Difference between revisions of "BGIOSGA006432"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA006432

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006432, complete gene.

LocusTag

RAD50

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA006432-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA006432-PA

Length

15612

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:18772936..18788547

Sequence Coding Region

18788425..18788547,18788232..18788318,18787702..18787869,18786364..18786539,18786068..18786182
,18785048..18785276,18784782..18784960,18784493..18784663,18784034..18784138
,18783830..18783937,18783377..18783588,18783163..18783255,18782561..18782688
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,18778439..18778640,18777426..18777595,18777025..18777349,18776665..18776811
,18776554..18776606,18773990..18774140,18773849..18773911,18773549..18773682
,18773324..18773452,18772936..18772975

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:18772936..18788547 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGAGCACGGTGGACAAGATGCTGATCAAGGGGATCCGGAGCTTTGACCCGGAGAACAAGAACGTCATCACCTTCTTCAAGCCCCTCACCCTCATCGTCGGCCCCAACGGCGCCGGCAAAACCACGATCATCGAGTGCCTGAAGCTCTCCTGCACCGGCGAGCTGCCCCCGAACTCCCGCTCCGGCCACACCTTCGTGCACGACCCCAAGGTGGCAGGTGAGACGGAAACAAAAGGGCAGATTAAGCTGCGGTTTAAGACAGCAGCAGGAAAGGATGTGGTGTGCATCCGCTCCTTCCAGCTTACCCAGAAGGCATCAAAAATGGAGTTTAAAGCAATTGAGAGCGTCCTCCAGACTATAAATCCACACACGGGCGAGAAAGTCTGCCTCAGCTACAGATGTGCTGATATGGATAGGGAGATTCCAGCTTTAATGGGTGTATCAAAGGCTATACTGGAGAATGTTATATTTGTGCACCAAGACGAGTCCAATTGGCCTTTGCAGGATCCATCGACACTCAAGAAGAAGTTTGATGATATCTTTTCTGCGACCCGCTATACCAAAGCTCTCGAAGTCATAAAAAAACTTCACAAGGATCAAGCACAGGAAATCAAGACTTTTAGGTTAAAGTTGGAGAACCTTCAGACTCTAAAAGACCAAGCATATAGGCTCCGTGACAATATTGCTCAAGATCAAGAGAAGTCAGATGCCTTAAAAATTCAAATGGAGGAACTGAGAACAAATGTTCAAGGTGTTGAAGACAAAATTCGTCGTACTGAAAAAAGTTTAGCTGACTTGAGGAGGCTTCAACAGGAAATTAACTCCAGTACATCTGCTAGAACTACATATTTTACACTTCAGCAGCAACAGTATGCTGCTCTTTCTGAGGAAAATGAAGATACCGATGATGAACTAAAGGAGTGGCAAACGAAATTTGAAGAAAGAATGGCATTGCTGCAAAATAAGATCAGTAAACTAGAAAGAGATGTGGATGATGAAAATACAACAAGCTCCTTCCTTTCCAAGGCCATAAATGATTTGATGCGAGAAACAGGAAGGCTCCAGGCAGAAGCCGACGCTCACATGTCAGTGAAACACGAACGGGATTCAGCAATCAGAAAGATCTTCACCAAACATAATCTTGGGCCAATACCTGATGCTCCTTTAACTGATGCTGCTGCCATGCACCTTACAAACATAACTAAAGCAAAACTGTCAAATCTTAATGATGATTTGCAGGATAAGAAGAAATCTAATGAGGCACAGAAACAGTTTCTGTGGGGACGCTATCTTGAAGTAAATACTCGCTACTCTGAAGTTGTTGGCCAGATAGAATCTAAGGTTGCCTCCAAGAAAGGTATTTCAAGGCGCATGAAAGATAAAGAGAGTGAACGCGATGCCGCGGAAATGGACCTCTCAAAGTACAATCTTCCCCGTATTGATGAAAAGGAGAAACATCTGCAAATTGAAGTTGAAAGGAAAGCACTTGCGCTGGGAGAAAGGAACTATGATTCAATTATAAATCAGAAGCGCACAGAGATATTTAGCTTGGACCAGAAGATAAAAACACTTCAGTGGGAAAAAGACAGCATTATTAGTGATTCCAATGACAGGGTACTACTAGACGTGAAGAAGGATGAATTGGAAGAAACCAAGAAGAAACTTAACAAGATATATGATGAGCATAAGGACAAAATCAGAAGTGTGTTTAAAGGGAGGATTCCTTCTGAGAAGGAAGTCAAGAAGGAACTTAGTCAAGCCTTTGGGTCTGTAGACAGAGAATACAATGATCTGAACTCAAAATCCCAGGAAGCAGCGCAAGAGCTGAAACTGGTACAGATGAAAATACTTGATGCTAGGAGCCACTTGTCAAAGCTTCAAAAGGAATTGGATGCAAAGAGAAGCTATGTGGAGTCCAAACTTCAATCCATTACGAAGATGTCTGCTGACATTAACATGTTTCCCAAACATCTGAAAGATGCCATGGATGAAAGAGAGAAACACAAAAACAATTTAAGTTACGCGAAGGGAATGCGGCAAATGTATGAGCCTTTTGAAAATTTGGCTCGTGAGCTCCACATGTGCCCTTGCTGTCAACGTGCTTTCACACCTGATGAAGAGGATGAATTTGTAAAGAAGCAAAGGACAACGTGTGAAAGTACTGCAGAGCGCATGAACAAGATCTCATTTGAATGCTCAAATGCTGAAGACTTTTTCCAGCAATTGAATAAACTCAATGCAACTTATGAGGAATTTGTGAAGCTGGGAAAAGATGCTATACCTCTAGCAGAGAAGAACTTGAAACAACTTTTGGCGGATGAAAGTGAGAAGGCACAAACATTTGATGATTTTGTCAGTGTTCTTGCTCAAGTTAAAATGGACAAGGATGCAGTGCAGGTATTGCTACAGCCAGTTGAAGTGATTGATAGGCACGTACAAGAAATACAGCAGTTAGGACCACAAGTTGAAAATCTTGAATATAAGCTTGATGTTCGTGGCCAAGGTGTTAAATCTTTGGAGCAAATCCAGTTGGAGTTGAACTCTCTGCAGAGGACAAGGGACACATTGAACAATGAAGTGGATGATCTAAGGGATCAACAAAGAACACTTACCGATGGTCTGACTAATGCTCAGATGCGATGGCATGATATTAGGGAAGAGAAGCTAAAAGCTTCAGGTGCAGTGCACAAATTTCAAAAAGCTGAAGAGGATTTGGGACATCTAGCTGAGGAGAAAGAAAAACTAACATTAGAAGAGAAGCATTTAGAGGAGTCTCTTGGTCCGTTGTCAAAAGAGAGAGAAAGCTTGTTGCAAGAGCATGAAGCTTTGAAGGAAAAGCTTGACCAGGAGTATCATCAGCTGGCAGAAAGAAAAAGGGAATTCCAGCAGGAAATTGATGCACTCGAGACACACAATGAGCGTATCAAAGGGTACCTGAATTCAAAGAAGGGCGAGAAGCTTAATGAACTACAGGAAAAACATACTCAATTGCAGTCTGATCTACATAAAAGTAAGGAAAGAAAAGAAGAAAAATCGGCGGAGTTAAGCAAGAACAAAGAGCTATTGAAGAGCCAAGATCAGTTGAAAAGAAACATTGATGACAACCTTAACTACAGGAGAACAAAGGCTGAAGTGGAACGACTTACTCATGAAATAGAATTACTTGAGGACAAAGTACTTTCCATTGGCAGCCTGTCTACTATAGAAGCGGATCTTAAGCAATATTCACAAGAAAAAGATAGGCTTCTTTCAGAGTATAATAGGTGTCAAGGAACGCAGTCCGTTTATCAAAGTAATATTTCAAAACACAAGCTTGAACTTAAACAGACGCAGTACAAGGATATTGAGAAGCGATACTTTAACCAACTTCTTCAACTAAAGGTTGATGGCATGAATGCCCAGACAACTGAGATGGCAAACAAGGACTTGGACCGATACTATGCTGCTTTGGATAAGGCTCTTATGCGGTTCCACACCATGAAAATGGAGGAGATAAACAAAATAATCAAGGAACTGTGGCAACAGACATATAGGGGCCAAGATATCGACTATATAAGCATTAATTCTGACTCTGAGGGTGCTGGCACGCGATCATACAGCTATCGTGTTGTCATGCAAACAGGTGATGCTGAGCTGGAAATGCGAGGGCGCTGCAGTGCCGGCCAGAAGGTGCTTGCGTCGCTTATAATCAGACTGGCACTGGCAGAAACATTCTGTCTGAACTGTGGCATATTAGCTCTAGATGAGCCGACCACTAATCTAGATGGGCCTAATGCAGAGAGCCTTGCTGGTGCCCTTTTGAGAATAATGGAGAGCAGGAAAGGGCAGGAGAACTTCCAGTTGATTGTGATCACCCATGACGAGAGGTTTGCTCAGCTTATTGGTCAGAGGCAGCTCGCCGAGAAATACTACCGAGTCTCCAAGGATGAACACCAGCACAGCAAAATCGAAGCCCAGGAGATCTTTGACTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSTVDKMLIKGIRSFDPENKNVITFFKPLTLIVGPNGAGKTTIIECLKLSCTGELPPNSRSGHTFVHDPKVAGETETKGQIKLRFKTAAGKDVVCIRSFQLTQKASKMEFKAIESVLQTINPHTGEKVCLSYRCADMDREIPALMGVSKAILENVIFVHQDESNWPLQDPSTLKKKFDDIFSATRYTKALEVIKKLHKDQAQEIKTFRLKLENLQTLKDQAYRLRDNIAQDQEKSDALKIQMEELRTNVQGVEDKIRRTEKSLADLRRLQQEINSSTSARTTYFTLQQQQYAALSEENEDTDDELKEWQTKFEERMALLQNKISKLERDVDDENTTSSFLSKAINDLMRETGRLQAEADAHMSVKHERDSAIRKIFTKHNLGPIPDAPLTDAAAMHLTNITKAKLSNLNDDLQDKKKSNEAQKQFLWGRYLEVNTRYSEVVGQIESKVASKKGISRRMKDKESERDAAEMDLSKYNLPRIDEKEKHLQIEVERKALALGERNYDSIINQKRTEIFSLDQKIKTLQWEKDSIISDSNDRVLLDVKKDELEETKKKLNKIYDEHKDKIRSVFKGRIPSEKEVKKELSQAFGSVDREYNDLNSKSQEAAQELKLVQMKILDARSHLSKLQKELDAKRSYVESKLQSITKMSADINMFPKHLKDAMDEREKHKNNLSYAKGMRQMYEPFENLARELHMCPCCQRAFTPDEEDEFVKKQRTTCESTAERMNKISFECSNAEDFFQQLNKLNATYEEFVKLGKDAIPLAEKNLKQLLADESEKAQTFDDFVSVLAQVKMDKDAVQVLLQPVEVIDRHVQEIQQLGPQVENLEYKLDVRGQGVKSLEQIQLELNSLQRTRDTLNNEVDDLRDQQRTLTDGLTNAQMRWHDIREEKLKASGAVHKFQKAEEDLGHLAEEKEKLTLEEKHLEESLGPLSKERESLLQEHEALKEKLDQEYHQLAERKREFQQEIDALETHNERIKGYLNSKKGEKLNELQEKHTQLQSDLHKSKERKEEKSAELSKNKELLKSQDQLKRNIDDNLNYRRTKAEVERLTHEIELLEDKVLSIGSLSTIEADLKQYSQEKDRLLSEYNRCQGTQSVYQSNISKHKLELKQTQYKDIEKRYFNQLLQLKVDGMNAQTTEMANKDLDRYYAALDKALMRFHTMKMEEINKIIKELWQQTYRGQDIDYISINSDSEGAGTRSYSYRVVMQTGDAELEMRGRCSAGQKVLASLIIRLALAETFCLNCGILALDEPTTNLDGPNAESLAGALLRIMESRKGQENFQLIVITHDERFAQLIGQRQLAEKYYRVSKDEHQHSKIEAQEIFD</aaseq>

Gene Sequence

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