Difference between revisions of "BGIOSGA006034"
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Revision as of 18:38, 20 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA006034 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006034, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1014_H03.7-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA006034-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA006034-PA |
| Length |
12689 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:26250370..26263058 |
| Sequence Coding Region |
26262723..26263058,26260721..26260876,26260559..26260621,26259711..26259779,26259390..26259552 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:26250370..26263058 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:26250370..26263058 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGGCGGCGCTGGAGGCGGCGCGCGCCAAGGACACGAAGCAGCGGCTGGCCGGGGTGGAGCGGCTCCACGAGGCGCTGGAGGCCGCGGCGAGGCGAGGGCTGACGTCGGCCGAGGTGACGTCGCTGGTCGACGCCTGCATGGATCTGACCAAGGACGGCAACTTCCGCGTCGCCCAGGGCGGCCTGCAGGCGCTCTCCGCCGCCGCGGTGCTCGCCGGCGACCACTTCAAGATCCACCTCAACGCCCTCGTGCCCGCCGCCGTCGAGCGGCTGGGCGACGGCAAGCAGCCCGTCCGAGACGCCGCCAGGCAGCTGCTTGTCACCCTCATGGAGGTTTCATCACCGACAATCATTGTTGAAAGAGCTGGAAGTTATGCATGGACTCACAAGAGCTGGAGGGTGCGGGAAGAATTTGTACGCACTGTTGCAACAGCTGTTGGCCTCTTTGCTTCTACAGAGCTCCCTCTACAGCGAGTGTTGCTTTCACCTGTCCTGCAATTGCTGAACGATTTGAATCAAAGTGTTAGAGACGCTGCAATCTCATGTATTGAGGAGATGTATAGAAACATGGGATCTCAATTCCATGAAGAGTTGCAGCGCCATAATCTGCCTTCTTACATGCTGAAGGACATAAATTCAAGATTGGATAAAATAGAACCAAAGGCTCGCTCATCTGATGGTGCTAGAATGCAATATAAGGTTATTGAAAGATCTGTAAGTGCTAATCCAAAAAGAGGCAGTCCAAGGAAAAAAAGTTCAACAAGGGAAAGCACATTATTTGGAGGTGACTCAGATATTACCGAAAAACCAGTGGAACCCATAAGAGTACATTCAGAGAAAGAATTACTTAGGGAGATGGAGAAGATTGCATCTGCCCTTGATCCAGAAAAGGACTGGTCTATACGTATTGCCGCAATGCAAAGGATTGAAGCCTTGGTATATGGAGGTGCAATTGATTATCCATCATTTCTTACGCTCCTGAAGCAGCTAGTTCCTCCCTTATCTGCTCAGCTGTCTGACCGACGGTCTAGCATAGTAAAACAGGCATGCCATCTACTTAATATGCTATCAAAAGAACTCCTTGGTGATTTTGAAGCATGTGCTGAAATATTTATTCCGGTACTTTTCAAGCTTGTTGTGATAACTGTGCTTGTTATTGCTGAATCCGCCGACAACTGCATAAAAACTATCCTGCGGAACTGCAAGGTTTCACGTATTCTTCCACTTATAGCTGACACGGCAAAGAATGATCGCAGCGCTATCCTTCGTGCTAGATGTAGTGAGTATGCCCTCCTAATATTGGAATATTGGGCAGATGCTCCTGAAATACAGCGTGCATCTGATATATACGAAGATCTAATAAAATGCTGTGTGGCTGATGCAATGAGTGAGGTCCGTGCAACTGCAAGATCTTGCTATAGGATGTTCACCAAGACATGGCCTGAGCGCTCACGTCGGCTTTTTATGTCATTTGATCCTGCAGTACAAAGGATAATAAATGATGAAGACGGGGGCCTGCAGAAACGGTATCCTTCTCCATCATTGCGTGAGAAGGGTGTCCAACTTTCTCGTGCTTCATCTCATGCAAGTGGTACACATTTAGCCGGATACAGCACTTCAGCTATTGTTGCGATGGACAAGAGTGCAGCTATTTCTTCTGAATCATCTCTTTCGTCAAGAAGTCTTCTGTCGCAGTCAAAGAAAATAGGTAGAACTGCTGAAAGAAGCATAGAGAGCGTTCTCAGTTCAAGTAAACAAAAGGTTTCTGCCATTGAAAGTTTATTGAAGGGTGTAAGCGGCCGGCAAAATTTCTCAGCTATGCGCTCAACAAGCTTGGATCTTGGAGTTGATCCTCCATCCTCTCGTGATCCTCCTATCCCACTTGCTGCAACTGCTTCGGACCATCTGTCTTTGCAGAATTCCATATTGCTGGATTCATCCCTGCCAAGCATTAATAACACAAGAAATGGTGGTTCACGCTTGGTAGATACAGTGAACCCTCATGTGGCCAATAAAGAGAGGTCAAGGTCACCATATTTGAGTAGTCTGTCGTCTGAATCAATATCAGGATCGTCACTGCCTTATGCGAGAAGCTCTTCTGGGAGGTCTCCATATGGTAGCACTATGGAAGAGAGTAATGATACATGGTCAACCAGGCGGATGCCACAAATGCAGATGGACAGACACTATCTTGATATGACCTATAGGGATGCCAGCCACAGAAATTTACACAATCACCAAGTTCCACACTTCCAGAGGCCTCTTAGGAAGCAAGTGGCATCAAGGACATCTGCAAGTTCGAGACACAGTTTTGATGATGGCCATATCTCATCTAATGACATGTCGCGATACACAGATGGTCCAACTTCTATAAGCGATGCACTCTCTGGGGGTCTTAGTGCAAGTTCAGACTGGGTAGCTAGAGTTACAGCCTTTAATTTTATTCAGACACTACTGCAACAAGGACAGAAAGGCATTCAAGAAGTTATGCAGAATTTTGAAAAGGTCATGAAGTTATTTTTCCGTTATTTGGATGATCCTCATCACAAAGTTGCACAGGCAGCTTTCTCTACACTTGCAGATATTATTCCAGCTTGCAAGAAGCAATTTGAGAGCTATGTTGAAAGAATTTTACCGTATGTATTTTCAAGACTTATTGATCCAAAGGAATTAGTTAGGCAACCATGTTCATCAACCTTGGAAGTTGTTGGCCGCACATATCCCATTGACACATTGCTACCTGCTCTAGTACGTTCACTGGATGAACAAAGGTCTCCAAAAGCAAAACTGGCTGTTCTTGAGTTTGCTAATAAGTCATTCAGCAGGTACAAAGTAGACTCAGAAGGTTATAGTAACAGTGGCTTTCTTAAGCTATGGCTTTCAAAGCTAGCACCTTTAATACATGAAAAGAATGCAAAGTTGAAGGAAACTTCCATTTCTGGAATCATAGCAGTTTATTCTCATTTTGACTCAACAGCGGTTCTAAATTTTATTTTAAATTTGTCTATTGAAGAACAAAACCTTGTGAGGCGAGCACTGAAGCAATATACTCCTCGTATCGAGGTCGATCTGGTAAATTACTTGCAGAGCAAAAAAGAACGTTCACGTCCCAAATCTTATGACCAAGTTGATTTTGGAAATTCTTCTGAAGATGGTTATGCACTGACACCAAAGAGTAGTTATGCATTTGGGCGGTTTTCTGCTAGTTCCCTTGATAATGCATCAGGGAAGAAGATGAATATGGTTCATGGATCAACATTCCTTGATATTTCTACTGGCCGAACATCCTCTGATGTCAGCATTGATAATGTTAAGCAATGTTTCGAACCTGAAGCTGAAGTTCTTGCAACAAGTAGGGAATCAAAGAACATTGCTCGCACAGTTGTAGAAGCTGCACGTTCATGGACAGACTATCCTGGAAAATCAGATGCTACCATTGATGATGAAAATTCTACTGGTACTCCTCGTCTGGAATTTGGTCGTCTTGCTGTTTCTGATGGACGTGGTGCTGTTATTTCAACTTCTGTGGAAGACACTCAAGAGGGAAATCCACTTGTGGAGCTTAGTTCTGTGAAGATTACCCCACACACCAGTAATGGCCCTAGCATCCCACAACTTATTCATCAGATAAGCAATGTCAGTGAAGTTACTAGTCTAGACAAGCGGGAGGCATTACAACAGTTGGTTACAGCTTCCACCAATAATGACAACTCTATATGGACTAAGTATTTCAATCAAATTTTAACAACCATCCTTGAGGTGTTGGATGACTCGGATTCTTCTATCAGGGAGCTTTCTCTATCGTTAGTTGCTGAGATGCTCCACAACCAGAAAGATCCTATGGAAGAATCCATTGAGATTGTCCTTGAAAAGCTCCTACATGTGACCAAGGATGTCGTGGCGAAGGTTTCAAATGAAGCAAACCAGTGCTTAAATGTCGTGTTGGCAAAATATGATCCTTTTAGATGCCTTGCTGTTATTGTACCTTTGTTGGTTAGTGATGATGAAAAGATGCTTGTCGTGTGTACCAACTGTTTGACAAAGCTTGTTGGACGCCTATCAGAGGAGGAATTAATGACTCAACTGCCTTCATTTTTACCAGCACTTTTTGATGCTTTCAATAACCAGAGTCCAGATGTTCGCAAGACTGTTGTATTCTGCTTGGTGGATATCTACATTATGCTTGGGAAAGCATTTGTACCATATCTAGAGGGGCTTAATAGCACGCAGCTGCGCCTAGTAACAATCTATGCAAACAGGATATCACAGGCAAGGTCTGGTGCACCGATTGATGCTAACCACTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEAALEAARAKDTKQRLAGVERLHEALEAAARRGLTSAEVTSLVDACMDLTKDGNFRVAQGGLQALSAAAVLAGDHFKIHLNALVPAAVERLGDGKQPVRDAARQLLVTLMEVSSPTIIVERAGSYAWTHKSWRVREEFVRTVATAVGLFASTELPLQRVLLSPVLQLLNDLNQSVRDAAISCIEEMYRNMGSQFHEELQRHNLPSYMLKDINSRLDKIEPKARSSDGARMQYKVIERSVSANPKRGSPRKKSSTRESTLFGGDSDITEKPVEPIRVHSEKELLREMEKIASALDPEKDWSIRIAAMQRIEALVYGGAIDYPSFLTLLKQLVPPLSAQLSDRRSSIVKQACHLLNMLSKELLGDFEACAEIFIPVLFKLVVITVLVIAESADNCIKTILRNCKVSRILPLIADTAKNDRSAILRARCSEYALLILEYWADAPEIQRASDIYEDLIKCCVADAMSEVRATARSCYRMFTKTWPERSRRLFMSFDPAVQRIINDEDGGLQKRYPSPSLREKGVQLSRASSHASGTHLAGYSTSAIVAMDKSAAISSESSLSSRSLLSQSKKIGRTAERSIESVLSSSKQKVSAIESLLKGVSGRQNFSAMRSTSLDLGVDPPSSRDPPIPLAATASDHLSLQNSILLDSSLPSINNTRNGGSRLVDTVNPHVANKERSRSPYLSSLSSESISGSSLPYARSSSGRSPYGSTMEESNDTWSTRRMPQMQMDRHYLDMTYRDASHRNLHNHQVPHFQRPLRKQVASRTSASSRHSFDDGHISSNDMSRYTDGPTSISDALSGGLSASSDWVARVTAFNFIQTLLQQGQKGIQEVMQNFEKVMKLFFRYLDDPHHKVAQAAFSTLADIIPACKKQFESYVERILPYVFSRLIDPKELVRQPCSSTLEVVGRTYPIDTLLPALVRSLDEQRSPKAKLAVLEFANKSFSRYKVDSEGYSNSGFLKLWLSKLAPLIHEKNAKLKETSISGIIAVYSHFDSTAVLNFILNLSIEEQNLVRRALKQYTPRIEVDLVNYLQSKKERSRPKSYDQVDFGNSSEDGYALTPKSSYAFGRFSASSLDNASGKKMNMVHGSTFLDISTGRTSSDVSIDNVKQCFEPEAEVLATSRESKNIARTVVEAARSWTDYPGKSDATIDDENSTGTPRLEFGRLAVSDGRGAVISTSVEDTQEGNPLVELSSVKITPHTSNGPSIPQLIHQISNVSEVTSLDKREALQQLVTASTNNDNSIWTKYFNQILTTILEVLDDSDSSIRELSLSLVAEMLHNQKDPMEESIEIVLEKLLHVTKDVVAKVSNEANQCLNVVLAKYDPFRCLAVIVPLLVSDDEKMLVVCTNCLTKLVGRLSEEELMTQLPSFLPALFDAFNNQSPDVRKTVVFCLVDIYIMLGKAFVPYLEGLNSTQLRLVTIYANRISQARSGAPIDANH</aaseq> |
| Gene Sequence |
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