Difference between revisions of "BGIOSGA014744"
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA014744 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA014744, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_16596 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA014744-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA014744-PA |
| Length |
14662 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:24167644..24182305 |
| Sequence Coding Region |
24182211..24182305,24181108..24181243,24180647..24180757,24179747..24179822,24178420..24178484 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:24167644..24182305 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:24167644..24182305 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGCGACGCCGCCGCCGCCGCCCCGGCAGCCGCGGCGGCGGGGCCGAGCAGCACGCGGGGGGAGCCGAAGGATCCGAGGACGATCGCGCGCAAGTATCAATTGGATCTCTGCAAGAGGGCTGTGGAGGAGAACATCATAGTGTACCTTGGGACAGGATGCGGTAAGACGCACATTGCCGTGCTGCTGATTTATGAGCTTGGTCATCTCATCCGCAAGCCAAGCCGCGAGCAAGCTGTGGTGATCGCAAGTTCCACCGATTTCAAAGTTCAATGTTATTATGGGAATGGTAAAAACTCGAGAGATCATCAGGAATGGGAGAACGACATGAGGGAGTTTGAGGAATTCTATAATAGTAACAGTGTTGAGAAATTCCCTCGGGTTTTTGGCATGACTGCTTCACCAATTATTGGGAAAGGTGGGTCTAATAAACTTAACTACACGAAATGTATCAACAGTCTTGAGGAATTACTTCATGCAAAGGTTTGTTCAGTTGATAATGAAGAACTTGAAAGTGTGGTTGCATCTCCTGATATGGAGGTGTACTTTTATGGCCCAGTTAATCACTCTAACCTTACCACAATATGCATCAAAGAGCTTGATAGCTTAAAGCTTCAGAGCGAGCGCATGCTAAGAGCGAGCCTATGCGATTTCAAGGATTCTCAGAAGAAACTGAAGTCCTTATGGAGGTTGCATGAAAATATTATTTTCTGTTTGCAAGAACTTGGTTCTTTCGGAGCTCTGCAAGCTGCGAGGACCTTTTTGTCCTTTGATGGTGATAAGCTAGATAGAAGGGAGGTCGATCTTAACGGCAGTACTTCCAGCTTCGCACATCACTACCTGAACGGAGCAACTTCTATTCTTAGTCGCAACAAAACAGATGGTTCCCACGCTGGTTCATTTGACCTTGAGAAGCTTGAAGAACCTTTCTTCTCAAATAAATTTTCTGTTCTTATCAATGTTCTTTCGAGATACGGGTTGCAGGAAAACATGAAATGCATTGTTTTTGTGAAAAGAATAACTGTTGCAAGAGCAATATCAAACATTCTCCAAAACTTGAAGTGTCTTGAATTTTGGAAATGTGAGTTTCTTGTGGGCTGCCACTCAGGATCAAAGAACATGTCAAGGAATAAGATGGATGCTATTGTTCAAAGGTTTTCTTCTGGTGAGGTGAATCTTTTGGTTGCTACAAGCGTAGGTGAAGAGGGACTTGATATTCAGACGTGTTGTCTTGTTGTGCGATTTGATCTTCCAGAAACTGTTGCTAGTTTTATCCAATCAAGGGGGCGTGCCCGGATGACTAAATCTAAATACGTTGTTCTCCTAGAGAGAGAAAATCAGTCTCATGAAAAGTTGCTTAATGGTTATATTGCTGGTGAAAGCATTATGAATGAAGAGATAGACTCAAGAACTTCAAATGATATGTTTGATTGCCTCGAGGAGAACATTTATCAAGTGGATAACACCGGTGCTTCCATTAGCACTGCTTGTAGTGTATCTCTACTACATTGCTACTGCGACAACCTTCCTAGGGATATGTTTTTTACTCCTTCCCCAGTGTTCTTCTACATTGATGGCATCGAGGGAATAATCTGCAGACTAATTCTTCCACCAAATGCTGCTTTCCGTCAAGCAGATGGTCAACCATGTCTGTCAAAAGATGAAGCTAAGAGAGATGCATGCTTAAAGGCATGCGTAAAACTTCATAAATTGGGTGCTTTGACAGATTTTCTTCTGCCGGGTCCAGGTTCAAGAAAGAATAAAGTATCAGTAACAAATAATTCATCAAACAACAAAGTTGAAGATGATAGTCTAAGAGAAGAGCTTCATGAGATGTTAATTCCTGCAGTTCTCAAACCTTCGGGATTAAAGTTGGATTCTTTATCGAACTTGCATTTCTACTATGTTAAATTTATTCCCATACCAGAAGATAGGCGATATCAGATGTTTGGTCTCTTTGTGATCAATCCCCTTCCTGTGGAAGCTGAAACATTGCAAGTTGATTTGCATCTTGCTCGTGGCAGGATTGTGAAAGCAGGAATTAAGCATTTGGGGAAAATAGCATTTGAGAAAGAGAAGGCATCATCCTGCTCATCTATGATGCTTGCACACAAGTTTCAAGAGATGTGTCTGAAGATTCTCCTGGACAGATCTGAGTTTACTTCACCCCATGTTAAATTGGGCAATGATGTTACATTAGAAATCAATTCAACATTTTACCTTCTGCTTCCCATCAAGCAAAAGTGTTATGGTGATAGATTTATGATTGACTGGCCAGCAGTTGAGCGCTGTTTATCATCACCGATTTTTAAAGACCCTATAGATGTGTCTGTGCATGCCTCATATTCATCAAATGAGTCTCTGAGACTTCTTGATGGAATCTTCAGTAAAACCGATGTAGTTGGCAGTGTAGTCTTTAGTCCCCACAACAATATCTTTTTCTTTGTTGATGGCATTCTGGACGAAATAAATGCTTGGAGCGAGCACAGTGGTGCAACTTATGCAGAACACTTCAAGGAAAGGTTTCGTATTGAGCTATCACATCCTGAACAGCCACTTTTGAAGGCTAAACAGATCTTCAACCTGCGAAATTTGCTTCATAATCGGTTACCGGAGACCACAGAATCGGAGGGCCGTGAATTACTAGAGCACTTCGTGGAGTTACCTCCAGAATTATGCTCTTTGAAGGTCATTGGGTTTTCAAAAGATATGGGCAGTTCCCTGTCCTTGTTACCTTCTTTAATGTATCGTTTGGAGAATTTGCTGGTGGCTATTGAGTTGAAGGATGTGATGTTATCTTCTTTTCCAGAGGCATCTCAAATTAGTGCTTCTGGTATACTTGAAGCGCTTACTACTGAGAAATGTTTGGAGAGGATATCTTTGGAGCGATTTGAAGTCCTAGGCGATGCTTTCTTGAAGTACGTAGTTGGACGTCACAAGTTTATTACATATGAAGGACTTGATGAAGGGCAATTGACCAGGAGACGTTCTGATGTAGTGAACAATTCACATTTATATGAGTTATCGATCAGAAAAAAATTGCAGGTATACATACGGGATCAACAGTTTGAACCGACTCAGTTCTTTGCTCCAGGAAGGCCTTGTAAAGTTGTTTGCAATACTGACGTGGAAGTGAGACTACACCAGATGGATATTCATCCAGATAACAGAGAAAACTGTAACCTGAGATGTACAAGGTCACATCATTGGCTGCATAGGAAAGTGATTGCAGATGTTGTCGAATCGCTTATTGGAGCATTTCTTGTTGAGGGTGGATTCAAAGCTGCATTTGCTTTCCTGCATTGGATTGGAATAGACGTTGATTTTAATAATCCAGCTCTCTATAGGGTATTAGATTCAAGCTCCATCAATTTATCTCTTATGGACTACACTGACATTGCCGGGCTTGAAGAATTGATAGGTTACAAGTTCAAACATAAGGGTCTACTTCTCCAAGCATTCGTACACCCTTCATTTAGTCAACATTCTGGAGGCTGCTACCAGAGACTGGAGTTTCTTGGAGACGCTGTTTTGGAGTATGTGATAACTTCGTACCTCTACTCTACTTATCCGGATATAAAACCTGGTCAAATAACAGATCTAAGATCGTTAGCTGTTGGTAATGATTCGCTTGCTTATGCGGCGGTTGAGAAATCTATCCATAAGCATCTTATAAAGGATTCAAACCATCTCACGTCAGCAATAAGTAAATTTGAGATGTATGTGAAGCTCTCCAATTCAGAGAAAGACTTGCTTGAAGAACCAGCATGTCCCAAGGCTCTTGGTGATATTGTTGAATCTTGTATTGGCGCAGTGCTTTTAGATTCAGGCTTCAACCTGAACTATGTTTGGAAGGTAATGCTTATGCTTCTAAAGCCAGTATTGACCTTCGCCAACATGCACACTAATCCGATGAGAGAACTTCGAGAGCTTTGTCAGTGTCATGGATTTGAGTTAGGCCTTCCGAAACCTATGAAAGCTGATGGAGAGTACCATGTCAAAGTAGAAGTTAACATAAAGAGCAAAATTATCATTTGTACTGCAGCAAATCGGAATTCAAAAGCCGCTAGAAAGTTTGCTGCACAAGAAACACTTTCTAAACTGAAGAATTACGGTTATAAGCACAGAAACAAGTCCCTTGAGGAGATTTTGATTGTTGCCAGGAAGAGGGAATCAGAACTGATAGGATATAATGAAGATCCAATCGATGTTGAGGCTGACATATCTGTAAAAATGAAGAGTCCACATATACATGAAGAGAACATACCTTTTCAAAATACAGAAACATCTTTCACTAGGAGTTCTAAATTCCACAATCAAATTATAGCAGGGTCTGGCAAACATGATGTCAATAATGGAAGGAACAATCAACCCAAGTTGGCAACACAGAGTGGTCGTCTGCCTAGTGAAGCAACAGAGAAAAGCAATAAAAAGGTGTATCATGGTGACATGGTACACAAAACAGCAAGATCATTCCTTTTTGAACTATGTGCTGCAAATTATTGGAAACCTCCTGAATTCAAGTTATGTAAAGAGGAAGGGCCAAGCCACCTTCGGAAGTTCACTTACAAGGTGGTTGTTGAGATCAAGGGTGCTTCGGCGACCCTTTTGGAGTGTCATAGCGATGGTAAGCTTCAGAAGAAGGCTGCACAAGAGCATGCGGCACAAGGGGCGCTCTGGTGTCTCAAGCAACTTGGGCACCTACCAAAAGAAGAGGACGTTCGTGTATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGDAAAAAPAAAAAGPSSTRGEPKDPRTIARKYQLDLCKRAVEENIIVYLGTGCGKTHIAVLLIYELGHLIRKPSREQAVVIASSTDFKVQCYYGNGKNSRDHQEWENDMREFEEFYNSNSVEKFPRVFGMTASPIIGKGGSNKLNYTKCINSLEELLHAKVCSVDNEELESVVASPDMEVYFYGPVNHSNLTTICIKELDSLKLQSERMLRASLCDFKDSQKKLKSLWRLHENIIFCLQELGSFGALQAARTFLSFDGDKLDRREVDLNGSTSSFAHHYLNGATSILSRNKTDGSHAGSFDLEKLEEPFFSNKFSVLINVLSRYGLQENMKCIVFVKRITVARAISNILQNLKCLEFWKCEFLVGCHSGSKNMSRNKMDAIVQRFSSGEVNLLVATSVGEEGLDIQTCCLVVRFDLPETVASFIQSRGRARMTKSKYVVLLERENQSHEKLLNGYIAGESIMNEEIDSRTSNDMFDCLEENIYQVDNTGASISTACSVSLLHCYCDNLPRDMFFTPSPVFFYIDGIEGIICRLILPPNAAFRQADGQPCLSKDEAKRDACLKACVKLHKLGALTDFLLPGPGSRKNKVSVTNNSSNNKVEDDSLREELHEMLIPAVLKPSGLKLDSLSNLHFYYVKFIPIPEDRRYQMFGLFVINPLPVEAETLQVDLHLARGRIVKAGIKHLGKIAFEKEKASSCSSMMLAHKFQEMCLKILLDRSEFTSPHVKLGNDVTLEINSTFYLLLPIKQKCYGDRFMIDWPAVERCLSSPIFKDPIDVSVHASYSSNESLRLLDGIFSKTDVVGSVVFSPHNNIFFFVDGILDEINAWSEHSGATYAEHFKERFRIELSHPEQPLLKAKQIFNLRNLLHNRLPETTESEGRELLEHFVELPPELCSLKVIGFSKDMGSSLSLLPSLMYRLENLLVAIELKDVMLSSFPEASQISASGILEALTTEKCLERISLERFEVLGDAFLKYVVGRHKFITYEGLDEGQLTRRRSDVVNNSHLYELSIRKKLQVYIRDQQFEPTQFFAPGRPCKVVCNTDVEVRLHQMDIHPDNRENCNLRCTRSHHWLHRKVIADVVESLIGAFLVEGGFKAAFAFLHWIGIDVDFNNPALYRVLDSSSINLSLMDYTDIAGLEELIGYKFKHKGLLLQAFVHPSFSQHSGGCYQRLEFLGDAVLEYVITSYLYSTYPDIKPGQITDLRSLAVGNDSLAYAAVEKSIHKHLIKDSNHLTSAISKFEMYVKLSNSEKDLLEEPACPKALGDIVESCIGAVLLDSGFNLNYVWKVMLMLLKPVLTFANMHTNPMRELRELCQCHGFELGLPKPMKADGEYHVKVEVNIKSKIIICTAANRNSKAARKFAAQETLSKLKNYGYKHRNKSLEEILIVARKRESELIGYNEDPIDVEADISVKMKSPHIHEENIPFQNTETSFTRSSKFHNQIIAGSGKHDVNNGRNNQPKLATQSGRLPSEATEKSNKKVYHGDMVHKTARSFLFELCAANYWKPPEFKLCKEEGPSHLRKFTYKVVVEIKGASATLLECHSDGKLQKKAAQEHAAQGALWCLKQLGHLPKEEDVRV</aaseq> |
| Gene Sequence |
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