Difference between revisions of "BGIOSGA012609"

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA012609

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012609, complete gene.

LocusTag

OsI_11548

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA012609-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA012609-PA

Length

11624

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:14549883..14561506

Sequence Coding Region

14549883..14549969,14550856..14550915,14551510..14551566,14552272..14552343,14552489..14552551
,14553394..14553570,14553942..14554067,14554150..14554216,14554458..14554654
,14556957..14556987,14557147..14557235,14557553..14557621,14558396..14558514
,14558737..14558875,14558972..14559472,14559727..14560026,14560128..14560309
,14560711..14560822,14561387..14561506

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:14549883..14561506 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:14549883..14561506 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGAGCGCGGGCTGGAGGACGCTGCTGCTGCGGATCGGCGACAGGTGCCCGGAGTACGGGGGCTCCGCCGACCACAAGGAGCACATCGAAACTTGTTATGGTGTGCTTTGTCGAGAATACGAACACTCCAAAGATGCAATGTTTGAGTTTCTCCTCCAATGTGCAGATCAATTGCCTCACAAGATTCCTTTCTTTGGAGTATTGATAGGTTTGATAAACTTGGAAAATGAAGATTTTTCCAAGGGTATTGTCGATACAACACATGCCAATTTACAGGATGCCTTGCATAATGAAAATCGTGACAGAATCAGGATATTGCTGCGATTTCTCTGTGGCCTGATGTGCAGCAAAGTTGTCCTGCCAAATTCTATTATTGAAACATTTGAGGCACTATTATCATCTGCTGCAACAATATTAGATGAGGAAACCGGAAATCCTTCGTGGCAACCACGTGCTGATTTCTATGTTTATTGTATCTTGGCTTCCCTTCCATGGGGTGGCTCAGAATTGTTTGAGCAAGTTCCAGATGAATTTGAGAGAGTTCTGGTTGGTATACAGTCTTATATAAGCATTAGAAGGCATTTTGATGATATTGCTTTCTCAGTCTTTGAAACAGATGAAGGCAACTCTCCCAACAAAAAGGATTTCATCGAAGATTTATGGGAGCGTATTCAAGTTCTTTCTCGCAATGGGTGGAAGGTTAAGAGTGTTCCAAAACCTCACCTGTCGTTTGAAGCTCAGCTGGTAGCTGGAGTTTCTCACCGTTTCTCCCCAATTAGTTGCCCCCCACCTACTATCTCGCAATCATCTTCTGAAATAGTAAAAGGTCAAGAAAAGCATGAAGCTGATCTGAAGTATCCTCAAAGGCTTCGTAGGCTTCACATATTTCCAACAAATAAAGCTGAGGATTTCATCTTTTCAAGTTTCAAGAACGGAGACAGTCGCAAAGAATGTGCATTTTATCTGGTCAGCTTACCTGTGCCTTTCCGTTATGAATACCTGATGGCTGAGACCATATTTTCACAGCTACTGTTATTGCCGAATCCCCCTTTCAGGCCAATTTACTATACCTTGGTTATTATCGACCTTTGCAAGGCATTGCCAGGTGCATTTCCTTCAGTTGTGGTAGGAGCAGTACATGCTCTTTTTGACAGAATTAGCAACATGGATATGGAGTGCCGCACCCGACTTATCCTATGGTTTTCACATCACTTGTCAAATTTTCAGTTCATTTGGCCTTGGCAGGAGTGGGCTTACGTCAAGGACCTTCCAAAATGGGCTCCACAGCGTGTTTTTGTCCAAGAAGTATTAGAAAGGGAAATTCGCTTGTCCTACTTTGACAAAATTAAGCAGAGCATAGAGGATGCTGTTGAATTGGAAGAACTGTTACCCCCAAAAGCTGGGCCTAACTTCAGATATCATAGTGATGAAGGCAAAGAAAGCACTGATGGCCACAGACTCTCCAAGGAACTTGTTGCCATGGTTAGAGGAAGGAAGACACAAGGTGATATTATTTCATGGGTAGACGAAAAAATAATTCCTGTAAATGGTGCCAAATTTGCACTTGATGTAGTTAGCCAGACACTTCTGGACATTGGCTCAAAAAGTTTCACCCATCTTATCACTGTTTTGGAGAGATATGGTCAAATAATATCAAAGCTGTGCCCGAATGAAGAAATGCAGTTATTGTTGATGGATGAAGTCAGTGCTTATTGGAAGAACAGTACCCAGATGATTGCCATAGCTATTGATAGGATGATGGGTTATCGCCTACTTTCCAATCTGGCTATAGTCAAATGGGTTTTTTCTCCTGCTAATGTTGATCAATTTCATGTTTCAGATCGTCCATGGGAGATTCTTAGAAATGCTGTTAGTAAAACATACAATCGGATTTTTGACCTCCGGAAAGAAATTCAGACACTCAGGAAAGGTCTTCAAGCTGCTAAAGAGGCCAGTGAAAAGGCCGCCAGAGAGTTGGAGGAGGCTAAATCTATTATTGAGATTGTAGATGGCCAACCTGTGCCATCTGAAAATCCAGGAAGGCTAAGACGACTTCAAGCGCGTGCTGACAAAGCGAAAGAAGGAGAAGTAACCACTGAAGAATCTTTAGAAGCAAAGGAGGCCCTCCTTGCTCGAGGGCTTGAAGAAAGCAAGGAATTGCTTAGGTTACTATTCAAGAGCTTTGTTGAAGTGCTAACTGAACGTTTGCCACCTATTTCTGCTGATGGAGATGTTCCTAATTTACGTGCTGGAGACCCGAATGTAAATTCTTCAGCCCGTGACCCTGAAGCAACAACCATGGAAATAGACAATGAAAATGGAGGAGATAACGATAGTCAGCTGAATGGTCAAAACAAGAAAATCAGTCACAATGTTGGAGAGCTTGAGCAATGGTGTCTCTGCACATTGGGCTATCTCAAGTCGTTTTCTCGTCAATATGCTACTGAGATCTGGTCCCATATTGCCATGTTGGATCAGGAGATTTTCGTTGGGAATATTCACCCTCTTATCCGGAAAGCTGCTTTCTCCGGTTTGTGCAGACCTACCAGTGAAGGGTCTCACCTTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSAGWRTLLLRIGDRCPEYGGSADHKEHIETCYGVLCREYEHSKDAMFEFLLQCADQLPHKIPFFGVLIGLINLENEDFSKGIVDTTHANLQDALHNENRDRIRILLRFLCGLMCSKVVLPNSIIETFEALLSSAATILDEETGNPSWQPRADFYVYCILASLPWGGSELFEQVPDEFERVLVGIQSYISIRRHFDDIAFSVFETDEGNSPNKKDFIEDLWERIQVLSRNGWKVKSVPKPHLSFEAQLVAGVSHRFSPISCPPPTISQSSSEIVKGQEKHEADLKYPQRLRRLHIFPTNKAEDFIFSSFKNGDSRKECAFYLVSLPVPFRYEYLMAETIFSQLLLLPNPPFRPIYYTLVIIDLCKALPGAFPSVVVGAVHALFDRISNMDMECRTRLILWFSHHLSNFQFIWPWQEWAYVKDLPKWAPQRVFVQEVLEREIRLSYFDKIKQSIEDAVELEELLPPKAGPNFRYHSDEGKESTDGHRLSKELVAMVRGRKTQGDIISWVDEKIIPVNGAKFALDVVSQTLLDIGSKSFTHLITVLERYGQIISKLCPNEEMQLLLMDEVSAYWKNSTQMIAIAIDRMMGYRLLSNLAIVKWVFSPANVDQFHVSDRPWEILRNAVSKTYNRIFDLRKEIQTLRKGLQAAKEASEKAARELEEAKSIIEIVDGQPVPSENPGRLRRLQARADKAKEGEVTTEESLEAKEALLARGLEESKELLRLLFKSFVEVLTERLPPISADGDVPNLRAGDPNVNSSARDPEATTMEIDNENGGDNDSQLNGQNKKISHNVGELEQWCLCTLGYLKSFSRQYATEIWSHIAMLDQEIFVGNIHPLIRKAAFSGLCRPTSEGSHL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..87#974..1033#1628..1684#2390..2461#2607..2669#3512..3688#4060..4185#4268..4334#4576..4772#7075..7105#7265..7353#7671..7739#8514..8632#8855..8993#9090..9590#9845..10144#10246..10427#10829..10940#11505..11624#ATGAGCGCGGGCTGGAGGACGCTGCTGCTGCGGATCGGCGACAGGTGCCCGGAGTACGGGGGCTCCGCCGACCACAAGGAGCACATCGTGAGCGCCCCCCCCCCCCGTTTCCCTCCCCTCCCCGCTCGTTTTGTTCTCTCCCCCCCGGGGGGGCCTCCCGCGCCCGAACCCTAGGTTTTCGGCGTCCGGATTTGGGGGGCGTGCTTGCGTTGGTTCGTGCTTGAGTGGGCGTCGTTCCTGGTTGCCTGCGGTAGGGGGAGTGAGGCGGTAGTGGTGGAGCTGGGGAGCTCAAAACCCTAGCCACCTGTTAACAATTGCTGGGCGCTTGGGGTTTGGGTGTGTGGAGCGGAGCCGTGACGGTCTTGTCCGGATGATGGAGATGAGGAGAGTAGTAACAACAGGAAGGACAGAACGACGTGTTTTGATAATTTGTTCTGCATAATTTCTACCATTTGAATATTGGAAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTAATGATGAAAACAGTTCAAGGTAGAGAGATCAAAATTGAACCCTGCTAAAGTACTTCACAGATGTAGTCACAAGGCAATGCACATTTGGAAGACTGTAGTCTGTAAATGCACAGCAATCTTGATGTGCTTTAAGTGTTGTTATTACACTATGTTCCAGCTTCTAGTTGAAAAGGCTCTTTTTTTAGTGAAATTGTGGCGCTATGCATGGTAGCATGGAAGGTGGTGCTGTAATGTGTTGATGCAATTCTGAACTTTTTACTCTTTTATATGCTATATGTGTTGATGGCATGTTTATTTGAGAACCAGTGCAACCAATGGACAAATATTCTAGTCAACTAATTTGACCTTGCTTACATTCATGAATCCTCTGAAGATTAGCTCAGAGCACAGCATCACCACCATCAACTCTTTTAAGTAGTATAAATTAATATTTTTATTTTATGATCCTTCTACACTTGTTTTGACCAAGCGTTTTCTTTGTAGGAAACTTGTTATGGTGTGCTTTGTCGAGAATACGAACACTCCAAAGATGCAATGTTTGAGGTCAGCACCCAATATTCTATCATGTGCCTTTTCACATAGTATTGTCTAAATTCACAATTAATTCGGTCTTTTGTTTTTATAGCAAGCTATATATTGTCTTAGTCCTATGAAGAAATATCGATGCCTAAAATTGGCATATTTCCAACTGCAGTCAGTTTCCCCTTCTAGAAAAAAAAAACTATAGTCCATTGGCTAAGCCAATCTTAGTATTCCCTACTTTCTCAAATATAAGCATTTCTAGGATTCGAATTTTGTACACAATATAAGCATTCCTGTAGTACTACTTGTCCCATCAACCTCTCATTCAAAAGTTCCCCATCTTTATCCGCAACCACCCTCCCATTCCCAACCACCCCTCATTTATTTTCAAACCTTATTCCTTAATCTCTACTAAACAACCTACAAATACTTATATTTGGAATGGAGGTAGTATTTGTAAAGAATTCTAAAGCCAAGATGTCTATTTATCTTGTCAACTTTTCTGCAGTGAAGGCAGAAAATAAAGATATCAATGGAGAGATAGTATATCTTATATTCTGCATCTTGTGAATGAATTGATATGATACTAACTGAACATACTTTTTTTTTGAGCAGTTTCTCCTCCAATGTGCAGATCAATTGCCTCACAAGATTCCTTTCTTTGGAGTATTGGTGTGCACCTACTTGAACCTTATAAAACTACATGCTATTTTATGGCCTTATAACTTGGTTATTGCTATTTGTGAGCATTTTATTTTTTTTGTCACAATATAATGATATGCTACTGTGCCCTCTTAATCCTTTGTTATCCCCAGAAGGTGAATGCACAACAAATTCAACCACTATTAGTGTAGTACTAAAAAAAATCTAGTACTCATATGCCTTTTGAATTTATGAAGCCTTTGAAGTTTTTATTTTTCGAGAACAAGCCTTGAGAAGTTAGATTAGCTCTTAAAGGTGGTTGCAAGCCACAAACACACTGCATAATTGTGAGTGCTGATTAACATGATTGATGAAACTATTGTGTGAGAGGAATCCGAAGTTGACATACGCTTTGCTTCATATTTTGTTTTGCTTGGTCCTGTTATTTCTTGAGCTGTTGCATATGACTATGCTCTGTTCTTTTAAATATAGTTTTTTTTCCTGAAGCTGTTATTGTTCATTATTCTGCCGCCTATGCGTGTTTGACTGTTCACTATGTATCCTCTATGGAACTTGGATTGTCAATTTCGTTCCAAACATTACCTATATCTTGTTTTAAGTTTATTTTTACACAATATTGGTGTAAGAACAAGACATGGCAATTTAGTTTTTATTATTTGACCTAGGCATTAAACTAAGTCCGTAAGATGGCTCTTTTTTTGTTTCTAATTTCAGATAGGTTTGATAAACTTGGAAAATGAAGATTTTTCCAAGGGTATTGTCGATACAACACATGCCAATTTACAGGTACATGTAGATGTTTTTCTTATGCCCCAGCAGTATTAGGTCTATGTAGATGTTTTTCTTTCGGTGCTGAATACTAAGTCGAAATCACATTATGGTTCTCCTTCTTAAAGATTATCTTAGGTTATAAATGATGTCTTAATTGCAGGATGCCTTGCATAATGAAAATCGTGACAGAATCAGGATATTGCTGCGATTTCTCTGTGGCCTGGTAAGTTTTGTATTTGGTTGATTTGATTTGATTTTGTTGTTGACATTATTGTGCTTGTTGCTTTCCTAATCTTAATTGGTGATGCCTGAAATGTGTCTAACTGACGTACTATCATAGTGTTATGTTTCATACAAACAACACATCTTTGCGAATAATTGAATCTGTTTGTCAACATTCCCAAGTATGCAAGGCTATTAGTTCTTGTCTTTCAACCTTACTAACTTGAGCGCTTATGAATCATGCAACAGTGCATTTGCATGACACAACATAGCAAACTCACAGGCATTTATAACTAGTGATTCATAAAATTTGCATTTGGTTAGCATAATCTTTACTTTTGGTCTGCATTCTAAAAGTTAGTGCTAGGCGCTGGGTAGCCATTCCGATTAGGCATTAGATGGTCAATCAGGCAGCTAACTATCCGTGGCGACTCTTGTGCTACTATTTTAGTGTTCATTTATCTAACTTCTCTGTCATATACTTGCTAATTGCTTTTAATTGACTAATTATGTTGGACCTAGGTGCCACCTAGGCGGTGTGCAGGCACCGACCCTGCCCGATCCTCTAGCACCTAGAGCCTTCTTGAGCCATGTTTTTAGTTCTGATTCTCCAAATTGCCACCTAGGACTGAGTTGACAAGTTATAAACTGTGAATGCTTTAGGTCTCCTCTCCAAAAGAGCAGAGTGACTTCTTTCTACACTCTTCAATTCTTCATATGTCGTGACAAACATTTTCTTTAATTGCACACTATATGGATATGATTGAGCTGTTTGTGGTGCAACATAGTTTTGTTTTTTCTTTTCTCCATTCTTTTCATAACTATTTAATGTTTGCCTTGTAGATGTGCAGCAAAGTTGTCCTGCCAAATTCTATTATTGAAACATTTGAGGCACTATTATCATCTGCTGCAACAATATTAGATGAGGAAACCGGAAATCCTTCGTGGCAACCACGTGCTGATTTCTATGTTTATTGTATCTTGGCTTCCCTTCCATGGGGTGGCTCAGAATTGTTTGAGGTAACTTGAACTGCTGTTCTTTACTGCTGATGTGAACATATGCAGTTCAGCATGACTGTATCACTGTATCTAAATTAGTTGTGCATGTGAATACTATTTCATGTACATTTCTGTTTTATCATTTTTCTTAGTTTTATTTCCTATATGAGCAGCTAGAGGGAAAGCTGAAGCGTCAACAATTTTTTGAAACATGTGAAACTATATGAAAATACAATACATTTCCACTTTAGGAGCACCCGTTGTTCAATTATTCTTTTACCTTGGGATCCATGACATGCTACCTTCGTTTTTGAAGCCATTTTGAAATTGTATACTAGAAAATTCTGCAGATAATCCAGTGGTATAATACACTAATGATATGTAACATGCAGCAAGTTCCAGATGAATTTGAGAGAGTTCTGGTTGGTATACAGTCTTATATAAGCATTAGAAGGCATTTTGATGATATTGCTTTCTCAGTCTTTGAAACAGATGAAGGCAACTCTCCCAACAAAAAGGTGAACATACACTGTTTCTCCTTATCAACTCAGACTCCACTAGTGATATCTAGATCAATGTTATTAAAGTTAGTCCTTGCAGGATTTCATCGAAGATTTATGGGAGCGTATTCAAGTTCTTTCTCGCAATGGGTGGAAGGTTAAGAGTGGTATGCGATAGTCCATATGATTTCTTAATGAACAAATGTTGTTGACCTTCAGTTGCAATTGCATATGATATGTGACAATTATACAGAGTTATATCACAATATGTTTCAAAAACCCTATATGCATCCAATAGTTACATTCAGAACACCTTTTTCTTATATTAAATTGGGCTGGTGGTATTCCAAAATCTTAGACATGCTTGTGTCTAATTGGTTTCTGCACTCTATTTTACTTCCTTGGCAGTTCCAAAACCTCACCTGTCGTTTGAAGCTCAGCTGGTAGCTGGAGTTTCTCACCGTTTCTCCCCAATTAGTTGCCCCCCACCTACTATCTCGCAATCATCTTCTGAAATAGTAAAAGGTCAAGAAAAGCATGAAGCTGATCTGAAGTATCCTCAAAGGCTTCGTAGGCTTCACATATTTCCAACAAATAAAGCTGAGGTAA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA012609