Difference between revisions of "BGIOSGA011731"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA011731

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA011731, complete gene.

LocusTag

OS03G0119500

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA011731-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA011731-PA

Length

26047

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:1272991..1299037

Sequence Coding Region

1272991..1273189,1274439..1274536,1275012..1275175,1275331..1275387,1276397..1276445
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,1297966..1298148,1298801..1299037

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:1272991..1299037 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:1272991..1299037 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGAGGGCGGCGGCGAACTGGGAGCGCCTGGTGCGGGCGGCGCTGCGGGGAGAGCGGTTGGCAGGCGCCTTCGGGGTGCCCGTCACCGGCATCGCCGGGAATGTGCCGTCGTCTCTCGGAAACAACGTCCACATCGACGAGGTGCTTCGCGCCGCCGACGAGATCCAGGATGAGGACCCTACCGTCGCCAGGATTCTATGTGAGCATGCATACACACTAGCCCAAAATCTGGATCCAAATAGCGAAGGGAGAGGTGTACTGCAGTTCAAAACAGGTTTAATGTCAGTTATCAGGCAAAAGCTAGCAAAAAGGGAAGGTGGTGCTATAGATCGAAGTCAGGATGTTGCTAAACTGCAGGAATTTTATAAGCTATACAGAGAAAAGCATAAAGTTGATGAATTGTGTGAAGATGAAATGAAGTTGAGAGAATCTGCTGTGTTCAGCGGTAACCTTGGAGAGTTGGAACGCAAAACTCTGAAGCGCAAGAAAGTCCTTGCTACTTTGAAGGTCTTATGGTCCGCAGGCAGTAGTACCTTTTCTCGAATGTTTTGTTACCAGTTAATAATGAAAAGAGTCATGCAAAAAGATGCAGAAAGAACAGAGGATGTTGTGGCTTATAATATTATTCCTCTAGATGCTTTGTCTACAACTAATGACATTGTGAATTTTCCAGAGGTAAGGGCAGCTATATCAGCTTTGCAGTACCATAGGGAACTTCCAAGGCTCCCTGCCACCTTCTCTGTCCCTGATGCTAGGAATTCCGATATGCTGGATCTCTTGCACTGTGTATTTGGTTTTCAGAAAGACAATGTGACTAATCAACGGGAGCATGTTATTCACCTGTTGGCAAATGAACAGTCCCGACTGGGGAAACTACCAGGGAATGAACCGCTAGCAAGAGAACTGGAGGAGATTATACGGAGACAGACTGCAGAGCCTGCTGAAAGCTGCATTTCAAATGGTGGCGTATCATTTCTTGACCAAGTCATTTCTCCTATGTATGAAATCATCGCAGCTGAAGCAGCCAACAATGACAATGGGCGAGCGCCACATTCTGCGTGGAGAAACTATGATGATTTCAATGAGTTCTTCTGGTTGGGATTAATGATCATTGCTTTTAAGGATCGTAAATTTGACAAAAAAACAGTATTGACACTCCTCAGCCTGGGTCCAACCTATGTCATCATGAAATTTATTGAGAATAACCATAATGCTCTAACTATTCTTTCTTTATGGGCTCCAGTGGTATCAATTTACCTTTTGGATATCCATGTATTTTACACCGTGATGTCTGCTATATGTGGGTTTCTCCTTGGTGCACGCGATCGCCTGGGAGAGATTAGGTCTGTTGAAGCAGTTCACAGATTCTTTGAGAAGTTCCCTGAAGCATTCATGGATAAACTCCATGTTGCTGTACCGAAAAGGAAGCAGCTGCTATCATCGAGTCAGCATCCAGAATTAAACAAGTTTGATGCATCTAAATTTGCTCCCTTTTGGAACGAAATTGTGAGGAATATGAGGGAAGAGGATTATATTAATAACACTGAACTGGATTTACTCTTGATGCCTAAGAATAATGGATCTCTTCCAATTGTGCAGTGGCCTCTCTTTTTGCTTGCTAGCAAGGTTTTCTTAGCCAAAGATATTGCAATTGATTGTAAAGACTCACAAGAGGAACTATGGCTAAGGATATCAAAGGATGAATACATGCAATATGCTGTTGTAGAGTGCTATCACAGCATTTATTATATTCTGACATCTATACTAGATAAAGAAGGACGTCTCTGGGTGGAGAGGATTTATGTTGGTATCCGAGAAAGCATTTCCAAGAGGAACATTCAGAGTGATCTTCATTTCAGCAGATTGCCCAATGTCATTGCCAAGTTAGTTGCTGTAGCAGGAATTTTGAAAGAAACCGAGTCTGCTGATCTGAGGAAAGGGGCAATTAATGCTATTCAAGATCTATATGAAGTTGTTCATCATGAAGTGCTGTCTGTTGATATGAGTGGCAATATTGATGAATGGGAACAGATTAAGCAAGCAAGAGCTGAAGGCCGTCTCTTCAATAATCTCAAGTGGCCAACTGACTCTGGATTGAAGGACTTGATCAAACGATTGTACTCTCTTCTGACCATCAAGGAGTCAGCTGCAAATGTTCCTAAAAACCTGGAAGCTAGACGGAGATTGGAGTTCTTTACAAACTCTCTGTTCATGCAAATGCCTGTTGCAAGACCTGTTTCAGAAATGCTTTCTTTCAGCGTATTTACTCCATACTACTCCGAGACTGTTCTTTATAGTAAAGATGAACTCCAGAAGAGAAATGAAGATGGTATAAGTACACTATTTTATCTACAGAAGATTTATCCAGATGAATGGAAGAACTTCCTTGCTCGCATTAACAGGGATGAAAACACAACTGACTCCGAACTTTTTAGTAGCCCTAATGACATGATGGAACTACGTCTGTGGGCTTCTTACCGTGGACAGACCTTAGCACGAACTGTTCGTGGGATGATGTACTATAGGAAAGCCCTTATGCTGCAAAGTTATTTGGAGAAGTTGCAATCTGAAGATATTGAATCTGCAGTTGCTACAACTGGTCTTGGTCTGGCTGATATACATTTTGAGCTGTCTCCTGAGGCACGTGCTCAGGCTGATTTGAAATTTACATATGTGGTTACTTGCCAAATATATGGGGTACAGAAGGCAGAGAGGAAACCAGAAGCTGCAGACATAGCTCTACTAATGCAAAGAAATGAAGCACTCAGAGTTGCTTACGTTGATATTGTTGAGAGCGTTAAGAATGGAAAGCCTAGCACCGAGTATTACTCAAAGCTTGTTAAAGCTGACATTCATGGAAAGGACAAGGAAATTTATTCCATTAAATTGCCTGGCAATTTTAAGCTGGGTGAGGGGAAGCCAGAAAACCAAAATCATGCCATAATATTCACCCGTGGAAATGCAGTGCAAACCATTGATATGAATCAGGATAACTATTTTGAGGAGGCACTCAAAATGAGAAACCTGCTTGAGGAATTCTATCAGAATCATGGCAAGCACAAGCCTTCAATTCTTGGTGTTAGAGAACACGTGTTCACGGGAAGTGTTTCTTCGCTGGCCTCGTTTATGTCCAATCAGGAAACTAGTTTTGTCACATTGGGACAGCGTGTTCTGGCCAATCCACTGAAAGTAAGAATGCATTATGGCCATCCAGATGTTTTTGATAGAATTTTTCATATAACGAGGGGTGGAATAAGTAAGGCCTCCCGTGTCATCAATATCAGTGAGGATATTTATGCAGGGTTCAACTCAACTCTGCGCTTAGGGAACATAACTCATCATGAATATGTTCAGGTTGGAAAGGGAAGAGACGTTGGTCTTAATCAGATTGCACTGTTCGAAGGAAAAGTTGCTGGAGGAAATGGTGAGCAAGTGCTCAGCCGGGATATATACAGACTTGGACAGCTTTTTGACTTTTTCAGGATGTTGTCCTTCTATGTGACAACTATTGGGTTCTACTTCTGCACCATGCTAACTGTTTGGACCGTGTACATATTTCTCTATGGGAAAACCTATCTGGCTTTGTCTGGAGTTGGAGAATCAATTCAGAATAGGGCGGATATATTGCAGAACACAGCCTTGAATGCAGCTCTGAACACACAGTTTCTTTTCCAGATTGGTGTATTTACTGCTATTCCTATGATTCTGGGTTTCATCCTGGAATTTGGTGTCTTGACGGCTTTTGTCAGCTTCATCACGATGCAGTTCCAACTTTGCTCTGTATTTTTTACTTTCTCCCTGGGTACAAGGACCCACTATTTTGGCCGCACAATACTACATGGTGGTGCAAAGTATAGAGCAACCGGTAGGGGTTTTGTGGTACGACATATCAAATTTGCTGAAAACTACCGTCTTTATTCCAGGAGCCATTTTGTGAAAGGGTTGGAGGTTGCTCTTTTGTTAGTGATCTTTTTAGCGTATGGTTTTAACAATGGTGGAGCAGTTGGCTACATTTTGCTTTCCATAAGTAGCTGGTTTATGGCAGTTTCTTGGCTTTTTGCTCCATACATATTCAATCCATCTGGATTTGAATGGCAGAAGGTCGTTGAGGATTTCAGAGACTGGACGAATTGGCTGTTTTACCGAGGTGGTATTGGGGTTAAGGGAGAAGAAAGTTGGGAAGCCTGGTGGGATGAAGAACTGGCACATATTCACAATGTTGGTGGGAGGATACTGGAAACTGTACTGAGTTTAAGATTTTTCATCTTCCAGTATGGAGTTGTTTACCATATGGATGCAAGCGAATCAAGTAAAGCACTATTGATATATTGGATATCATGGGCTGTGCTTGGTGGCCTTTTTGTCCTCCTACTGGTATTCGGTTTGAATCCCAAGGCGATGGTGCATTTCCAGTTGTTCCTCCGACTTATCAAAAGCATTGCGCTACTGATGGTTTTGGCGGGCTTGGTTGTGGCAGTTGTGTTTACAAGCCTTAGTGTCAAAGATGTGTTTGCTGCCATCTTAGCATTTGTGCCAACTGGCTGGGGAGTTCTTTCGATCGCTGTGGCGTGGAAACCTATTGTGAAGAAACTAGGTCTATGGAAAACAGTGCGCTCACTAGCTCGTCTGTACGATGCTGGCACAGGAATGATCATTTTTGTCCCGATAGCCATCTTTTCCTGGTTTCCTTTCATATCCACCTTCCAGACCCGACTTCTATTTAACCAGGCTTTCAGCAGAGGTTTGGAGATCTCTCTCATTCTTGCTGGCAACAATCCAAATGCGGGAGTATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MARAAANWERLVRAALRGERLAGAFGVPVTGIAGNVPSSLGNNVHIDEVLRAADEIQDEDPTVARILCEHAYTLAQNLDPNSEGRGVLQFKTGLMSVIRQKLAKREGGAIDRSQDVAKLQEFYKLYREKHKVDELCEDEMKLRESAVFSGNLGELERKTLKRKKVLATLKVLWSAGSSTFSRMFCYQLIMKRVMQKDAERTEDVVAYNIIPLDALSTTNDIVNFPEVRAAISALQYHRELPRLPATFSVPDARNSDMLDLLHCVFGFQKDNVTNQREHVIHLLANEQSRLGKLPGNEPLARELEEIIRRQTAEPAESCISNGGVSFLDQVISPMYEIIAAEAANNDNGRAPHSAWRNYDDFNEFFWLGLMIIAFKDRKFDKKTVLTLLSLGPTYVIMKFIENNHNALTILSLWAPVVSIYLLDIHVFYTVMSAICGFLLGARDRLGEIRSVEAVHRFFEKFPEAFMDKLHVAVPKRKQLLSSSQHPELNKFDASKFAPFWNEIVRNMREEDYINNTELDLLLMPKNNGSLPIVQWPLFLLASKVFLAKDIAIDCKDSQEELWLRISKDEYMQYAVVECYHSIYYILTSILDKEGRLWVERIYVGIRESISKRNIQSDLHFSRLPNVIAKLVAVAGILKETESADLRKGAINAIQDLYEVVHHEVLSVDMSGNIDEWEQIKQARAEGRLFNNLKWPTDSGLKDLIKRLYSLLTIKESAANVPKNLEARRRLEFFTNSLFMQMPVARPVSEMLSFSVFTPYYSETVLYSKDELQKRNEDGISTLFYLQKIYPDEWKNFLARINRDENTTDSELFSSPNDMMELRLWASYRGQTLARTVRGMMYYRKALMLQSYLEKLQSEDIESAVATTGLGLADIHFELSPEARAQADLKFTYVVTCQIYGVQKAERKPEAADIALLMQRNEALRVAYVDIVESVKNGKPSTEYYSKLVKADIHGKDKEIYSIKLPGNFKLGEGKPENQNHAIIFTRGNAVQTIDMNQDNYFEEALKMRNLLEEFYQNHGKHKPSILGVREHVFTGSVSSLASFMSNQETSFVTLGQRVLANPLKVRMHYGHPDVFDRIFHITRGGISKASRVINISEDIYAGFNSTLRLGNITHHEYVQVGKGRDVGLNQIALFEGKVAGGNGEQVLSRDIYRLGQLFDFFRMLSFYVTTIGFYFCTMLTVWTVYIFLYGKTYLALSGVGESIQNRADILQNTALNAALNTQFLFQIGVFTAIPMILGFILEFGVLTAFVSFITMQFQLCSVFFTFSLGTRTHYFGRTILHGGAKYRATGRGFVVRHIKFAENYRLYSRSHFVKGLEVALLLVIFLAYGFNNGGAVGYILLSISSWFMAVSWLFAPYIFNPSGFEWQKVVEDFRDWTNWLFYRGGIGVKGEESWEAWWDEELAHIHNVGGRILETVLSLRFFIFQYGVVYHMDASESSKALLIYWISWAVLGGLFVLLLVFGLNPKAMVHFQLFLRLIKSIALLMVLAGLVVAVVFTSLSVKDVFAAILAFVPTGWGVLSIAVAWKPIVKKLGLWKTVRSLARLYDAGTGMIIFVPIAIFSWFPFISTFQTRLLFNQAFSRGLEISLILAGNNPNAGV</aaseq>

Gene Sequence

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