Difference between revisions of "BGIOSGA005750"
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Revision as of 18:36, 20 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA005750 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA005750, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1038_A06.28 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA005750-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA005750-PA |
| Length |
11843 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:31366629..31378471 |
| Sequence Coding Region |
31378234..31378471,31378056..31378126,31377808..31377942,31377076..31377129,31376706..31376764 |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:31366629..31378471 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGAGCCCCGCGAAGGAGGAGGCGGGAGGGGAGCTGGCGATGGAGATCGAGTCCACCGTCACGGCGGAGGACTGGCGCCGGGCGCTGGCACTCGTGGTGCCCTCCGTCGTCGTCCTCCGCACCACCGCGCCGCGGGCCTTCGACACCGAGGTCGCCGGCGCCAGCTACGCCACCGGCTTCGTCGTCGACAAGTCCAGGGGCATCATCCTCACCAACCGACACGTCGTCAAGCCAGGGCCTGTCGTCGCGGAGGCGATGTTCGTGAACAGGGAGGAGATCCCCGTGTATCCCCTGTACAGAGATCCTGTACATGATTTTGGTTTTTTTCGCTATGATCCAGGTGCTATCAAGTTCCTTAAGTATGATGAGATCCCGCTAGCACCTGAAGCAGCATCTGTTGGTCTGGAAATCCGGGTTGTCGGCAATGACAGCGGCGAAAAGGAGACATCTCTTCAACTAGTTGGCTCAGAAACTGTAGATATGTGCCAATCAATGGTGTCAATTTTGGCGGGAACACTTGCTCGACTTGATAGAGAAGCACCTTACTACAAGAAGGATGGGTACAACGATTTCAACACATTCTACATGCAGGCTGCATCTGGTACCAAAGGTGGCTCTAGTGGTTCCCCTGTTGTTGATTGTCAAGGAAGAGCTGTCGCCCTGAATGCTGGAAGTAAATCTTCCAGTGCTTCTGCGTTTTTCCTTCCATTAGAACGTGTTGTTAGGGCACTTAATCTGATACGTGACAGTTGGGAAGCTTTTGGTAGCAAGCCTGAATCTGATTACATTCCTCGTGGTACACTTCAGGTGACCTTTCAACACAAAGGATTTGAAGAAACTCGGCGTCTTGGACTCAGGAATGAAACAGAACAGATGGTACGCCTTGTTTCTCCATCAGGCGAGACTGGAATGCTGGTTGTTGATTCCGTGGTTCCGGAAGGACCTGCACATAAACATTTGGAACCTGGTGATGTGCTTGTTCGCATGAATGATGAGGTTGTAACACAGTTTCTCGCAATGGAGACCTTGCTTGATGACAGTGTTGGCAAGGAGATAGATTTGCAGATCGAAAGAGGTGGTACACCTTTAACAGTAAAGTTGGAGGTTGAGGATTTGCACTCTATAACTCCAAATCATTTCTTGGAAGTTAGTGGTGCTGTGATCCATCCACTTTCGTACCAGCAGGCAAGGAATTTTAGGTTCAAATGCGGTCTCGTATATGTTGCTGAGGCAGGGTACATGCTCTCTCGGGCATCTGTTCCACGCCATGCTATTATTAAAAAGCTCGCAGGAGAGGATATTGAAAATTTAGGGGACCTTATTGCATGTATTTCAAAACTATCTAGAGGAGCAAGAGTTCCTCTTGAATATGTAAAGTACACCGACCGTTATAGGAATAAGTCTGTACTGGTGACCATTGATCGGCATGAATGGTATGCGCCTCCTCAGTTATTTACTCGAAATGATGCAACTGGCTTGTGGACTGCAAAATCAGCTATACCGCCGGAATCTCCTTTTATAGCTTCAGCTCATCATGCTGGTCCTATTGATGCAAACTCCAATTCTGTTTCATCTTTACCTGAATCTAGTCCTATGGATCTCAAGTGCCAGCATGAGTCTGAGAATTTGACAGATGGATGCATCAAAACACAAACTGATGATGAGATTAATGTAGATGGATCCCACTCGAGTGAAGATTCTCTTGTTGAGAAAAAAAGGCGGCGGGTGGATGAGGAGATAGCTGCTGAGGGAACGATATCATCTTCTGGTGATTTAGATGAAATAAAAGGTGGTGGTTTGAGGCATCTGTCTAGTGTTGATGGTTCTGACCTTGCTCGAACAATATCAAGTAATGCATCATTGGCAGAACAAGTAATTGAACCAGCCCTTGTAATGTTTGAGGTGCATGTACCACCAGTGTGCATGCTTGATGGAGTGCATTCGCAACACTTCTTCGGAACTGGTGTAATAATATATCATTCGGACTGTCTGGGTCTGGTTGCTGTTGATAGGAATACAGTTGCTGTATCTATCTCTGATATAATGCTTTCTTTTGCTGCATATCCCATTGAAATACCTGCAGAAGTCGTTTTTCTGCATCCCGTTCACAATTTTGCATTGGTTGCTTATGACCCTTCTGCACTAGGAGCTGGAGCATCAGTTGTCCGGGCTGCTAAGCTTCTTCCTGAACCTGCCTTGCGCCGAGGAGATTCTGTCTACCTAGTTGGGCTAAGTAGAAGCTTGCAGGCTACATCAAGGAAATCAATCATAACTAATCCCTGCACTGCTGTTAATATTGGGTCAGCTGACTGTCCACGGTATCGTGCAATTAATATGGAGGTCATTGAGCTCGATACTGATTTTGGTAGTGCATTTTCGGGTATATTGACGGATGAGCAAGGAAGAGTTCAAGCATTATGGGCAAGCTTTTCCACCCAGCTGAAATATGGTTGTAGCAGTTCGGAGGATCATCAATTTGTTAGAGGTATACCAATATATGCAATAAGTCAAGTCCTTGAGAAGATAATCTCTGGTACTCCTGGACCATTTCGTATTATCAATGGAGTTAGGAGGCCAATACCATTCATCAGACTTCTGGAGGTGGAACTCTATCCAACTTTGCTTTCAAAGGCAAGAAGTTATGGATTGAGTGATAGCTGGGTGCAGGCTCTAGCTAAGAAGGACCCTGTGCGAAGACAGGTTTTGCGGGTCAAAGGTTGTTTGGCTGGATCCAAAGCAGAAAATCTCCTTGAACAGGGAGACATGATCCTTGCTATCAATAAGGAGCCAATTACATGCTTCCTAGATATCGAGAATGCTTGCCAGAAATTGGACCAATCTGTTGATTCAGATGGAGTCCTTAACATGACAATATTCCGTCAGGGAAAAGAAATTGATCTTATTGTTGGAACCGATGTAAGAGATGGCAATGGAACAACACGGATGGTGAATTGGTGTGGATGCATAATCCAGGATCCTCATTCAGCAGTGCGCGCACTTGGTTTTTTGCCCGAAGAAGGTCATGGAGTTTATGTTGCTAGATGGTGTCATGGAAGTCCCGTACATAGATATGGTCTCTATGCTCTGCAGTGGATAGTGGAAGTTAATGGGAAGCCAACTCCAGATCTTGAAACTTTTATACAAGTGGTGAAGGGATTGGAAAATGGTGAATTTGTTAGGGTGCGGACCGTCCATTTGAATGGCAAACCTCGTGTGCTTACTTTGAAACAGGACCTTCACTACTGGCCGACCTGGGAGCTCAGAGGGTGTTCCTTAGGGAGCCTAAGCATGGAGGTGCGGAAATGGGGAATGCGTGCCCAACTGCCCATGTTGGTAAGCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