Difference between revisions of "BGIOSGA014675"
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Latest revision as of 15:57, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA014675 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA014675, complete gene. |
| LocusTag |
OSIGBA0115K01-H0319F09.22 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA014675-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA014675-PA |
| Length |
10990 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:25155049..25166038 |
| Sequence Coding Region |
25165013..25166038,25164093..25164917,25162269..25162295,25161315..25161413,25161164..25161226 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:25155049..25166038 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:25155049..25166038 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGTCTCTGTTTCAGCAAGAAGCAGCAAGTGAGGCGGCGGCGAGAGGAGCAGCAGCAGCCGCCGTGCCATGAGGCCAGGAAGGCCGGCGGCGGCAAGAAAGCTGGTGCTAAGGAGGTCGCGATAGTCCCGGAGGCGGCCAAGAAGGCGCCGCCGCCCAGGAAGGCTGTTCCCAAGGCGGAGGAGCCGGCGGCCGACAAGAGGACGGTGTTCGTCGTCAAGGCGGCCGCGGCCGCGGCTGCTGCCGAGGTCGCCGCCTCGGCGAGCGGCGAGGCGGCGGATGAGGAGGCGAAGAGGCCCGCCCCGGAGGAGGAGGAGGCGAAGCCCGTCGTCGTCAGCAGGGTGCCGGTGCGGACCTCGAGCTGCACCAAGGAAGAGGTGGACGCCATCCTGATCCAGTGCGGCCGGCTCAGCCGGAGCTCGTCGTCGTCGGGGAAGGTGGCGTCGGGTGAGGGCGGCGGCGGGCACCGGAGGTACTCTGGATCTAAGAGGAGCTACGATTTCGACCGCGAGAGGAGGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGTGGACGACGACTGCGACTGGGAGAGGCAGGGCGCCGCCGTGTCCAGGCCGTCGCCGCGCCGGAGGACGCCGGAGCGGAAGCGGTCGGGGAGCCACGAGAGGAGCGGCGGAAGTGGAAGCAGGAGAGTGAGCCGTTCGCCAGGGAGGCGCGCGGACAGCGTCCCCGCGACGGCGAGCGGCGAGCGGGCCTCGCGGCAGCAGCCGGGGAAGATGGTGTCGGTCCCGGCCAGGGAGAAGGGGCGGGCGCCGTCGCCCGTGCCGGCCGCGTCCGGGAAGAGGTACCCGTCGCCCAGGTCCAACTCCCCGGCGAGGGCGGGGGCCGCGGGTAATGAGAACGCCGCCGCGCAGCTGGCGCACGGGCCGTCTCTGAGCCGGAGCTCGTCGCGGAAGGCCGAGCACTCGCCGTACCGTCGCAACCCCATGGCGGAGCTCGACGAGAACACGCTCGGCAACCACCACAGTTGCAACAACAATGGCAGGCCCCAAAAGAAACCTACGGAGAGTGGCGGCGCCCTGCCGCAGAAGGTGGCGGAGCGGGCTAAAGATCAGGTAGCCGCAAGCCGGACGGCGGCGAAGGAGAAGCAGGAGATCGTGGAGGTGCCCGTGGCATCATCAGACACCAAAGGGGGGAATTCCGGGAGGATGAAGGCGACGCACTCGGTGAGCATTGTGGCCGAGAGCGTCGTCAACCAGAAGGGCCGGTCGTCGAGGAGATCTTCCCACGACTTCGACAACAATGGCAACTCGTACGCATCCCTGCTCCTCGAGGACATCCAGAACTACCACCAGCAGAGCACCGGCTCCGCCGCCGCCCCGGCGCCAGCGTTCTCGCTCCCGGCCTGCGTGTCCAAGGCCTGCTCCATCCTCGAGGCGGTCGCGGACCTCAACTCCTCGTCGTCGGAGAACAAGAGCTTCGAGCTGGACCGGTCGGCCAACGACAAGTGCTCGGCAAACGGGAGGTACGGCGACGGCAAGGTCGCCGGCGGCGGCACGCTCGTCGTCGAGTCGGAGGTTGTTGTGAAGGACGACCTGATGGAGCCGAGCCTGCACAAGTACGTCTCCGTGCGTGACATCCGAGGCGAGGCGGAGCCGCAGGAATCCGCCGGGAGCAACAGCTTTGCCGGCAACGCGTGGACGCCCTCGTGGGAGCCCAGTTCCGTCGATTCCACCGACCGGACATGGACAGCGTCGCAGTCCAACAACGGCGACGAGGTGGAGCAGCTCAGCAGCGGCGCGGTCAGCCCACTGGAGCTGTCGTGGCAGGGCAAGCAGAAGCTCCCGTCGCAGGAGCCAAGTGGTGGTGGCCGTTCGCGGTGTAGGTCCGATTTGCTCACCGGAAAGATGCCTCGTGTCCAAACATCAAGGTTGGGTAAAAATCCCATTGAAGTTGATTCTGATGGAGGTGAAGATTTTCATGTTGATTATGAAGTTGGTAATGATGTTGATGAAGGTCCTGAACATGGTGAAATTGATGGTTTACTCTCTGTTGTGCTCAGGAAAATGATTGTTCAAGAAGTGAAAAAGAATTTGGTTGACACTTCTTCTGTCAATTTTCACAATCCCATTAAGCGTATTATTGGTGACTATGGTTTTAATTCTTTGCTGATGTTTGACAATGCTTATGTCCCAAACAAATTTGCTTCTTGGATTGCAAATCATGTTGATGTGAAGTCTTCTCAAATTGTTTTAAAAGATAAAGTCATTGCAATTAATAAAGAATGTGTTCATCATATTTTGGGTCTGCCTATTGGTGGTATGGAGTTCCCAACTGATTGTGATGCTGGAAAGTCTTTTATTCTTTCAAAGTTTGGCAAGAGCGCTCTTCCATCTGTGCTTTATCTGGATTATGTTGAGTTTGGTGACAAGAATGTTCCTATTGGCAAGAATGTTCCTATTGGTTTTCCTAGAATTTCTCACTGGAAGAATAATATGATTACTTTGTATTCTAACCTTGACAAAGTTGATGAAGAAAACTTTGGCCTTAGGCCCATTAAGGATTTCAATGATACAACTTATTTCAAGGTTGTACCCCCTGAAAATAGAATTAATACATTCAGAGATAAATTGGAGTCTGCTATTGGAACCATGTTACCTGCTTTCATTAAGGAGAAAATTTGTTCAATGGTTGTTAGTCATTGTTCTGCCAATCACATTGTTGACAGTGAGTCTTGTGAAGATATTGCTATCAGCATTATGCTCTTGCTATGTGAACATGCTGGTTCTAGATATGGTGGTGATCCTGATGAAAACTTAATTTTTGATGATATCAACCCTGGGTTTCAGCCTAACTATGCAATTGATGTTGAAAATGAAATCCCTTGTGATGCTCATAACAATGGAAGTACCAATAAATCTGTTGCTAGTAAAGCTAATGAAACAAGTTTTCGCCATACACCTTCTCATGATAAGGAATTGGGGGTAAATGATGATTCTGTTATTGTCTCTAAATCTGCTGTTAGATTTTCCCTTTCACCAAACTTTGAAAAAGATCAAGGCTTACTAACCCCTGAAGTTGGATATGCTAATAACTCCAATTCACGATTTGAACATTTTCGATCTGTTCTTATCATAGTTATTTTGCCAGCTTCAGGTCCTACTGTATCTGCTGTTGCTGCTGTTAGGAATGTTGCAAATAAAATTAAATCAAGATTATCTCAACTCAACAATGATGACAAAAGAGGACCATTGTTCCCTGATTTAATTGATTCTTGTGAAGATGAAGCTGTTGGTTATGCTAAGTCACTTTCATGTCAAAAGGAATATCTTAACCCTCGATATGTCACTTCCTCTTCATCACAGCCTGGTATATCTTTACACTGTCTTGACAATTCACCTGTTCAAGTAATTGGTATAAATAATAATGAAGGAACACGCAGAACTCATTGTATTCAGAATGTGAAGAAGAGGCGTTTTGATGATGTTATTAATTCTCCTGATGTGGAATATTTTGGTCATTCTACATTTCCTGATTGCTGCAAGGTGTTGTGTACCCAGACTGATAATTTGTATAATGCCAAGAACATGTTGAAAAGTAACAACCTGGATTTGAGTTCTACCGGTGGAAAATTACCTCCCCATGGCCCTAGAAGAGTCTTAGTTCCTTCTCGGAAATTTTCAGATCCTTATGTTCTTTCTGTTAGACGCCGATTTCTAGTGTCAGATCAAGAAAAGAGACATTACAATGCAATATGCAAGTTGTCCGAGAGCTCTAAATGGCATAGTTATGATGCTGTAGACATTGATAATGTTAGAGCAAAATTCTCTTCTTTTGGGCAATCTCTCATGAAAGGTGGTACTGTATTGAGCTATGTTATCAATGTGTTTTGCCGTGTTTTGTTCAACAACAATCATCCTTCAAACTCCAAGAGACACTATTTCTTCTCTTCTATTGGTGAACTATTGTTAACTGATCTATCTTGTGCTGATTTGAGCAAGGTGAAAAGATCGTCTCTTGGAGCAGCTAGTGCTAGGAAGTTGCACCTTTCTGACATGCTATTTTTCCCCATCGAACACCTTGAACATTGGTTCCTTTTTGTTGTTGATATAAAGGACAGAATGTTGGTCCTCTTAGATTCTTTACATGAAAAAGGTGATCCCTATTTTGAAGACATTGAATGCTTACTGTGTATGGAATTGTGGTCACCAAGGGTTGTTCTACCAAATGAATTTTCTTCAGATGATATTGACCATATTCGGATGTTGTATGCAAATCAGTTATTCTTCCATCCAACGAATAAAATGCTGCAGACTGAAGTTGAAGAAGTTGTGCTCAATTGGTTTAATCCTGATCAATTTGCTGGTGAAGGCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGLCFSKKQQVRRRREEQQQPPCHEARKAGGGKKAGAKEVAIVPEAAKKAPPPRKAVPKAEEPAADKRTVFVVKAAAAAAAAEVAASASGEAADEEAKRPAPEEEEAKPVVVSRVPVRTSSCTKEEVDAILIQCGRLSRSSSSSGKVASGEGGGGHRRYSGSKRSYDFDRERRGGGGGGVDDDCDWERQGAAVSRPSPRRRTPERKRSGSHERSGGSGSRRVSRSPGRRADSVPATASGERASRQQPGKMVSVPAREKGRAPSPVPAASGKRYPSPRSNSPARAGAAGNENAAAQLAHGPSLSRSSSRKAEHSPYRRNPMAELDENTLGNHHSCNNNGRPQKKPTESGGALPQKVAERAKDQVAASRTAAKEKQEIVEVPVASSDTKGGNSGRMKATHSVSIVAESVVNQKGRSSRRSSHDFDNNGNSYASLLLEDIQNYHQQSTGSAAAPAPAFSLPACVSKACSILEAVADLNSSSSENKSFELDRSANDKCSANGRYGDGKVAGGGTLVVESEVVVKDDLMEPSLHKYVSVRDIRGEAEPQESAGSNSFAGNAWTPSWEPSSVDSTDRTWTASQSNNGDEVEQLSSGAVSPLELSWQGKQKLPSQEPSGGGRSRCRSDLLTGKMPRVQTSRLGKNPIEVDSDGGEDFHVDYEVGNDVDEGPEHGEIDGLLSVVLRKMIVQEVKKNLVDTSSVNFHNPIKRIIGDYGFNSLLMFDNAYVPNKFASWIANHVDVKSSQIVLKDKVIAINKECVHHILGLPIGGMEFPTDCDAGKSFILSKFGKSALPSVLYLDYVEFGDKNVPIGKNVPIGFPRISHWKNNMITLYSNLDKVDEENFGLRPIKDFNDTTYFKVVPPENRINTFRDKLESAIGTMLPAFIKEKICSMVVSHCSANHIVDSESCEDIAISIMLLLCEHAGSRYGGDPDENLIFDDINPGFQPNYAIDVENEIPCDAHNNGSTNKSVASKANETSFRHTPSHDKELGVNDDSVIVSKSAVRFSLSPNFEKDQGLLTPEVGYANNSNSRFEHFRSVLIIVILPASGPTVSAVAAVRNVANKIKSRLSQLNNDDKRGPLFPDLIDSCEDEAVGYAKSLSCQKEYLNPRYVTSSSSQPGISLHCLDNSPVQVIGINNNEGTRRTHCIQNVKKRRFDDVINSPDVEYFGHSTFPDCCKVLCTQTDNLYNAKNMLKSNNLDLSSTGGKLPPHGPRRVLVPSRKFSDPYVLSVRRRFLVSDQEKRHYNAICKLSESSKWHSYDAVDIDNVRAKFSSFGQSLMKGGTVLSYVINVFCRVLFNNNHPSNSKRHYFFSSIGELLLTDLSCADLSKVKRSSLGAASARKLHLSDMLFFPIEHLEHWFLFVVDIKDRMLVLLDSLHEKGDPYFEDIECLLCMELWSPRVVLPNEFSSDDIDHIRMLYANQLFFHPTNKMLQTEVEEVVLNWFNPDQFAGEG</aaseq> |
| Gene Sequence |
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