Difference between revisions of "BGIOSGA014757"
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Latest revision as of 15:58, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA014757 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA014757, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_16565 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA014757-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA014757-PA |
| Length |
14848 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:23978901..23993748 |
| Sequence Coding Region |
23993649..23993748,23991959..23992056,23990855..23990974,23990187..23990234,23988829..23988879 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:23978901..23993748 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:23978901..23993748 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCGTTGTCGGCCAGCAGGCAACTGGGCAAGGTGAAGGAGACGTTGATGGGGACGCGTGGAGCTGCGGACGCAGCTGGCGGGCAGGCGGCGGGACCAGAAAATGGAGAGGTGCAGGAAACCATCATCAATGCAATTGACTCAGAGACTTGTGTATTCAAATATTTTAGGATTGGATCCAACTTTAAGAAATGGAAGGTGGGAGATTTCTACGAGGCTGTTGGGTTTGATGCATGTATCCTTGTGGAGCATGCAGGCTTAAATCCTTTTGGAGGCTTGCGTTCTGATAGTATTCCAAAAGCTGGATGTCCAGTCATGAATTTGCGGCAGACATTGGATGATTTGACTCGATGTGGTTACTCTGTGTGTCCTCATGCTGAACAATTGATTGGGCCTGACATAAGTCTCTGGAGAGAGTGCATAGTTGAAGAAATTCAAGGCCCAACCCAAGCTCGTGCTAGGAAAGGCCGATTTATTTCTGGCCATGCACATCCTGGTAGTCCTTATGTATTTGGTCTTGCTGAAGTAGACCATGATGTTGAGTTCCCTGATCCAATGCCTGTAGTTGGGATTTCACGATCTGCAAAAGGCTATTGCCTGATTTCTGTGCTAGAGACAATGAAAACATATTCAGCTGAGGAGGGCTTAACAGAGGAAGCAGTTGTTACTAAGCTTCGCATATGCCGTTATCATCATCTATACCTTCATAGTTCTTTGAGGAACAATTCTTCAGGCACATCACGCTGGGGAGAATTTGGCGAAGGTGGGCTATTGTGGGGAGAGTGCAGTGGAAAATCTTTTGAGTGGTTTGATGGTAATCCTATTGAAGAACTGTTATGCAAGGTAAGGGAAATATATGGGCTTGAAGAGAAGACTGTTTTCCGTAATGTCAGTGTCTCATTGGAAGGGAGGCCTCAACCCTTGTATCTTGGAACAGCTACTCAAATTGGGGTGATACCAACTGAGGGAATACCCAGTTTGCTAAAAATTGTTCTCCCTCCAAACTTTGGTGGCCTTCCATCATTGTATATTAGAGATCTTCTTCTTAACCCTCCATCTTTTGATGTTGCATCATCAGTTCAAGAGGCTTGCAGGCTTATGGGTAGCATAACTTGCTCGATTCCTGAATTTACATGCATACCGGCAGCAAAGCTTGTGAAATTACTCGAGTCAAAAGAGGTTAATCACATCGAATTTTGTAGAATAAAGAATGTCCTCGATGAGGTGTTGTTCATGGGTAGCAATGCTGAGCTTTCTGCTATCCTGAATAAATTGCTTGATCCTGCCGCCATAGTTACTGGGTTCAAAGTTGAAGCCGATATACTAGTGAATGAATGTAGCTTTATTTCACAACGTATAGCTGAAGTAATCTCTTTAGGTGGTGAAAGTGACCAGGCAATAACTTCATCTGAATATATTCCGAAAGAGTTCTTCAATGATATGGAGTCATCTTGGAAGGGACGTGTAAAAAGGGTGCATGCTGAAGAGGAGTTCTCAAATGTTGATATAGCTGCTGAGGCACTGTCAACAGCGATAAAGCAATTGAAGCCTGCAATTGACTCAAAAGGTAGAAAGGTCGGAGAAGAATGGTTCACCACTATCAAAGTTGAGAATGCTTTAACCAGGTACCATGAAGCTTGTGATAATGCAAAACGTAAAGTTCTTGAGTTGTTGAGAGGACTTTCAAGTGAATTGCAGGACAAGATTAATGTCCTTGTCTTTTGCTCAACGATGCTCATCATAACAAAAGCACTTTTTGGTCATGTTAGTGAAGGACGAAGAAGGGGTTGGGTGCTTCCTACTATATCTCCCTTGTGTAAGGATAATGTTACAGAGGAAATCTCAAGTGAAATGGAATTGTCAGGAACTTTTCCTTACTGGCTTGATACTAACCAAGGGAATGCAATACTGAATGATGTCCATATGCACTCTTTGTTTATTCTTACTGGTCCAAACGGTGGTGGTAAATCCAGTATGCTGAGATCAGTCTGTGCTGCTGCATTACTTGGAATATGTGGCCTGATGGTGCCAGCTGCTTCAGCTGTCATCCCACATTTCGATTCCATCATGCTGCATATGAAAGCATATGATAGCCCAGCTGATGGTAAAAGTTCGTTTCAGATTGAAATGTCAGAGATACGATCTTTAGTCTGCCGAGCTACAGCTAGGAGTCTTGTTCTAATTGATGAAATATGTAGGGGCACAGAAACAGCAAAAGGAACATGTATAGCTGGTAGCATCATTGAAAGACTCGATAATGTTGGCTGCATAGGCATCATATCAACTCATTTGCATGGCATTTTTGACCTTCCACTGTCACTCCACAATACTGATTTCAAAGCTATGGGAACCGAAATCATCGATAGGTGCATTCAGCCAACATGGAAATTAATGGATGGCATCTGTAGAGAGAGTCTTGCTTTTCAAACAGCCAGGAAAGAAGGTATGCCTGACTTGATAATTAGAAGAGCTGAGGAACTATATTTGGCTATGAGCACAAACAGCAAGCAGACATCATCAGCTGTCCACCATGAAATATCCATAGCCAACTCTACTGTAAATAGCTTGGTTGAGAAGCCTAATTACCTGAGAAATGGACTAGAGCTTCAATCTGGTTCCTTCGGATTACTAAGAAAAGAAATTGAGAGTGTTGTTACCACAATATGCAAGAAGAAACTGTTGGATCTCTACAACAAAAGGAGCATCTCAGAACTGATTGAGGTGGTCTGTGTTGCTGTGGGTGCTAGGGAGCAACCCCCACCTTCAACTGTTGGCAGGTCCAGCATTTATGTAATTATCAGACGTGACAGCAAGCTCTATATTGGACAGACGGATGATCTTGTGGGTCGACTTAGTGCTCACAGATCGAAGGAAGGTATGCAGGATGCCACGATATTATATATTTTGGTACCTGGGAAGAGCATTGCATGCCAACTGGAAACTCTTCTCATAAATCAGCTACCTTTGAAAGGTTTCAAGCTCATCAACAAGGCAGATGGCAAGCATCGAAATTTCGGTATATCTCTTGTCCCAGGAGAGGCAATTGCCGCATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPLSASRQLGKVKETLMGTRGAADAAGGQAAGPENGEVQETIINAIDSETCVFKYFRIGSNFKKWKVGDFYEAVGFDACILVEHAGLNPFGGLRSDSIPKAGCPVMNLRQTLDDLTRCGYSVCPHAEQLIGPDISLWRECIVEEIQGPTQARARKGRFISGHAHPGSPYVFGLAEVDHDVEFPDPMPVVGISRSAKGYCLISVLETMKTYSAEEGLTEEAVVTKLRICRYHHLYLHSSLRNNSSGTSRWGEFGEGGLLWGECSGKSFEWFDGNPIEELLCKVREIYGLEEKTVFRNVSVSLEGRPQPLYLGTATQIGVIPTEGIPSLLKIVLPPNFGGLPSLYIRDLLLNPPSFDVASSVQEACRLMGSITCSIPEFTCIPAAKLVKLLESKEVNHIEFCRIKNVLDEVLFMGSNAELSAILNKLLDPAAIVTGFKVEADILVNECSFISQRIAEVISLGGESDQAITSSEYIPKEFFNDMESSWKGRVKRVHAEEEFSNVDIAAEALSTAIKQLKPAIDSKGRKVGEEWFTTIKVENALTRYHEACDNAKRKVLELLRGLSSELQDKINVLVFCSTMLIITKALFGHVSEGRRRGWVLPTISPLCKDNVTEEISSEMELSGTFPYWLDTNQGNAILNDVHMHSLFILTGPNGGGKSSMLRSVCAAALLGICGLMVPAASAVIPHFDSIMLHMKAYDSPADGKSSFQIEMSEIRSLVCRATARSLVLIDEICRGTETAKGTCIAGSIIERLDNVGCIGIISTHLHGIFDLPLSLHNTDFKAMGTEIIDRCIQPTWKLMDGICRESLAFQTARKEGMPDLIIRRAEELYLAMSTNSKQTSSAVHHEISIANSTVNSLVEKPNYLRNGLELQSGSFGLLRKEIESVVTTICKKKLLDLYNKRSISELIEVVCVAVGAREQPPPSTVGRSSIYVIIRRDSKLYIGQTDDLVGRLSAHRSKEGMQDATILYILVPGKSIACQLETLLINQLPLKGFKLINKADGKHRNFGISLVPGEAIAA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..100#1693..1790#2775..2894#3515..3562#4870..4920#5243..5307#5544..5629#6205..6369#6823..6932#7133..7238#7326..7401#7539..7597#9525..9592#10208..10381#10461..10667#11106..11197#11526..11669#12272..12323#13076..13375#13829..14536#14624..14848#ATGCCGTTGTCGGCCAGCAGGCAACTGGGCAAGGTGAAGGAGACGTTGATGGGGACGCGTGGAGCTGCGGACGCAGCTGGCGGGCAGGCGGCGGGACCAGGTGAAGGAGACGCCGATGGGGGCACGTCCCCAGCAGCAGTAGCCGTGGACGTCGTCGGCGGGCAGGAAATGGGATGAGGCAAAGGAGACATCGGTGGGGACGCGCAAGGCTGTTGCATTGGCTACGTGGGCAGCAGCCGCGAATGGATACCGCCGGCGGCGGGTCGAGGCGGAGGAGACGCCGGGGATGCGCGAGGCTGCTGCCGCTGACCACCGCCACCATCAAGGGCCATTGCCTCCTGCTCTCCTCCGGCGAAAGTGGCACGAAATTGAAAAATTCACAGCCCTGGTGGCATTTTATCAAAGGCATGCGGATTGGGTGGTAAATTATCAAAGGCGTGCGGATTAGATGGCATATTACCAAATTTCTTGGTTTTTTGGAGGTTTGAGATGCCCTACCAAATCATTGGTAGTCCGTAGTCCAAAACGTACCTTTTGGTAGAGTTGGATATAGGACTTGTATTGGTTTTGGCAAGTATTGGCATCAATCCAAATATCTACAAAGTACTATTAAAGTTGCCAATTATTTGGTAGGGCAAATTTTTGCATCAACCAAAACAACCCATACTCAACTACTATTACTATGTACTAGGTTACTACTATGATCTAGGGACACACTGGAGGATGGCCATGTCCACGCTCCGATCATAGCTTCCTAGGCTTTCAAATTGAAATTTTGTCATCCTTGTAGAGACAGACACAGAAGTGCAGTACAACATTATCTCACATCCTCACATATACCAATTTCAGTCTCCCTCATGATATGCTGTACCATGCGAAGCCACTTCAGGGTTAAGTAAACGGTATTGAAAAGGTTAGGGGGTAGAATCCCTGGTTTGAGAGTTTGGGGGGGTTAAATAGTCAACCTGCAATAGTTTGGGGGGTTATGTAGACTTATTCCATGTTTCCATATTAAAGTAAACTAAAAAATCAAGTTCAAATGCACTACTGTAATTTAGAACAACCAATGGGAGGTCATTCAGTGATGCAATTGGTAGTGCTGTAGTGCACTGCACGCGTGCATCATTATTTGGGGATGAAACCAGTGAACACGTAACGTTGATGCCCTATACAGCTATACTAAAAGTCCAGTTCTGGCAAGATCCATTTTACTATACTAAACCAGTGAACACGTAACGTTGGTGCCCTATATGAGTTGGATCAGCTCCTATTTCCTACTGCACAATGTTGATAGACACACAAAAATATTAAAGAAATTATTTATAGATTGTTGTACCTTGAACCTGATCTCAATTTCACTTTTTAGAAGTGGCATGCTTGGCTTGATTTTTGTTCTATATTATTTGGCCTGTTTAAACTTCTTGGTAATCTGGGTACATCCACACTTCAGGCTATTTAACAGGAGGTCCTGGTCTAAACCAAGGAAAGTCTCACGAAGCATTTCCATGGTGTCTAGGAAGATGAACAAACAAGGAGATCTCTGTAATGAAGGCATGCTGCCACATATTCTGTGGTGGAAAGAGGTGCTTGCAAAAGTTGGCATATATGTATTTTTTTTCTCTCCAATGTATTGACAGGGAATCACTAATGCTTCAGCTTTGTTATTGCTGTTATTCTGTTTAATGTTCTCAGAAAATGGAGAGGTGCAGGAAACCATCATCAATGCAATTGACTCAGAGACTTGTGTATTCAAATATTTTAGGATTGGATCCAACTTTAAGAAATGGAAGGTGAATCAGATGCTCATGCTTAATATAATTATGCAATGATCATTTCTTTCACATTTTCTTTAAGAAATAGAAGGCTAGCATGACGTTGTACTATTTTTAAGTTACTGTGAATTACTTCAGTTTTTCATATTCTAAAGTGAAATATGTATGTGTTCATTACTCCATTTGTTTGCTTAGTTCTATTAATCTTACAATTTGTATGTTCCTATTCTTTGCTTAATCATTGGAGAATTTTATGGCAATCACGGCTTCATGTATGTCTTGAAAAAGAATTTCTACCAGAGCAATCTGACTAGTTTGGAGAAAGTTTATTGTAATTTTGTATCATATATAATCAATTCCTTTCTTCCATGGTTATTTTTCTTTCATTTTATTAAATATTTCTTGCTTGAGCCATTTTTGTGTTGGTCAAATCAGGCACATTTCTTGGTATTTACTTTCTTTTCATTAACACAAATGTTGATATGAATCTTTGCAGCTTGAAGGATGGAAGCCTGAACACGGAAATGTTGCAATTCAAATCGAAGTTTCCTCGTGAAGTTCTACTTTGCAGAGTAATGCTATTCTATTCTTTTATTTTGTTCACATGCTTGATCGTCTTTTTTGCGAAAATCTGGAGAAATGCCAAGAATTTCTTAGCTGGGAATTTTTAGTTATCAAAACCTATAATGTCATAGATGTTTCTTTCTGAACATCTATGACATGTGATGGTGTGTTTTATGTGCCTCTGGGAAATCTTTACTATGCCATAACTTACGTGCACTGCTGTCCTTGTTTCCAAAACAATTTACTTTTTGTTTCACTACATACCCCTCCATACCCATTTCCATCTGTCAATCTGGATTCGCTTTCAGCATTTTGCTAAATATAATACTCAGAATTAATGTATCTCTCCAGCGTTCTTCTGGTTTTCCTCTTACATTCAAGCTGGAAAAAAAAATCCAAATACATAGACCTATAACGGAATAACCTTTCTCCATTCAGGTGGGAGATTTCTACGAGGCTGTTGGGTTTGATGCATGTATCCTTGTGGAGCATGCAGGCTTAAATCCTTTTGGAGGCTTGCGTTCTGATAGTATTCCAAAAGCTGGATGTCCAGTCATGGTAAACTGTTACATAACTATGCTGATGCTCTGAAATTAGGATTGCTTTAAGAACTATCATAGTGATCTGCCTAGTTAATTATCAAATTTTTGCATCATTATGTAATTTGTTTTTTGAAAAAGTGGAGAACGAGGAGCTTGAACTTCTTCTGTGAAACAGATCTTGTTGCGTTCCTTTGTTATGCTTTTGAAGAGTCAGCGTATCAGTACCATACTGTGCGGCACTTACTGCTGCCTTTTATCTACATATAAGTTTCAGTCTAACCACAATAACATTTTGTAAGTTGCCTGCCTTTTTTTTGCAATTACACATTGTGGATATGGAAGACTTATTTATTTTGTTAGTTACTTACATCACACCTGTCTAGCATTTCGTATGCTCATGATCCATCAATATAGTTCAAGCTTTATTCACCAATATGGTTTGAACTAGGAGACATGCTAGGAATTGAAGTTAGCATGCTTCATATCTTATTGTTCTGTTGGCAATAGTATGAAAAGAGCATTCAGAACTTGTGGCAAACATTGATTTAATATGGTTTATACTTTATAACTAATAATGCACATCTTTTTACATTATGTTGATAATATTCTATGACATCAGAGCACATTTCCTTACAGAATTTGCGGCAGACATTGGATGATTTGACTCGATGTGGTTACTCTGTGGTAAGATGTTAACTCAGTTGCTTGTAACATATCCATTAGGATCATTTGTGCAAGGGATAATTGCATCTGTACCCCCATTTTGAAAGCCAATTGTTGTTTTACCCCCACTTTTTAGGGTTTGCAGTTTTGCCCCCACTTTTTGAATCCGAACCAGCCGTCTACCCTCACTTGTAACAGCCGTTTGGTGGGTCCCACGCTTCTGTGTTAAAGAAATACAAAAGGAAATAAAAAAAAGGTTTTTAGGAAATATGATATTACCTTTGTACCCCCGAGGGAATGGATAAGGCCTCTGAGTCTGTTTCGTGCGAGACGGTTTCGTGTGGGCGACGACGTGTGCGCGAGGCGGCGACGGTGAGGGCGCGCGTGGGCGGAGGCGGAGGCCGCGGGCGAGGCGGAGACGGCGGCGGCGGCGGGCGAGGCGGAGGCGGCCGCGGGCGCGCGCGGAGGTGGTGGCAGCGGCCGATGGCGCGCGTGGAGGCGGCGACGGCGGCGGTGGGCGCACGCGGAGGCGGCTACGGTGGCCGTGGGCCGCGGCCGCGTCGAGGGCCTGCCGGCGGCCACTTTTTCGTCAAATTTTGTAAATGCTGTTAAAATTTTATTCAAACTTTGGTCAAATTTTGTTATTGCCTAGTAGATGCTCATATTTGGTCCAAATGCTCATCACACAAGCTGAAATGCACAAAATAGGGGCAAAATCGCACAGCTGAAATAAAATAAAATGGGGGCAAAAATGCAATAACCACCAAGGGTATAAATGTCCTTTTTTCTACCACTAACACTGTTAAAACCGGCTGTTAAAAGTGGGGGTACATGGCTGATTCAGATTCAAAAAGTGGGGGTAAAACTGCAAACCCTAAAAAGTGGGGGTAAAACAGCAATTGGCTTCGAAAGTGGGGGCATGGATGCAATTGCCCCTTTGTGCAATGTAATTTTCAGTGTTCTTGACAAAAGAACCACAATTCTGCATGTAAGGAACATGTGCCCCAACCTTGTACCGGTCAAGCTGCATAAGCGGCTGATTTTCCCATAAGTGCTACAAGGTGGGGTGATCCCATGGAATCTGATATCACTTTTTAGAACCTTGGTAGTTGTAGAAATACAACTTCAACTATAAGGTCTAAAGTCACTGTTCCAGTAAGCCATAAGTTCAATGATCTACATGAAATGTCAGTGCTTATTTG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