Difference between revisions of "BGIOSGA008198"
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Revision as of 18:50, 20 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA008198 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA008198, complete gene. |
| LocusTag |
P0487H05.39 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA008198-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA008198-PA |
| Length |
12890 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:17382469..17395358 |
| Sequence Coding Region |
17382469..17382558,17384052..17384187,17384266..17384353,17385634..17385786,17386750..17386912 |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:17382469..17395358 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATCTGCAGAGCCTCGCCGTCGTGCTGCGCGCGGCGCTCAGCCACGTCCCCGAGGAGCGGAAGGCCGCCGAGGAGAGCCTCAACCAGTTTCAATACGCACCACAACATCTGGTTAGGTTGTTACAGATTATTGTCGATGGGAGCTGTGATATGGCTGTACGACAGGTTGCAAGTATTCATTTCAAGAACTTTGTTGCAAAGAACTGGTCTCCAAATGATCCTGAGGAATCTCAAAAGATTTCAGAAAGTGACAAATTGATGGTCCGCGAGAATATACTGGGTTTTATTGTTCAAGTACCCCCTTTACTAAGAGCACAGCTTGGTGAAAGTATCAAAACTATAATACATTCAGACTATCCTGAGCAGTGGCCAGGTCTCCTTCATTGGGTTACACACAATCTGGAATCAGAAAATCAAATTTTTGGAGCTTTATATGTGCTAAGGGTTCTTTCCAGGAAATATGAGTTCAAATCTGAGGACGAGAGGATCCCTTTATATCACATTGTTGAGGAGACCTTTCCTCGCTTGCTAAGTATCTTTAGCAAACTTGTTCAGATTGTCAACCCTCCAATTGAAGTAGCTGACCTGATCAAGCTAATATGCAAAATATTCTGGTCTTCAATTTATTTGGAGATTCCGAAGCAGCTCTTTGACCCAAATGTCTTCAATGCATGGATGAGTTTGTTTATAAACTTGTTGGAAAGACCAGTTCCAGTGGAAGGCCAACCATTGGATCCTGATGTGAGGAAATCTTGGGGCTGGTGGAAAGTTAAGAAATGGACAATTCATATATTGAATCGTCTATACACCCGATTTGGTGATATGAAACTACAGAAACCAGAGAGTAAAGCTTTTGCACAAATGTTTCAAAAGAACTATGCTGGAAGAATTTTGGGCTGCCACTTGCAGATTCTGAATGCAGTTCGAACTGGTGACTATTTGCCAGACAGGGTTATCAATCTTGTTCTTCAATACCTAACCAACAGTGTTACAAAGAACAGTATGTATCAGTTGATGCAGCCTCAAATCGACATCATTCTGTTCGAGATAATTTTTCCGCTCATGTGTTTCAATGACAATGATCAAAAGTTATGGGATGAAGATCCTCATGAATATGTTCGGAAGGGATATGATATCATTGAAGATTTGTACAGTCCTCGAACAGCTGCTATGGATTTTGTGAGTGAATTGGTAAGAAAACGAGGAAAAAGCAATCTCCAAAAGTTTATCCATTTCATTGTGGATATTTTTAGGAGATATGATGAGGCATCTATTGAAATCAAGCCATATCGCCAAAAAGATGGAGCACTTCTTGCTATTGGGACATTATGTGATAAGCTGAAGCAAACAGATCCATATAAAGCTGAGTTGGAGCGTATGCTGGTCCAGCATGTCTTCCCTGAGTTTAATAGTCATGTTGGACACCTGCGTGCCAAGGCTGCATGGGTTGCTGGACAGTATGCACATATCAGTTTTTCAGACCAGGACAATTTTCGGAAAGCTATGCATTGTATAGTTTCTGGAATGCGTGATCCAGATCTCCCTGTTCGGGTCGATTCAGTGTTTGCACTTCGTTCTTTTGTTGAAGCATGCAAAGATCTCAACGAGATACGACCTATACTCCCTCAACTCCTTGATGAATTTTTTAAACTGATGAATGAAGTTGAGAATGAGGATCTTGTTTTCACTCTTGAAACCATCGTTGATAAATTTGGTGAAGAGATGGCACCATATGCACTGGGGTTGTGCCAGAATTTGGCTGCTGCCTTCTGGAGATGCATGGCTAGTCAAGAAGCTGATGATGAAGCTGATGATTCTGGTGCTTTGGCAGCTGTTGGTTGTTTACGAGCCATAAGCACAATCCTTGAGTCTGTTAGCAGTCTCCCACACCTTTTTATTCAAATTGAGCCAACTCTGTTGCCAATAATGCGCAGGATGTTGACTTCTGATGGTCAAGATGTTTATGAGGAAGTTCTAGAAATTGTCTCATATATGACTTTTTTCTCACCATCAATTTCGTTGGACATGTGGAGCCTGTGGCCGTTGATGATGGAGGCTCTAAATGATTGGGCAATAGACTTCTTTGAGAATATTCTTGTTCCATTGGACAACTATGTTTCCCGGGGATCGGACCATTTTCTTGCCTGCAAAAACCCAGATTATCAGCAAAGCTTGTGGAGTGCACTATCATCTATTATGATGGATCAAAACATGGAAGATTCAGATATTGAGCCTGCTCCCAAGCTCATTGAGGTGGTTTTTCAAAACTGCAAAGGCAATGTGGATCAATGGGTTGAGCCTTACCTCAGTCTTACAATTGATCGATTGCGTCGAGCACACAAACCATATTTGAAATGTCTCCTTGTTCAAGTGATTGCTAATGCGTTCTACTACAACCCTTCTTTGACACTTGCAACCCTACATAAACTTGGGGCTGTGACTGAAATTTTTAACATTTGGTTTGGTATGTTAGAACAAGTCAAAAAGAGTGGTGTACGAGCCAATTTTAAGAGAGAGCATGATAAGAAAGTTTGTTGCTTGGGGTTGACCTCACTTATTAGCCTTCCAGCAGATCATATTCCAGGAGAAGCCCTGAATCGTATTTTCAAAGCAACACTTGATCTGCTTGTTGCCTACAAAGAGCAAGTGGCAGAATCTAAGAAACAAGATGATGCTGATGGTGATGATATGGATGGTTTTGATGCTGATGAAGATGAAGATGATGATGAGGTTGAATCTGATAAGGAGATGGGACTTGATGAAGAAGATGCTGATGAAGTAAACAGTCTTCATCTTCAGAAATTAGCTGCTGAGGCCAGAGGCTTCCAGCCAGCTGATGAGTATGATGAATCTGATGACGATTTCAGTGATGATGAGGAGCTGCAATCACCAATAGATGAGGTTGACCCGTTCATTTTGTTTGTTGAAACTGTCCAAGGCTTGCAAGCATCTGATCCTATCAGGTTCCAGAGCCTCATGCAAACTCTTGATTTTCGTTACCAGGCCCTTGCTAGTGGCATAGCTCAACATGCTGAGGAAAGAAGAGTTGAGATTGAGAAAGAGAAGTTGGAGAAAGCAAATGCACAATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDLQSLAVVLRAALSHVPEERKAAEESLNQFQYAPQHLVRLLQIIVDGSCDMAVRQVASIHFKNFVAKNWSPNDPEESQKISESDKLMVRENILGFIVQVPPLLRAQLGESIKTIIHSDYPEQWPGLLHWVTHNLESENQIFGALYVLRVLSRKYEFKSEDERIPLYHIVEETFPRLLSIFSKLVQIVNPPIEVADLIKLICKIFWSSIYLEIPKQLFDPNVFNAWMSLFINLLERPVPVEGQPLDPDVRKSWGWWKVKKWTIHILNRLYTRFGDMKLQKPESKAFAQMFQKNYAGRILGCHLQILNAVRTGDYLPDRVINLVLQYLTNSVTKNSMYQLMQPQIDIILFEIIFPLMCFNDNDQKLWDEDPHEYVRKGYDIIEDLYSPRTAAMDFVSELVRKRGKSNLQKFIHFIVDIFRRYDEASIEIKPYRQKDGALLAIGTLCDKLKQTDPYKAELERMLVQHVFPEFNSHVGHLRAKAAWVAGQYAHISFSDQDNFRKAMHCIVSGMRDPDLPVRVDSVFALRSFVEACKDLNEIRPILPQLLDEFFKLMNEVENEDLVFTLETIVDKFGEEMAPYALGLCQNLAAAFWRCMASQEADDEADDSGALAAVGCLRAISTILESVSSLPHLFIQIEPTLLPIMRRMLTSDGQDVYEEVLEIVSYMTFFSPSISLDMWSLWPLMMEALNDWAIDFFENILVPLDNYVSRGSDHFLACKNPDYQQSLWSALSSIMMDQNMEDSDIEPAPKLIEVVFQNCKGNVDQWVEPYLSLTIDRLRRAHKPYLKCLLVQVIANAFYYNPSLTLATLHKLGAVTEIFNIWFGMLEQVKKSGVRANFKREHDKKVCCLGLTSLISLPADHIPGEALNRIFKATLDLLVAYKEQVAESKKQDDADGDDMDGFDADEDEDDDEVESDKEMGLDEEDADEVNSLHLQKLAAEARGFQPADEYDESDDDFSDDEELQSPIDEVDPFILFVETVQGLQASDPIRFQSLMQTLDFRYQALASGIAQHAEERRVEIEKEKLEKANAQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
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