Difference between revisions of "BGIOSGA009136"

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Revision as of 18:55, 20 July 2012

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA009136

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA009136, complete gene.

LocusTag

OJ1534_E09.18

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA009136-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA009136-PA

Length

17011

Source

Oryza sativa Indica Group 

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:35002134..35019144

Sequence Coding Region

35002134..35002253,35003872..35004021,35004357..35004502,35004593..35004749,35004891..35004949
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,35019009..35019144

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGAGCTACCGGAAGGGGTTGAAGGTGTGGGTGGAGGAGAAAGGGGAGGGGTGGGTGGAGGCGGAGGTGGTGGAGGTGAAGGACCGGGCCGTCTTCGTGCTCACAAGCCAGCGGAAGAAGATTACAGTTTTGGCAGAGAAGTTGCTGCCTAGGGACACAGATGAAGATCTAGGTGGGGGGCATGTCGATGACATGACCAAACTAACTTATCTTAATGAACCAGGTGTTCTATACAATTTGAAGAGAAGATATGCATTGAATGAGATATATACATACACTGGAAGCATCTTGATTGCTGTTAATCCATTCACGAGGCTTCCTCACCTGTACAATGAGTACATGATGGAGCAATACAAGGGTGTCCGGCTAGGGGAGTTGAGTCCACATGTTTTTGCAGTGGCTGATGCATCATACAGGGCTATGGTGAATGATTCCCGGAGCCAGTCAATCCTGGTTAGTGGTGAAAGTGGTGCTGGCAAGACTGAGACAACGAAGCTTATCATGCAGTATCTTACGTACGTTGGTGGTAGAGCTGCCATTGACGATCGAACTGTTGAACAGCAGGTTCTTGAATCTAACCCTCTTCTGGAGGCATTTGGCAATGCAAAAACAGTTAGAAATGACAACTCAAGCCGGTTTGGCAAATTTGTTGAGATACAATTTGATGCAAATGGTAGAATATCTGGAGCTGCTATTAGGACCTATCTTTTGGAAAGGTCCCGTGTTGTGCAGATTAATGATCCTGAAAGAAATTTTCATTGCTTTTATCAGTTATGTGCGTCTGGAAAGGATGCAGAACTGTACAAGCTTGGTCACCCAAGGAGTTTCCATTACTTGAATAAAAGTAAGACATATGAATTGGAAGGAACAAATAATGAAGACGAGTACTGGAAGACGAAAAGGGCAATGGATATTGTCGGAATTAGCAGAAATGATCAGGATGCTATATTTCGGATACTGGCAGCCATTCTTCATCTTGGCAACATTGAGTTTTCTCCTGGAAAGGAAATTGATTCTTCAAAAATTAAGGATCCAACATCAAATTTTCACCTTCGAATGGCAGCCAAACTATTCATGTGTGATCCAGATCTGTTGATCTCAACTCTATGTACCCGCTCCATTAACACTCTCGAAGGAGCAATTATAAAAGCATTGGACTGTTCTGCAGCAGCAGCTAATCGTGATGCTCTAGCAAAGACTGTATATGCAAGACTATTTGACTGGCTTGTCGAGAATATTAACAAATCTATTGGTCAAGATGTTGATTCCAAAGTACAAATTGGTGTCTTGGATATTTATGGTTTTGAGAGCTTTAAAAACAACAGTTTTGAGCAGTTCTGCATCAACTTCGCCAATGAAAAGCTTCAGCAACATTTCAATGAGCATGTATTCAAGATGGAGCAGGAGGAGTACAAAAGCGAAAAAATCGATTGGAGCTACATTGAATTTATTGATAATCAAGATGTTTTGGATTTGATCGAAAAGAAACCGATTGGAATTATTGCACTGCTGGATGAAGCTTGTATGTTCCCAAAATCTACTCATGAGACCTTCGCAACAAAGATGTTCAGAAATTTCTCTTCGCATCATAGGCTTGAGAAGACAAAATTCTCAGAGACAGATTTTGTTATCTCCCATTATGCTGGGAAGGTGACGTATCAAACAGAATCGTTTCTGGAGAAGAATCGAGATTATATTGTTGCAGAGCACTGCAATCTTTTATCTTCATCAAGATGCCCTTTAGTTTCTGGACTTTTTGGTTCATTACCAGAAGAATCTTTGAGATCGTCATACAAGTTCTCATCAGTTGCTTCCAGATTTAAGCAACAACTTCAAGCCCTCATGGAAACCCTCAACTCGACAGAGCCTCACTACGTACGCTGCGTGAAGCCTAACTCTGTTAATCGGCCTCAGATGTTTGAAAATCAGAGTGTCCTGCATCAACTGCGCTGTGGAGGTGTTTTAGAGGCTGTTCGCATCAGTCTTGCTGGCTATCCTACCAGAAGAACTTACGCTGAATTTGTTGACCGGTTTGGCGTTCTAGTTCCCGAGTTGATGCTTGGAAGTTATGATGAGAGGGCATTGACAAAGGGAATTCTTGAAAATATGAAGCTTGAAAATTTTCAACTTGGTAGCACTAAGGTTTTCCTTAGAGCTGGTCAAATCGCAATATTAGATATGCGTCGTGCTGAAGTTTTGGAGAACGCTGCACGCCACATTCAAGGTCGTTTCAGAACATTCATTACACGCAAAGAGTTTGTTAAAACAAGGGAGGCTTCAATTTCTATACAAGCATATTGCAGAGGCTGTTTGGCAAGGAAGATGTATATGGTGAAAAGAGAAACGGCGGCTGCTATAATTGTTCAGAAGTATGTCCGGAGATGGCGGCTTCATCGGACTTACCAGCAAGCTCATTCAGCAGCTCTTCTTATTCAGTCCTGTATTCGAGGATTTATCGCTCGCCGTTATTTCTCAGTTATCAGAGAGCAGAAAGCTGCTTTGGTGATACAGTCATTGTGGAGAAAACGGAAGGTTATAATTCTTTTCCAACAATACAGGCAAGCCACTGTGAAAATTCAGTGTGCTTGGAGACAGAAACTTGCAAGAAGAGAACTAAGGAGACTCAAAATGGCTGCAAACGAAGCAGGTGCACTGCGTGAGGCGAAGAATAAACTTGAGAAAAAGTTGGATGACCTTACTCTGAGACTAACTCTAGAAAGGCGACTGCGTGCTGCTGGTGAGGAAGCAAAGTCAGTAGAAATATTAAAGCGCGACAAAATGATAGAATCATTAAGTGCCGAATGTGCTGCAGCTAAGTCAGATGCTCAAAGTGAACATGACAAAAATCGGCTACTCCAGAGGCAATTGGATGATTCGTTGAGAGAGATAACTATGTTGCGGGGTAGCAAGATTATGACAGCAGAAGCAGAAAAGGAGAACTCCAATCTGAAGAACTTAGTTGAGTCATTATCAAAGAGGAATTCGTCACTGGAATATGAACTCACCTCAGCTCGTAAAGGTAGTGATGATACGATGAAGAAATTGAAAGATGTTGAGGGAAAATGCAACCATCTCCAGCAAAATTTGGACAAATTGCAGGAGAAACTTACAAACTTGGAAAATGAAAATCATGTTCTTAGGCAAAAGGCATTAAACATGTCTCCGTTGAACAATATGTCCATGGCTACAAAGGCTTTTCCTCAGAAATTCGCTACACCGATTGGGCTTCCAAACGGCAAGCAGAAGCACGGATATGAAACACCACCAGCAGCAAAATATCTCGCTTCACTTCCACAGAGTTTAACTGGATCAAGGAGAACCAGGATGCCTGTTGAAAGGCAGGAGGAAAATCATGAAATCTTATTACGATGCATAAAGGAAAATCTAGGATTCAAGGATGGTAAACCAGTCGCCGCATGCATCATCTACAGTTGCCTTTTACACTGGCGTGCTTTTGAATCTGAGAGGACTGCTATTTTTGATCATGTCATTGAAGCCATAAATAATGTTCTCAAGGGGGAAGAGGCTGACGGTAGATTACCTTATTGGTTGTCCAATACCTCTGCATTGCTATGCCTTCTGCAGAAGAATTTACGGTCAAATGGATTATTTGCTACACCATCCCGCCGGTCTGGTGGACCTCTAGGGATAGGTGACAAGATAGTGCAAACACTCAGATCTCCTTCGAAGCTTATGGGACGCATTGATACTCTTGGACAAGTGGATGCTCGGTATCCAGCCATATTATTCAAACAGCAACTAACTGCATGTGTTGAAAAGATTTTTGGGCAACTCAGGGATAATCTGAAAAAGGAAATATCACCACTTCTTAGTGTCTGCATTCAGGCTCCAAAATCATCACGTGCACAGCCTGGAAAAGCATCCAAACCACCTGGGGTTGGTGCCCAACCACCATCAAACTCCCATTGGGACAATATTGTCAATTTTCTGGACTTGCTTATGTCCACGTTGCATGCAAATTATGTGCCATCATTCTTTATACGTAAACTTATCACTCAGCTATTCTCTTTTATAAATATACAGCTTTTTAACAGCCTTCTTCTTCGGCGCGAATGCTGTACTTTCTCCAATGGGGAATATGTCAAAGCCGGGCTGTCATTGCTGGAGAAATGGATTTCTGATGCCACGGATGAGTTTGCAGGAACATCTTGGCATGAGCTAAATTATATCAGACAAGCTGTTGGTTTTTTGGTCATACATCAAAAAAGAAAGAAGACGCTTGAGGAGATTAGGCAAGATCTTTGCCCGAACTTGAGTGTACGCCAAATATACAGGATATGCTCAATGTACTGGGACGACAAATACAATACCCAAGGAATATCGAATGAGGTTGTTTCTGCAATGAGGGAGGAAGTAAACAAATATACTCAGAATCTCGTATCAAATTCCTTTTTATTAGATGATGATTTAAGTATACCGTTCTCTACAGAGGATTTGTCAATGGCCATCCCTGCTATAGATTATGCAGATGTAGAACTTCCAGAATCGCTTCATCACTATCCATCAGTACAGCTCCTAGTCAAGCATCATGATCCACAGCCTGTCTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSYRKGLKVWVEEKGEGWVEAEVVEVKDRAVFVLTSQRKKITVLAEKLLPRDTDEDLGGGHVDDMTKLTYLNEPGVLYNLKRRYALNEIYTYTGSILIAVNPFTRLPHLYNEYMMEQYKGVRLGELSPHVFAVADASYRAMVNDSRSQSILVSGESGAGKTETTKLIMQYLTYVGGRAAIDDRTVEQQVLESNPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFVEIQFDANGRISGAAIRTYLLERSRVVQINDPERNFHCFYQLCASGKDAELYKLGHPRSFHYLNKSKTYELEGTNNEDEYWKTKRAMDIVGISRNDQDAIFRILAAILHLGNIEFSPGKEIDSSKIKDPTSNFHLRMAAKLFMCDPDLLISTLCTRSINTLEGAIIKALDCSAAAANRDALAKTVYARLFDWLVENINKSIGQDVDSKVQIGVLDIYGFESFKNNSFEQFCINFANEKLQQHFNEHVFKMEQEEYKSEKIDWSYIEFIDNQDVLDLIEKKPIGIIALLDEACMFPKSTHETFATKMFRNFSSHHRLEKTKFSETDFVISHYAGKVTYQTESFLEKNRDYIVAEHCNLLSSSRCPLVSGLFGSLPEESLRSSYKFSSVASRFKQQLQALMETLNSTEPHYVRCVKPNSVNRPQMFENQSVLHQLRCGGVLEAVRISLAGYPTRRTYAEFVDRFGVLVPELMLGSYDERALTKGILENMKLENFQLGSTKVFLRAGQIAILDMRRAEVLENAARHIQGRFRTFITRKEFVKTREASISIQAYCRGCLARKMYMVKRETAAAIIVQKYVRRWRLHRTYQQAHSAALLIQSCIRGFIARRYFSVIREQKAALVIQSLWRKRKVIILFQQYRQATVKIQCAWRQKLARRELRRLKMAANEAGALREAKNKLEKKLDDLTLRLTLERRLRAAGEEAKSVEILKRDKMIESLSAECAAAKSDAQSEHDKNRLLQRQLDDSLREITMLRGSKIMTAEAEKENSNLKNLVESLSKRNSSLEYELTSARKGSDDTMKKLKDVEGKCNHLQQNLDKLQEKLTNLENENHVLRQKALNMSPLNNMSMATKAFPQKFATPIGLPNGKQKHGYETPPAAKYLASLPQSLTGSRRTRMPVERQEENHEILLRCIKENLGFKDGKPVAACIIYSCLLHWRAFESERTAIFDHVIEAINNVLKGEEADGRLPYWLSNTSALLCLLQKNLRSNGLFATPSRRSGGPLGIGDKIVQTLRSPSKLMGRIDTLGQVDARYPAILFKQQLTACVEKIFGQLRDNLKKEISPLLSVCIQAPKSSRAQPGKASKPPGVGAQPPSNSHWDNIVNFLDLLMSTLHANYVPSFFIRKLITQLFSFINIQLFNSLLLRRECCTFSNGEYVKAGLSLLEKWISDATDEFAGTSWHELNYIRQAVGFLVIHQKRKKTLEEIRQDLCPNLSVRQIYRICSMYWDDKYNTQGISNEVVSAMREEVNKYTQNLVSNSFLLDDDLSIPFSTEDLSMAIPAIDYADVELPESLHHYPSVQLLVKHHDPQPV</aaseq>

Gene Sequence

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