVADKGPVNAYNFPGGFDSFLDQWSTVSEFSFDLHYVKKSIKSSSTYFDILGLAVCWENSPVYYCNFPKDLMMAGSNDSIEMWDELTRRWNRVIEIMRQNSVKKMTWNLKFQIQALKYPCVSCQRLSRLHLDYKMLKNVEVLDNLYVFLQPVSVHSGLDICLVAWVLWPDEESKTVPNLEKTRALCSVLRKLLVSQNLNDLLETIEGPLVNVLADMELWGIGADMDACLRARHIIIRKLKELEKEAYKLAGKSFSLNATADIADVLYTHLKLPVPKGCGKGKLHPSTDKQSLDHLRDQHPIISVIKEHRTLAKLLNGTLGSICSRAQLCSKSQRYIIQGNWLQTSTATGRLSMEEPNLQENWLLVTADYSQIELRLMAHFSKDTALIELLSKPDGDVFTMIASRWTGKAESLICSKERETTKRFIYGILYGMGANSLAEQLECSPEDAAQKIQSFKRFFPGVSSWLHEAVASCRHKGYVETLMGRRRFLSKITAGNSKEKAKAQRQAVNSICQGSAADIIKVAMIKVHSAITNGSTVGATVDSIDVAMQNFSEIRGRCHLILQVHDELVLEVDPCMVAEAVRLLQTVMENSASLLGPSVSFLLLRATLNLYKTGYIASVTESIVENED</aaseq> |
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