Difference between revisions of "BGIOSGA013338"

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA013338

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013338, complete gene.

LocusTag

OS03G0681300

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA013338-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA013338-PA

Length

21552

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:31117408..31138959

Sequence Coding Region

31117408..31117478,31119070..31119181,31120163..31120359,31120817..31120868,31122155..31122259
,31122315..31122421,31122715..31122856,31123782..31123955,31124036..31124113
,31124194..31124445,31124766..31124939,31125430..31126830,31128103..31129948
,31130100..31130200,31130806..31131162,31131308..31131426,31132910..31133162
,31134313..31134537,31135029..31135094,31136001..31136099,31136186..31136306
,31137203..31137498,31138483..31138959

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGTCGTCGCCGGTCAAGTTCTTCTCGGTCTTCCTCGCTGTCTCCGTCGTCGGATGGGTCGTCTTCACATTTGCATCGCGATTATTAGCTTGGTTCTTGAGCCGTGTACTACATGCCTCTGTTGGGTTCCGAGTTGCTGGGTTCAACTGCTTGCGTGATGTAACAATAAAATTCTCCAAGGGTTCTCTTGAATCTATTTCAATTGGTGAAATAAAGCTAAGTTTCCGCAAGTCATTGGTCAAATTAAGTTTTGGTTTCATATCCAAAGACCCAAAGCTACAGTTACTAATAAATGATCTTGAAATTGTAACAAGATCTTCACAAGGAAAAAAATTAAGCAAGCCAGGAAAGTCGCGTTCCACAGGAAAAGGAAAATGTGAGCTTTTTAGTGGGAGGTGCACATGTAGAGGCCCTAAAGGATATGGTAGGGTACCAAGTGGTGCTGTTGACATTAAAGAGTTAAAGGTGGACACATTTAAAATTGCTGGACCTAATCATATTCTTGGTGTTAAGTTACATCTTGTACCTTTGAATCTTGATGCTTTCCAGTCTGATCAAATATCTCTAGCTAATTCAGAGAAAGTTGTTGCTCCATTTGTTTGTGAAGATTTGTTCGTTACTTGTGACTTTGGCCATGAAAAAAACACACAAAGCCAGAGGGTTTTAGTGGCTCTGAAAATGGTGGAGATGCTTCCCCTGGATGCTTCAGCAATGAACCAAACATCAAAAAGCAAATCCATTCTACCATCATTGAAGAAACAGATCCTTGCATTTCCGGATAAGATTAGCTTCAGTGTGCCGAAGCTTGATGTGAAGTTCACACACCTGGGTGAAGGACTTAGTGTTGATAACAATATAATGGGGATCCACTTTACTAGTGCAAAGACCGTGCCACAGGATGATCTAGAGGAAGCCACACCTCATTTTGATGTTCAAATTGATCTCAGTGAAATTCATTTGGTGAGAGAAGGCTCTAGTTCTCTGTTGGAAGTGCTTAAAGTTGCAGCTGGAGCTTCTTTGGATATTCCTGTTGATCCATTTCTTCCAATCAGAGCTGAGATCGATGCCAAGCTTGGTGGTACACAGTGCAATCTTATGTTAAGCAGATTGATGCCATGGATGCGTCTTCATTATCTGAAAAGCAAAGGAATGAAGATTTCAAAGGAGAACTCTCATCGAGGAATTTCTCAAACAAAAGAGATCAAGCTAATTATGTGGACCTGCACAGTTTCTGCTCCTGAAATGTCCGTAATGCTTTACAATCTTAATGGATTGGTTTTGTACCATATCTGTTCCCAATCATCTCATCTGTATGCAAATAACATTGCAAGCAAGGGTATTCAGATACACACAGAGCTTGGTGAATTGCAAGTGCATATGCAAGATGAATACAAAGAATTTTTAAAGGGGAACGTATTTGGTGTTGACACCTACTCTGGTTCCTTAATGCACATTGCTCGGGAGAAAAGGTCAACAGAAGCTGAACTGGAACGGGTGAAGGCAATCTATGAGGAGGATCTTAGCTCTAGTGTCAAAGTGACACTGCTAGATATGCAGAATGCTAAAATTGTTCGCCGATCAGGTGGCCTTCCAGATGTTCCTGCTTGTTCCCTCTTTAGGGCAACAGACATTAATCTCAGATGGGAGCCTGATGCGCATTTAGCAATACTCGAGACCTTCATCCGCATCAAGTATTTCCTACATAATAACAAGCCAATCAATGCTGAAGTTGGCGATATCTATGAGAATGGACCTGGTAGTATATCTACTGGTCCAGGAAAACCTCAGAAGTCTGACAAAAGAGGGTCGATTTTTGCTGTTGATGTGGAGGTGCTCAGAGTATCTGCTGAGCTTGCAGACGGTGTTGAAGCAAACATGCATATACAATCTATTTTTACTGAAAATATTATGATAGGTGTACTGTCTGAAGGCCTTTGTCTCAGTCTTAATGGTGCCAGAATAATGAAGAGCACGCGAATACAAATCTCATGTATTCCTTTTGGCACCAGTAGTTTGCTTGATGCAAAGGTTGAGTCATCATCCAAAAGAGATTGGGTTGTTCAAGGGTTAGATGTCCATATCTGCATGCCTTATAGGCTGCCATTGCGTGCTATAGAGGATGCTGTTGAAGATATGATTCGTGCCCTAAAGCTTATCTCTGCTGCCAAGAAAACTATGCTGTTTCCTGACGGCAAAGAAAACCCAAGAAAGGTTAAGTCTGGCACCACCAGCTTTGGATCTGTAAAGTTTGTGTTACGTAAACTGACAGCAGAAATAGAGGAGGAACCCATTCAAGGTTGGCTTGATGAACATTATCATTTGATGAGGAACAAAGTCTGTGAATTGGGAGTTAGGTTGAAATTTCTTGAAGAGGCTATATCAGGAAGTGTAGATCCTAATAATTGCAGTTCCAAGGAGAAACTTCTCTATGATGGCATTGAGGTTGACATGCATGACACTGCAGCTCTTCAAAAATTGCGGGACGAAATCCATAAGCAAGCTTTTCAATCTTATTATACGGCTTGTCAGAAAATGGTACATGCAGAAGGATCAGGAGCATGTGCAGAGGGTTTTCAAGCTGGATTCAAACCAAGTTCACGGAGAGCTTCACTTCTTTCACTTTCTGCTTCTGAACTGGATGTTACTTTGACCAGGATAGATGGTGGAGAGGTTGCGATGGTTGAATTCATAAAGGGGCTCGATCCTGTTTGTCAGGAGAAAGATATACCATTCTCCCGGCTATATGGGAGTGATATTGCTGTGCTTGCAGGTTCATTGGTCATACAACTGAGAGATTATACTTCTCCTCTCTTTTCTGCAACCAGTGGGCAATGCCAAGGTCGTGTTATTCTTGCTCAGCAGGCAACATGTTTTCAACCCCAAATACAGCAGAATGTATATGTTGGAAGATGGCACAAGGTCATGATGCTACGTTCTGCCAGTGGTACCACACCAGCAATTAAAATGTACTCAAATTTACCTATTTATTTCCAGAGGGGGGAGATTTCCTTTGGTGTTGGTTATGAACCATCTTTTGCTGACATAAGTTATGCATTTCAAATAGCCCTAAGGAGGGTTAATCTTAGCACCAGAGTAAAAGATTCTGGCCCAACAAACCAACCACCTAAAAAGGAGCGCAGCTTGCCATGGTGGGATGACATGAGATATTACATCCATGGAAAGATAGTTTTGTATTTCAATGAGACCACATGGAAGTTCCTGGCAACAACAAATCCTTATGAGAAGGTGGACAGGCTCCAAATTGTTTCCGAATACATGGAGATCCAGCAAACTGATGGGCATGTAGATGTTTCTGCAAAGGAATTCAAGATGTATATCAGTAGCTTAGCAAGTATGATGAAGAACTGCACATTAAAAGTTCCACCTGGTGTGCCCAGACCTTTTATCTATGCTCCTTTCTTCTCCCTTAATGTTGTTATTGATTGGCAGTGTGAATCTGGCAATCCATTGAATCATTATTTGCATGCGCTCCCCATTGAGGGTGAGCCAAGGAAGAAAGTTTATGATCCATTTCGATCCACTTATCTCTCGCTTAGGTGGAACTTCTCCCTCAAACCTTTGCAAGTACAATACGATAATGACGCATTATCTCCCAGTTATGGAAATAGTTCAATGCAATGTGGAGCCATCTCTGATAATCATTCCAAACTGGCTAATGTTGAATTCCCTACCATGAATCTGGGAGCCCATGACCTTGCTTGGGTTTTCAAGTGGTGGAGCTTAAATTATAGCCCTCCTCACAAACTGCGTTCGTTTTCGAGATGGCCTCGCTACAAAATTCCTCGAGCTGCTAGATCTGGTAACCTCTCACTGGATAAAGTTTTGGTCGAGTTCTTTTTCCGTGTTGATGCTACTCCCTGTTGCATAAGACATGCAACCTTAACTGAGGATGATGCAACCTTAACTGAGGATGATCCTGCTAATGGCTTGACCTTTAAAATGTCAAGGTTGAAGTATGAGTTATGTTACAGTCGGGGCAAACAGAAATACACATTTGATTGTAAGCGTGAATCTTTGGATCTTGTTTACCGTGGTCTTGACCTTTACAAGCCAGAAGTTTATATCATGCGAGACATAAACCTGTCTTCAGCTGAAACTGTATCCAACTTGAAAACAAATACACAACTAGGAAAGGTTATTCATAATAAAGGCAACATGGGCAATTTCCAGGATAAACATGAGGATGGCTTCCTCTTATCTTGTGATTATTTCACAATAAGAAGACAATCTCGTAAGGCAGATCCTGCAAGACTTATGGAATGGCAGGATGCTGGTAGGAATCTTGAGATAACATATGTTAGATCTGAGTTTGAGAATGGAAGTGAAAGTGACCACACTCTTTCTGAGCCTAGTGATGATGATGATGGCTTCAATGTGGTGCTAGCAGACAATTGTCAGCGCATTTTTGTCTATGGCCTTAGACTTTTATGGACTATTGAGAACCGAGACGCAGTTTGGTCATGGGTTGGAGGAATTTCCAAAGCATTTGAGCCTCCAAAACCCTCTCCGTCGCGGCAATATATTCAAAGGAAGATGATTGAGCAAAGGCATACTACTGAGGGTTCTAAACTAACTCAAGATGCTACCTCTTCTGTCCATGTTGGTTCTCCTTCAGGGCAACATGTTGAGGCTCTGGGTTCTACTTCCCCATTACATAGTAAAGCCAATTTATCCTATGATATTGCCGGGAAGCATGGCCTTTTTGATGATTCAGATAAGGGAGGGAATCTCCAATTCATGGTTAATGTTATTAAACCCCAATTCAACCTACATTCTGAAGAAGCCAATGGTAGGTTTCTACTTGCTGCAGCCAGTGGGCGTGTGCTGGCTCGTTCGTTTCATTCAGTTGTTCATGTTGGGAAAGAAATGCTAGAGCAAGCACTGGGGGCAAGCAGTATACAAATTCCTGAGCTACAACCTGAAATGACCTGGCAAAGGGCTGATTACTCAGTGCTTCTTGAAGATGT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Protein Sequence

