Difference between revisions of "BGIOSGA012987"
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Revision as of 15:48, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA012987 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012987, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_12282 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA012987-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA012987-PA |
| Length |
15966 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:22930517..22946482 |
| Sequence Coding Region |
22930517..22930928,22932484..22932662,22934717..22934838,22934931..22935081,22936335..22936406 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:22930517..22946482 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:22930517..22946482 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCGCCGGCTACGGCGAGCAGCCGCTGCCGCTGGTACAGGAGGCCACCGCCCGAATCTTCTCCGGTGGCGCAGACGCGTCCCGCACCACCGTCCGATTGGCCCACTTCCTCCTCCCCCGCGCGGGCGCCTCCCACCCGCCCGCTCTCCCGCCCCTGCCTCCCAGCGATTTCGGCCCCGTCCTCGACGACGGCCTCAAGGTCGAGTTCAAGGGCTGGGCGCCGGAATCCCCCAAGCTCTGGAGGCGGTGGGTCGCCAAGCTCCGCCCGCGCCACGAGCCCCTGTGGCGTAAGGTTGGGATCCTCGACGCCGTCCTCGCCACCACGTGCCGGGTGCGCCGCGACGAGGGCGCGCTGCTCCAGCTCGCCGACTTCTGGTGCGGCGAGACCAACACCTTCGTGTACCCCTGGGCTTGTCAACCACTAGGCGTTCGCTTCTTTGAAGGAGCTGGCTGTGTTGGAGCAAGCAGCCGCCACCCTCGTGCCCAGGGCAGTGGATCCAAAAGAAAACGTTTGCCCTCTCTCGAGAAGACTACTGGGGTGGAGACACTAGTTAGGACGAGCAGCTCTGAGGTGAGGCTTCTATTTCAGGCACGTTCCAAACTTCGGCACCACAATGCAGCTGTACAGGTGCCGATAGGATTAGAAGAAGAGTTTGAAGGCCTGGTGGATCTTGTGGAGTTGAAGGCTTATAAGTTCGAGGGTGGTAGTGGCCAGAATGTTGTTGCATCTGATGTTCCATCCAACATGCAAGACTTAGTCATGGAGAAGCGGCGTGAACTTATTGAAGTTGTTTCTGAAGTAGATGATCAGCTTGCTGAAGCTTTTCTCAATGATGAACCAATACAAGCTAATCAACTCAAGGCAGCTATTCGAAGAGCAACAGTAGCACGCAAGTTTATACCAGTTTACATGGGAAGTGCATTCAAAAATAAGGGTGTCCAGCCGCTTCTTGATGGTGTGCTTGACTATTTACCTTGTCCAATGGAAGTTGAAAGCTACGCACTTGATCAAAACAAATCAGAAGAGAAGGTCTTATTGGCTGGAACTCCTGCTGAGCCACTTGTGGCATTAGCATTTAAGCTGGAGGAAGGTCGGTTTGGTCAATTGACATATCTAAGAATCTATGATGGGGTTATAAGGAAGGGTGATTTCATTTACAATGTGAATACAGGGAAGAAGATCAAGGTTCCTCGCTTGGTAAGGATGCACTCCAATGAGATGGAGGATATTCAAGAAGCACATGCTGGTCAAATTGTTGCTGTCTTTGGTGTTGATTGTGCGTCAGGTGATACATTTACAGATGGATCAGTGAAATATACCATGACTTCCATGAATGTCCCTGAACCTGTGATGTCCTTGGCTGTCTCCCCTATATCTAAAGATTCTGGAGGACAATTTTCAAAGGCTCTGAATCGTTTCCAGAAAGAGGATCCTACTTTCCGTGTAGGTCTGGATCCAGAAAGTGGAGAGACAATTATTTCTGGGATGGGTGAGCTGCATTTGGATATCTATGTTGAACGCATCAGGAGAGAGTACAAGGTTGATGCAAAGGTCGGAAAACCTCGTGTGAACTTCAGGGAAACTATCACTCAGCGTGCTGAATTTGATTACTTACACAAAAAGCAATCTGGTGGTCAAGGTCAATATGGACGAGTTTGCGGGTACATTGAGCCTCTTCCATCAGAAGCTGATGGTAAATTTGAGTTTGATAACATGATCATTGGACAAGCAATTCCTTCAAACTTCATACCAGCAATTGAGAAGGGTTTTAAGGAAGCTTGCAATTCTGGTTCGTTGATAGGGCATCCTGTGGAAAATATTCGAATTGTGCTGACTGATGGTGCTTCACATGCAGTGGATTCCAGCGAACTTGCTTTTAAGTTAGCTTCTATCTATGCTTTTAGACAGTGTTATGCTGCTGCTAGACCTGTAATATTGGAACCAGTGATGAAGGTGGAACTAAAAGTTCCTACAGAGTTCCAGGGCACGGTAACCGGTGACATGAACAAGAGAAAGGGTATCATTGTTGGAAATGATCAGGAAGGCGACGACACAGTTGTGGTTTGCCATGTTCCACTAAACAATATGTTTGGATATTCAACAGCTCTTCGGTCAATGACACAGGGGAAAGGTGAATTTTCGATGGAGTATCTGGAGCACAATACCGTATCGCAGGATGTACAGATGCAACTAGTGAATACGTACAAGGCCAGCAGGGGCACAGAGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAGYGEQPLPLVQEATARIFSGGADASRTTVRLAHFLLPRAGASHPPALPPLPPSDFGPVLDDGLKVEFKGWAPESPKLWRRWVAKLRPRHEPLWRKVGILDAVLATTCRVRRDEGALLQLADFWCGETNTFVYPWACQPLGVRFFEGAGCVGASSRHPRAQGSGSKRKRLPSLEKTTGVETLVRTSSSEVRLLFQARSKLRHHNAAVQVPIGLEEEFEGLVDLVELKAYKFEGGSGQNVVASDVPSNMQDLVMEKRRELIEVVSEVDDQLAEAFLNDEPIQANQLKAAIRRATVARKFIPVYMGSAFKNKGVQPLLDGVLDYLPCPMEVESYALDQNKSEEKVLLAGTPAEPLVALAFKLEEGRFGQLTYLRIYDGVIRKGDFIYNVNTGKKIKVPRLVRMHSNEMEDIQEAHAGQIVAVFGVDCASGDTFTDGSVKYTMTSMNVPEPVMSLAVSPISKDSGGQFSKALNRFQKEDPTFRVGLDPESGETIISGMGELHLDIYVERIRREYKVDAKVGKPRVNFRETITQRAEFDYLHKKQSGGQGQYGRVCGYIEPLPSEADGKFEFDNMIIGQAIPSNFIPAIEKGFKEACNSGSLIGHPVENIRIVLTDGASHAVDSSELAFKLASIYAFRQCYAAARPVILEPVMKVELKVPTEFQGTVTGDMNKRKGIIVGNDQEGDDTVVVCHVPLNNMFGYSTALRSMTQGKGEFSMEYLEHNTVSQDVQMQLVNTYKASRGTE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..412#1968..2146#4201..4322#4415..4565#5819..5890#6183..6278#6791..6879#6998..7064#8122..8160#8294..8354#8497..8606#8691..8765#8839..8907#11418..11539#12974..13099#13189..13309#13425..13525#13856..13916#14852..14905#15862..15966#ATGGCCGCCGGCTACGGCGAGCAGCCGCTGCCGCTGGTACAGGAGGCCACCGCCCGAATCTTCTCCGGTGGCGCAGACGCGTCCCGCACCACCGTCCGATTGGCCCACTTCCTCCTCCCCCGCGCGGGCGCCTCCCACCCGCCCGCTCTCCCGCCCCTGCCTCCCAGCGATTTCGGCCCCGTCCTCGACGACGGCCTCAAGGTCGAGTTCAAGGGCTGGGCGCCGGAATCCCCCAAGCTCTGGAGGCGGTGGGTCGCCAAGCTCCGCCCGCGCCACGAGCCCCTGTGGCGTAAGGTTGGGATCCTCGACGCCGTCCTCGCCACCACGTGCCGGGTGCGCCGCGACGAGGGCGCGCTGCTCCAGCTCGCCGACTTCTGGTGCGGCGAGACCAACACCTTCGTGTACCCCTGGGGTGAGGCCACGGTGGACGCTCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCTTATCTTCCCCAACTAAGACTCGGACACCTTATATTCCAGGAAGATAATTTCATTCTTTATCAATCGTATTTCCTTAATTAAAGGATACATTCTCATATACTATCGAGTATATGGTATTGCCGTATTACACAAACCCATGTATAGGAGGTATGTCTTATCCTTGACACTGACAGTAACGCCCTGACACTGACAGTAACACCCGACTCTAATGCAAATGAGTAGGTTAATGTTCCAGAGCAAAGATCCTGAAGAAAATCATTGTCGAACTCACCTAACCATTCTCGAACAGCTGAGTAAGTTTAGAGTACATGACATGGTCCTTCTATTCTCTTTGTCCGAGACTTCAACTCAAATTTGAATTTGGATTGAAGTCAGAAACTTTAAACTGCTATAAACAAATCCACAAAAACTCCGACGGTGATTTCTCCGTCTTCCTCCAAATTCGAACCGTCGGACGTGGGTTATAAATTCCACTTATGAGATCCATTTGGGTTACGTTTTCCTAAACAAACATTTTGCTTCCCCTTCGCGCACCTTCCCACTGCTCCAACAAGCAAAAAAAAAACCCTAAGCCACAAACTTCCCTCATCTCCTCAGCGACTCTCCATGGATCTTCCGGAGTCCTTCCGAGTTTCTTTCACTTCTTCTTGATTTCTATGATATGCACCTTCTCCATCTGAATCCTAACTCCCTTGATTCCTTAGTATCTTCACTCATTTATGCGAGGCTTACCTTGGGGTACAGCTTTTCATAGCTCTATTTAGATATTTTATAAGCTTGGATGGATGGAGGCCTTTAGAATCTCTGGATGTTGTAGTCTCCATCTGAGGGACAAGATGAAGGGTAGATACATCCCCTTTAACTGTCCATCCTCTAGAAAATACTAGAGGGATAGCTGGTTTTATCTTCATGTCACTGATACCACTCCTTGTCTTGCTATTCCCGAAGAAAATCCCTCATATTCTGGGGTCATGGACCTCCAAACATTCTCTGACCCCTGCTCTGAAGGGATTCAATGACAAAATTCATGATCTCTAAGAACGCGGTCTGACTGGGTACGAAGTTGTAGAGAAGACTTTGTTCGTCGTCTAATCCAGTCTCTCCAAGCCCGTGCTCACCCTGCATACGAGTACATGGGGGCAAAGGACATGACGTGGATATCGCACTTTGGTAGAACCCAAAGTTTTCTGATAACCCTAGTACTATGAACTGTCTCTAACATCTAATCTTTCACTGTTATCTTTGTTATAGCTGTTTCTGATGCAGCCGTGGTGAAGTGGGTAGGGCAGGTAGTGGTCGATCCACCATCGGCCACTGCTGACATCCCGATGCCGATAAGCAACCTCCCATAGGCCAAGAAGGACATCATCGTGAACGTAAGCATCTCGGACTATTCTCCATATCTATCATATATTTGGCTATAGAAGTAGTAATCTTGACCCATACTAGCATGGCCTCTAACGGATGTGATCGGCCAGCTTGTCAACCACTAGGCGTTCGCTTCTTTGAAGGAGCTGGCTGTGTTGGAGCAAGCAGCCGCCACCCTCGTGCCCAGGGCAGTGGATCCAAAAGAAAACGTTTGCCCTCTCTCGAGAAGACTACTGGGGTGGAGACACTAGTTAGGACGAGCAGCTCTGAGGTGAGGCTTCTATTTCAGGTTTGTCTGACAATCATGGTAGCCTTCTCGATCTTAACCTTTCTTGTTTGCAAATAACTTCCAGCACAAAGTCCGCCTCCATCAAGAAGGGAATGCTACCGATGAAACAAAAAGTCGGATGAGTACCAACTTGACCTTTTTTTGTTTCCACTTGACGTCGTGTAGCTTTTGTAACCCAAGATGTTTTGAATGCAGCCCTTCACCTGCGGCCTCGGGACAATGTGCCAAGGCTTGTGAGGAGGTGAGCTCCAAGTCGCCTCATGCTACTGCTGCTGCTACTGTTGTCCCTACATTTCTTCCTCCGTCGGCCGGCGCCCTTGTCATCTCAGGCTCGACCTCTGCCTCCAACAAGCTGCTACAAGCTTATCGATTGTTGGAAGCAAGTGCCTGAGATGCCGTGGCTGAGCTTGGACAACTTGCAAAAGTCGCCTATTCGGTTGACCCCGCATTGGGGCCCTGGAAGCCCTATTAACGGGAAGAGCGTGCGGACAACGCCAAGCTGCAGGAGGAGATTGCCAGCGCGGAGGAATCACCAAGTCCAAGGACAACCTGGCTTCACTCTGGCAAGCTCTGCACTAGAACTACGGGCGCCTCGATGTGGCCGCAAAAGGGCCTGGGGATGAGCGTTCCTCATCCCGAGTTTCCTGACGAAACCACGGTCCTGGTGTCCCTTGGGTCGCTGATAACCAAGCTGGAGACCGCCGCGAGCTCCCATGCAGACCAAGTAGACAAGGGAATGAGGTCTAGGATCCAGACCGACGCATGCCACGTTCTTATGTGCCTCAAACTCACACGCCCGGAGGTCAACATTGAACAAATGATGACCAAGGGAGGAGCCAACAAGCGTCGCGAGGACATGATATCAGAATTGGAGGATGTCGAGGAGTCTGTGATCCCCTTTTTTGAAGAGTAATATGCTAATTTTAGTTTCATTGCAACCTTAAGGACAAGTATTTCGTCTGTTGCCCGAGAACACTTCCCTTCTGTTATCCTTTTAAGGTTTCCATCTTGTCTTTTGTATTCTGTAGATGCTTTGAAGTCGAGAATGAGAACGTCCAGCAAGGCGGACGCTCGTCAGGCTTAATTGCACATCCTAGTACGCCCTAGGCCTCGTCAACCCCGAGTGATGGCGACCGTGCTCTGGTCGTCGTCACTTCTGATGGCACGTTGGCCTCTCAAGATGATCAACTCACGCTCCTTCGTGAGAAATATCAAGGTGCGAAAACCCGAAATTATAGTGTATTGCTCCTGTACTCAGAACAAAGGATGCTAATGGTGTCGCTGTCTATTCTAGATCTTAAACATTCTCTCGAGGAGATGAAACGCTGGGCCGAGTACTGGAGAACTAAGTTCGAAAAGAAAGAGCCGGAGCGAGCAACCGACAATATCAAGAAAGGCTAGAACTCGAAGCTTCTCAAGGAAAGAGAAGTCCAGATGGAAGCTTATACTGAAGGTTGTTGCACATCGCTTGATCAGCTATGCCAAGAGTTGCATGTGGTTCGTCTAGCTCCTAAGAGATCCATAACAGGTTATCTAGGCTGGCTGTGGAGTACATGCGATGACCTGGTTGGCACCGCTCATTGGATCAACAAAAGCCTCAAGCAAGAGAGTGTCGGACCAATCAGTTCGCTGGTGGTCATGTGCTCGCGTGCATCCGTATTTTGTGACCGCAGATGAACATGAACTGTCTTCGGCAAAGGTTTTCTCTTTCTCCACAGACGGCCGCCAAGATCGATCAACTAGCCCCCGAGCCAATGTCGGTGGTGATATTGATGTCGTCGTCCAGCGAACTCTTAACAGATGGACTGATTAATACTTCTAGGAACATGCCAGGTTCCATTTGCTCTCTACTAGAAGCTCGTCGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCTAGTTCCTGTAATTGATTCGTTTTTGGTCTTAACATTCCTTTTATTTCTGATGAGGCATTTCACAGTGATATGTTGCTATTTCCATAGCTGATAGCTTTCATTTTCTTTCTTTCTTTTCTTTTTTGCTATTGAAGGCACGTTCCAAACTTCGGCACCACAATGCAGCTGTACAGGTGCCGATAGGATTAGAAGAAGAGTTTGAAGGCCTGGTGGATCTTGTGGAGTTGAAGGCTTATAAGTTCGAGGGTGGTAGTGGGTGCGTCCCTGTTCTTTACAAGTTCTTCACCCTGAAGGCTATGTGCATTTGGATATTTCAATAACATACCTAGCCTCATGTTTAATGTGCAGCCAGAATGTTGTTGCATCTGATGTTCCATCCAACATGCAAGACTTAGTCATGGAGAAGCGGCGTGAACTTATTGAAGTTGTTTCTGAAGTAGATGATCAGCTTGCTGAAGCTTTTCTCAATGATGAACCAATACAAGCTAATCAACTCAAGGTTCGTTAATCATACTTCAATTTTTTCGTATATTATAATCTTACTCTGCCATTTAATATTCATGGAATTATTCATATTAAACAATATTTAAATGCCTGTTGTATTGCAATGGATCTCAAATGCATAATACTATAAAATGTAAACTAGAAATAAATCGAAGTTCCTTATATAGAAAACCATTGAAGACCAAT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