MESPAKEEAGGELAMEIESTVTAEDWRRALALVVPSVVVLRTTAPRAFDTEVAGASYATGFVVDKSRGIILTNRHVVKPGPVVAEAMFVNREEIPVYPLYRDPVHDFGFFRYDPGAIKFLKYDEIPLAPEAASVGLEIRVVGNDSGEKETSLQLVGSETVDMCQSMVSILAGTLARLDREAPYYKKDGYNDFNTFYMQAASGTKGGSSGSPVVDCQGRAVALNAGSKSSSASAFFLPLERVVRALNLIRDSWEAFGSKPESDYIPRGTLQVTFQHKGFEETRRLGLRNETEQMVRLVSPSGETGMLVVDSVVPEGPAHKHLEPGDVLVRMNDEVVTQFLAMETLLDDSVGKEIDLQIERGGTPLTVKLEVEDLHSITPNHFLEVSGAVIHPLSYQQARNFRFKCGLVYVAEAGYMLSRASVPRHAIIKKLAGEDIENLGDLIACISKLSRGARVPLEYVKYTDRYRNKSVLVTIDRHEWYAPPQLFTRNDATGLWTAKSAIPPESPFIASAHHAGPIDANSNSVSSLPESSPMDLKCQHESENLTDGCIKTQTDDEINVDGSHSSEDSLVEKKRRRVDEEIAAEGTISSSGDLDEIKGGGLRHLSSVDGSDLARTISSNASLAEQVIEPALVMFEVHVPPVCMLDGVHSQHFFGTGVIIYHSDCLGLVAVDRNTVAVSISDIMLSFAAYPIEIPAEVVFLHPVHNFALVAYDPSALGAGASVVRAAKLLPEPALRRGDSVYLVGLSRSLQATSRKSIITNPCTAVNIGSADCPRYRAINMEVIELDTDFGSAFSGILTDEQGRVQALWASFSTQLKYGCSSSEDHQFVRGIPIYAISQVLEKIISGTPGPFRIINGVRRPIPFIRLLEVELYPTLLSKARSYGLSDSWVQALAKKDPVRRQVLRVKGCLAGSKAENLLEQGDMILAINKEPITCFLDIENACQKLDQSVDSDGVLNMTIFRQGKEIDLIVGTDVRDGNGTTRMVNWCGCIIQDPHSAVRALGFLPEEGHGVYVARWCHGSPVHRYGLYALQWIVEVNGKPTPDLETFIQVVKGLENGEFVRVRTVHLNGKPRVLTLKQDLHYWPTWELRGCSLGSLSMEVRKWGMRAQLPMLVS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..238#346..416#530..664#1343..1396#1708..1766#2238..2274#2981..3106#3954..4043#4453..4518#4851..4907#5021..5086#5562..5669#5833..5913#6394..6443#6860..7025#7147..7647#8409..8591#8679..8781#8904..9074#9164..9243#9611..9838#10157..10372#10466..10623#11321..11432#11551..11660#11765..11843#ATGGAGAGCCCCGCGAAGGAGGAGGCGGGAGGGGAGCTGGCGATGGAGATCGAGTCCACCGTCACGGCGGAGGACTGGCGCCGGGCGCTGGCACTCGTGGTGCCCTCCGTCGTCGTCCTCCGCACCACCGCGCCGCGGGCCTTCGACACCGAGGTCGCCGGCGCCAGCTACGCCACCGGCTTCGTCGTCGACAAGTCCAGGGGCATCATCCTCACCAACCGACACGTCGTCAAGCCAGGTAGGGGCCCGCCCGATCCCGCCCGTTTCCCTCCCCGGGAGTTTCCGTGTGATTTGTGCATTGACTCGTGTGCTACTGGTTTGATGCTGCTGTCGCTGTGTTCGCAGGGCCTGTCGTCGCGGAGGCGATGTTCGTGAACAGGGAGGAGATCCCCGTGTATCCCCTGTACAGAGATCCTGTAAGTGTTTGCTTTCATTTCATTTCATTTCATTTCTGTTCTATTCTATTTTGTTCTCCCTGTGCTAATGGCATAATGTTAATCCAAAAATTTTCCCCCTCTTCTCGAAACAGGTACATGATTTTGGTTTTTTTCGCTATGATCCAGGTGCTATCAAGTTCCTTAAGTATGATGAGATCCCGCTAGCACCTGAAGCAGCATCTGTTGGTCTGGAAATCCGGGTTGTCGGCAATGACAGCGGCGAAAAGGTTACGTAAAAACTAGATTAACCTCTTTCCTAGTTGATATTGTGAACTATCATATAATGAGCAATGTGGCACAAGAAACTTGCTAGGATTTACATCTCCAGAAATTCTCTTATGGACTATGGGACAATCATTTTTAATTGTTAGGCTTTAGGCTTTAGTTTCTTATATTGGCCTTGTTTAGTTCCAAACTTTTTCTTCAAACTTCCAACTTTTCCATCACATCAAAACTTTCCTACACACATAAACTTCCAACTTTTCCGTCGCATCGTTCCAATTTCAACCAAACTTCCAATTTTAGCGCGAACTAAACACACCCATTGTTGAGAAGCACAATGTAGAGCTCACAAAGCAAATGTTCTGTACATCGTACAGTTCATTGTGGGCTCTATTATCACATGATGCAGTTTGGCATTTCAGCAACAGCAAGCGAACTGTCTCTTCTTGCATCTAATAAAGGCTAAAATGATACAATTCATTGAAACCTCTATGTTCCACACATGTAGTTCACTGAAAACTATATAATCAAATGGTACAGTTTGGCATTTCAGCAAGTGAACTGTCTCCTCTTTCCTGTAATATTGTGTGGTCTGTAGTGCTTATAAGATTTTAGCATATAGGGAAAAAGACAATGCATACAACATCCTATTACGGGCCTTTAATCAATATTTGTTGATTCAGGAGACATCTCTTCAACTAGTTGGCTCAGAAACTGTAGATATGTGCCAATCAATGGTATAGATCAAAACATTTCACATATTAGGCTGGAAAGAGGCACTGGAACAAATTATTTTACTTCCTATTTAAGTGTGATAATTCAGATTCTGTTGTGTCCTATGTGACATGCTTTGACGGGACAATGATTTGTACTAACACTAGATAGTGATGCATTAATATGTATATACATTTTCTGGACCTAGATGTGGAGGTTAATCACTTAATCCTTTACATTCCATGGGTACACATCAGCATAATAACTTCAAAAATTATCCGATAGATTGTGTTTCATACTGCAACGGTTTCTGATTTTCATTCACCGAATGCAGGTGTCAATTTTGGCGGGAACACTTGCTCGACTTGATAGAGAAGCACCTTACTACAAGAAGTATGTCTCCTTTCTAGTTACCATAACGGCCCATTACATTAGTGCTATTTTCTTTTCTCATGATTACCCCTGGATCTATTGTTGGACATAGGGATCAAATATATAGTACAAAATTCATTTGTTGGCTACTGAACTTAGAAAATAGTAATAAAATATAGGGAGATACATATCATAGAGGATCAGAGATCATAGTTTACTTGCTATGCGAACTTTATTTAGTTTCAGTAAGTGAAGATACATATGGAGAAAGCGGATTAAATCTCAACCTTTCGCTTCATTTTTCTCCAAGCCTTTTCAATCCCCGAACTTGGGCAAAAAAGACTTTGTAGTTCGTATTCACTCTATATTCTCTACCCACCCAAATGGAGCAGCTTGCCACCACCAGCTTCTACTAGATAATACTATATGATTAATAATTTTTATGTGCAGCCTTGCTGCATATAATCTTACGTTTAACCTTTTTTTTGACAGGGATGGGTACAACGATTTCAACACATTCTACATGCAGGTACTTTTCTCGGGCTACTCAATATTACATCCATACTCTCGTTCTCTTCTGACTTGTCAGTTGGGACATTAATACACACCTTTTAACCATTACTTATCTGAATGATGTGCTCATACAATATCGATATTAAAATATAATGATACCCATTTTAAAAATAATGACATTAAAGTAGTTCTCGTGACAAATATACTCTTATAATTTTTTGCATGACATATTTGAATATTTTTATGTATATAATAATGGCCAAAATTTCTAAAGTCTGACTGTATGCATTCTAGAATGAAATCTATTTGAGAATAGTATATGTTTAATTCAAATTGGTGATGTTCATGCATCTTCTGAAATATCGGGCATGTTTTAGTTTGATGCCGAAACCAGCCTTATCAAATTTTGTTAATGCCACACCTTATTTATTTATTTTTTTGGGTAAGGTAGGTATGTGGTGGTACGTTTAGTTTGAAACCTCATCTATTTGGGTGTGATGTTAGGTCAGGAAGTTTATTAGCTACCAAATATTGGTATGGAAAGGTAGGTATGGTTGGTTTGTTGCCTTGCTAAAATTTGGTAAGGTTAGAAATGGTAGCAAACCAAGCATGCCCATTATCCGTGATTTTGTCTTATAGTTCAATTGCTTTTATCCAATAGAGGTTCACTAATTTTCCTTTTACTCTCTCTGTCATTTTAATGTAATCATATGTTTCTATAGGCTGCATCTGGTACCAAAGGTGGCTCTAGTGGTTCCCCTGTTGTTGATTGTCAAGGAAGAGCTGTCGCCCTGAATGCTGGAAGTAAATCTTCCAGTGCTTCTGCGTTTTTCCTTCCATTAGAACGTGTAAGTTGTTTACAAAATGTTCATTGAAACTAGCTAAATGCATGTGCTTTGCTACGGATAAAAGAAAACGTATTAATGTGTTACCCATCTTTTTTGCTATAGGGAATATTCATCTTACTCTAATTTAATGTGGCTATCCATTTAGATTTGATATTTTTTAATATTAAGAAGTTCAGGGATTAACTTGCAAAATTTACAATGGGAGTAGGTGGGGTGACAGATTCATTGCCACCACCACTACCTTCTTTTAAAGGAGTATAGATATACTACTTTTAGCCCAGGAAGCTTATGCTTTTGTTCTAAAATTGCAAGGTCTCTTATTTAATAAGACCAACGAAGTGGTCCTGCTAGTTGAAATTGATACGAGTCATAAAAGCACACATGCAATTAGGTTAACATCTATACTAGACATCACAAGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAAAGAAAAATATAATTTGGCATTGACCGACATCCGAGTTCATACAAAAAGGAATAGCATTGCTGTTTAATATTGATTAATTGTAAGGTCTCTTATTGACAGGAACAACGAAGTGGTCCTGCTAGTTCAAAATGATGTCATTATAAAGCGCACATGCAATTAGGCTAACTTTAACATCTATACTAGATTAGCTGGCTTAATGATTTTCATCAGGTAAAAGTATGGTATGAAGTATCCTATTATGCACTAGACATCACAAGGAGAGAGAGAGAGAACTTATAGTTTGGCACTTTGGCATTGACCAAAATCCGAGATCATACAAATAGGAATGCCATTGCTGTTTAATATTGATTGATTGCCTGTGGCACCCTTATGTTTATTATATTGTTTGTCCAAACTGTTTCCAGGTTGTTAGGGCACTTAATCTGATACGTGACAGTTGGGAAGCTTTTGGTAGCAAGCCTGAATCTGATTACATTCCTCGTGGTACACTTCAGGTGAGCATGCTGTCTGATGATCCCATTGTTCTATTTTTTTTACCAAGACCTGCTGTGTCATTAGATGTTTATTTCTATTACGGTGGAGCTACTGAAGATGTATGGTGAACAAGTAAACATTTTAGCACTTAATTGTTCTTCTTTCTTTGTATGTCAGTGATAAAGTTTGTGAATTTGCAATGATCAGCACCACAAGTGTACAGAGTGCTGCAGCAGCCATTGTATAGTCAATTTTGCTCCTCTGACTGCTGTACTTTTATTACAGCGATAGTTAAAAAGCACAATCTGTCCATGAGATTATTAGAGTTAACAAAGGCTATTACTCTTGTTTGTGTTGCCATTTCTACCTATTCTTGTTGCCCCCCTCCTGCCAGTCCTTAGATCATTTCCCTTTTCCCTTGTTTTTAAGGTGACCTTTCAACACAAAGGATTTGAAGAAACTCGGCGTCTTGGACTCAGGAATGAAACAGAACAGGTATTTTTGTGCATCATTGCTGGTTTGCTATTGGCTAGAATTTCCACCCTCTTTGCAATTTGAATGACATCAGTCAGCATCAGAAAATAGTCATGTTCAATATGTTTGTAATGTATAAATTTAAGTTGTTCGAGAGTTTTTTTTAAAGTTGATCTATACTTGCTATTTGTGACTAATTAC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