Difference between revisions of "BGIOSGA015476"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA015476

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015476, complete gene.

LocusTag

OS04G0252400

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA015476-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA015476-PA

Length

16962

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:7613705..7630666

Sequence Coding Region

7630530..7630666,7629680..7630026),complement(7627921..7627976,7627725..7627806),complement(7626544..7626622
,7626166..7626216),complement(7625523..7625619,7625394..7625426),complement(7625108..7625236
,7623993..7624184),complement(7623772..7623855,7623585..7623683),complement(7623439..7623512
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,7619358..7619435),complement(7614903..7615102,7614060..7614150),complement(7613834..7613923
,7613705..7613758

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:7613705..7630666 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:7613705..7630666 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGACGGGAGAGAGAGGGAGAAAGAGGGGTGGCGGTGAACGCCGGCGACGGGAGAGGCGGCCCTCCTCGTCGTCCTCATGGCCGCCGGCGACGGAAGAGGCGAGCGGCAGCGGCGGCGAGAGGGAGAGGCGCCTTCCAGAATCCTCTGCTCCGCCCGAATCGCCGCCGCTTCTTCCGAACCGGTGGCGCGGCCGCGGAGCCCTAACCCCTAACGCGTGCTGTGACATCTCCGGCTGTGACAAGGCAGTGGGGGCCTCCGGGGACCTCATTTTCCGCAAGTGGAATCCGCTGCTCCACCCGAATCGCCTCCGCGTCTTCCGAGTCGGTGGCGCGGCCGCGAGCCCTAAACCTACGGCGTGCTGCGACGTCACCGGCGGTCTCGAGGCAGTCGGGGTTCTCCGGGCGGCCATGTCGATGGACTCGGTCATCTCCTCGCGCAGCGGCGCCGACTACAGGAGCTTCCGCCAGATCACCCGGGATCGTTTATTATTTGAAATGTTGAGATCAACGAAGAAGAGCTCAAAATCGGCATGGAAGGTTCTTATCATGGACAAACTTACGGTGAAGATTATGTCATTTTCTTGCAAGATGGCAGATGTGATGGAAGAAGGTGTTTCATTGGTTGAGGACTTATACATGCGGAGGCAACCATTACCATTGATGGATGCAATTTATTTCATTCAACCAACTAAGGAAAACATTCGCATATTCATGTCCGACATGTCAGGGAAAATACCACTGTATAAGAAAGCCTATGTGTTTTTCAGTTCACCCGTACAAAGAGAGTTGGTGGCCCAAATAAAAAAAGATTCAAATGTTAGAGCACGCATAGGTGCACTCAGTGAGATGAATCTGGAATATTTTGCTATCGATAGCCAGGGCTTTACAACTGACCATGACAAGGCCCTAGAAGAGCTATTTAGTGAAAATGCAGAAGGTTCACTCAAGTATAACTCTTGCCTTAACATGATGCCCACTCGTATTGCTACAGTATTCGCATCAATGAGGGAATTTCCTCGTGTGCACTATCGTGTTGCCAGGACGATTGATGCTTCTACTTTGACAACACTACGAGATTTGGCACCCACAAAGCTTGCTGCTGGTGTGTGGAATTGCCTTGCAAGATTTAAGGCTATGATACCTGAATTCCCTCAGACTGAAACATGTGAATTACTTATCGTAGACCGATCAATAGATCAGATCGCACCAATTATTCACGAATGGACCTATGATGCCATGTGTCATGATCTACTCTGCATGGATGGCAACAAGTATGTACAACAGGTCCCAAGCAAGTCTGGTTCAGGCACTGAGAACAAGGAGGTTTTGTTGGAGGATCATGATCCAATATGGCTTGAGCTTCGGCATGTACATATAGCCAATGCTAGTGAAAGATTGCATGAGAAGATGACCAATTTTGTATCAAAAAACAAAGCTGCTCAACTACATCAAGCAAGAAATGGTGGAGATTTATCAACCAAAGAGTTGCAAAAAATGGTTCAAGCTCTTCCGCAGTACAGTGATCAAATTGACAAGCTTGCGCTTCATGTTGAGATTGCTGGAAAGCTCAATAGCACAATTAAAGAGCAACAATTGAAAGATGTTGGGCAGCTTGAGCAAGATCTTGTGTTTGGTGATGCTGGGACAAAAGAACTCATAAATTTCTTCAGGACACATTTGGATATCAGTCGTGAAAATAAGCTGCGTTTGCTTATGGTTTATGCTGCCATCAATCCAGATAAAACTCGAAGTGATAAGGGTGCAAAGTTGATGCAGCTCGCAGGATTATCTGCTGATGACATGATTGCAGTGAGTAATATGCGTTGCCTTTGTGGGCATGATTCTAAAAAGTCTTCGGCAGGTGGCTTTACTCTGAAATTTGATCTACGTAAGAAAAGGCATGGTATCAGAAAGGAGCGGATAGGAGAAGAATCAAAATGGATGTTGTCCCGGTTTTATCCCATCCTGGAGGAGTTGATTGAGAAACTTAGCAAGGGTGAGCTACCAAAAGATGAGTATCACTGTTTGAATGACCCTAGTCCTAGTTTCCGGGGAATTCCAAGTGCATCTACCCAAACAAGCCCAGCTCACCAGCCAGCTCAATCCATGAGATCTAGAAGGACAGGTGGCACATGGGCCAGGCCTCGAGACTCTGATGATGGGTATTCAAGTGACTCGGTACTGAAGCACACATCAAGTAATAGCAGAAAGTTGGGTCAGCGATTATTTGTTTTTGTTATTGGTGGTGCTACTCGATCTGAGTTATGTGCTGCTCACAAGCTATCATCAAAACTGAAGAGAGAAATTATCCTTGGCTCCTCTAGTCTTGATGATCCACCCCAGTTCATCACTAAATTAAAAATGTTATCAACCGATGATTTGACACTTGACGATCTACAGATATAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MATGERGRKRGGGERRRRERRPSSSSSWPPATEEASGSGGERERRLPESSAPPESPPLLPNRWRGRGALTPNACCDISGCDKAVGASGDLIFRKWNPLLHPNRLRVFRVGGAAASPKPTACCDVTGGLEAVGVLRAAMSMDSVISSRSGADYRSFRQITRDRLLFEMLRSTKKSSKSAWKVLIMDKLTVKIMSFSCKMADVMEEGVSLVEDLYMRRQPLPLMDAIYFIQPTKENIRIFMSDMSGKIPLYKKAYVFFSSPVQRELVAQIKKDSNVRARIGALSEMNLEYFAIDSQGFTTDHDKALEELFSENAEGSLKYNSCLNMMPTRIATVFASMREFPRVHYRVARTIDASTLTTLRDLAPTKLAAGVWNCLARFKAMIPEFPQTETCELLIVDRSIDQIAPIIHEWTYDAMCHDLLCMDGNKYVQQVPSKSGSGTENKEVLLEDHDPIWLELRHVHIANASERLHEKMTNFVSKNKAAQLHQARNGGDLSTKELQKMVQALPQYSDQIDKLALHVEIAGKLNSTIKEQQLKDVGQLEQDLVFGDAGTKELINFFRTHLDISRENKLRLLMVYAAINPDKTRSDKGAKLMQLAGLSADDMIAVSNMRCLCGHDSKKSSAGGFTLKFDLRKKRHGIRKERIGEESKWMLSRFYPILEELIEKLSKGELPKDEYHCLNDPSPSFRGIPSASTQTSPAHQPAQSMRSRRTGGTWARPRDSDDGYSSDSVLKHTSSNSRKLGQRLFVFVIGGATRSELCAAHKLSSKLKREIILGSSSLDDPPQFITKLKMLSTDDLTLDDLQI</aaseq>

Gene Sequence

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