Difference between revisions of "BGIOSGA011861"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA011861

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA011861, complete gene.

LocusTag

OS03G0146600

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA011861-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA011861-PA

Length

20281

Source

Oryza sativa Indica Group 

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:3044570..3064850

Sequence Coding Region

3044570..3044648,3044729..3044819,3044911..3044965,3045074..3045205,3045678..3045749
,3046876..3046934,3047015..3047078,3047789..3047892,3048054..3048159
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,3058371..3058499,3058583..3058657,3058739..3058872,3059131..3059203
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,3062734..3062808,3063461..3063553,3063725..3063796,3064082..3064167
,3064263..3064356,3064425..3064532,3064611..3064850

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCTCGATCCGTGGCGTCCTCCTCCTCCATCTCCACCATGCCGTCCTCCTCCGCGGCGGCGGCGGCCGCCGCCCTAGAGGCCGTGCAGGTCCTCGTCACCTCCCTCGCCGACGAATCACCCGTCGCCCGGGACGCCGCGCTCGCCGCCCTCCGCGAGATCGCGCCGATGAACCCGCTGCTCGTCCTCGACTGCTGCGCCACCGTCTCCAGAGGCGGTCGTCGGCGGTTTGGCAATATAGCTGGGGTTTTTCTCGTGATGGCTTCTGCAGTGAAGGCTCTCGATCGCTCTGATGCTGAGCGTGAATTTCTTCGGAAACTTGCGAAGATTGCAACAGCAGAGATTGTTAGCTCAAAGGAACTCAATGTCGACTGGCAAAGAGCAGCAGCGAGTCTTCTTGTTGCCATAGGGTCACATGATCCAGACTTGGCAGCATGGCAGTACATAGGAGATGCCCCCTCTGAGCTTCCTTTCGATACTGACGTCATGTCCTTTATGAATTCAGTATTTGAATTACTTCTAAAAGTATGGACAGGTTCGCGTGATCTAAAGGTGCGGTTGTCTTCTGTTGAGGCTTTGGGAGAAATGGTTGGTCTTGTCACAAGATCACAGTTGAAATCAGCACTGCCAAGGATCATACCGACAATGTTGGACCTATGTCGGAAAGATCAAGAAATTGCTTTTGTTGCATCTCACAGCCTTCATAACCTTCTTAATGCATCATTATTGTCAGAAAGTGGTCCTCCTTTACTTGATTTTGAGACATACAATGAAATCCAACATTGCTTCTTGGTAATTAGTTCAGCATACCCCGAGGATTTGTGCATGTTCCTTTTGAATAAATGCAAGTCAAAAGACGAAGCATCTATTGTTGGGGCACTTGGCACAATAAAACATCTATTGCCTAGGTTGTTGGAATCATGGCATACTAAGCAAGCGTTACTTGTTGAAATTGTGAAATCACTTTTGGAGGAGCAGAGCTTGGGTATTCGAATGGCACTAGCTGAGCTAATTGTTGTTATGGCTTCACATTGCTATTTAAGTGGACATCCTGCTGAGCTGGCAGTTGAGTTTTTGGTGCGTCATAGTGCTATAACTGATGATGATCTGAATGATCCTAACACTCTGAAAAACGAGTACTTTCAGGACAAAAGATTTGAGATGAAAATAAGCCTATCTGGTCTTTCAGAGCTAAGAGCTGTATGTGAAAAGGGTTTGCTTTTGCTAGCAATTACCATTCCTGAAATGGAGCTTGTTCTGTGGCCATTTATCTTGAAACTGATAATTCCGAAGAAGTATACAGGTGCGGTAGCTACGATCTGCAAATGCATAACTGAATTGTGCAGGCATAAATTGTCTCAGACAAACCCACTATATACTGAATTTAATGCTTCAAATGAGATCCCCAATCCCGAGGATTTGTTTGCTCGTTTGCTCGTGCTTCTGCACAATCCACTTGCTAGGGGTCAACTTGCCACACACATCCTGATGGTGATGTGTTACTTGGGTCAACTTTTCCCAAGAAACCTTTCTTTATTTTTACAAGATGAGGTCCCTAAGATGAAAGCTTACATCGGTGACCCTGAAGACCTTAAGCAAGATAGCACATACCAGGAAACGTGGGATGACATGATAATAAATTTTTTAGCAGAATCTTTGGATGTTGTGAATGACAGTGAGTGGGTAATATCCTTGGGCGATGCATTTGCTAGACAATATGATCTATACGCTACATGTGATGGACATTCTGCTTTGCTGCACAGATGTTTAGGAATGCTTCTTCAGAAGGTTGATGACCGAATTTATGTCCGTGAAAAGATTGACTGGATGTGTGCACATTCAAGCATGTCTATTCCTATTAATCGCCTTGGGCTTGCCCAAGGCATTGGTCTGGTTGCAGCATCTCACTTGGATACAGTTTTGGAGAAGCTGAAGAACATATTGGAGAATGCAGGACAGAGCGCTCTCCAAAGGTTCCTATCACTTTTCTCATTGGGAGCAAAAGTTGAGGATGTTGATGACACATATGCAGCCCTGGCATTGATGTATGGATATGCTGCAAGATATGCTCCATCAACAGTTATTGAAGCCAGGATCAATGCACTTGTGGGGACTAATATGCTTGGAAGATTTCTTCATGTTCAACATCCTACTGCAAAGCAAGCTGTCATTACTGCCATTGACCTTTTAGGCCAAGCTGTTATTACTGCTGCTGAAATGGGGATTTCATTCCCACTGAAACGAAGAGACCAATTGCTGGAGTATGTGCTAACGCTAATGGGAAGAGATCAAAATGATGACCTTGTTGATTTCAGCACTGAGCTTCTGCACACTCAAAGTCTAGCTTTAAGTGCCTGTACTACTCTGGTTTCGATAGAGCCAAGATTACCTATGGAAACAAGAAACCGTGTGATGAAGGCAACACTAGGATTTTTTGCTTTGCCAACTGAGCCCTCAAACATTGTTGAGAGCCTCATAACAAACCTGATTATTTTGTTAGGGGCCATTCTGCTAACTAGTGGTGAAGATGGTAGAAGTCGAGCAGAGCAGCTCCTGCATATTCTTAGGCAGCTTGATCCATATGTTTCATCTTCTGCCGAACACCAGAGAAGAAGAGGGTGTGCTGCTGTAAATGAGGTGTTAGTTAAGTTCCGCAATCTCTGTTCTGGTGGATTTGGTGTGTTGGGTTCTTATACAACATTCACACTGAACAAGCAAATTGATCAGGCAGCCCCTAGGAGCTTGTCAAGTTTGCCATCTGCATTTGTGTTGCCTACCCGAGATTCCTTAAGCTTGGGAGAGAGAATAATGGCATATCTTCCTCGCTGTGCCGATACAGATGCTGAAGTCAGGAAAGTTGCTATTCAGATACTTGCACTTTTCTTCAACATTGCATTGTCACTTCCAAAGAAGAAGGCGTCTGTGAACGACATTGATCTGGAGTCTTCATACAGCGCTTTATCCTCCCTAGAGGACATAGTCTCTATCATTAGAAGAGAGGCATCAATTGACCAGGCCGAAGTATTTCACAGGGTTGTCTCTTCTCTGTGCGTTCTATTATCGAAAGATGAGCTTGTTGTCTTGCTACGCTCCTGTACATTAGCAGCATGTGATAAAGTAAAGCAATCATCAGATGGTTCAATTCAAGCTATTATCATGTTTATTATCAGAAGAGGCAAGGAGCTACGTGAAGCTGACGTATTGAGGACAACACAATCTTTGCTGTCGTCTGCAGTCTCGCTTACCAACAAGGAGTCACGCCGAGAAGTTCTCAATGCTATATCGTGCTTAGCAGAAAACACCAATCACACCGTCGTGTTTAATGAAGTTCTATTTGTGGCTGGGCGGGATATTTGTACAAAGGACATAGCAAGAATTCGTGGTGGCTGGGCTATACAGGATGTTTTTCATGCATTCTCCCAGCATAAGGTGCTAGCTATTCTTTTTCTGGAGTACATTTTGTCTATACTTCACAAGGAACCTGTGGCAACAAATGATTCAGAAAAGGGGGAGATCACCTCTGAGTCATCAGCTGATGACTGTATTCTACAAGCAACTATGTTTGCTCTAAATGCATTTCTGAGGGGTGGTGGAAAGATTGGGAAACAAGCAGTTGAACAAAGTTACCCTTCTGTTCTTTCTGCCCTTATACTGAAGCTGGGAAGTCTTCATGGTCTTGCTGAATTGGGCCGGAATGAACTTCTACGATCATTGTTAATTGCGTTTCAGTCATTTTGTGACTGTGTTGGTGATATTGAGATGGGAAAGATATTAGCCCGTGATGGCGAACAAACTGAGAAGGAGAAGTGGATTGATCTTGTTCAGGAGGTTGCATGCAGTTCCTCAGTAAAGAGGCCCAAAGAGGTTTTACCAACTTGCAGCATCTTAAGCAAAGCTCTCAACAAAAACCAGAGGGCTGAAAGGGAGGCTGCAGCAGCCGCACTGTCAGAATATATTAGACACAGTGAAAAAGAACCTATATTGCTTGACCAAATGGTTCTGGAGTTGTGTCAACATGTCTCTGATGACTCGCCAACTGTCAGGAGTCTGTGCCTACGTGGACTTGTGCAGATACCTGAGAGCTGTATTCCTAAATACATCCAGCAAGTCTTAGGGGTAATATTAGCATTACTTGAAGACACCAAGGAGTCTGTTCAATTAACTGCTGTCCAGTGCTTGTTAACTGTTCTTAATGTGTCAGAACAAGATGCCATTGACCCAGTTTTAATCAATCTTTTAGTAAGGCTACGCAATCTCCAGGTTTCGATGAATACGAAAATGAGGTCCAATGCGTTTGCAGCTTATGGTGCTTTAAGTGCCTATGGTGTAGGTTCACAGCAGTTTCTTGAGCAGATTCATGCCACTCTTCCTCGCTTGATCCTCCATCTTCACGATGATGACCTAAGCGTTCGCCTTGCCTGTCGGAATACGTTCCAACTCCTAGCGCCTTTGATGGAAGTAGATGGTTTGTCTTCACTCCTCAGCAAAAAATATTTCACCTCTGATCGCCGTTCGGATTATGAGGACTTCATTAGGGACTTAACAAGGCAACTCTGTCGACTATCTCCTGCCAGAGTCGACAGCTACTTTGAATCTGCTATCCAGGCGTTTGATGCACCTTGGCCAGTCATCAAAGCAAATGCAGTTTGCTTGGTGAGCTGCATGCTATCCTTTTTAGATGATCAACGGTTCCTCGCTCCTTACTTCTCCCAGGTGTTTGCTATTTTGGTCGGTAGACTGAGCCAATCACCAGATGCAGTTGTTCGAGCAGCATCATCTTCTGCACTGGGCCTTCTGATAAAGAGGTCTAACGTGGTTAAGACGTTGACTCCGAAATTTGATCGGGCTGATTCATCCCAGAATTTTCAACATGGAGATACTCGTACGAAAACATCATCCGAGCCTCAACAGGAGACTATAGATATGCCAAACGATACACAACGAGAGCAATAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MARSVASSSSISTMPSSSAAAAAAALEAVQVLVTSLADESPVARDAALAALREIAPMNPLLVLDCCATVSRGGRRRFGNIAGVFLVMASAVKALDRSDAEREFLRKLAKIATAEIVSSKELNVDWQRAAASLLVAIGSHDPDLAAWQYIGDAPSELPFDTDVMSFMNSVFELLLKVWTGSRDLKVRLSSVEALGEMVGLVTRSQLKSALPRIIPTMLDLCRKDQEIAFVASHSLHNLLNASLLSESGPPLLDFETYNEIQHCFLVISSAYPEDLCMFLLNKCKSKDEASIVGALGTIKHLLPRLLESWHTKQALLVEIVKSLLEEQSLGIRMALAELIVVMASHCYLSGHPAELAVEFLVRHSAITDDDLNDPNTLKNEYFQDKRFEMKISLSGLSELRAVCEKGLLLLAITIPEMELVLWPFILKLIIPKKYTGAVATICKCITELCRHKLSQTNPLYTEFNASNEIPNPEDLFARLLVLLHNPLARGQLATHILMVMCYLGQLFPRNLSLFLQDEVPKMKAYIGDPEDLKQDSTYQETWDDMIINFLAESLDVVNDSEWVISLGDAFARQYDLYATCDGHSALLHRCLGMLLQKVDDRIYVREKIDWMCAHSSMSIPINRLGLAQGIGLVAASHLDTVLEKLKNILENAGQSALQRFLSLFSLGAKVEDVDDTYAALALMYGYAARYAPSTVIEARINALVGTNMLGRFLHVQHPTAKQAVITAIDLLGQAVITAAEMGISFPLKRRDQLLEYVLTLMGRDQNDDLVDFSTELLHTQSLALSACTTLVSIEPRLPMETRNRVMKATLGFFALPTEPSNIVESLITNLIILLGAILLTSGEDGRSRAEQLLHILRQLDPYVSSSAEHQRRRGCAAVNEVLVKFRNLCSGGFGVLGSYTTFTLNKQIDQAAPRSLSSLPSAFVLPTRDSLSLGERIMAYLPRCADTDAEVRKVAIQILALFFNIALSLPKKKASVNDIDLESSYSALSSLEDIVSIIRREASIDQAEVFHRVVSSLCVLLSKDELVVLLRSCTLAACDKVKQSSDGSIQAIIMFIIRRGKELREADVLRTTQSLLSSAVSLTNKESRREVLNAISCLAENTNHTVVFNEVLFVAGRDICTKDIARIRGGWAIQDVFHAFSQHKVLAILFLEYILSILHKEPVATNDSEKGEITSESSADDCILQATMFALNAFLRGGGKIGKQAVEQSYPSVLSALILKLGSLHGLAELGRNELLRSLLIAFQSFCDCVGDIEMGKILARDGEQTEKEKWIDLVQEVACSSSVKRPKEVLPTCSILSKALNKNQRAEREAAAAALSEYIRHSEKEPILLDQMVLELCQHVSDDSPTVRSLCLRGLVQIPESCIPKYIQQVLGVILALLEDTKESVQLTAVQCLLTVLNVSEQDAIDPVLINLLVRLRNLQVSMNTKMRSNAFAAYGALSAYGVGSQQFLEQIHATLPRLILHLHDDDLSVRLACRNTFQLLAPLMEVDGLSSLLSKKYFTSDRRSDYEDFIRDLTRQLCRLSPARVDSYFESAIQAFDAPWPVIKANAVCLVSCMLSFLDDQRFLAPYFSQVFAILVGRLSQSPDAVVRAASSSALGLLIKRSNVVKTLTPKFDRADSSQNFQHGDTRTKTSSEPQQETIDMPNDTQREQ</aaseq>

Gene Sequence

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