Difference between revisions of "BGIOSGA014543"

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA014543

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA014543, complete gene.

LocusTag

OsI_16991

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA014543-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA014543-PA

Length

15361

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:27019608..27034968

Sequence Coding Region

27034910..27034968,27034662..27034761,27034367..27034474,27033052..27033202,27032539..27032786
,27031609..27031791,27031341..27031417,27031111..27031228,27030579..27030662
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,27025069..27025137,27024902..27024978,27024416..27024485,27024077..27024226
,27023504..27023648,27023291..27023355,27023119..27023184,27022572..27022665
,27022459..27022495,27022308..27022365,27021450..27021564,27021247..27021311
,27020905..27021026,27020585..27020737,27019608..27019704

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:27019608..27034968 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCAGCTTGTTTTTCTCGTGCCTCCTACAAGAGCCCAGCAATCTAATGGTACTTCAAGGGTTGTACCTGCAGAAGGATACTGTTCCATGTACGGTATTTGTGCACAGCGAAGTGATGGGAAGGTCTTGAACTGCGTGAATGCAACCAAAGCTGTTAAGCCAGACACTTTGTTTTCTGCGAGGATTCAGAGTTTGTGCCCAACTATCACTGGCGATGTCTGTTGTACGGTAGATCAGTTTGACACATTACATCAACAGGTGCAACAGGTTAATAATACTATGACTGTTAATGGCATAGATTACTATGTAACAAGTACCTATGGTGAAGAGCTATACAACTCCTGCAAGGATGTTAAATTTGGCACACTGAACACACGTGCAATGGATTTCCTAGGTGGAGGCGCTAAAAATTACAAAGAGTGGATGGCATTTATTGGGCGACAGGCCGACCTTAATCAGATTGGTTCACCTTATTTGATAACATTTCCATCCGATATTAGTGGTTCGACTGCGGTGAAGCCGCTGAATGCTACAATTTATTCTTGTGGAGATCCATCTTTGGGCTGTTCATGTGGTGATTGTCCTTCTTCTTCTGTTTGCACGGGATCCTTGTTGCCTCAGTTGAACACAGAAACCTCCTGTTCAGTTAAAATGGGTTCTCTGAAGGCCAAATGCTTGGACTTCTCACTGGTGGTTGTATACCTTGTGTTATTGTGTATATTTTTATTTGGGGCATTCTTACACAGAACACGAAGATCTGGCATCTTCTCACACACAAAACCATTGAAAAATGCAGAAGATAAGATCCACTCAAGCAACAATGGCAAGGTTCCTGATAGCTCTGCTCAGGTGTCTGAAGCTGCATCCGCTCCTGTCCAATCAGCCCATCCTTCTGTTATTCAAACTTACATGTCAACTTTCTTTAGGAAGCATGGGACATTTGTTGCTAAACATCCTCTTCTTGTGTTATTTGTATCCTTGCTTGTCCCTACCCTATTATGCATTGGTCTAATTCGTTTCAAGGTTGAAATACGACCAGAGAAGCTTTGGGTTAGTTCTGGAAGTCGGGCTGCTGATGAGAAGCAATATTTTGATAGTCATCTTGCACCATTCTATAGGATTGAGCAGCTTGTATTAGCCACTTCTGCATTTGGTGGTTCTGAAGCTCCTACAATAGTCAATGACAACAATATGAAATTACTATTTCAGATTCAGAAAAAGATTGATGATCTGCGTGCAAATTATTCTGGGTCAACAGTATCTCTTGCTGACATCTGCTTAAAGCCGCTTGGTACAGAATGTGCTACACAAAGTGTTCTACAGTATTTCCAACTGGATCCTAAAAAGTATGATGATTCGGGTATAGACCATGCTAAGTTTTGTTTTCAGCATTACACTACTGAAGAGACATGTTTGAGTACTTTTCAGTCACCTATTGATCCTAGTACCATATTAGGTGGTTTTCCAGGAAACAATTTTACTGAGGCTTCTGCATTTGTAGTAACATATCCTGTGAACAACAAGGTTGAGACAACAGGACAGGAGAATGGGAAAGCTGTGGCTTGGGAAAGGGCATATGTTAATCTTGTCAAGGAAGAAATATTGCCAATGGTATTAGCACACAATCTTACAATGTCCTTCTCATCCGAGAGTTCTATCCAAGATGAATTAAACAGAGAGAGTACAGCTGATGCAATTACAATAGTGATTAGCTATATTGTGATGTTTGCCTACATATCATTCACTCTCGGAGACCGTCCTTCTCATTTGCTGTCACTATTTGTTTCATCAAAGGTCCTTCTTGGCTTGTCTGGGGTTGTCCTGGTGATGCTTTCAGTTCTAGGATCAATGGGATTCTTCAGTGCAATCGGAGTGAAATCAACTCTAATCATAATGGAAGTAATCCCGTTTCTAGTATTGGCTGTCGGTGTGGACAACATGTGTATCCTTGTGCACGCTGTCAAACGCCAACCAGATGGCTTGGATTTGGAAGAACGGATAAGTACTGCATTGGTGGAAGTTGGACCATCCATTACATTGGCCAGTTTGGCTGAAGTTTTAGCTTTTGCTGTGAGTGCAATCAATCCAATGCCTGCGACCAGAGTATTTTCCATGTTCGCTGCATTGGCGGTGCTTCTGGATTTCCTTCTCCAAGTTTCAGCTTTTGTGGCCCTTATTGTACTTGATTTCAGGAGGGCTCAAGATGGAAGGATTGATTGTATGCCTTGTGCGAGAGTAAAATCGAGTGTTGTTGCTTCTGATGGTGGTAACCACCAGGGGCTTCCTTTGCTTGCACGATACATGAAGAATGTCCATGCACCAATTCTCGGTTATCGGGCAGTGAAGTTTGTTGTGATTGCTGTGTTTGTAGGATTTTCATTTGCAAGCATAGCATTGTCCACTAGACTGCAACCAGGATTGGAGCAGAAAATTGTTCTACCACGAGATTCCTACTTACAGGATTATTTTGATGATCTTGCAACATACATGAAAGTTGGCCCACCACTATATTTTGTCATAAAGAACTTCAATTATAGCTCAGCATCAGAACATACAAATAAGATATGTTCAATCAACCAGTGTGATTCAAATTCTCTTTTAAACGAGATAGCAAAACAATCATTATCTCCCGAGACAAGTTACATTGCTAAACCTGCTGCCTCATGGCTTGATGATTTCCTAATATGGATGTCTCCTGAAGCGTTTGGATGCTGTCGGAAATTTGTTAATGGAAGTTATTGCCCACCAGATGACCAGTGCTTCTTACGATCAGACTTGCATAATGGACGCCCATCCACAACTCAATTCAAAGAGAAACTTCCATGGTTTCTTGACGCACTTCCGTCAAGTGATTGTTCTAAGGGTGGCAAAGGAGCTTATTCTACAAGTTTGGACCTTAACGGTTATGAAAATGGCATTATACAAGCGTCAGCATTTCGAACATACCATACTCCTCTCAATAAACAGAGTGATTATGTTAATTCTATGAAAGCTGCACGGGACTTCAGCTCTAAAATGTCCAAAGAATTACAGATGCAAATGTTCCCATATTCAGTATTTTACATATTCTTTGAGCAATACCTGGGAGTATGGAAGACGGCTATCATGAACATATGTGTTTGCCTTGGTACAGTGTTTGTCGTTTGCTTCGTAGTCACAAGCAGTTTGTGGGCTTCGATAATCATTTTAATAGTGCTGGCCATGATAGTACTGGATTTGATGGGAATGATGGCTATCCTTGGCATTCAGCTCAATGCAATTTCTATTGTAAACCTTGTTATGTCAATAGGAATTGCTGTTGAATTCTGTGTTCATATCACACATGCCTTCATGGTAGTATTTGGAAGATTTGGCAGAGAATCAAGTACCACACTTAGTCCACTTCTACAGAAACCGTTAGTGCTGTTCTTTTCCATTGTCATTCTGAAACCCTTGATGACATTCTTTGAGATGCAGATAGGCATTGGAAATAGAGAAAGCCGTGCAAGGCAAGCTCTATCGACGATGGGGGCTTCTGTATTCAGCGGAATCACCTTGACCAAACTTGTTGGAGTTATTGTCCTACGTTTTGCAAAATCTGAAGTTTTTGTGGTATTTACATCTGAACCGACAGTTCTTAGCACTGTATTCGGATTGGAGCTTAGTTTAAAGGATCTCTTTGTTTATCCAAATGACAGATTCTCAAAAGCTGTGGACTGTTTGGAGCAGCTTCTAGCAGAAGCAGCTTTTGGGAAAAGCTGCAGCTGGGATAAGCTCCCCCAAACAGGGCCGTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MQLVFLVPPTRAQQSNGTSRVVPAEGYCSMYGICAQRSDGKVLNCVNATKAVKPDTLFSARIQSLCPTITGDVCCTVDQFDTLHQQVQQVNNTMTVNGIDYYVTSTYGEELYNSCKDVKFGTLNTRAMDFLGGGAKNYKEWMAFIGRQADLNQIGSPYLITFPSDISGSTAVKPLNATIYSCGDPSLGCSCGDCPSSSVCTGSLLPQLNTETSCSVKMGSLKAKCLDFSLVVVYLVLLCIFLFGAFLHRTRRSGIFSHTKPLKNAEDKIHSSNNGKVPDSSAQVSEAASAPVQSAHPSVIQTYMSTFFRKHGTFVAKHPLLVLFVSLLVPTLLCIGLIRFKVEIRPEKLWVSSGSRAADEKQYFDSHLAPFYRIEQLVLATSAFGGSEAPTIVNDNNMKLLFQIQKKIDDLRANYSGSTVSLADICLKPLGTECATQSVLQYFQLDPKKYDDSGIDHAKFCFQHYTTEETCLSTFQSPIDPSTILGGFPGNNFTEASAFVVTYPVNNKVETTGQENGKAVAWERAYVNLVKEEILPMVLAHNLTMSFSSESSIQDELNRESTADAITIVISYIVMFAYISFTLGDRPSHLLSLFVSSKVLLGLSGVVLVMLSVLGSMGFFSAIGVKSTLIIMEVIPFLVLAVGVDNMCILVHAVKRQPDGLDLEERISTALVEVGPSITLASLAEVLAFAVSAINPMPATRVFSMFAALAVLLDFLLQVSAFVALIVLDFRRAQDGRIDCMPCARVKSSVVASDGGNHQGLPLLARYMKNVHAPILGYRAVKFVVIAVFVGFSFASIALSTRLQPGLEQKIVLPRDSYLQDYFDDLATYMKVGPPLYFVIKNFNYSSASEHTNKICSINQCDSNSLLNEIAKQSLSPETSYIAKPAASWLDDFLIWMSPEAFGCCRKFVNGSYCPPDDQCFLRSDLHNGRPSTTQFKEKLPWFLDALPSSDCSKGGKGAYSTSLDLNGYENGIIQASAFRTYHTPLNKQSDYVNSMKAARDFSSKMSKELQMQMFPYSVFYIFFEQYLGVWKTAIMNICVCLGTVFVVCFVVTSSLWASIIILIVLAMIVLDLMGMMAILGIQLNAISIVNLVMSIGIAVEFCVHITHAFMVVFGRFGRESSTTLSPLLQKPLVLFFSIVILKPLMTFFEMQIGIGNRESRARQALSTMGASVFSGITLTKLVGVIVLRFAKSEVFVVFTSEPTVLSTVFGLELSLKDLFVYPNDRFSKAVDCLEQLLAEAAFGKSCSWDKLPQTGP</aaseq>

Gene Sequence

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