Difference between revisions of "BGIOSGA011065"
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Revision as of 15:37, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA011065 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA011065, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_10837 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA011065-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA011065-PA |
| Length |
14207 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:9088239..9102445 |
| Sequence Coding Region |
9102393..9102445,9102167..9102380),complement(9100777..9100840,9100492..9100596),complement(9099858..9100057 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:9088239..9102445 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:9088239..9102445 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGCGGATCTGCTGATCCCGAGGCGCCGACGCCGACGCCGTCGCCGTCCCCTTCCCCGGCGAAGGCGACTCCTTCGCCTGCTTCCGCGGACGGGAATCGGTTGCGGCGGTGCGTTCAGTCGAAGCTCTCGTGGGGACCTCCCAAGGCGGGCGGAGGCGGAGGAGAAGCAGGAGGTGCCGGTCTCCCTCCCCTGGCCGCGGGCGATGGGGCGCCGGAGAAGGTGAAAAAGAGAGGAAGGCCGCGGAAATCAGAGGCCGGCAAGAAGCCGTCTTCAAACAGAGAGACAACTGGTCTGGAGCAAGATAGTAAGGATGAAGTGATTTTGGTTGATGAAAGCCCTCAGAAAAAACAGAGGAAAGGCAGGGGTAAGAATCAGGGTGCAGCACTGAAGGTTCCGAACCGAAAGCACTGCAAAGCATTGGAATCTACTGTTGGTCATGAAAGTTGTCAGCAACTACGCAGCAGTCAGACTCAAGCTGTCTTGCCTCAAAAATCACCCACATCAGTTGATATTGATTCGGTGACCGGCCCATCTGAAGCAAGTCCGGTTAATGATAATGTTGATGCACTAGACAATGAAGATAAGCCACAGTTGATAGTTGATCTAAGGTCAGAGGCAAATATAGCTGCAGAGGAAAATCGGAGGTTATCATCTGGAAAGAAAATGCATCCATTTTTTGCTTCTCGGAAAATACACAAAGGTGCTGGCCAAGATATTCTTAATGTTGAGGATGAGGATATGGATTCACTTTGTGCTTTTGAAAGAGACCCACCTTTATGTCCTGTTCATGTTTTGTACGAACTGGAGGTCACTATGCCAATTCACTGGAGTAACAAATGGCTAATTGCCGACAAATCTTTTCTTGGCACTAGTACCACTGAGCAGAATTCTGCAGAGCATGCAGATCCAGGAAAACATTTGGCTAACTTTCATGACAAACAAAACAAAAGCAAGTTTTCTTCTCAGGATGTGATTGATGTTGATGATGAGTGCCTGTTAGCATCTAGTTCCTGTTTCCATGCCTCTCTTTTTGAAAGCAAACAACACGAAAGGGTACAGCATGAATTGCCTGAAGTCACTCCGAAAGGCTGTCAGACAGCTAACCTATGGACTGACAAGTACCGGCCTGAAACTGCTGCACAGGTTTGTGGTAATTCCGAGCATGTAAAATTCCTCAATGAGTGGCTTAAAGGGTGGGATGAAAGAGGTCACAGAAATAAACAGAATATAGTTACTAACGGGAGCATGAATGGTAGATCCTGTCAAGATGGTTCTGATACAGATTATTCAGAAGATGCTTCTGATTATGAGAATGTGCTTCTAATTACTGGACCAGTTGGGTGTGGAAAATCAGCCGCAGTTTTTGCATGTGCGAGAGAACAAGGATTCAATGTAATTGAGGTAAATACATCCGATATGAGAAATGGGGCTTATGTAAGGCAGAAGTTCGAGGAAGCAACTAAATCACATGGTCTAGAAAAATGGTCACAAGAGGAGATCATCGGTTTACCAATAAGCAATTCCTTAGATCCAGCTTCAGGGACTCCTGGCACGGCTGAATACAAACAAGTCATTAACAAGACCCTCATCCTATTTGAAGATGTAGATACTGTTTTTGATGAGGACCGTGGATTTATTTCAACTATACTTAAGATGGTGGAGACTACAAAATGGCCAATCATACTGACCAGTAACAAGAAAGATCCGCCATTGCCTCATCTCTTGGCTCAGCTAGTATTGGATTTCACATACCCATCATCTGCAGAGTTACTTTCACATGTCGACATGATATGCAAGTCTGAAGGAGTAGAAATCACTGTTCCTCAACAGAAGCATATAATTGATGCCTTTTTAGGTGATATTAGGAGAACAATGATGCTTTTACAGTTTTGGTATCAAGGCAAGCAGCAATACTCAGGGAGGTTGAATAAGTGCCTGTCCTGCCCTTCTCTACTTGATTTGGATGCAGTACATTCTACTGTACCAAGAATAATGCCTTGGGACTTCCCTTGTAAATTATCAGAAACAATATACATGGAAATAGACAAAACAATCGTGACAGCTGAACAAAAGAAAAAACAGATGGAAGTATCAGAATTTGAAGGCCTCGAATTACAAATAATGACACCTTTGACCAAGGGAAGAAGTGCTGGTAAAACAAGAAAACCTAAGAAATCCAAGTTAAAGCATGGCCGCTCTGCTGATTGTAATGATGCTTCACCTTGTAAGAATGACCTTGACGATTTCCATGATAGTCCAGATATCCCTCTTCCATCCAATCATCAAAGAATGAGAAATAGGCGTGGAGTAGTTTTGTTTGCTGAGTCTGATGATGATCTAGCTGATGCACATGCTGCCAAAGATGCCACATTTACTGTTCAAGAAGGTAGATTGCTCCCACAATCTTCAGAGCTGCCCTGTTTATATGGCCATGGGATTTCCAACATTGTTCCAGAAAGTGTTTTCTTCCAACAATCATCTGTGCCTCATTTACATAGGGAAGTGATTTCAAATCAATTATGCTTTCCTAGCGAATCAAGGGCCTTTGAACCTGCCAGTTCTTTCCAAAACCAGCTTGAAAGCAACATGCCCGGGTCCATTTCACAAATATGTGATACCTTTATGTCTCAGGGCATTTCATGTGTGCCTGAGTCATCGTTCATGGTTGGGGGGACATCTGCATCAATCAGCAGTGATGATCTTTTATCAAGTCTAGTGTCCAATGGTTTGTCTGCCCTTCGTAATGAGAGTACTTACACTGCATCTGTAGTGGCACTAGAAGACACTAACAAGGTGGAGAATCAAATGACTGATGAACCTCAAAAATGCATGGAAGATGAAGTTGGTGAGACTTGTGAGGCTTATGTGGAATTGGCTGACAGGAATGATCATGCAAGCTGTTCAATTACAGGATATCAATTGATGGATGAATGCAGTCGTGCTGAAAGTGTTTGGTTGCTTTCAGGGAAAAAAAACAATGACTCCTGCAAGGTCGAACATGTACAAGATACTTGGAACAGGCTACGGCGGTGCCATCCTGTACTTCCATGTGACATGAATCACAACAGATCAGTTTCTGGAGCTTTGAAGCGTGTTTCAAGAGTGTCTGATTTAATATCAGAATCAGATCTTATGCTCATTAGCTGCCACCCTTTTAGTAATGATATTTCAGATCCATCTTTGACTCCTTACACTGAGTCTGATGGCTTCTCGTACAGCAAGCAGCTTGAGATGGGATCTATCTATGCTCAGCATGGTCTTTGCATTTTTCTACAGGATTCCCAAGCTACAGATGATGGTTTTGTTGATTTGTTACAAGAGTTGTTATTTAGCGGTACAACTACCACATCTTTGGGTAAATTTGTTAGCTCTGGAATCAGCTGTGGTGATGGATCTGGGAACATTTCCCATGTAAAATACCCAACAAGTTGTATTTCTAAGAGAAGGGAGCGACAAGCTCGTCTTCGTGAAGTCCTGCTTCCGGTAGTTCCTCCTAAGCTATCTCAGTCACTGAGAGGTCCTGCTTTTGTTGATTATTTGTCTTCGATGAGTCAGATTTCACAGTTGGAAAATATGCAACTCTCTGAATGTAAAGCCTCAAGCAAGCAAAGAAGGTGTCGTCAGCCGAGGCATTACTTGAGTTCTGGTGCACTTTCACTGTCTGCTGAAGATATTGGATTATTAGCACAGTGCAGCACTTTCAGCGACAGACGGGAGAGCGAGACGATTATAGAGCAAGCGATTTCCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGGSADPEAPTPTPSPSPSPAKATPSPASADGNRLRRCVQSKLSWGPPKAGGGGGEAGGAGLPPLAAGDGAPEKVKKRGRPRKSEAGKKPSSNRETTGLEQDSKDEVILVDESPQKKQRKGRGKNQGAALKVPNRKHCKALESTVGHESCQQLRSSQTQAVLPQKSPTSVDIDSVTGPSEASPVNDNVDALDNEDKPQLIVDLRSEANIAAEENRRLSSGKKMHPFFASRKIHKGAGQDILNVEDEDMDSLCAFERDPPLCPVHVLYELEVTMPIHWSNKWLIADKSFLGTSTTEQNSAEHADPGKHLANFHDKQNKSKFSSQDVIDVDDECLLASSSCFHASLFESKQHERVQHELPEVTPKGCQTANLWTDKYRPETAAQVCGNSEHVKFLNEWLKGWDERGHRNKQNIVTNGSMNGRSCQDGSDTDYSEDASDYENVLLITGPVGCGKSAAVFACAREQGFNVIEVNTSDMRNGAYVRQKFEEATKSHGLEKWSQEEIIGLPISNSLDPASGTPGTAEYKQVINKTLILFEDVDTVFDEDRGFISTILKMVETTKWPIILTSNKKDPPLPHLLAQLVLDFTYPSSAELLSHVDMICKSEGVEITVPQQKHIIDAFLGDIRRTMMLLQFWYQGKQQYSGRLNKCLSCPSLLDLDAVHSTVPRIMPWDFPCKLSETIYMEIDKTIVTAEQKKKQMEVSEFEGLELQIMTPLTKGRSAGKTRKPKKSKLKHGRSADCNDASPCKNDLDDFHDSPDIPLPSNHQRMRNRRGVVLFAESDDDLADAHAAKDATFTVQEGRLLPQSSELPCLYGHGISNIVPESVFFQQSSVPHLHREVISNQLCFPSESRAFEPASSFQNQLESNMPGSISQICDTFMSQGISCVPESSFMVGGTSASISSDDLLSSLVSNGLSALRNESTYTASVVALEDTNKVENQMTDEPQKCMEDEVGETCEAYVELADRNDHASCSITGYQLMDECSRAESVWLLSGKKNNDSCKVEHVQDTWNRLRRCHPVLPCDMNHNRSVSGALKRVSRVSDLISESDLMLISCHPFSNDISDPSLTPYTESDGFSYSKQLEMGSIYAQHGLCIFLQDSQATDDGFVDLLQELLFSGTTTTSLGKFVSSGISCGDGSGNISHVKYPTSCISKRRERQARLREVLLPVVPPKLSQSLRGPAFVDYLSSMSQISQLENMQLSECKASSKQRRCRQPRHYLSSGALSLSAEDIGLLAQCSTFSDRRESETIIEQAIS</aaseq> |
| Gene Sequence |
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