Difference between revisions of "BGIOSGA006435"
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Revision as of 18:40, 20 July 2012
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Expression
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA006435 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006435, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_07299 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA006435-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA006435-PA |
| Length |
17726 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:18736810..18754535 |
| Sequence Coding Region |
18754163..18754535,18752673..18752773,18752534..18752590,18752353..18752447,18751464..18751563 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:18736810..18754535 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:18736810..18754535 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGCGGCACCTCGCGCCACCAGGAAGCTTCCACCGCCTCCTCGCCTCCCGGCACTACCCGCCTTCCTCCCCGGCACCGCCGCCGCGCCCTCTCCTTCTCCTCCCCAAAACCCTAATACCGCCGGCCGCCGCCGCAATGGAATTCCCTCGCCGCGGGCGGCGCGACGTCGCCGCCGCCTCCGCCCCGGCATCCTCCTCGCCGGAGACCGAGGTAGCGCCGGGGGCCTGGGGGAAGGTCTCCGCCGTGCTCTTCGACATGGACGGCGTGCTCTGCAACAGCGAGGAGCTCTCGCGCCTCGCGGGCGTCGACTTATTTGCCGAGATGGGCGTCGACGTCACCGGGGACGACTTTGTTCCTTACATGGGCACAGGTGAGGCTAATTTCCTTGGAGGTGTAGCGAAGTTGAAGGGAGTGAAAGATTTCAACGCTGAAAGTGCCAAGAAACGTTTTTTTGAGATATATCTTGACAAGTATGCAAAGCCAAATGCTGGCATCGGATTCCCTGGGGCTCTAGATCTCGTAACAGAGTGCAAAAATGCAGGTTTGAAGGTTGCTGTTGCATCCAGTGCTGATAGGATTAAGGTGGATGCAAATTTGGCAGCTGCTGGTTTGCCTCTGTCGCTATTCGATGCCATTGTTTCTGCTGATGCATTTGAAAATTTGAAGCCTGCTCCGGACATTTTTTTGGCAGCATCTAAAACCCTAGGTGTTGACACAGATGAGTGCATTGTGATAGAAGACGCACTTGCTGGAGTTCAAGCTGCAAAAGCTGCCGAAATGAGATGCATTGCTGTGATGACTACTCTGGAGGAAGATGCGTTACAGCAAGCCAGTCCCTCACTCATACGGAAGAATATTGGAGATATTTCAATTAGAGATATTTTGTATGGTGGTTCTAATGCTTACCACAAGATTCTGAATGGAGCAACTAATGCTGAATCTGCTCCGAGCACAAATTCTGCAAGCTCAATTGATGATTCCTGTGAAGGGCTGGTAGGTTCTCGTCGGAACATATTAAGATATGGAAGTCTTGGAATAGCTGTTTCTTGTCTTATCTATACAACCAGGAATTGGAAGGCCATGCAGTTTGTATCTCCCAAAGGGCTGCTTAATTATTTCACGGGTGGAAATAGTTCGATATTTGCTAGTAATGAAGGAGAACAACTCACATCAAGGGTTCAACAAATAAAGAAGTATTTAGCTGATTTTGAAACTGGAGGTTCTGCTACTTGTGTACCTGAGTTCCCAAGAAAGCTTGATTGGTTGAATACAGCGCCACTTCAGTTTGGAAGAGATTTAAAAGGAAGAGTGGTCCTGTTGGATTTTTGGACCTATTGCTGCATCAATTGCATGCATGTCTTGCCCGACCTGGAATTTATAGAGAAGAAGTACAAGGATAAACCTTTCACTGTTGTCGGTGTGCACTCTGCCAAATTTGATAATGAAAAAGATCTTGAAGCCATCAGAAATGCTGTTCTGCGCTACAACATTACTCATCCGGTTGTAAATGATGGGGACATGTACTTGTGGAGAGAACTGGGGGTGAACTCTTGGCCTACATTTGTTGTGATTGGGCCCAACGGGAAGGTTTTAGCACAAATATCAGGTGAAGGTCACAGAAAGGACCTTGATGATGTGGTTGGTGCAGCTCTTGAATTTTATGAAGAAAATAAATTATTACAAAACAGTTCTCTTCCCTTGGCATTGGAGAAGGACAAGGATAGTCGTTTACTAGCTTCACCGCTTAAATTTCCTGGGAAACTTGCAATAGATGTACTGAACAATCGGTTGTTTATATCAGACAGTAATCATAATCGAATTGTAGTTACCAACCTGGAAGGGGAATTTATATGTCAAATTGGAAGTTCTGAAGAAGGACTACTTGATGGCACATTTGATACTGCTTCATTTAATCGCCCTCAAGGTCTTGCTTACAACTCCAAAAAGAATATCCTGTATGTTGCAGATACTGAGAACCATGCACTGCGAGAGATTAATTTTGTGAGCGAGACTGTCAAAACACTGGCGGGAAATGGAACGAAAGGCTCTGATTACAGAGGAGGAGGTCAGGGAACTAATCAGGCATGCTTCTTCATGGTTCTAAATTCACCATGGGATGTCTGCTATGATCCCTCAAAGGAGACCCTATACATCGCAATGGCTGGACAACATCAGATCTGGAAACACAACACATTGGACGGTGTAACAGAAGTTCTCAGTGGTGATGGCTACGAGAGAAATTTGAATGGATCGAGTTCGACCAGAACATCGTTTGCACAGCCATCTGGGATTTCATTAGCTCCTGAATTGCAGGAGTTGATTGTTGCTGATAGTGAAAGCAGCTCCATTCGAGTTGTTAATTTGAAATCTGGGGGTTCAAGATCGCTAGCTGGGGGAGACCCAATGATTCCAGAGAATTTGTTTAGGTTTGGAGATCATGATGGGACTGGCTCGGATGTGCTACTCCAGCATCCATTGGGTGTTGTCTATGCTAGTGATAATCAAATATATGTTGCGGACTCTTACAATCACAAGATAAAAAGGTTAGATCCTGTCACACGGAAAGTTACGACGATTGCTGGTACGGGACGTGCAGGATACAAGGATGGTCCAGCCTTGTCAGCTCAACTGTCTGAGCCAGCAGGACTTGTTGAAGTGGGAGATGGAAGGCTTCTTGTAGCAGATACAAACAATAGCACAATCAGGTATATAGTTTTGAATGAGAAAGGCGCTGAGGTGCGCACGCTAGATTTGATTGGAGTTCAGCCACCATCACCAAAACCAAAGACATTGAAACGCCTAAGAAGACATCTATCAGCAGACACGGATGTTATTAACATTGATGGTGGTTCTTCAATTGAAGGATATTTGTCTCTAGCAATCTCTGTCCCTGATGGTTACCATTTCTCCAAGGAAGCTCGAAGTAAATTTGATGTGGACATAGAACCAGCTGATGCAATTGAGATAGAGCCAGTTAATGGTTTTCTAAACTCAGGACAGGCATCACTCAAGTACAGAAGGAAATCTTCATCGTCATCAACGGGAAGGATCAATTGCAAGGTTTACTACTGCAAAGAAGACGAAGTTTGTCTTTACCAATCTGTTGCCTTCGATGTCAAATTCCGGGAAGAGGCAGTCCCCAGTCCAGCGCAGATTACTCTTTCCTATTCTGTGGTACCAAGAGATACTTCAAGTAGCGCACAATTAATAGCCGCTGGAAAGAACGGCAAGTGCCAGAAAGGTAAGCTCTTTTTTGGAGGGTGTCTAAAGTTCCAACTGCCTTTGGATGATGTATATGTTGTAATATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MARHLAPPGSFHRLLASRHYPPSSPAPPPRPLLLLPKTLIPPAAAAMEFPRRGRRDVAAASAPASSSPETEVAPGAWGKVSAVLFDMDGVLCNSEELSRLAGVDLFAEMGVDVTGDDFVPYMGTGEANFLGGVAKLKGVKDFNAESAKKRFFEIYLDKYAKPNAGIGFPGALDLVTECKNAGLKVAVASSADRIKVDANLAAAGLPLSLFDAIVSADAFENLKPAPDIFLAASKTLGVDTDECIVIEDALAGVQAAKAAEMRCIAVMTTLEEDALQQASPSLIRKNIGDISIRDILYGGSNAYHKILNGATNAESAPSTNSASSIDDSCEGLVGSRRNILRYGSLGIAVSCLIYTTRNWKAMQFVSPKGLLNYFTGGNSSIFASNEGEQLTSRVQQIKKYLADFETGGSATCVPEFPRKLDWLNTAPLQFGRDLKGRVVLLDFWTYCCINCMHVLPDLEFIEKKYKDKPFTVVGVHSAKFDNEKDLEAIRNAVLRYNITHPVVNDGDMYLWRELGVNSWPTFVVIGPNGKVLAQISGEGHRKDLDDVVGAALEFYEENKLLQNSSLPLALEKDKDSRLLASPLKFPGKLAIDVLNNRLFISDSNHNRIVVTNLEGEFICQIGSSEEGLLDGTFDTASFNRPQGLAYNSKKNILYVADTENHALREINFVSETVKTLAGNGTKGSDYRGGGQGTNQACFFMVLNSPWDVCYDPSKETLYIAMAGQHQIWKHNTLDGVTEVLSGDGYERNLNGSSSTRTSFAQPSGISLAPELQELIVADSESSSIRVVNLKSGGSRSLAGGDPMIPENLFRFGDHDGTGSDVLLQHPLGVVYASDNQIYVADSYNHKIKRLDPVTRKVTTIAGTGRAGYKDGPALSAQLSEPAGLVEVGDGRLLVADTNNSTIRYIVLNEKGAEVRTLDLIGVQPPSPKPKTLKRLRRHLSADTDVINIDGGSSIEGYLSLAISVPDGYHFSKEARSKFDVDIEPADAIEIEPVNGFLNSGQASLKYRRKSSSSSTGRINCKVYYCKEDEVCLYQSVAFDVKFREEAVPSPAQITLSYSVVPRDTSSSAQLIAAGKNGKCQKGKLFFGGCLKFQLPLDDVYVVI</aaseq> |
| Gene Sequence |
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