<aaseq>MASSPVKFFSVFLAVSVVGWVVFTFASRLLAWFLSRVLHASVGFRVAGFNCLRDVTIKFSKGSLESISIGEIKLSFRKSLVKLSFGFISKDPKLQLLINDLEIVTRSSQGKKLSKPGKSRSTGKGKCELFSGRCTCRGPKGYGRVPSGAVDIKELKVDTFKIAGPNHILGVKLHLVPLNLDAFQSDQISLANSEKVVAPFVCEDLFVTCDFGHEKNTQSQRVLVALKMVEMLPLDASAMNQTSKSKSILPSLKKQILAFPDKISFSVPKLDVKFTHLGEGLSVDNNIMGIHFTSAKTVPQDDLEEATPHFDVQIDLSEIHLVREGSSSLLEVLKVAAGASLDIPVDPFLPIRAEIDAKLGGTQCNLMLSRLMPWMRLHYLKSKGMKISKENSHRGISQTKEIKLIMWTCTVSAPEMSVMLYNLNGLVLYHICSQSSHLYANNIASKGIQIHTELGELQVHMQDEYKEFLKGNVFGVDTYSGSLMHIAREKRSTEAELERVKAIYEEDLSSSVKVTLLDMQNAKIVRRSGGLPDVPACSLFRATDINLRWEPDAHLAILETFIRIKYFLHNNKPINAEVGDIYENGPGSISTGPGKPQKSDKRGSIFAVDVEVLRVSAELADGVEANMHIQSIFTENIMIGVLSEGLCLSLNGARIMKSTRIQISCIPFGTSSLLDAKVESSSKRDWVVQGLDVHICMPYRLPLRAIEDAVEDMIRALKLISAAKKTMLFPDGKENPRKVKSGTTSFGSVKFVLRKLTAEIEEEPIQGWLDEHYHLMRNKVCELGVRLKFLEEAISGSVDPNNCSSKEKLLYDGIEVDMHDTAALQKLRDEIHKQAFQSYYTACQKMVHAEGSGACAEGFQAGFKPSSRRASLLSLSASELDVTLTRIDGGEVAMVEFIKGLDPVCQEKDIPFSRLYGSDIAVLAGSLVIQLRDYTSPLFSATSGQCQGRVILAQQATCFQPQIQQNVYVGRWHKVMMLRSASGTTPAIKMYSNLPIYFQRGEISFGVGYEPSFADISYAFQIALRRVNLSTRVKDSGPTNQPPKKERSLPWWDDMRYYIHGKIVLYFNETTWKFLATTNPYEKVDRLQIVSEYMEIQQTDGHVDVSAKEFKMYISSLASMMKNCTLKVPPGVPRPFIYAPFFSLNVVIDWQCESGNPLNHYLHALPIEGEPRKKVYDPFRSTYLSLRWNFSLKPLQVQYDNDALSPSYGNSSMQCGAISDNHSKLANVEFPTMNLGAHDLAWVFKWWSLNYSPPHKLRSFSRWPRYKIPRAARSGNLSLDKVLVEFFFRVDATPCCIRHATLTEDDATLTEDDPANGLTFKMSRLKYELCYSRGKQKYTFDCKRESLDLVYRGLDLYKPEVYIMRDINLSSAETVSNLKTNTQLGKVIHNKGNMGNFQDKHEDGFLLSCDYFTIRRQSRKADPARLMEWQDAGRNLEITYVRSEFENGSESDHTLSEPSDDDDGFNVVLADNCQRIFVYGLRLLWTIENRDAVWSWVGGISKAFEPPKPSPSRQYIQRKMIEQRHTTEGSKLTQDATSSVHVGSPSGQHVEALGSTSPLHSKANLSYDIAGKHGLFDDSDKGGNLQFMVNVIKPQFNLHSEEANGRFLLAAASGRVLARSFHSVVHVGKEMLEQALGASSIQIPELQPEMTWQRADYSVLLEDVQAHVAPTDVDPGAGLQWLPRILGSSEKLKRTGALLERVFMPCEMYFRYTRHKGGTADLKVKPLKELIFNSPNITATMTSRQFQVMLDVLTNLLFARLPKPRKNSLQYSSDDEDVEEEADEVVPDGVEEVELAKISLEQKERERKLLLDDIRSLMGTGNNHTSNFLSVERDDCLWMINSGKSLLVERLKRDLENLKKSRKSASSTLRKALQKAAQLRLMEKEKNKTPSCAKRISMKISKVVWSMIADGNTFAEAEISEMVFDFDRDYKDIGVGRFTTKCFEVEIHPLKIYLSETMYRMMWDYFFPEEDDSQRRQEVWRVSTSTGARRARRISTGADAVASTSYSVREHELPGRSELRRTSSFEMTLEESAVDSITNNNVVSLVNSNVSSRDTNNFMADNSVAAAEMFRSRTKDSKPTKSVRLSQDEKKVGKSHDEKRTRARKLIEFHDIKISQVKKFKAHNRETHDGAVPDHDLNLSDSDGDHHGKPDQFPVSWLKRPGEGAGDGFVTSIRGLFNSQRRKAKAFVLRTVRGDGDNECHDEWSDSDGEFPFARQLTITKKLLRRHTRKLRPRGQKNTGLTLQDSLPSSPRETTPYQSDSDSSSESPYEDFHE</aaseq>

Gene Sequence

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