Difference between revisions of "BGIOSGA012630"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA012630

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012630, complete gene.

LocusTag

OS03G0353600

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA012630-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA012630-PA

Length

15377

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:14920406..14935782

Sequence Coding Region

14920406..14920557,14920752..14920863,14920978..14921274,14921587..14921753,14922863..14923073
,14923646..14923816,14923897..14923974,14924501..14924746,14924989..14927109
,14927363..14929145,14929354..14929457,14929993..14930349,14930451..14930569
,14931416..14931677,14931910..14932134,14932316..14932455,14933328..14933400
,14933650..14933751,14933866..14934237,14934402..14934449,14934740..14935124
,14935664..14935782

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGATGGTCGTCGGGCTGGTCCAGCTGCTGGTGGCGTTCGTCGTCGCCTGGGAGGCCGTCGAGCTGGTCCTCCGCCACGGCCTCCTCCTCTCCTTGTTCAAGTTCGCCCTCGCCGCCGCGCTCGCCGTGGCCGCCTCCTTCGTTGCCGCCCTCTTCCTTGCCAGGGTTGTGGCCTGGGTGCTTCGGCGCACGGCCAAGCTCTCCATCGGATGCCGCTCCTTCAGCTTCAATTATCTCAGGGACATCACCATAAAATCCCCAAAGGGTGCAGTTGACTCCATCTGTGTAGGTGAAATTAGACTTGGCCTGCGAAGGCCACTCACCCAACTGGGATTTACCATACTAAACCATGGCCCTATCCTGCAATTGCAAATCTCTGACCTGGACATTGTGCTCAGGCAACCTGCAAAATCTGCTAAGAAAAAGAAACCTCCCCCTCGCAAATCAACCTCGACCTCACCGGCAAAAGGAAAAGGAAAGCCGAAAGGACAAGGGAAATGGAGGCTTATAACAAACATTGCCAGTCTTTTGTCGCTTTCTATAGTGGAGCTGAGGTTCAAGGCTCCAAAAGCTGCTCTCGGCATCAAGGACCTTAAGATTGATTTATCAAAAACTGGAGGATTGGATCCAATTCTCAATGTTGAAATACATATCTTACCTTTATTTGTGCAAGCATTAGAACCAGATGGCATTGACAACAGTACATCAGTATTTAGCAAATTGGATTGGGGTAAAGGAGTTGGAGTCAAGAATTTGGATTTGGTAATTGGCCCAATCGTTGTGAACTTGGAAGAAAAACTATTCACCAAGAAGAAGCTTTCTGCTCCCACAGTTGCTGAGAAGACGGATGAACCTGCTGCAGATGTTAAGTCAGATACTAAATCTGAAGGGAGCAAACTTTCATCATTGAATAAGAAGATTGATTTGCTTCCTGAAAAGGTTAGCTTCAATATGTCCAAGCTAGATCTGAAGTTTTTGCCAAAGGACCATGGCCTCTTGATCAACAATGAAATTGGTGGCATCTCCGTGAGATTTGTGAAGTCACAACCACACAGTGACTTTGGGGAGGCAACACACCTTCAGCTGGAAACTGATGTGTCTGATATTCATCTTCTAATGGATGGTGCTACGTCTGTATTAGAGGTTGTGAAAGTTGCAACTGTTGTCTCAGCTAACATTCCCATTCAGTCAACTTCACCAATTCGAGCTGAAGCAGGTATCAAAATTAGTGGCAGCCAATGTAATATCATTATAAGCAGAATTAAGCCACTGATTCCATTAAACTCGGCACAAAAGAAGCCCACTGTTCCTCGTGAAAGTTCAACACAAGAAAAGACACCTAAAGAAAAGTTAGCATTGGATTTGGTATTTACACTCTCAGCACCGGAGCTGACTATTGTGCTCTACAGTCTTGATGACATACCACTGTACCATTGTTGCTTGCTGTCTACTCATTTCGCTGCAAGTAAGACAGTAAACCAAGGAACTGAACTGCACGCAGTGCTGGGTGAGTTAAAATTGATTGTTGCCGGAAAACCTCAACAGTCAATAAAAGACCGTATCTCAGGCACTTTATTGCAGATTAGCCGCTCTACTATTGATCTGGAGCAAAAGGTCCCAGACAAAGATAATTGCATAGACAATCCAAAATCTTCTCTTTCTCTCAATATATCTGGAGTCAGAATGAACGTCTGTTTTTACTATCTCGAGTTACTTTGTACCACTGCAATGTCTTATAAGGTATTTTTGAAAAGCATTCGCCCTCCTAAGAAGCGACCTGCACAGGGGACTAGTCAGAAAACTACCAAGAACGCTAAAGGAGCACAGATAGTCAAGATTAGTGTTGAACAGTGTGCTGTTTTGTATGTTGGTGACATGATACTTGAAGATATGAGTATACAAGATCCAAAGCGTGTAAATTTTGGTTCACAGGGTGGTCGTGTTGTCATAATCAATGATGCTGATGGTTCCCCAAGGATGGCCTATGTCAACTCAACCAGCCTTCCAGATCATAAGCATGTTAATTTCTTCACTTCTATTGAGATTAATCAAATTGGTCTATGTCTGAACAAGGAAAAGCAATCCGTGCAGGTTGAACTTGGAAGATCCAGATTAACACATAAAGAAGATCTGCTTGATGATAAGCCTGTAGAGGAGGTTACGCTTTTTGATGTGCAAAAGGTGAAGTTTGTCCGGCGCTCTGGTGGGTCAAATGACAGTGCAGTCTGCGCCCTCATAAATGTAACAGAAGTAGCAGTTTGGTGGGAACCTGATCCCTATCTGGAGTTACTTGAAGTAGCCACTCGACTTAAATCCATTATGCACAGGATCAAGCACCAGAATTCTGCTAATGAGATAAAAGATGATACAGTGTACACGGATACTTTGGCAAAAAAGGATTCACTCACAGAACATGGCCAACAAGAAAAACCACAGAAGAAACAAGAATTGGTTATTGCCGTTGATGTGGAATCTTTGAAAATTTCAGGTGAACTTGCTGATGGAGTTGAAGCAATGATTCATGTTGGATCCATTTTTTCTGAGAATGCAAAGATCGGTGTTTTAATTGAAGGACTAGTAGTTAGTTTTTGCGGTGCACGGATTTTCAAATGCAGTCGCACGCAGCTATCACGCATCCCAGTTTCCATTTCAGACAGCCTTCCCGATAAGAAGTTGCAGTCTGCAGCTACATGTGATTGGGTTATTCAATGCCGAAATGCTTATGTCTGCCTGCCTTTTAGGTTGCAGCTACGAGCTATAGATGATGCAGTTGAAGACACATTGCGGGCCATTAAACTTATTTCTGCAGCAAAAATGTCTGTATTATTTCCTGAGAAGAAATCTAGCGGTAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAAAAAGAGCAAATCAAAATCAACAGAATTTCGGTATGTGAGGGTCATTGTACGTGACCTCGTAGCAGAAATTGAAGAAGAGCCTATCCAAGGCTGGCTTGATGAGCATATCGATTTAATGAAGAGTGTATTTAATGAGTCGACAGTAAGGTTGGATCTGCTTGATGAGCTTGCTTCAGTCAAACATAAAGACTCTCCCAAGGCAAAATTGGATGGATCTTCTTCTGAAAAGAACAATGGATGCCCTGAAGTGGATGGTGATGCTCCTGGTGTGTGTTCATTTGAAAAACTCAGAGAGGATATATATAAGCAGGCATTTCAATCATATTACTTGGCATGCCAGGCATTGAAAGTATCAGAAGGGTCAGGTGCATGTTCTAGTGGCTTCCAGTCTGGTTTTAAGATGAGTACTCGCAGATCATCAGTTATGTCAGTCTGTGCAAAAGATGTTGATGTGAGCCTATCAAAGATTGATGGTGGAGATGAGGGAATGATTGGTTTTATTAAAACTATGGATCCTGTTTGTGCAAAAAATGATATTCCGTTTTCCCGGTTGTATGGTAGCAATTTTACTTTGAAAGCTAAATCCTTATCAGCGTACTTAAGAGACTACACATTTCCACTCTTTTCTGGAACCTCTGCTAAATGTAATGGACGGCTTGTGCTGGCTCAGCAGGCAACCTGTTTTCAACCCCAGGTTCGACAAGATGTTTATGTTGGGAAGTGGTGGAGAGTAAATCTGTTACGCTCTGCAACTGGTTATACGCCGCCGATGAAATCATATGTTGACCTACCATTGCATTTTCAGAAAGGGGAAGTATCCTTTGGAGTTGGGTACGAGCCAGTTTTTGCTGATGTGAGCTATGCTTTTACATGTGCTCTACGTAGGGCCAATCTAGCTAAAAGATGGTTTTTTGAGCGACCTGAACCCCCTAGAAGAGAACGCAGCTTACCATGGTGGGATGATATGCGGAACTATATTCATGGGAAATTTAGATTGGATTTTACCAAAACAACGTGGCATCTCCCTGCTAAAACAAGCCCTTATGAGAAGCTAGATCAAATGTTAATCACATCTGACTATTTGGAAATATGTTATGTGGATGGTTATGTCAGTCTGTATTCAAAGTATCTAAAGGTGTACCTAACAAGCCTAGAGAGCCTTGCGAAGAAATGTAGTCTGGAAACTCCACATCATGAAGTAATACCTTTCCTTGAAACCCCCTCCTTTTTCATGGACATTGCGATTCAGTGGGGATGTGATTCAGGTAACCCAATGGATCATTATATATTTGCTCTTCCTGCGGAGGGCAAACCACGGGACAAAGTTCTTGATCCATTTCGCTCAACTTCTCTTTCACTGAAGTGGAGCTTTTCACTTAAACCTTCTACAACTGAACCTGTGAAGCATCAGCAGAATATTCAGGCAGTTTCGAATAATTCACCGACTGTGAATGTTGGAGCTCATGATTTTGTCTGGCTAATGAAGTGGGTTAACATATTTTTTCTTCCTCCCCATAAACTTAGACTGTTTTCCAGGTTTCCACGCTTTGGGGTTCCTAGATTTATACGGTCTGGAAACCTGCCACTTGATAGAGTTATGACCGAACAGTTTATTCGTTTTGATGCTTCACTATTGCAGATCAACAATATGCCGCTACAGGTTGATGATCCCGCTAACGGATTGACACTGCACTTTACAAAATTTAGGCTTGAAATTGCTTTCAGTCGTGGGAAGCAGATATTTACTTTTGAATGCAAGCGTGAACCTCTTGATCTTGTCTACCAAGGCATAGACCTGCACTTACTGAAGGTATCTATCAAGAAAACTCCTGAACCATCAATTTCTAAGGATGCTCAGGTAGAAAATAAGAGCCTGCATATGAAAGCTACAGATAGTCCTGGCAAAAACAAAACTAGTTCAACTGAGAAAAGCCGAGATGATGGATTTTTTCTGTATTCTGATTATTTCACAATACGAAAACAAACTCCCAAAGCCGATGCTGCTAGATTATCTGCATGGCAGGAGGATGGTAGGAAAAAATCAGAAATGCCATTGGCCAAGTCTGAGTTTGATGGGGGAGAGGAAAGTGATCATGCACAATCAGGTAG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Protein Sequence

