BGIOSGA007066

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Structured Information

Gene Name	BGIOSGA007066
Description	Cullin-associated nedd8-dissociated protein1
Definition	Oryza sativa Indica Group BGIOSGA007066, complete gene.
LocusTag	OSJNBA0085K21.46
Ensembl Transcript ID	BGIOSGA007066-TA
Ensembl Protein ID	BGIOSGA007066-PA
Length	9014
Source	Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 2
Location	Chromosome 2:4327802..4336815
Sequence Coding Region	4336780..4336815,4336508..4336677),complement(4335888..4336095,4334401..4334566),complement(4334169..4334298 ,4333833..4333947),complement(4333595..4333752,4333390..4333513),complement(4333146..4333196 ,4332980..4333062),complement(4332739..4332823,4332575..4332676),complement(4332400..4332498 ,4332212..4332322),complement(4332051..4332134,4331833..4331973),complement(4331214..4331306 ,4330986..4331104),complement(4330749..4330911,4330434..4330670),complement(4329710..4329958 ,4329441..4329626),complement(4329194..4329340,4328995..4329111),complement(4328724..4328892 ,4328399..4328476),complement(4328161..4328299,4327802..4327898
Genome Context	<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:4327802..4336815 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:4327802..4336815 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>ATGGCAAACATGAACATAACCACCATCTTGGAGAAGATGACAGGGAAAGATAAGGACTACAGATATATGGCAACTTCAGATTTGCTTAGCGAATTGAACAAAGAGGGCTTCAAAGCTGACCAAGACATCGAGCCAAAGTTGACTACTACCGTTCTTCAACAACTGGAAGATGCTTCAGGAGATGTCTCTGGTTTAGCTGTTAAATGCTTGGCTCCACTTGTCAAGAAGGTTGGTGAGGATAGGGTGGTGGAGATGACCAACATTCTTTGTGATAAGTTACTCAATGGAAAGGACCAACATCGAGACACTGCTAGTATTGCTCTGAAGACAATCATTGTGGAAGTTACGACAACATCACTTGCTGAAAAGATTTTGGTGTCTCTTGCCCCACAGCTAATCAAGGGCGCCACTGCTGGAAAAAGTGCGGAAGTGAAATGCGAGTGCCTTGATATATTGGGGGATGTACTTCATAGATTTGGCAACTTGATCACAAAAGATCATGATAGTATGCTCACTGCCTTGTTATCCCAGTTGAGCTCTAACCAAGCAAGTGTTAGGAAAAAGTCTATTTCTTGCATTGCATCACTTGCTGCATGTCTGTCTGATGATTTATTAGCCAAGGCAACTTTTGAGGTTGTCCAGTTGCTTAAAAATAGAAGTGCAAAGTCTGAAATTGCCCGAACAAATATCCAGATGATTGGCGCTCTAAGTCGCTCGGTTGGATACCGTTTTGGGCCACACCTTGCTGAAGCTGTTCCTTTGCTCATAAACTATTGTACAAGTGCATCGGAAAATGATGAAGAGCTCCGTGAATACAGCTTGCAGGCCCTCGAGAGTTTTATGCTGAGGTGTCCAAGAGATATATCTCCATATTGTGAGGGTATTTTAAATCTTGCATTGGAATATATAAGCTATGATCCAAATTTCACTGATAGCATGGAGGAGGACACTGATGATGAGGCTCAGGATGAGGAAGATGATGATGAGAGCGCAAATGAATACACAGATGATGAGGATGCAAGCTGGAAAGTCCGGAGGGCTTCAGCAAAGTGCTTATCTGCAATTATAGTATCTCGTCCTGAAATGTTGTCTAAGATGTATCTGGAGGCTTGTCCAAAGTTAATCGAACGGTTTAGGGAAAGAGAGGAAAATGTAAAGATGGACATCTTTAACACATTTATTGAGTTGTTACGCCAAACTGGTAACATGACAAAAGGACAAGGTGACATTGATGAGTCTAGCCCTAGATGGTTGCTGAAACAAGAAGTACCTAAGGTTGTCAAATCCATCAATAGGCAGTTGCGTGAAAAATCAATCAAGACAAAGGTTGGAGCATTCTCTGTATTGAAGGAGCTTGTTGTTGTACTGCCAGACTGTCTTGCTGATCATATTGGGTCACTTGTTCCTGGGATTGAGAAGGCTTTGAATGATAAGTCATCTACCTCCAACCTGAAGATTGAAGCCCTTGTATTTACAAGACTTGTTATGGCTTCACATTCCCCAGCTGTGTTTCATCCATACATACAGGCCCTTTCTGGCCCAATATTGTCTGCTATTGGAGACAGATATTACAAAGTCACCGCTGAGGCTTTAAGAGTCTGCGGAGAGCTAGTTCGTGTACTTCGTCCAAATTTTGAGGCACGCACTCTAGATTACAGGCCATATATTGGTCCAATCTATAAGGCTATCTTGGCCCGCTTGGCAAATCAGGATCAGGATCAGGAAGTTAAAGAGTGTGCCATATCTTGCATGAGCCTTGTGGTATTCACGTTTGGTGATGGTCTCCAAAGGGAACTGCCGGCATGCCTTCCCATTCTTGTTGATAGAATGGGTAATGAAATAACTAGACTTACAGCAGTTAAGGCGTTTGCAGTGATTGCTAAATCACCTCTTCGCATTGATCTTTCGTGTGTCCTAGACCATGTCATTTCTGAGCTCACGGCTTTCCTTCGAAAGGCAAACAGAGCTCTAAGGCAGGCTACATTGGGAACACTAAATTCTCTTGTTGTTGCGTATGGTGGTCAAATTGGATCCTCTTATGAAACTATTATTGCTGAACTTTCTACGCTCATTAGTGACATGGATTTGCACATGACTGCTCTTGCGCTGGAACTTTGTTGCACGATCATGGTCGATAGAAAATCCATCCAAAATGTTGGTCTTGCAGTGAGGTACAAGGTTTTGCCCCAGGCCCTTATTTTGATCAGGAGTGCTCTCTTGCAAGGGCAGGCACTACAGGCACTGCAGAGATTTTTTGCTTCACTGGTCCAGTCTGCAAATACAAGCTTTGACACTTTGTTGGATTCTCTTATTTCTACTGCTAAACCATCGCAGTCAGGTGGACTTGCCAAACAAGCATTGTCTTCCATTGCACAGTGTGTTGCTGTGTTGTGCTTAGCAGCTGGGGATCAGAAGTGTGCCTCAACTATTGAAATGCTTAAAGGCATTTTAAAAGATGACAGCACTACTAATTCTGCTAAACAGCACATGGCCTTGTTATGTTTGGGAGAAATTGGAAGAAGGAAGGACCTCAGCAATCATGCTCAAATTGAGAATATTGTCATTGAGTCATTTCAGTCACCTTTTGAGGAGATCAAATCTGCAGCGTCATATGCTCTCGGAAACATTGCTGTTGGAAATTTATCGAAGTATTTGCCTTTTATCTTGAATCAGATTGACAACCAACAGAAGAAACAGTATCTATTGCTTCATTCACTGAAAGAGGTAATTGCACGGCAGTCTGTTGACCATACTGGCCAGAGTGAGCTCCAGGATTCAAACATTGAGAAGATTTTGGCATTGCTCTTTAATCACTGTGAAAGTGAGGAGGAAGGAGTTCGGAATGTAGTTGCAGAATGCTTAGGCAAAATTGCTCTGATTGAACCTAGGAAATTAATCCCTGCTCTAAAGGAACGCACATCTAGTCCTGCTGCAAACACAAGAGCTACAGTTGCCATTGCTATAAAATATTCAATTGTTGAACGGCCTGGAAAAATAGATGAAATTATGTACTCCGAGATTTCTACCTTCCTGATGTTGATTAAAGACAGTGACAGGCACGTGAGGCGTGCAGCTGTGCTGGCCTTGAGTACAGCTGCCCACAACAAGCCAAATTTGATTAAGGGTCTTCTTCCTGAATTATTGCCTCTTTTGTATGACCAAACTGTTGTTAAGCAAGAATTGATCAGAACAGTTGACCTTGGGCCTTTCAAGCATGTTGTGGACGATGGTCTTGAACTCAGGAAAGCTGCCTTTGAATGTGTGGATACATTGCTGGATAGCTGTCTTGATCAAGTGAACCCATCATCATTTATCGTTCCTTTCCTCTTATCTGGTTTAGGTGATCATTATGATGTAAAAATGCCTTGCCATCTGATTCTCTCAAAGCTAGCAGACAAGTGCCCTTCTGCTGTTCTGGCAGTTTTGGACTCATTAGTTGACCCCATTGAGAAAACTATAAATCACAAACCCAAGGGCGATGCAGTGAAGCAAGAGGTTGATCGCAATGAAGACATGATTCGAAGTGCTCTTCGAGCAATCGCTGCTCTAAGCCGCATAAGTGGTAATGATTACAGCATGAGGTTCAAGAATCTGATGAACAAGATAATGGCCTCACCTCCGCTTGCTGACAAGTACAACTCGGTGCGCAGCGAGTAA</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MANMNITTILEKMTGKDKDYRYMATSDLLSELNKEGFKADQDIEPKLTTTVLQQLEDASGDVSGLAVKCLAPLVKKVGEDRVVEMTNILCDKLLNGKDQHRDTASIALKTIIVEVTTTSLAEKILVSLAPQLIKGATAGKSAEVKCECLDILGDVLHRFGNLITKDHDSMLTALLSQLSSNQASVRKKSISCIASLAACLSDDLLAKATFEVVQLLKNRSAKSEIARTNIQMIGALSRSVGYRFGPHLAEAVPLLINYCTSASENDEELREYSLQALESFMLRCPRDISPYCEGILNLALEYISYDPNFTDSMEEDTDDEAQDEEDDDESANEYTDDEDASWKVRRASAKCLSAIIVSRPEMLSKMYLEACPKLIERFREREENVKMDIFNTFIELLRQTGNMTKGQGDIDESSPRWLLKQEVPKVVKSINRQLREKSIKTKVGAFSVLKELVVVLPDCLADHIGSLVPGIEKALNDKSSTSNLKIEALVFTRLVMASHSPAVFHPYIQALSGPILSAIGDRYYKVTAEALRVCGELVRVLRPNFEARTLDYRPYIGPIYKAILARLANQDQDQEVKECAISCMSLVVFTFGDGLQRELPACLPILVDRMGNEITRLTAVKAFAVIAKSPLRIDLSCVLDHVISELTAFLRKANRALRQATLGTLNSLVVAYGGQIGSSYETIIAELSTLISDMDLHMTALALELCCTIMVDRKSIQNVGLAVRYKVLPQALILIRSALLQGQALQALQRFFASLVQSANTSFDTLLDSLISTAKPSQSGGLAKQALSSIAQCVAVLCLAAGDQKCASTIEMLKGILKDDSTTNSAKQHMALLCLGEIGRRKDLSNHAQIENIVIESFQSPFEEIKSAASYALGNIAVGNLSKYLPFILNQIDNQQKKQYLLLHSLKEVIARQSVDHTGQSELQDSNIEKILALLFNHCESEEEGVRNVVAECLGKIALIEPRKLIPALKERTSSPAANTRATVAIAIKYSIVERPGKIDEIMYSEISTFLMLIKDSDRHVRRAAVLALSTAAHNKPNLIKGLLPELLPLLYDQTVVKQELIRTVDLGPFKHVVDDGLELRKAAFECVDTLLDSCLDQVNPSSFIVPFLLSGLGDHYDVKMPCHLILSKLADKCPSAVLAVLDSLVDPIEKTINHKPKGDAVKQEVDRNEDMIRSALRAIAALSRISGNDYSMRFKNLMNKIMASPPLADKYNSVRSE</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>1..36#139..308#721..928#2250..2415#2518..2647#2869..2983#3064..3221#3303..3426#3620..3670#3754..3836#3993..4077#4140..4241#4318..4416#4494..4604#4682..4765#4843..4983#5510..5602#5712..5830#5905..6067#6146..6382#6858..7106#7190..7375#7476..7622#7705..7821#7924..8092#8340..8417#8517..8655#8918..9014#ATGGCAAACATGAACATAACCACCATCTTGGAGAAGGTATGGGTTTCACTGATCTGCATGTGAACTGTAAACCTGAATTTTGCTCTTTATTTTTCTATGATTTGATCTTAACATCCGTTGTGTAAAATTTTCTTTCAGATGACAGGGAAAGATAAGGACTACAGATATATGGCAACTTCAGATTTGCTTAGCGAATTGAACAAAGAGGGCTTCAAAGCTGACCAAGACATCGAGCCAAAGTTGACTACTACCGTTCTTCAACAACTGGAAGATGCTTCAGGAGATGTCTCTGGTTTAGCTGTTAAATGGTATGCATTAATTGCTTTCTCCCTTTATTGAGAGCGGTATCGTCTGATTAGCATTTTGTTTTGTTAATGGTGATCATCCGCTCCTTATTGCAAGAAATCACTGTCATTTGGATCTCGCTACTTTTGTAATTTATGTTAGTTGCAGTTGCTATTGTTAAGGATTTGTACTGCCTCATTCAATTTTCTGGACTAATATAGGGCATTGATTATTACAGTAGATGTTTTTTTTTTCTGTATATATCTCTAACTGCTGTTTTTTTCACTGCAACTTCATGCCTCAATTATTGCATCCATTGAAGCACATTTAGTATAGCAATTTGATACCCAATTGTTCTGTTATGTTTTCCACATTCCGGTGTTCTGCACTTCATGGTTTGCTATGTTAATCTGTATTATTACTTCTCTTGGTTAGCTTGGCTCCACTTGTCAAGAAGGTTGGTGAGGATAGGGTGGTGGAGATGACCAACATTCTTTGTGATAAGTTACTCAATGGAAAGGACCAACATCGAGACACTGCTAGTATTGCTCTGAAGACAATCATTGTGGAAGTTACGACAACATCACTTGCTGAAAAGATTTTGGTGTCTCTTGCCCCACAGCTAATCAAGGGCGCCACTGCTGTAAGTTCTCAATTCGTCTCCTAATTGTGGTAAAACATGCTTCCATATTAATCTTGCGGCGGGTGCCATTCGAACCATATAGTTTGTATTTGCTATTACAATCATGGTTGTCAAGTCGTAAAGTCGAGTCGAGGTACCCCTGGACCGACTTGGTCGACTAGTCCATGACTTGGTCATGCAAAAAACAGGGGATGCAATATATAATCTTTACTACTATTATACTGTGCTAAGAAATGTATGGAGTATAAACTATGGACTATGGAGTAGCAAAGCAAGACAATAGGTCAACAAGAAATAAAACTAAAGTACTAAACACAATAAGCCAATTAGCATGGTGAATTGGTGATTTGCTACGACTAATCACGACTAATTTACGACCGACTTTATGACTAATCTACGACTAACCACGACTTACCACGACTAATCGCACGACTTGCTGTTTGGTCGAGTCGTGGCTCTTTAGTCGACTAGCTTGACTGACTTTACGACTAATCTATGACTAATCACGATTAGTCGGGCGACTTGATAACAGTGATTACAATTGAAAGTTTCAGCCTGCTAATTAAGTTTACAGCGTTTCTGATGGTGCATTATACTTTTGAGGTATACCAAAGAACACATTTGCAAACCTTGTAACTATGTATTTATTTTTACCTCCCTATTCATCCAGTCTGGTTAGGTGTTCAGCCATGTTTGCTTGCCATATTCAATTGAAGTCATTATATGCTGGCTTCACAACTTCAGAATTATGTTAGCAGCACAGAGAGCCAAAAAGAAATTGTGTTTTAACATTTGTTTTTAGTTTGAGAGCCATGATAGTAAGTGCCATGGTACAGTACCTTCCGCTACTGCAGAAAGTTGGATAGTTTTCCAGACCAGTCAATATTTTTAGATTTTTCTAGCCACCATAAATTTCAAACCGCAATTTTAGCTACTGCAGCAAATACAATGCAAATGATAAACCATGAGCAATCTTTTCTTTGGATAAATTAATTAGGAAACTGTGCTACCCTTCCTAACACATGATAGATTTTAGCTGCAAATCTGGCAATGATGCTGACCATGCACAGTCCATGAGGTTTTATCTGTCAATTTCTAGCTATCCACATAACTATAAGAACACATTAGCTTTCACCTATGCGTCTTTACCTTAAAAAAACAAGAGCGGTTTATTGAATTGCCTTTGCCAGCACATCATGTTTAACACCTGCCTATAATAGATAAACCAATATATGGATTTTGGGGCTTAGTAGCATATACTTGGTTTTGTCATACCATGGGATGTCTTGGGTAGGTTTGATAACTCTTCTTTTGTTGACAGGGAAAAAGTGCGGAAGTGAAATGCGAGTGCCTTGATATATTGGGGGATGTACTTCATAGATTTGGCAACTTGATCACAAAAGATCATGATAGTATGCTCACTGCCTTGTTATCCCAGTTGAGCTCTAACCAAGCAAGTGTTAGGAAAAAGTCTATTTCTTGCATTGGTAAGTCGAACTGATGTGCTGTGCTGTTATATGTTGGTTTTTTGGGTGGCTTGAATTTGTAAAGGTGTTTACACTGACTGTTAACATGCTATTTTTCTTCAGCATCACTTGCTGCATGTCTGTCTGATGATTTATTAGCCAAGGCAACTTTTGAGGTTGTCCAGTTGCTTAAAAATAGAAGTGCAAAGTCTGAAATTGCCCGAACAAATATCCAGATGATTGGCGCTCTAAGGTATATACTTTGGCTTTCAACTGTACATGTATGCCTTGAGTAGTTCTTTTAAGGAACAGGGCACACTCATTTGTTCGCAATAGCTTAGATGAAATCATGTTCACGCTTCAAACTTATCTAGCCAGTTGAAATCCAGATATTTACTATTTTTTGGCGATTTAGTGGTTCTTATCTGGTGTGCGGCAATCCAAGTTTTGATTCAATATTATTTTCATTTACAGTCGCTCGGTTGGATACCGTTTTGGGCCACACCTTGCTGAAGCTGTTCCTTTGCTCATAAACTATTGTACAAGTGCATCGGAAAATGATGAAGAGCTCCGTGAATACAGCTTGCAGGTGAACAATTTTCTTCTTTCCAATGTTACATGAAACGAGTGTTCTCTTGTATGACTCCTGTGGGTTTTTCCATAATGTAGGCCCTCGAGAGTTTTATGCTGAGGTGTCCAAGAGATATATCTCCATATTGTGAGGGTATTTTAAATCTTGCATTGGAATATATAAGCTATGATCCAAATTTCACTGATAGCATGGAGGAGGACACTGATGATGAGGCTCAGGATGAGGAAGATGATGAGTACGTAATTGATGCTCTTACAGTAATAGATAAATAGCATCTGTTTACTTGATCAAAATATGTTTTCGATATTTTCTCCAGTGAGAGCGCAAATGAATACACAGATGATGAGGATGCAAGCTGGAAAGTCCGGAGGGCTTCAGCAAAGTGCTTATCTGCAATTATAGTATCTCGTCCTGAAATGTTGTCTAAGATGTATCTGGAGGTATATTGACATAATCATGTTAAACCAACATATGATCATCTGAAAAATGTTCTGTTTGATGGCATGTTTAAATTTCTCCCATGTTTCGGATAGTGTTTCTGTAATGATTTTTACCAGTTAGTAATGTGACCCATTAGCTAATAATGAGTGTCCCATTTAACTTCGATGTTTTTCTTTTTTAAAAAATATGCAGGCTTGTCCAAAGTTAATCGAACGGTTTAGGGAAAGAGAGGAAAATGTAAAGGTAATTGCTTTGTATCAATAATTTGTCAGTCTCTGAGTTTTCTTTCTGTTTGTCAATCTGATGAAGCTTCTATATGATTCTAGATGGACATCTTTAACACATTTATTGAGTTGTTACGCCAAACTGGTAACATGACAAAAGGACAAGGTGACATTGATGAGTCTAGGCAAGTCTATTGTGCTCTTATGTGCATCATTATTTTCAACTTCTCCAAGTTATAGCATCTTATGCAGTTTATTGGTGAAATACTTTTACATGCTTGAAGTTGATCCTACCATGTTTAGAGCACTGAGCCCATGTTGGCAATCCTTTTGCTTTTCAGCCCTAGATGGTTGCTGAAACAAGAAGTACCTAAGGTTGTCAAATCCATCAATAGGCAGTTGCGTGAAAAATCAATCAAGACAAAGGTGAGCTCTTTGACTGCAAATCATGTCTATCGACCTGGTTCTGATTTTAGATAAAATTTCAGGTTGGAGCATTCTCTGTATTGAAGGAGCTTGTTGTTGTACTGCCAGACTGTCTTGCTGATCATATTGGGTCACTTGTTCCTGGGATTGAGAAGGCTTTGAATGTTGGTGATTCCCATTTTGCTTAAAATATTATGTGCAGGACTTCTACTTGTTGCTAACTTGTTTTCTTTTTCATAGGATAAGTCATCTACCTCCAACCTGAAGATTGAAGCCCTTGTATTTACAAGACTTGTTATGGCTTCACATTCCCCAGCTGTGTTTCATCCATACATACAGGTAACTGTAGCGTATATCTTCAGTAAAATATACTTATGGCATTTGTCATCATTGTATTGATCGTAGTGAAATTCCAGGCCCTTTCTGGCCCAATATTGTCTGCTATTGGAGACAGATATTACAAAGTCACCGCTGAGGCTTTAAGAGTCTGCGGAGAGCTAGTTCGTGTACTTCGTCCAAATTTTGAGGTCAATCTTGTATTTCATATGTTGCTGAACAAAATCTAAGTTCTGTTTCTTGAAGCCTTTGTTTGTTTGTGATA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