Difference between revisions of "BGIOSGA015667"
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Revision as of 16:03, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA015667 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015667, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBB0080H08.21 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA015667-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA015667-PA |
| Length |
11782 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:1930002..1941783 |
| Sequence Coding Region |
1941648..1941783,1940642..1940823),complement(1939638..1939880,1939385..1939496),complement(1939121..1939291 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:1930002..1941783 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:1930002..1941783 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCTCCGCCGCCGAGGAGGCCAAGGGCGTGGAGGAAGGAGGAGGAGGAGCCAGCGCCAACGGCGGCGACAACCCCGACACCGACACCGACTCCGCCTCCGCCGCGGACGCGGCCTCGTCGTCTTCCCCCGATGATGACAGGGGCCTCCCCAGATCAAGCACTATGCCAGGTGGGATTAATAATGTTGAAATAACCAATGAAACTGCTGGTCCATCTAATCTGGAAAGATCAAGAACAGAGAGGCGTCGACAAAACAATCCAGCTGATGATCCTACCAAACAGTTATTTGATGATAAAATTTCCCTAAAAAAGAAGCTCAAAATGATAAATCGGATAGCTACAGTGAAACATGATGGAACTGTGGTGGTTGATGTGCCAAGTTCTCTGGAAACAAGTACAACTGATGGTGTAGCATATGATGGCTATAGTGATGTTACTGTTGAGGAACCATTGGATGGAGCAGACATACCTGTGAGGCCTCCTATGCAAATTGTTATTCTTATTGTGGGCACAAGAGGTGATGTTCAGCCATTCATTGCTATAGGCAAACGCTTACAGGATTATGGACACCGTGTGAGATTGGCAACCCATGCAAACTTTAAGGAGTTCGTTCTAACGGCTGGTCTGGAGTTTTTCCCTCTTGGCGGTGATCCAAAAATACTTGCTGAATACATGGTGAAGAATAAAGGATTCTTGCCTTCTGGTCCTTCAGAAATTCCTATTCAGAGGAAACAGATGAAAGAAATTATATTCTCTTTGCTACCTGCGTGCAAGGAGCCTGATCCTGACACTGGTATTCCTTTCAAAGTGGATGCTATCATTGCTAACCCTCCAGCATATGGACATACTCATGTGGCAGAGGCACTAAAAGTACCTATTCATATATTCTTTACCATGCCATGGACGCCAACTAGTGAATTCCCCCATCCTCTTTCTCGTGTGAAACAAGCGGCTGGATATCGACTTTCTTATCAAATTGTTGACTCTATGATTTGGCTTGGTATCCGAGATATGATAAATGAATTTAGGAAGAAGAAGCTGAAGTTGCGTCCGGTAACATACCTAAGTGGTGCACAGGGTTCTGGGAATGACATTCCTCATGGTTACATCTGGAGTCCTCACCTTGTTCCAAAACCGAAAGATTGGGGCCCCAAGATTGATGTTGTTGGATTTTGCTTTCTTGATCTTGCTTCCAATTATGTGCCTCCTGAACCACTTGTAAAATGGCTTGAAGCTGGTGACAAGCCCATATACGTTGGGTTTGGTAGTCTTCCAGTTCAAGATCCAGCAAAGATGACTGAAGTCATTGTCAAAGCACTTGAAATAACTGGACAGAGAGGTATCATCAACAAAGGTTGGGGTGGGCTTGGAACATTGGCAGAGCCAAAAGATTTTGTATATCTACTTGATAACTGCCCCCATGACTGGCTCTTCCTGCAGTGTAAAGCAGTGGTACATCATGGCGGTGCTGGAACAACAGCTGCTGGCCTCAAAGCAGCGTGCCCTACAACTATTGTACCTTTCTTTGGTGACCAACCATTCTGGGGAGACCGAGTGCATGCTAGAGGGGTAGGGCCTCTACCTATACCAGTTGATCAATTCAGCTTGCAAAAATTGGTTGATGCTATAAACTTCATGATGGAGCCAAAGGTGAAAGACAATGCCGTGGAGCTTGCCAAGGCCATGGAATCTGAAGATGGTGTGTCAGGTGCAGTCAGGGCATTCCTCAGACATCTACCTTCAAGAGCAGAGGAAACAGCACCTCAGCAGACATCCAGCTTCCTGGAATTCTTAGGTCCTGTAAGTAAATGTCTTGGTTGCTCATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASAAEEAKGVEEGGGGASANGGDNPDTDTDSASAADAASSSSPDDDRGLPRSSTMPGGINNVEITNETAGPSNLERSRTERRRQNNPADDPTKQLFDDKISLKKKLKMINRIATVKHDGTVVVDVPSSLETSTTDGVAYDGYSDVTVEEPLDGADIPVRPPMQIVILIVGTRGDVQPFIAIGKRLQDYGHRVRLATHANFKEFVLTAGLEFFPLGGDPKILAEYMVKNKGFLPSGPSEIPIQRKQMKEIIFSLLPACKEPDPDTGIPFKVDAIIANPPAYGHTHVAEALKVPIHIFFTMPWTPTSEFPHPLSRVKQAAGYRLSYQIVDSMIWLGIRDMINEFRKKKLKLRPVTYLSGAQGSGNDIPHGYIWSPHLVPKPKDWGPKIDVVGFCFLDLASNYVPPEPLVKWLEAGDKPIYVGFGSLPVQDPAKMTEVIVKALEITGQRGIINKGWGGLGTLAEPKDFVYLLDNCPHDWLFLQCKAVVHHGGAGTTAAGLKAACPTTIVPFFGDQPFWGDRVHARGVGPLPIPVDQFSLQKLVDAINFMMEPKVKDNAVELAKAMESEDGVSGAVRAFLRHLPSRAEETAPQQTSSFLEFLGPVSKCLGCS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..136#961..1142#1904..2146#2288..2399#2493..2663#3480..3543#3634..3691#5951..6128#7689..7819#8924..9026#9131..9207#9523..9570#9835..9984#11606..11782#ATGGCCTCCGCCGCCGAGGAGGCCAAGGGCGTGGAGGAAGGAGGAGGAGGAGCCAGCGCCAACGGCGGCGACAACCCCGACACCGACACCGACTCCGCCTCCGCCGCGGACGCGGCCTCGTCGTCTTCCCCCGATGGTGATCCATCCATCCGTACCCCCCAAACCCCGCCTGCCTCTCTCCTTACGTCTTCGATTCAGTGTAGCTTTGCATGCGAGAGGCAAACTAGCGTGTAGGGATAGGTGGCGGTTGCTTTGCCTTCCCTAGTTCACGCTTCGCCCCCCCAAATCTGCGGCGGCTTCTGCCATCTCCGCTCATGTGGACTGCTGCTAGTTGCGAGCGCACCTTCGCCTTGTTGGTGGACACTCTGATGGCTGCTTCACTGTCTGGGTCACGCTGGTTGCTGGGAATGCTGCGTGTGAGGGTTTGGTGTGGGGGTTTGGTGCTGTGTTGAGTGCTAATTTTAGGCGTTGACTCCACGACTAGTGGGTGATGGCCTGCCTTCTCCTAGATTTTACCTTTCTGAATAATGGTTTTCTCAAATCTCTTCACAAAACGAAGCCGTTTTGGAGGGTTAGATTACATCGAAACCCCAATGAACTAAACTTATTGTAATTTTGTTTACACTGTCAAGCAGGTTGTGCTCTTCAGCTCTGGTTATTACACAATATTGTAGGTCCATTGCACAGTGTGAAAGTATGCTCTACTCACTACTCAGGGTAACACTGCTAGGCTTAGTTGTACCATGTGGCTTGTGAGTTGTGTTCAATAGGATTATGCAGTGGTGTTTATAGTTGTATCATTTTTTAAAGGATAATTTACTGCAGCAAACCTCAAATCATAGTGCAAATATATCTTTTGTTGATACATTTTAATCTCACTTTGTTCAGTAAGTTATGATGGTGTAAAAAAAAAGGAATGTTGTCATCCATATTTTTCAAACCATCATTATGTTTTTGTAGATGACAGGGGCCTCCCCAGATCAAGCACTATGCCAGGTGGGATTAATAATGTTGAAATAACCAATGAAACTGCTGGTCCATCTAATCTGGAAAGATCAAGAACAGAGAGGCGTCGACAAAACAATCCAGCTGATGATCCTACCAAACAGTTATTTGATGATAAAATTTCCCTAAAAAAGAAGGTGCGGATAACATAGTCCTGTTGCCTATGTCTTGCCTTTCCTTCATTTGCAATGCACCCTGTTTCATCTATTTACCCTTGTAGCTTCCTTTTCTTCATGCATTTGACCTTTGAAATTTGGAGCATGTATATGTTCATATAAGAGAAGCCATTTTGAACTGTCACGTGAACTGTTAGCCTTATCTGCTGAGCGCAGACAAGATAGCTATATCTGAATTTGATACATTTTAGTATAATGCAGCATTGTGAAAAAGGGCTAGGAGCCTGTTGCAGAGGTGAGGGCTAAGATAGCTATATCTGTTAAACGATTATGTGTGATACTGCTGATTAATCAGAATTTTGATAGTTATGCTCTACTAATTTATTTATTTATAACTAAAGTCAATTAAATCATGAAAATTATGACATGTTATAACCACTTAAAAACAGCACTTGCTAAGCTTGACATGTTGTATTTTGTGCTTCACTGCTTCATCTCCAAAGCAAACACTACTACATGAGATCAGATATTAGTTCACTGTAATTAGGGAGTAAAGTCTATTTTACGATTAAACTTGAGAAACATTCCAACTGATTGAAAAATAGTTGATTATTCAGATTATTATGCAGCCAATTCAGCCTTTTTTTCACAACAATTGTGTATTGTGATACACTGCATGGTAGCTTTGAATAGTCAGGAACTCAGTGCCAGATGTACTCTTTTGTATCTGGATGCTTGATGTTGTTCAACAGTTTTTTGTGATATTTTACATTTTATTGTAGCTCAAAATGATAAATCGGATAGCTACAGTGAAACATGATGGAACTGTGGTGGTTGATGTGCCAAGTTCTCTGGAAACAAGTACAACTGATGGTGTAGCATATGATGGCTATAGTGATGTTACTGTTGAGGAACCATTGGATGGAGCAGACATACCTGTGAGGCCTCCTATGCAAATTGTTATTCTTATTGTGGGCACAAGAGGTGATGTTCAGCCATTCATTGCTATAGGCAAACGCTTACAGGTTAGATCAAAAGCTACCATTGTTTGTTAATTTCACATTATTTTATCTCTCATCAGGTGAACTATTTTGCTTCTCAAGCTTAATGTTTCTAAATACATGGTTTCTGTATGACTAGGATTATCCATTACCTGTTTTTTTTAGGATTATGGACACCGTGTGAGATTGGCAACCCATGCAAACTTTAAGGAGTTCGTTCTAACGGCTGGTCTGGAGTTTTTCCCTCTTGGCGGTGATCCAAAAATACTTGCTGAATGTATGAAAATAAATCCTTGTATTCACATAGTTGATTTTTTTCAGTTTCTACGTCACGATGATTAATATATTTGGTATATTCATATTTGAGCAGACATGGTGAAGAATAAAGGATTCTTGCCTTCTGGTCCTTCAGAAATTCCTATTCAGAGGAAACAGATGAAAGAAATTATATTCTCTTTGCTACCTGCGTGCAAGGAGCCTGATCCTGACACTGGTATTCCTTTCAAAGTGGATGCTATCATTGCTAACCCTCCAGCATATGGTCAGTATATCTTACCAGCTTTGGATTGATTTCTTGCACTTTGCTTTACTTTCTCTCTACCTTACAAGTGTAACTCCAAGTTTGTTTATTATATGCTCAACTAAGTACCTACTACTCTAAAAAACACCAATTTCTGACATACTCATGTACAAGGTTGTGAGGATCAGGATCCAAGGCAGGATTTTTTTTTTGTCCTGACATGCTTGGAGTCTTAGTATTGCACTGTGAAAATTGTTACTGTGAAGGTTATATGTTATAAGTTACTAATTTGCATGGTCGTCAGAATTTAAAAGATCCTATGCACGTTAGGATCCAACGGGATCAGCGTCATCATATTTTATGGTGCAGTCAAGATCATATATTTTTTAAAACGAAAAGATCTTAAATTTTTATAAGTTTGCTCATGTACAATTCTTTCTTACCGCTTCAATTTGGTTTATTTTTCTGATTTGAGGCATCCATTTCAGAACAATCATTTCTTGATTCATGCCTTATGATGGTGATGCTTTTCTTTGGTGTGCAATTAATAGGCAGACTGACCTAGTAATATACTTGGGAAGTTGACATCTTTAAAAGCTCTTTCTGTTTCGCCAATCTTTCTGGAGGCATCTCTTTTCAGGATTTTTCTGTGTTTATCACTTTGGAACCAATCATAGTCATTTCCAGCTCACATGATTAGGCAATGATGTGTTTACAAGGTGCTCTAGTGTGAATTTTTTTGCATGTTTTGTATTTTATGGTCCAGTAGCCAATTGCAATTCACTTCTATGAAAATTTATAAATGTTTCTTTGCTGCTGACCTTAACGATTATTCAGGACATACTCATGTGGCAGAGGCACTAAAAGTACCTATTCATATATTCTTTACCATGCCATGGACGTGAGTCACTATTGTTTTGCTTCCTCTTTGAAGAGCACATTTGCTGAGGAATATTCTCATTTGGAGATCTAACTTGTGCTGCTTGTTCAGGCCAACTAGTGAATTCCCCCATCCTCTTTCTCGTGTGAAACAAGCGGCTGGATATCGAGTGAGTTTGCATCTTACATATTTATTCAGGAAATATTTAAAACTTCTTCTCTTAGACACATTTGTTATAGTTGCTCAATGATTAAATTAACCCTACCGGCATAACCCAGCTGTGTTAGCTAAACCTGATTTTGTTTTTGGCAGCAAACTTAGACAGTTTAAATGCAATTGCCATTAGGCTAGATATGTGGTTTTGCTTCATTAACAGTAGAAAAAACAGAATCATTAGTGCTTATATTGTGGTGGTTAGCTTACTCTATGCCTTTTTTGGTGGGTAGCTTAATTATAGGTTTGAACCCATAACCATCTCTTAATTTGAACCAAACCCACAGCATTGGCACATACTACAAACTAATACTGTGGTGTAGGCCATTCTGGATCATTGTAAATTTCACAGAAAGGATAAACAACACATACTTGAATGATGTGTCTGGGAATGCGCTTTCTAAGCCTCATGAAAGAACAAAAAGAGATATGAGTATCTATGGAAATATATTCTAAGAACATAAGAAAGAAAACACTCTGCTGTTTGCTGTTATACATTTTCGCATTTATAATTTAAGTTCAATATTTTCAAGGTCAGTAGATCTTTAATCCTTGAACCTTATAGTTGATTTAGAGGGGTATTTCTGATTTGGGACATGGAAGAATAGAAGCAGCATTCTAAGGGCTTTAGACATTTCCCATTTTTCATCAACCGCGTCTAATTGATTAACTATCATATTTTGTGACACTTAGGCTTATTGAAAACTGCAGTTGGTTTTATGGCATAGGCCTCAGGAATACTTCTTTTTGGAGTAAGCAACTAAGCATAGCGTTAATCATATGTTAGAAAATGGCAGGCAAGGATTGATCTTCAATTTCCCATTTCTTAGTCAGTATGCTAATTGATGAACTGAAAGAAATACTACAAAAAAGGTTGCCGGGAGCTTACATTCTCTTTTAATCAATACATAATGATCCTTATACTATTAAATGCGGCAGACACTGCAGGGAGGATAGCTGGCAGTGTCAGCTGCTTGTGAGAGAGAACATTATATATGACGGACACTTAGATGAGATTAGATTTTATTTGTTCTTTCTTGCGTTCGATTACTATATCTGGCTGCCTTCTTAAGTAGGCGACTAACCCATAATTAAGCAAA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