Difference between revisions of "BGIOSGA015982"
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Revision as of 16:05, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA015982 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA015982, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_15039 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA015982-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA015982-PA |
| Length |
11510 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:6582167..6593676 |
| Sequence Coding Region |
6582167..6582169,6582290..6582362,6582726..6582847,6582928..6582987,6583064..6583135 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:6582167..6593676 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:6582167..6593676 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATTACCTCAAGACGGTGGTTCCATCACAGCTGATGGCCGAGCGCGGCGCCAACCTCGTCGTCATCAACCCAGGATCTTCAAATGTGCGCATTGGGTTCGCAAGTCAGGATGTTCCATTCAATATACCGCACTGCATTGCTCGACATATCACTCAGCGGAAGGATGATACACCAAGGCTTTCTGTGCGAGACAAGATGCTCAACTGCCATGCAACTCCATCGCAGAATGCAGAGCGGGAGAGGGCATATGATATTATTGCATCGCTGCTCAAAATACCCTTTTTGGATGAAGAAATGCCTTCAGCGAACCAGGCGTTACCTCCTAAGATGGGACGTGTTGATGCCCTTTCTTCACAGCAAAACAAAGATGATAGTAAATTCACATGGACAGATGTAATGGACAGAAGTATTAAATCATCTACACCAATTGAAAGGCCAGTTGACAAGGATGCTGACGTGGATCCCCTGCAAAGATCAACTCCTGACGATACTGAGCCTAATTCTGAAGAAAACATGTATAAAGAAATAATATTTGGAGAGGATGCTTTGAAAATCCCACCTTCTGAGTCATACTGTCTGAGTCACCCGATCAGGAGAGGCCATTTCAATATTTCTCAGGATTATTCATTACATCAGGTTTTAGAAGATTTGCGCACTATTTGGAACTGGATATTGACAGAAAAATTGCATATCAATCCAAGAGATCGGCATCTGTATTCTGCAATTCTTGTTCTAGGAGAGACATTTGATAACCGAGAAATCAAGGAAATGTTGTCAATCGTACTTTGCGATTTGGGTTTTAGCACAGCAGTGATACATCAGGAAGCTCTAGCTGCAGCATTTGGAAATGGCTTGTCGACATCTTGTGTGGTCAACATTGGCGCGCAAGTTACACAAGTAGTTTGTGTTGAGGATGGTGTTGCTTTACCCCACACAGCCCTGGCGCTTCCATACGGTGGAGATGACATATCTAGATGCCTTCTTTGGGTTCAACGTCGTCATCGCACATGGCCAAACTTCCAAACTGATCCAGTGAACAGGCCTATAGATATGCTAATGCTCAACAAACTAAAAGAGTCATACAGCCAGATAAGAAGTGGAAGTTTTGATGCTGTCAGTGTTGTTCATTCATATGAGCATGAAAAATCAGTTGGTCATCAGAAAACAAAGCTATCGGCTCTGAATGTACCTCCTATGGGGCTACTTTATCCAAGGGTTCTTGTCCCAGAAGAATACCCTCCACCTCCTCGATCTTGGTTCCAAGATTATGATGACATGTTAGAAGATACATGGCAAACAAGTGACAGTCTTTACTCAAGTGGGAATGGTGGGTTCGGTATGTGGGACAATTATCCGATGTTTCCCACCAGATTAAAAAAGTTTGATAACATCGGTCTTGTAGAAGCCATTGTTAGTAGTATCCTTTCGACAGGACGTATTGAGCTTCAAAGGAAGCTATTCTGCAGCATTCAGCTGGTTGGTGGTACAGCTTCAACAGCAGGCCTTGCACCAGTTCTAGAACAAAGGGTTCTCAATACTATTCCATCAAATCAACCGATAGAGAAAGCAGAGGTATTACAGTCGAGGAGTTATCCATTATTTGTCCCATGGAAAGGTGGTGTGATTTTGGGCGTACTTGATATTGGTCGTGATGCTTGGATACATAGAGAAGATTGGGCTAAAAATGGTGTCCACATAGGGAGTGGGAGAAAATATAGGGATTCTTATTTTCTTCAGGCACAGGCAATGTGTTACTACAATTCATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDYLKTVVPSQLMAERGANLVVINPGSSNVRIGFASQDVPFNIPHCIARHITQRKDDTPRLSVRDKMLNCHATPSQNAERERAYDIIASLLKIPFLDEEMPSANQALPPKMGRVDALSSQQNKDDSKFTWTDVMDRSIKSSTPIERPVDKDADVDPLQRSTPDDTEPNSEENMYKEIIFGEDALKIPPSESYCLSHPIRRGHFNISQDYSLHQVLEDLRTIWNWILTEKLHINPRDRHLYSAILVLGETFDNREIKEMLSIVLCDLGFSTAVIHQEALAAAFGNGLSTSCVVNIGAQVTQVVCVEDGVALPHTALALPYGGDDISRCLLWVQRRHRTWPNFQTDPVNRPIDMLMLNKLKESYSQIRSGSFDAVSVVHSYEHEKSVGHQKTKLSALNVPPMGLLYPRVLVPEEYPPPPRSWFQDYDDMLEDTWQTSDSLYSSGNGGFGMWDNYPMFPTRLKKFDNIGLVEAIVSSILSTGRIELQRKLFCSIQLVGGTASTAGLAPVLEQRVLNTIPSNQPIEKAEVLQSRSYPLFVPWKGGVILGVLDIGRDAWIHREDWAKNGVHIGSGRKYRDSYFLQAQAMCYYNS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..3#124..196#560..681#762..821#898..969#2163..2265#3125..3330#4975..5095#6054..6118#7275..7364#7509..7559#8480..8611#9252..9341#9516..9586#9667..9842#9915..9958#10044..10093#10166..10211#10472..10522#11367..11510#ATGGTAGGCTCCCCATGGCTTCTCTCCCCTCTCAATCGCGGCCAAAATTCCACTGGGTTTTCTGCTACTTTTGAGCCATAAATCCCCGAGAAACCCTAACTAACAAGTAATTTTCCATCGCAGGATTACCTCAAGACGGTGGTTCCATCACAGCTGATGGCCGAGCGCGGCGCCAACCTCGTCGTCATCAACCCAGGTGCGCCCCTCCGGAAACCCTAGCCCCTGATATCAATCTGGTCATCCCCTCCTCTTTTGGGTGCTATTTCGTATGGCCAAGTCCTTCTTGAGATTCATGCCTTCCACCCTCCAATATCGAGAATATTTGGACGATTTGAATGGGTTGATGTGTTCTTTTGGATGAAAGAGTTGGAAGTAGTTGGACGAAATGCATAAAGCGCAACCGTATTAGTAAAGTAATTTTTGTGTGATAATTTTGTGGTTGTGTGCTGACAAATTATCTTCGCAGCAGCTAGGTGCCTGCCTTATCTAGATGCAGTTTTGCTGCCAGTTCAATTCGTAGTTGCTTTCAGCTGACCAATCAATTATCCGTGTTCTCTAGGATCTTCAAATGTGCGCATTGGGTTCGCAAGTCAGGATGTTCCATTCAATATACCGCACTGCATTGCTCGACATATCACTCAGCGGAAGGATGATACACCAAGGCTTTCTGTGCGAGACAAGGTGGTGCAAATATTGGGAGGTTTGTGATGCAATGCAATTTATCTTTATCCTAATTGAACGACATTCATGTTTATTTGCAGATGCTCAACTGCCATGCAACTCCATCGCAGAATGCAGAGCGGGAGAGGGCATATGATATTGTAAAAAGCAAACACTTGGCGTTGTTTCTTTTTGGATTATGTTTCTACTTGAGCTAATGAGGTGATAGACTTGCAGATTGCATCGCTGCTCAAAATACCCTTTTTGGATGAAGAAATGCCTTCAGCGAACCAGGCGTTACCTCCTAAGGTAGGACGCACGATCTTTAAGTCTTACCTATCTGGTTGTACGGTTATAGGCAATGAGAGTGAACTACAGAACTAGAGGAATCTGCTGAGAATATAGTAGCACATGCTCCACCCTACTGGATCAACTACAGTATTATTGGGTTTAAAAATTCGAGTTCCACCCTATTGCAAGATCCAGATGTCCTTTTGCTCTTGTATGGAACAAAAAGGCTTTAAGATGGGCTCATTATATTATGTCTTTGGTGTTGATGTTTTTTCCTTAGCAGCCAAATGTATGTTACATTATGTACAATTAAGTAAACTATGTGATCTTCTAATCCTTTACAAAGGACCCAACAAAATGACATGCACACATCTATGTAGATCAATTCACAAAAGATCACATGTTATGGAACTAAACATCACAACAACTAACTCCTTTTCATGAGTAAAGATATGCTCGGGCACTTTGGTCTTAATGCATAGCCATGATCAGGTGGGCCACAGAAATCCTGCTTCTTGCCCATCAGTGCCTTGATTGGATGAGTTAGCACTTTTCAGTGAACAAAGAAAAATAGCATTGGTAGAGGGAGAAAATGGGGAGATAGAGTGGATATTGCTTGTTATCCTTTGTAAGCAATGATACCTCTCCTGCCTCTAAGCTGAAGGCAGAAACTAAAGAATAGCAGGAAGCTTATTCTTGTAAGTCGACTTCACCTAGATATGGTTCAGGATTGACACAATAAAACACTGTATTTCACTAATTAATATAAGCTCAAAATTCTAGTTCAATGTTAAGTCTATGTTTTTGCAAATAGATCCTTGATATCCAATATCCATGAAAAACTTGAGGGGCTATCAAATATATAAAATACTCATAGGGTGTGTTGAAAAGAGAAAATTGATAGTGACATTCATTTATATTGTACAGTGAATCTTTGAAAATATTGCAAAGTGAACTGATTAGTTCATCACTTTCTCCAACTCTTCTGGATTTATAGATTATTTTTGAATTATTCTTTTGTCTAATTTGAAATATACTTTTATCTTTTCATCTTGTAGCTATAAATGACTACAGCTGTTCGATTTTGCAGTATAGCTCTGTTAGATGGTTTGAGTGTTTGACATCAATGTTCTTGAGACCAAACTTGTTTTGTTTAATAAAGATCCTAGTGTTGTTTCTATATGCTGATATCATTGCATTTACCTCTTCAGATGGGACGTGTTGATGCCCTTTCTTCACAGCAAAACAAAGATGATAGTAAATTCACATGGACAGATGTAATGGACAGAAGTATTAAATCATCTACACCAATTGGTACTGTCTGATCATTTTGCTTGTTTTATGGGGACACTTCATTCTTTGTTTTCTCTTTTCATAGTTGTCCGTTAGCTGAAGCTAAATTGTATACTTTAAGTTAGGGCACTGTTTCTGTAGATATGCTTGTCCATTTGGAAGTTGTACATGAATGTTATTTGATATGGCTTATTTTATTTGACATTATAATTCATTTGTTATGCCTTATGTGGAACACCCCCAGCCAAATGGGTGGTAATCCTCAGATTGGAAGTTAACTTGGATTTGGGCAGTGTTTACACAATTGGAGTCAAATTCAAATGTAGAAACTTGGGGTCAAACCATTTGTGTGCGCATTTGTTGGAAAGGAGGGAAGAGGGCAGAATCCTATGCAAGCTGCCATGCGCGTATCAATGTCTGTGGCCTGTGCCTGAGCTTATGGCAGTAGTGAACTTTGTACTCTGTAGGACCATTGCATTATGATTTGTGGCTAGTTTAGCTGGAGCTTGGAGCGAGCTAATTCTGTTATTTTGTTGGATTTAACTCTTATGTTTTGTTATGGTATTTCTTTCCCATTGGATATATTTGGATTGGAACTTTGCAGTAGCTATATTGATGTGGACATTGTACTTCAGAAACAATTGTAACTGTTATCTGAAAAGGTGGAAGCTTAGTCGAAATTTGCATCCCATTCTTTTTACATAGCATGTATCGTCTAGCTGCTTTAGATTATTGGATTGGGCATAGCATGGGTATTAGTGGATTTGTTTAATTCCAGGGAGATTAGAAGAGCAGTTTTGCATCAATAGTGAAGTAACCTATGTTTTACCTATACTATTTTATGATATCAATGTTTTGCTGAACTACTCAAATTGGTCAGAAAGGCCAGTTGACAAGGATGCTGACGTGGATCCCCTGCAAAGATCAACTCCTGACGATACTGAGCCTAATTCTGAAGAAAACATGTATAAAGAAATAATATTTGGAGAGGATGCTTTGAAAATCCCACCTTCTGAGTCATACTGTCTGAGTCACCCGATCAGGAGAGGCCATTTCAATATTTCTCAGGATTATTCATTACATCAGGTATTAGTATGTGACTTAATTATTATATGCCATTTTCCTTAGGCTCATTCAGTTATAAACTTATAGTAATGCTCCTTCTGGATGTAATTGACAACACAGCCATTTCAAATGATTAAGCTAGGTTGTCGTTACATTCAAGATAATCAGTAAGGAACGGAACATGATATTTGTTGGAACATTGTTTATTAAGTAAAAATGTATTAACTGATTTGCATCACAACTTCGGTAGAAAGGATTTGCTCAAATGTATTGAACAAAGCTGACGCCTTCCACAAATCTGTTAGAAAATTTGGCAGAATCTCCCCTGTATTTAATTACATCCACGACAAACAGTTTATAAAAATAATTAAACATCACTTAACCCGTAGACATGATAGCACACAAACTCTCACAGTATAAAAGTAAACAATAATTACAAAGCCAAATGTGAACTATTCAAATATTAAGGAACTAAGTTTAGTTTAATTCTGTGAGCTGTGGAGATAAGGGGTGCTACTTCCTGCCCATACATACTGGATACCTAAAACCAAATAAAACAGGTGAGTATAATATACTCAGCAAGTATAGTATGGAACTACAGAATGGAAATAGAAAAACATACACACAGCAAATTGCAATAAAATCACATTTTTCTTTCAAGACAAAGGATTCATTTTATTTTCTTCCAAACTCAGCAAGTATAGTGCCACTAGTAAGCCCTAGTTCTGCTTACTTGGCTTTGCTGGCAAATGCTCTAAAGATGTATTCACTCTTGTCCCGCCTATTGTTTCAAGGAAAAGAAAATTTTGTTTCAAAGACAAGAAAAATAATCTCTTTTGTCTTGAAAGAAAAAGAGTTAGTAGTTTTAGTGTGTTCTGTGTAGCACTCTAGGTTTGTGGATATGGTACCTAGGGTGTTATATTTCTCCATCTTAAAACACGTATCAGGAACATGTTGAAACAAAGCGTTAGTATTTTCTTTGATCTCAATATCCCTTCATCACTTCTCTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTTTTTGTGATCTGCAATCAAGTCCAATATTGTTCGATGCTTTAGCATGCACCCAATTTCTCAGACCTACCCAAAATGGGTCAAGTGGTTCATCTTCTGAAAAAGAAATATACGTGATGAAGTACAGTTGTGATGAAAGAATGAGATACTAACGTTCTGAATCCACTAGAATTATTATTTACACTTTCTGGTATCCTACTTACTGGTTCTTCTTCTTCTTTTTTCTGCATAATTAATAAAACAATTAATCAATCAGTTTATGCTGCTTGTGAGGCAGCATTTGTACAGCCTTGTAGTGCCATATTGTAATTTTAGGCACTGTTGATTTTGTGTTCAAAAGTTAAAAATTTATTCCAAATTATATGTTATTTCTTCCTCAGTTTTTATCTCTGATGTGATGTATTTGTTTATGAATGACATACCATATAAAATGT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