<aaseq>MMVVGLVQLLVAFVVAWEAVELVLRHGLLLSLFKFALAAALAVAASFVAALFLARVVAWVLRRTAKLSIGCRSFSFNYLRDITIKSPKGAVDSICVGEIRLGLRRPLTQLGFTILNHGPILQLQISDLDIVLRQPAKSAKKKKPPPRKSTSTSPAKGKGKPKGQGKWRLITNIASLLSLSIVELRFKAPKAALGIKDLKIDLSKTGGLDPILNVEIHILPLFVQALEPDGIDNSTSVFSKLDWGKGVGVKNLDLVIGPIVVNLEEKLFTKKKLSAPTVAEKTDEPAADVKSDTKSEGSKLSSLNKKIDLLPEKVSFNMSKLDLKFLPKDHGLLINNEIGGISVRFVKSQPHSDFGEATHLQLETDVSDIHLLMDGATSVLEVVKVATVVSANIPIQSTSPIRAEAGIKISGSQCNIIISRIKPLIPLNSAQKKPTVPRESSTQEKTPKEKLALDLVFTLSAPELTIVLYSLDDIPLYHCCLLSTHFAASKTVNQGTELHAVLGELKLIVAGKPQQSIKDRISGTLLQISRSTIDLEQKVPDKDNCIDNPKSSLSLNISGVRMNVCFYYLELLCTTAMSYKVFLKSIRPPKKRPAQGTSQKTTKNAKGAQIVKISVEQCAVLYVGDMILEDMSIQDPKRVNFGSQGGRVVIINDADGSPRMAYVNSTSLPDHKHVNFFTSIEINQIGLCLNKEKQSVQVELGRSRLTHKEDLLDDKPVEEVTLFDVQKVKFVRRSGGSNDSAVCALINVTEVAVWWEPDPYLELLEVATRLKSIMHRIKHQNSANEIKDDTVYTDTLAKKDSLTEHGQQEKPQKKQELVIAVDVESLKISGELADGVEAMIHVGSIFSENAKIGVLIEGLVVSFCGARIFKCSRTQLSRIPVSISDSLPDKKLQSAATCDWVIQCRNAYVCLPFRLQLRAIDDAVEDTLRAIKLISAAKMSVLFPEKKSSGSSSSSSSSSSKKSKSKSTEFRYVRVIVRDLVAEIEEEPIQGWLDEHIDLMKSVFNESTVRLDLLDELASVKHKDSPKAKLDGSSSEKNNGCPEVDGDAPGVCSFEKLREDIYKQAFQSYYLACQALKVSEGSGACSSGFQSGFKMSTRRSSVMSVCAKDVDVSLSKIDGGDEGMIGFIKTMDPVCAKNDIPFSRLYGSNFTLKAKSLSAYLRDYTFPLFSGTSAKCNGRLVLAQQATCFQPQVRQDVYVGKWWRVNLLRSATGYTPPMKSYVDLPLHFQKGEVSFGVGYEPVFADVSYAFTCALRRANLAKRWFFERPEPPRRERSLPWWDDMRNYIHGKFRLDFTKTTWHLPAKTSPYEKLDQMLITSDYLEICYVDGYVSLYSKYLKVYLTSLESLAKKCSLETPHHEVIPFLETPSFFMDIAIQWGCDSGNPMDHYIFALPAEGKPRDKVLDPFRSTSLSLKWSFSLKPSTTEPVKHQQNIQAVSNNSPTVNVGAHDFVWLMKWVNIFFLPPHKLRLFSRFPRFGVPRFIRSGNLPLDRVMTEQFIRFDASLLQINNMPLQVDDPANGLTLHFTKFRLEIAFSRGKQIFTFECKREPLDLVYQGIDLHLLKVSIKKTPEPSISKDAQVENKSLHMKATDSPGKNKTSSTEKSRDDGFFLYSDYFTIRKQTPKADAARLSAWQEDGRKKSEMPLAKSEFDGGEESDHAQSGSDEEGFNVVVADSCQRVFVYGLKILWNLENRAAIVSWVGDLTQAFQPPKPSPSRQYTQRKILEKKQSTKEAEMSNDGTLSSSPLASQSSDPPKQTKSSEPPSSGPSKLESTSTSDTAMKTSNSSDSEEEGTRHFMVNVVQPQFNLHSEEANGRFLLAAGSGRVLVRSFHSIVHVGQEMFEKALGSSNVAIGETRPEMSWSRYEVSVMLEHVQAHVAPTDVDPGAGIQWLPKIHRRSSEVKRTGALLERVFMPCQMYFRYTRHKGGNPELKVKPLKELAFNSPDITAGMTSRQFQVMMDVLTNLLFARAPRTKKSNLSYPLDNDDDDDTGEESDAVVPDGVEEVELAKIDVEIKEREWKILLDDIRTLSVGSEISADETQTPKSDDATWIVTGSRASLVKCLKKELVNVRNGRKEASSMLRVAMHKAAQARLMEKEKNKSPSFAMRVSLKINKVVWSMLADGKSFAEAEINDMIYDFDRDYKDIGIAHLTTKLFVLKNGLANAKSDTVLAPWNPPSEWGKNAMLRVNARQGAPTGGNSVIESLLVDIYPLKIYLTEAMYRMMWGYFFPGDEQHPQKRQELFKVSTTAGTRRVKKSTSIAETNSPSKQSLKDSMLLQKPELRRTSSFDRTWEETVAESVANELVTQFQSQSNAPPESQDAPKEAKLVRSARSTREEKKNMDPNEVKQTRPQKMMDFRNINISQVELQLTYEGLPFAVSDGKKFKAKSTSQKEPTASLIAASDFNLSDSDGDEAGGSDQLPAFLKKPNDGAGDGFATSVKGLFSSQRKKAKAFVLKTMKGDADHDFQGERSENEIEFSPFARQLTITKTKKLIRRHTKKIKSKVPKGAATSQELGSELPPRGPSGNQTDSSSSDDNDSSPTETNPKD</aaseq>

Gene Sequence

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