Difference between revisions of "BGIOSGA010037"
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Revision as of 15:32, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA010037 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA010037, complete gene. |
| LocusTag |
OS03G0683900 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA010037-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA010037-PA |
| Length |
10756 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:31297432..31308187 |
| Sequence Coding Region |
31308134..31308187,31307942..31308064,31306334..31306574,31304992..31305040,31304460..31304931 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:31297432..31308187 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:31297432..31308187 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGGTGCCGCCCGCCAGCCACCGCCAGGTTCCCCCTCTTCTCCACGCCATGGTGTCCCTGAGGGGATCGAGCGCGAGGGAGATCACCCGCGACGCGCTGCTGCAGAAGGTCTCCGAGGAGCGCCAGCTCCGCAGCCACCTCCGCCGCGCCGCCGCCGCGGCGCTCTCCATCCAGCGTGTTTGGAGAAGATACTCAGTCATAAGAATTGTTTCAGAACAGCTCCATGAAGAGTGGGAAGCATTAATAAACCAGCCTGACATTAATCTGACAAAACAATGGATATCAAGCATGATGCTTAGACCATTTCTTTTCTTCGTTACTCAACCATCAAGCTGGTACAAGGGACAACAGGACAAGACTCTAAACTCAATTTCGGCATGCTTCAAAATCATCTTGAATAGCATAAACTCAATGGATGCAAGCAAAAATTTATGTTCCTTTGCTGTGGGCACGCCAGAAGAAAGGTGTAACCATTCTTGCTGTAAGGATGGAAACATGGTTCAGATTACTGACACTGCTATGAGGTTGGCTGTGTCTTTAACTGATTGCAAAACATGGAAAAAAATTACAAGTGAGGATACTAGAGCTGCTGATGCATCTGTGGAGAGCTTGATTGAATTTATTGGTGCAATCCAGAGTGGTACATATAGTTGTCTTAGGAGATATATAGTAAATCTTGGTTCTCATGCCTTGGAGAAGAAAATTTCTTCAATCTCAACAGATGATCAGTTCCTGATTACTGCTAGTGCAGTCACCATTGCGCTACGACCTTTCCATTCTATGAGAGCAGGGAGGGGTGCTGATCTAAATGGTGCTTCAAAGGAATACTTTACACTTATACTCACAATTCCGGATCTTTGCAAACGCTTGCCACCTCTGTTGTTGCCTGCTATAAAGCACATCTCTATACTACAACCATCCCTAGATATTTTACTGATCTCCAAGGACAAAATATTTGAGGAAATAACTAAATTGGAGAAGTCAGGGGTTTCTAGTGGTGGTTCTGGTACCATTCCCTACTGTGGATGGGCTCTTGGAAATATTGTAACTTTAGCTACAGAGCATGATGATTTATCCAATTCAGGGTGCTTTGTTCAAGGGCTAGATTGTTGCCTATATGTTGATGCAATTAACTGTGTTTCCCAAAGCTTACTGAAATTTTTTGAGGAGAACAAGGAAATGCTTCTTAGTTTTGGTGATAGTGTTGATACATCTTTCATCAAGGAAAATGATACCAGTGACAGCTGCAGCAGAACACTGTTTATGGATCTTCTGAAGCCAATTTACCAGCAGTGGCACCTCAGGAAACTTTTGGTGTTGGCAAAGGAGGATGCTGTGTGCAAGAGGCAAAATAATCATGACCCAGATACGCAGACCCATTCGCGTAGCCTAAAATTGCTGGACATTGTATGCTTTTACTATCACATGCTCCGAATTTTCTCTTTACTGAGTCCATCTATTGGTTCATTACCTATTCTCAACATGCTCTCATTCACCCCTGGATTTCTTGTTGATTTATGGGGGGCATTAGAAATATATATCTTTGGACAAGCAGTCCACAAATTACAAGGACCAAAACATGAAAGAGAATCAGCTACAAGTAGTTCAGGTGAGCATGTATCCTCCATGAGGCAAAGAAGAAATTTCAAGGATACATCAAACAAGTGGTCGAATGTGTTCCAGAAGATTACAGGAAAATCAAATGACGCAGAGGATACAAATTTGGTTGACAATCCTTTAAATTCTGAGCAGAATGGTGAAGCATTAATTTTATGGGATATTGAAGCCATGAGACAAGGATCTGAGTGTATTGGAAAGGATTTAATGCAAATGTTGTATCTGTTTTGTGCTACGTATGGACACCTATTGCTTGTGCTAGATGATATTGAGTTTTACGAGAAGCAGGTTCCTTTTACCCTAGAGCAGCAGCGAAAGATTGCATCTTCACTCAATACGTTCGTATACAGTACTTTCATTCAGAATGGTGGAAGCAGCAGCAAACCACTTATAGATGTGACTGTGAGATGTCTTAATCTACTGTATGAAAGGGACAGCAGACACAAGTTTTGTCCTATTTCTCTGTGGCTGGCACCTGCTAGGAATGGCCGAATTCCAATCGCAGCGGCTGCCAGAGCCCATGATGCAGCATTTGCTACATTGCCAGGAAATCAGTTTTTTGGAATTCCTATCCGGAGCTCTGTACTTACTACAATACCACATGTATATCCATTTGAGGAAAGAGTGCAGATGTTTAGAGAATTTATTGAGTTGGACAAAGCATCCCGAAGAGTTACTGGAGAAGTATCTGGGCCAGGTCCAGGATCTATTGAGATAGTTATTCGTCGAGGTCACATTGTTGAAGATGGATATAGACAGTTGAACTGTCTTGGATCAAAATTGAAGTCTTGCATTCATGTGTCGTTTGTCAGTGAGTGTGGCCTTCCTGAAGCTGGTTTGGACTATGGTGGTCTATCAAAGGAGTTTTTGACGGATCTGTCTAAAGCTGCCTTCAGTCCAGAATATGGGCTTTTTTCACAAGCATCAGCATCTGATAGCAGCTTAATTCCAAGCAATTCTGCTAAACTTTTGGATAATGGCATCGATATGATTGAATTTCTTGGCCGAGTTGTTGGCAAAGCGCTCTATGAAGGAATTCTATTGGACTATTGTTTTTCACCTGTATTTGTGCAGAAACTTCTTGGGCGCTATAGTTTTTTGGATGAACTATCAACTCTTGATTCTGAGCTTTACAGAAGTCTAATGCAACTCAAGCACTATGAAGGGGACGTTGAGGACCTATGTTTGGATTTTACTCTGACTGAAGAGTTGGGTGGTAGAAGAATTGTCCATGAACTGAGGCCTGGTGGTAAAAACATCTCAGTTACAAATGAAAATAAATTGCACTATGTTCATGCTATAGCAGACTACAAGCTCAATCGTCAGATACTGCCTTTTGCAAATGCATTTTACAGAGGACTCGGTGATCTCATTTCACCATCTTGGCTGAGCTTGTTTAATGCTAACGAATTTAATCAGCTGCTTTCAGGCGGATTACAGGATTTTGATGTCGATGATCTTCGGAACAACACCAAGTATACTGGTGGTTATACCGAGTCAAGTCGATCTGTTAAACTCTTCTGGGAGGTTATCAAAGGATTTAAGCCAACAGAACGTTGCATGCTACTGAAGTTTGTGACAAGCTGTTCCCGAGCTCCATTACTTGGATTCAAGTATTTGCAGCCTTCTTTCACAATTCATAAGGTTCCATGTGATGTTACACTTTGGGCTACAATTGGAGGCCAGGACGTGGATCGTCTTCCATCTGCTTCCACGTGCTATAACACACTCAAGCTTCCAACATACAAACGGTCAAGTACGCTGAGGAGCAAACTGCTATACGCGATTAGCTCAAATACTGGGTTTGAACTCTCGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSVPPASHRQVPPLLHAMVSLRGSSAREITRDALLQKVSEERQLRSHLRRAAAAALSIQRVWRRYSVIRIVSEQLHEEWEALINQPDINLTKQWISSMMLRPFLFFVTQPSSWYKGQQDKTLNSISACFKIILNSINSMDASKNLCSFAVGTPEERCNHSCCKDGNMVQITDTAMRLAVSLTDCKTWKKITSEDTRAADASVESLIEFIGAIQSGTYSCLRRYIVNLGSHALEKKISSISTDDQFLITASAVTIALRPFHSMRAGRGADLNGASKEYFTLILTIPDLCKRLPPLLLPAIKHISILQPSLDILLISKDKIFEEITKLEKSGVSSGGSGTIPYCGWALGNIVTLATEHDDLSNSGCFVQGLDCCLYVDAINCVSQSLLKFFEENKEMLLSFGDSVDTSFIKENDTSDSCSRTLFMDLLKPIYQQWHLRKLLVLAKEDAVCKRQNNHDPDTQTHSRSLKLLDIVCFYYHMLRIFSLLSPSIGSLPILNMLSFTPGFLVDLWGALEIYIFGQAVHKLQGPKHERESATSSSGEHVSSMRQRRNFKDTSNKWSNVFQKITGKSNDAEDTNLVDNPLNSEQNGEALILWDIEAMRQGSECIGKDLMQMLYLFCATYGHLLLVLDDIEFYEKQVPFTLEQQRKIASSLNTFVYSTFIQNGGSSSKPLIDVTVRCLNLLYERDSRHKFCPISLWLAPARNGRIPIAAAARAHDAAFATLPGNQFFGIPIRSSVLTTIPHVYPFEERVQMFREFIELDKASRRVTGEVSGPGPGSIEIVIRRGHIVEDGYRQLNCLGSKLKSCIHVSFVSECGLPEAGLDYGGLSKEFLTDLSKAAFSPEYGLFSQASASDSSLIPSNSAKLLDNGIDMIEFLGRVVGKALYEGILLDYCFSPVFVQKLLGRYSFLDELSTLDSELYRSLMQLKHYEGDVEDLCLDFTLTEELGGRRIVHELRPGGKNISVTNENKLHYVHAIADYKLNRQILPFANAFYRGLGDLISPSWLSLFNANEFNQLLSGGLQDFDVDDLRNNTKYTGGYTESSRSVKLFWEVIKGFKPTERCMLLKFVTSCSRAPLLGFKYLQPSFTIHKVPCDVTLWATIGGQDVDRLPSASTCYNTLKLPTYKRSSTLRSKLLYAISSNTGFELS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..54#124..246#1614..1854#3148..3196#3257..3728#4292..5260#5351..5685#6488..6766#6869..7121#7952..8122#8211..8303#8751..8858#10230..10346#10432..10521#10673..10756#ATGTCGGTGCCGCCCGCCAGCCACCGCCAGGTTCCCCCTCTTCTCCACGCCATGGTAGATTCCTCTCCCTCCGCATCGCTCTACCGTGGCTGATTTTTTTTTGTTTTTTTCTGGTTGCTGTAGGTGTCCCTGAGGGGATCGAGCGCGAGGGAGATCACCCGCGACGCGCTGCTGCAGAAGGTCTCCGAGGAGCGCCAGCTCCGCAGCCACCTCCGCCGCGCCGCCGCCGCGGCGCTCTCCATCCAGGTACCTCTCCACCCCTCTCCTCTCCGCGGCCTACCTACCAGCCTCCCGATCTTATCTGGGAATCTCGTCGTTCCTCATGAGATATACTTTTACTTTTACGTTTTATTCTTTTGCGAACTTCGATTAGATCGTGCTGTGCCTTGTTGGTGTGTTAGAAGCAATGCTTTTCTGGAGATTGTGTGGAGATGGATTTGATTTGTTTGAATTAAGTGCGAGGTCATATGAAGATTTTTTTTGGGAGGTTGATGTAATTATTGGTCCACAATGATTACGAATTTAGGATGCGCATATCAATCTGAATGGAAGTGTTGCTGGTGCTAAATTTTGAGAGTTGGTTTAAGCATGGGTGAGAGGTCTGACAGGTAGAGAATATTGAGAAACCCATAATTGCTCAGTGCCTTTCTAGATATTTCATTAACAAAGTCCTGCAAAGATACTGAGAAGCTTATAATTAGTTTTTGCATAAATAATATCAGCAGCTAACCAAGTCTGCGAACCACCTTATGTGGCCATTTCAAAAAGAAGTCCACAGAGTCATTAGGCATGTGGCTGTTGTTCATATGTGGGTATGAGAAACACAAAAATGATGGATGGTTAAAACATAAAAGTAGGATAGAAGTCTTCATGATCCTCTTGTTGCTCGATGTGGTTAGATTGGCAGGATGGTTTTGGTGCTACAGTTGTCTGTGAGGTGGAGAAATCATGGATGGCTACTAGAGTACTAGACAGGTTGATAAGTTGATTAGTGGCTTGATATGTAATATATTTAACGATTTTGTGTTTGCACGAATTTGCTACATTAGGGTAAGACTTTCAATTTGATGCAAACTTGTGAGGAGTTTGTGATAATCCTGTCTTTGTAGGTAGCCTTAACACACAATAGATGTGCAGATGGTCAAATCAAATGGATTAATTTATTGCAGGTTCAACATTTAAAATTAGGTTTATATGTGATTTTCCCTCAGTGCAAACAGCACCGGGAGTTCTCTGACAAGAAACTTGATGCCCTTGCAAGCTGCTGGAGTACTTAAAATATGTCTTGATTATTAACATGTTTGGAGATCAGTTAGTCGATTGTTATCTCCTTTCTCTTTATAGACACAACCTCAGACAGTAGAATTTTTTTAGGATCATGCTAATCCACTATGTTTCTTTTTCCTGTGTGTGGGTCGTTCTTCTGACCATTAAGCTTGATGCAGAAATTGTTATTTTTATCATGGGAAATATACATCCAAAGTAGACATAAAGGCCCTCTCAGTGCTCTTGTATATGATCTAGATTTCTGCTGTACTTCTTTCAAACTACTCTACTGTTGCACTTGTACACTTATACAATTGATGCTTTTGTTTTTTGCTTTGTTATGCCAGCGTGTTTGGAGAAGATACTCAGTCATAAGAATTGTTTCAGAACAGCTCCATGAAGAGTGGGAAGCATTAATAAACCAGCCTGACATTAATCTGACAAAACAATGGATATCAAGCATGATGCTTAGACCATTTCTTTTCTTCGTTACTCAACCATCAAGCTGGTACAAGGGACAACAGGACAAGACTCTAAACTCAATTTCGGCATGCTTCAAAATCATCTTGAATAGCATAAACTCAATGGGTATGCCTTTTTCATAATCAAAGTTTGACTTTACCGACTTCCATCTTGACCTTTTTGTACTTTATTTTCTCCTCCTTAATGAAATGACACGTAGCTCTCCTGTGTAGTTTGAAAAAAAATGTTTTACTTTACCCATTCCACTAGTTGTGGTTAACTCCTATAAAAATTTATTTATGTAATACTTCCTTTTGCTGTAAGGATTATAATCCTTTATATTATTCAATCCTTGTATGGCGATGACCTAATTGTTAGTTCTAGAATGGAATTATGTACTTAACCGAAAAGAAATTGCAGTCGACGTGAGATAAGCAGATACTCCCTCCGTCCCTAAATATAAGGGATTTTGGTTGGATGTGATGTATCCTAGTACTACGAATCTGGACAGAGACTTTAATATATATCATATATTTAGTACTAGGATACATCATATCCAACCAAAATTCCCTATATTTAGGGACGGAGGTAGTATTTGTTTTGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAGTACTGTTTGGTTGAGCAGTGCAATATGGAAGGAATATTACAGTAACTTTTTTCTTGAGGCTCTTGATCCACTGAGCTGGCACAAATGGGTAGTCTCTTCTCGGTGAGATTTTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGTGGAATGTATCTGTTTCAAGAAAAAAGAAGTTCTTTGAATTTGAATGTAAAGTGCATGCTATGCTTTGATAGACAAGAAGTATGAAGTGGGTCTACGATATGTAACCTTGTTTAATAATGGACAGATGCATGCTAAGCTACAGAGAGAAGCTCCCAACCAGCTGGCCTCCATGTTTAAAGATAATACAAATATTACCACATAACTAGTTTAGAATGCATAGGTCCATAACTGTCCTTCAATTATCATTTGGTAGATGAGGTTAAACACAAAAAGCATGAACTATCTTGGAGAGCTAGCTTTCCTTTAACCATTACAGTAACAATAAGAACAGCCTTTAGTCCCAAGCAATTTGGGGTAGGCTAGACAGGAAATCCAAGTCAAACCACATGAAACACAAGAAAAAAGGAAAAAAAAACTACTTAAACCACAAAAAGTGATTTTCTAGGCCATAGTTCTGGCACATGGATAGCTACTTTCCACAAACTCTTATCCAATGCCAAATCTTTCGATACATTCCAAGCCTTCAAGTCTCTTTTAATTCCTTCATCCCATGTCAGTTGTGGCAGGTCATGCTTTGATTTAACCATTGCACCTTCCTTTTCAACTGACATGTATCTTTCCTCTGTAGATGCAAGCAAAAATTTATGTTCCTTTGCTGTGGGCACGCCAGAAGAAAGGTCTATTTGGCTTTATCAGGCAAAAAAGTTGATTTCACTGTGCTCATTCATTCTTGCCAGGTGTAACCATTCTTGCTGTAAGGATGGAAACATGGTTCAGATTACTGACACTGCTATGAGGTTGGCTGTGTCTTTAACTGATTGCAAAACATGGAAAAAAATTACAAGTGAGGATACTAGAGCTGCTGATGCATCTGTGGAGAGCTTGATTGAATTTATTGGTGCAATCCAGAGTGGTACATATAGTTGTCTTAGGAGATATATAGTAAATCTTGGTTCTCATGCCTTGGAGAAGAAAATTTCTTCAATCTCAACAGATGATCAGTTCCTGATTACTGCTAGTGCAGTCACCATTGCGCTACGACCTTTCCATTCTATGAGAGCAGGGAGGGGTGCTGATCTAAATGGTGCTTCAAAGGAATACTTTACACTTATACTCACAATTCCGGATCTTTGCAAACGCTTGCCACCTCTGTTGTTGCCTGCTATAAAGCACATCTCTATACTACAACCATCCCTAGATATTTTACTGGTAAGAGTTTCAAGATTTTGATATGGACAAGTCACTCTATTGCATTTTGTATAGTATAGCATTTAGCTGCCGTGGAAGCCTTGACTCTCCTAGAAGTCATAGGTTCAACAGTTCTTTTGCTGCTAACATGATAATTGCACACTATAGTTGATCTACTGATTTTCAAATAATAATTAATTTGTTAATAGCAGGTATTTATTAGGTTTATTGATGTACCATCATAGGAGATTGATTCTAGCCCCCATTTTTGTTTGAAACTTTTTTTGGGTCGCTGGTTCAGTGGTAAATGAATTTGTGCTACATCATGAATGATATATTATATCTTGTTGTAAGGCCTAGAACTTCTACAGACTAAATATATCCTTTTGGCAGATATAAAACAAGTTCTTTTTAGAGGAATATAAAACAAGTTGATTCCATGGTATTTTTGGATTTTGAGTGAACGCCAACATGCTTAATAGGGGCCAACAATTTGATTTAATAATTTTAGGTGCCATGCTATTTTTTAAAATATTGACATATTGTGAGTGCGAAACTGATCAAGGCATGGCAGGTGGTAGCAGATCTCCAAGGACAAAATATTTGAGGAAATAACTAAATTGGAGAAGTCAGGGGTTTCTAGTGGTGGTTCTGGTACCATTCCCTACTGTGGATGGGCTCTTGGAAATATTGTAACTTTAGCTACAGAGCATGATGATTTATCCAATTCAGGGTGCTTTGTTCAAGGGCTAGATTGTTGCCTATATGTTGATGCAATTAACTGTGTTTCCCAAAGCTTACTGAAATTTTTTGAGGAGAACAAGGAAATGCTTCTTAGTTTTGGTGATAGTGTTGATACATCTTTCATCAAGGAAAATGATACCAGTGACAGCTGCAGCAGAACACTGTTTATGGATCTTCTGAAGCCAATTTACCAGCAGTGGCACCTCAGGAAACTTTTGGTGTTGGCAAAGGAGGATGCTGTGTGCAAGAGGCAAAATAATCATGACCCAGATACGCAGACCCATTCGCGTAGCCTAAAATTGCTGGACATTGTATGCTTTTACTATCACATGCTCCGAATTTTCTCTTTACTGAGTCCATCTATTGGTTCA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