Difference between revisions of "BGIOSGA010887"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA010887

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA010887, complete gene.

LocusTag

OsI_11234

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA010887-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA010887-PA

Length

11215

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:11997501..12008715

Sequence Coding Region

12008360..12008715,12007449..12007600,12006595..12006704,12006438..12006515,12006243..12006349
,12005258..12005301,12004819..12004943,12004534..12004724,12004303..12004378
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Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:11997501..12008715 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCTCTTAGAAAACACCAACCTTCTGGTAATGCGGCCTCCATTAGTATGGTGCCCCTGGATTTTCCAAGTCAGGAACTTGAGAAGGTTAATTCTGTCAATCCAGTGGTAGCAACAGATGTTCCACCTGAGGCTGATGTTGATGTTGATATGAGGGAAGTTTACTTTCTCATCATGCATTTTTTATCACATGGTCCATTTAAGCGGACTGTTGGAGAACTCTGCAATGAGCTCCTTGAACATCAGCTGCTACCTAGAAGATATCATGCTTGGTATTCACGAGGTGGTTTTCATAGCGGTGAAGAAAATGATGATGGCATATCACTCCCTTTGGGATACCTAAAGTTAGTTGAGAGATACCCCCACATTGGTAAAGACCACTTGGTAAAGCTTTTAAAGCAGCTGATTTTTAGTTCTTGCCACCCACATGGCTTGGTTGGAGGGGTTTCTCCAAATGCTGCTGATGTCCCAACGCTTCTTGGATCAAGTTCCTTCTCCCTTCTTGCATCTACTTTTGATCGAACGGGACGTTATGTTATTACTGGTTCTGATGATCGCCTTGTTAAAATTTGGGCAATGGAAACAGCATTTTGTCTGGCTAGCTGCCGAGGTCATGAAGGTGATATTACTGACCTCGCAGTGAGTTCCAATAATGCTGTGGTAGCATCTTCATCCAATGATTTCATTATTAGAGTTTGGCGTATACCTGATGGCCTGCCTATCTCAGTGCTGAAGGGGCATACAGGGGTTGTAACCGCCATTGCATTTAGTCCAAGGCCCGGTGCTGCTTTCCAGCTGTTGTCATCTCATAAGTGCGATTTTCATACCATGAAGAATGCTTATGCATGCAAGGGTGGTGATGCATCTTCTAGTGCTGTTCAAGTTCAACCAACGAATCACCAAATCTTATGTTGTGCGTTCAATGCGAATGGAACTGTATTTGTTACTGGTAGCTCAGACACCTTTGCAAGGGTATGGAATGCTTGCAAGAGTTCTTCTGAGGAACATGACCAGCCGAATCATGAGATGGATCTATTGTCTGGCCATGAAAATGATGTAAACTATGTGCAGTTTAGTGGATGTGCGGTGGCTTCTAGGTCCTTTTCAGTTGACACCACTCACACCATTAAGGAAGAAAATAATCTTAAGCTAAGAAACTCCTGGTTCACACATAATATTGTCACCTGCTCCCGTGATGGCAGTGCAATTATCTGGGTTCCACGATCTCGGAGATCACATGGAAAGGTTGGACGTTGGACACGAGCTTACCATCTTAAAGTTCCTCCACCTCCAATGGCTCCTCAACCACCTCGCGGTGGTCCACGTCAAAGATACCAGCCTACTCCTCGTGGTGTTAATATGATTGTTTGGAGTTTGGATAACCGCTTTGTGCTTGCTGCTATCATGGATTGCAGAATTTGTGTTTGGAATGCTTCTGATGGGAGCTTGGTACATTCATTGATTGGGCATAAAGAATCAACATTTGTTCTTGATGTGCATCCATTCAACCCCCGTATAGCTATGAGTGCTGGGTATGATGGAAAGACAATCATATGGGATATTTGGGAAGGGAAGCCTGTACAGATATATGAAACTGGGCATTTCAAGTTAGTTGATGGGAAGTTCTCACCGGATGGGACATCACTGATTCTCTCCGATGAAATTGGACAAATATTCATTATTGGTACAGGGCAGGGAGAGTCGCAGAAGGATGCGAAATATGATCAGTTCTTCCTTGGAGACTACCGGCCTCTTATCCAAGACACGAATGGAAATGTTATTGATCAGGAAACACAGCTTGCACCTTATAGGAGAAATATGCAAGACCTTCTGTGTGACTCTGGTATGATACCCTATCCAGAGCCCTTCCAGAGTATGTACCAGAAACGACGGTTAGGTACCCTGGGTATTGAGTGGCGACCTCCCTCCGTGAATTTTGCTGTCGGTCCCACTTACAATGCAACCACTGGTGAATATCAAATCATCCCAGTTATTGATCCAGATAGGTGGGAACCACTTCCAGAGATAACAGACTTCATTGAGCTTGAACCAGAAAATGAGGTTATTTCAGATGATACTGATTCTGAGTACGATGGCCTGGATGAGCATTCTAGTGAAGGGGAACATGAGGCTTTGAATGGTGATTCATCTGGTGCTTCGTACTCAAGTGGAGAAATTGATGGGGATAACCTTACTGATAGCGCTCTCCGCAGATCGAGAAGAAAAAAGAAAAAATCAGATGTAAGAGGCAACAATCGTGATCATTCCTTCCTCTTTTATGCCACCTTCTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MALRKHQPSGNAASISMVPLDFPSQELEKVNSVNPVVATDVPPEADVDVDMREVYFLIMHFLSHGPFKRTVGELCNELLEHQLLPRRYHAWYSRGGFHSGEENDDGISLPLGYLKLVERYPHIGKDHLVKLLKQLIFSSCHPHGLVGGVSPNAADVPTLLGSSSFSLLASTFDRTGRYVITGSDDRLVKIWAMETAFCLASCRGHEGDITDLAVSSNNAVVASSSNDFIIRVWRIPDGLPISVLKGHTGVVTAIAFSPRPGAAFQLLSSHKCDFHTMKNAYACKGGDASSSAVQVQPTNHQILCCAFNANGTVFVTGSSDTFARVWNACKSSSEEHDQPNHEMDLLSGHENDVNYVQFSGCAVASRSFSVDTTHTIKEENNLKLRNSWFTHNIVTCSRDGSAIIWVPRSRRSHGKVGRWTRAYHLKVPPPPMAPQPPRGGPRQRYQPTPRGVNMIVWSLDNRFVLAAIMDCRICVWNASDGSLVHSLIGHKESTFVLDVHPFNPRIAMSAGYDGKTIIWDIWEGKPVQIYETGHFKLVDGKFSPDGTSLILSDEIGQIFIIGTGQGESQKDAKYDQFFLGDYRPLIQDTNGNVIDQETQLAPYRRNMQDLLCDSGMIPYPEPFQSMYQKRRLGTLGIEWRPPSVNFAVGPTYNATTGEYQIIPVIDPDRWEPLPEITDFIELEPENEVISDDTDSEYDGLDEHSSEGEHEALNGDSSGASYSSGEIDGDNLTDSALRRSRRKKKKSDVRGNNRDHSFLFYATF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..356#1116..1267#2012..2121#2201..2278#2367..2473#3415..3458#3773..3897#3992..4182#4338..4413#4816..4984#6811..6881#7826..7906#7980..8050#9399..9495#9891..9950#10622..10676#10767..11215#ATGGCTCTTAGAAAACACCAACCTTCTGGTAATGCGGCCTCCATTAGTATGGTGCCCCTGGATTTTCCAAGTCAGGAACTTGAGAAGGTTAATTCTGTCAATCCAGTGGTAGCAACAGATGTTCCACCTGAGGCTGATGTTGATGTTGATATGAGGGAAGTTTACTTTCTCATCATGCATTTTTTATCACATGGTCCATTTAAGCGGACTGTTGGAGAACTCTGCAATGAGCTCCTTGAACATCAGCTGCTACCTAGAAGATATCATGCTTGGTATTCACGAGGTGGTTTTCATAGCGGTGAAGAAAATGATGATGGCATATCACTCCCTTTGGGATACCTAAAGTTAGTTGAGAGGTAACTATTTATCCGTTCATTCCAATGTTGGTTCTGAAAGATCATCAGGATGTTGAGGTCTGGAATTCAAAGTGAAAATTTCCAGACCAGTTTTGTGCTATTATATTAATTATTGTTAATTAAGGATTTTTATGACGCAAGAAACTAGAGGTTCATTCTGCTCGGAGCACATAAAAATAATATTATGCCTGTAGTGAACTGGAGATGCTTCTCAGTTTCTTAGAGTAAAATTGGGAAACAATTGAAAAATATCTGGTATTGTATCCATCTGTCTTCTCCTGTGGAGTTCATACTTCATCACTCTTCCCTGGTGTGCTAGTCTAGATTCTAGAGCTGATGAATCATACTATTTCTGAAACGTCAGATTTTTTGTAATGGTATTACATATATAACATTTCACAATGGGAGTGAACAGAAAGAATACTAGTATGTTTTTCAGTGTTTGTGTAACTTACCTAGAGTTGATTAAACTTTATGTTCTCAAACCTGTATTCTGCAAAGGTTGCATTGTATAACATAGAAGGTGAACATACAACGTTTTCGTATTTTTGGGACAAATATTGAACTGATGAAGCTTTATGTTTCTTAAACTGCTGCTAGTTTGTTAATGTGTTAGGATATAATTTGAGCATAACAGATGAACAAACACATACAACTGTCCCTTGCCGTGGCAGACCAGTTATTATCTGCTTTATTTTCTCAATGATCACATGACACTGAGCATTTCACATACTTTTGTTTATGCTGCTCATTTTGTAGATACCCCCACATTGGTAAAGACCACTTGGTAAAGCTTTTAAAGCAGCTGATTTTTAGTTCTTGCCACCCACATGGCTTGGTTGGAGGGGTTTCTCCAAATGCTGCTGATGTCCCAACGCTTCTTGGATCAAGTTCCTTCTCCCTTCTTGCATGTATGTACACTATGTTCTTCTAGTCCCGATGAGCTGTTTATAATTTCATTTCTACCCAACCTTGTGTTCCTAGTTTCGCTAGTTTGATTTATGTTATGTACATTTTCGCTGTTATAATTGCTATGTGCTGAACTGCTTATGAGAAATCTTGGATCCTTCAGCTGATACAAGCAGGCAAGAAAAGGAAAATCCCAAGCTGTTGCGTTATCTCCGTTGGCCACACATACAAGCCGATCAAGTTCGCGGTTTAAGTCTGAGAGAGATTGGCGGTTTCACTAAACATCGCCGAGCTCCGTCTGTACGCGCGTCATGCTATGCCATTGCGAAGCCATCGACCCTTGTTGAAAAGATGCAGATTATAAAGAGATTAAGGGGACATCAAAATGCTGTGTATTGTGGTCTGTTGGTCTTTCTTTTTTCTTAACACATAATGCTTGAATAAGTTATTTGAATATTTTTCCGTGGATACATCATTCCATGGTTGTTGTTTTGAGTATCTACAGTGACCATATGCGCCATACTGCCACGGTCTATTCAGCAAAATGGTTACTGATATTAACTTTACAATTTGCTAAATTATGCAACATTACTAAAGGACTTATCCCTATATCTTCAACAAATGTAGCTACTGCCTTGTCCTTTTGTTAATTTGTTCTAGACCATCATACCTTGTTGTTTTTTACATTTTCTCTCTTTTATCTGCTCTATTGTTTTTTCAGACTGAGATTGTTTCTGTTTCTGCAGCTACTTTTGATCGAACGGGACGTTATGTTATTACTGGTTCTGATGATCGCCTTGTTAAAATTTGGGCAATGGAAACAGCATTTTGTCTGGCTAGCTGCCGAGGTCATGAAGTAAGTTTTGCTTATTGTAACATAATAACATTTACAACCTTTCATCAGAAAACTTACTGCCCTTTTTTTTCGAATTAAGGGTGATATTACTGACCTCGCAGTGAGTTCCAATAATGCTGTGGTAGCATCTTCATCCAATGATTTCATTATTAGAGTTGTAAGTTCATTGTATGCTTTCTCAATAACTGTGATAATATCTTTCTTCCTTTCCTGTTAATGACTCTGTTTACTACTCACTAATGTAGTGGCGTATACCTGATGGCCTGCCTATCTCAGTGCTGAAGGGGCATACAGGGGTTGTAACCGCCATTGCATTTAGTCCAAGGCCCGGTGCTGCTTTCCAGCTGTTGTCGTGAGTGCTCGTATCTTTCTGAATACTTTATTCTATAGTATTTTCATAAAAGCATAAACTGAAAGGATAAACTTGTCATCAGTCTATGGTATACAATTCGGTGTTCAATCTGCTTTAGGCTGTGTTCGTTGCTCTTTGTTCCCAACCCCTCTTCCTCGTATTCCACGTGCACGCTTTTCAAACTGCTAAACTTTACTTTTTTTTGCAAAAAAGTTTCTATATGAAAATTGCTAAAAAAAATCATATTGATCCATTTTTGAAAAAAAATTAGCTAATACTTAATTAATCACGTGCTAATGGACCGCTCCGTTTTCCGTGCGGAGGGAATGAGTTCCCAAGCCAGAGAAACGAATGTAGCCTTAGCCAAACCTGAAGCTTGTCTGAGACACCAAACTACTTATGTACACACTAAAAGGAAACTGCAGAGATATATCTGTAAGTTGTTTACTACTCCCTCCGTTTCAGGTTATAAGACGTTTTGACTTTGGTCAAAGTCAAACTACTCTAAGTTTGACTAATTTTGTAGAAAAAAGTAGTAATTTTAACCCAAGACTAATATATTATGAAAATTTATTCAATTATTGATTTAATGAAACTATGCTGGTGTTGTAAATATTACTACTTTTTTCCATAGAGTTAGTCAAACTTAAAGTAGTTGGACTTTAACCAAAGTCAAAACGTCTTATAACCTGAAACGGAGGGAGTATATCACAGGCGATATATGAAGACTTATCTATTCCAGAGTATGTGAGTGAACTTAATTTGTTCAGTCCTACTTATTTGTGCACATAGCAATTAAAGTTACTAATACCTATGTGAATTATGTAACTGTTCTAGTGGACACTAGTATGCCATTTCCTAATAAAGGAAATGGTACACCCCATGGTGTATCATGTGATTTTTCTTTAATGTAAATGTAACTTTCTTTTTGAACGCTGCAGATCTCATAAGTGCGATTTTCATACCATGAAGAATGCTTATGCATGTCAGATTTATTACAATATGTTTATTCCATATATATTCTTGTGATATAGCCTTATCTTGTTTGCTGTATGTACCCTTGATCTTGCAATTTGTTATTTGCTTGCTATTTTTCTCTCAATTTTGTACACAATATTGGTGTGCAGATCATCAGATGATGGGACATGCAGGATTTGGGATGCCAGACAATCTCAACAATCTCCACGTATATATATACCAAAACCTCCAGATGTTGCCCCTGGTTAGTTTATTGAAGCATGTCCATTGCATGGGTAATGCCTATATCTAGTTAATTCAATCATGTGGTGTTTATGCCAGGCAAGGGTGGTGATGCATCTTCTAGTGCTGTTCAAGTTCAACCAACGAATCACCAAATCTTATGTTGTGCGTTCAATGCGAATGGAACTGTATTTGTTACTGGTAGCTCAGACACCTTTGCAAGGGTATATTATTTATTTTGTTGTCGTCCACTAGTGAACTACTGATTTTAAAATCAATAGGTGAATTGCCCTTTTTCATTAGAAATGTTGATTGCAGGTATGGAATGCTTGCAAGAGTTCTTCTGAGGAACATGACCAGCCGAATCATGAGATGGATCTATTGTCTGGCCATGAAAATGATGTAAACTATGTGCAGTTTAGTGGATGTGCGGTGGCTTCTAGGTCCTTTTCAGTTGACACCACTCACACCATTAAGGAAGAAAATAATCTTAAGCTAAGAAACTCCTGGTCAGTATTTTACTCTTATTTATGGTCTGCTTGTTCCTTATACATGTTTATTGTGTTAATGTCTTTAGCTCCTTCAGTTATCTTACCTATTGTGCAAATTGTGCCTTTTTGGTTTCAACGGTTTCACTTCAGCTGAAATTTTCTGCTTTTGCTAGGTTCACACATAATATTGTCACCTGCTCCCGTGATGGCAGTGCAATTATCTGGGTTCCACGATCTCGGAGATCACATGTAAGCTCATGTGATCTAGATCTCTTGATTTCGCTCCTGAAAAAGTGTTTTTAGATTAACAGTTATATTGTGATTTGCATAACTGCCTGTTCTGTCCATTGCTACGGTATATGAAACGCTTGCTGAATAATTGCCCATTTTGTTTTCTTATGCGATCACCGTGTATTTTTATTGTTTCACATGATGAATTGCTAGTGTTAGAGGTTGTTTAGTAAGGGTTGGCCAGTGTACAATCTACCTGCCTTAGCAACCAACTGTAATATTGTACCACACATACTGGGTAAGGCACGTTTATTGGTTGCTAATCTGTACTGTGGAAATGCAGACATCTTTAGTGCTCTTTCTCTATACTTCCATTCAAAAATATTTTTTTTTCATGACATGTT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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA010887