Difference between revisions of "BGIOSGA016100"
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Revision as of 16:06, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA016100 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016100, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_15282 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA016100-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA016100-PA |
| Length |
13621 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:11173257..11186877 |
| Sequence Coding Region |
11173257..11173306,11174741..11174792,11174873..11174949,11175023..11175156,11175851..11176021 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:11173257..11186877 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:11173257..11186877 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTGGCTGTTCTGGCGCAGCAGGAACCGCTTCTCCCTCGAAGAGCTCCGGTATCTAACAGATCAGCTACAGAAGGTTCATATTGTTTATGAAGCTAATAAGGATTTTGTTGTTGAAGCATTGAGATCAATTGCAGAATTGATGATCTATGGAGATCAGCATGATCCGTCATACTTTGAATTTTTCATGGAGAAACAGATTATGGGTGAATTTGCTCGTATTTTGAGAATTTCTAAGCTCTCAAGAGTGTCTCTACAGTTACTACAGACAATGAGCATCATGATCCAGAATTTGCGGAATGAACATTCAATTTTTGAGCTGTACATGTTATATGAAACACAGTCTTGTAACAGATTTCCTCTATACTATATGCAGGATGAGGTCATTTCCTTTCCGCTGTATGTTGAGGCCTTAAAGTTTGCTTTTCATGAGGACAGCATGATTAGAGTTGCTATACGTACTTTGACGCTTAATGTGTACCATGTTGGAGATGAATCTGTTAACAGATTTGTCTCACGTGCACCACTGTCAGACTATTTTTCAGACATGGTCAATCATTTTCAGAAACAATGTATTGACTTGGATAAGTTGGTTGTTCGTTCTGTTCGAAATGCAGATTCTGCTGTGCCAACAGCCTCTGTTGAGGATGCAATTGTGCAAATTGAAGATACACTCTATTATTTCAGTGACGTTATGTCTTCTGGGATTCCTGATCTTGGAAGATTCATCACTGAAAATATCTTGCAACTTTTGGTGTTTCGGTTCTTACTCCCATCGTTGCAAAGGCAGAGCACTGATTTGGGTATAAGTGTCACTACTTCCATGTACTTGATTTGCTGTATACTTCACATTTTTAAGAACAAGGATATGGCAAGCACTGTTGCTGCTGCCCTTTTCCATCAACCTGATTGCCATGATAGGAAGCAAGGAACTCCAAACGGTTATACCTCTGAGCATGAGAATGGCATATCTGACAATCAGGGCACTAGCACCTCAGATATAGACCAGTCAAATGAAGACAAATCGGATATCTTGTCTTCATCAAACACGCATTGCTTGCCTGATGATCCAGCATCAAGTGATTGTTGCCAAGGCAATACACTTAGGTGCGTGGATGATAGTGTGATCATTATTATCATAAACTCAATAAAATTTTATGAAATTACAGAATATTGCATGAGGGAACATTTGCTGTCTTATATAATAAGTGGGGATGACTTCCAAGCTTTAGGTTCTTTGTGCTTATTTTCTACATTGTTGCAGACAAAAGAACTTGATGAATCAATGCTAGATGCACTTGGAATTCTGCCTCAAAGAAAGCAGCATAAGAAGCTTCTATTACAAGCTTTGGTAGGAGAAGATCTAGCTGAAAGGCAATTATTTTCATCCAGTAGCGGTCTAGCAGATGACAGCATCTGCAGTGATTTTGATATGTATGTAAGGAAGCTTCAGGATAAATACGGTTTAAAGTGTCATCATCCACGGCAAATGACCTCTAAATTCCACAGATATCAGGTGCTCGATGCATTAGTTGCCCTTTTCTGCAGATCTAATGTATCTGCAGATGTTCGCTTAGTTGGTGGCTGGCTTTTCAGGCAACTGCTACCCCATGGAGAAGAAGAGTTCACTGCTTTTCATCTAAAATGGCTAAAGGATTCGCATAAGGATTACAGTATAAAACTTTTGGACGAATCTGGAGGATGCTGGCGGGACTTGCTTGTTCCTATTGTTAAAGAAGCCTGGAAGAATTGCAAGAAAGCAATCGAGACATCTTCACCACCTAAAGGATCCAAGTCTGCTATTTTACCCCTGGATTCATGTTCATTTGGAGGTGATTCGTCCATTGCCATCGCAGAGAGAATCTATGAGATGGTGAAGGAAATGTGGCCACAAAGATTTACTTCAGTCATCATTGTGCTCATGTGCTGTGGAGCAGTGTGGTGTGGCTTGTCAGTAATGGTGCCTACTCATGCTGCCAGCAGGCATATATGGCTTGGCCCCAGTGCAGTTTTGAGGTCACTGAATTTATCTCATGTTGAGTCCAATGATCAGGGTTTTGTGCTACAGCGTCAAGTTATCCTCTTCTGCCTTGGAGAAACTCTCACCGACCAGCCTCCTATTTTTTCCCCAACTGATTTGCCTGTAAATAATCGAGCAACTTTAGCAGGTTTCGATGGCTCAGTACCCAAACCTGGACTTGAAGTTAACTTAGTTGATGCGGTCCCTTGTCGAATAGCATTTGAGAGGGGCAAAGAACGCCACTTCTGCTTTTTGGCTCTATCTAATGGAACTTCTGGGTGGATTCTTCTTTTAGAAGAATTACCTCTCAAGGAAAAACGTGGAATTGTTCGTGTCACAGCTCCCTTGGCTGGGTCTGATCCAAGAATAGATGAAAAGCATGCAAAATGGTTACATTTACGTATCCGTCCTTCTACAGTTCCCTTTTTGGACACAGAAAAATACAAAGGGAAGACAAGAAAGTACCTTGTTGATGGAAGATGGACCCTTGCTTTTAGAGATGAGCAATCATGTAAGGAAGCAGAGACTATGGTTATAGAGGAGATGAAGCTCCAACAAGGTGCTGTTGGAGAACAGTTGAAGCTATTGCTTGAATTTGACATGCCTGAGGATGGATTACAGCATCCTTGCTCCTCTCATGAAACCACTTCGGATGATGGGTCATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MWLFWRSRNRFSLEELRYLTDQLQKVHIVYEANKDFVVEALRSIAELMIYGDQHDPSYFEFFMEKQIMGEFARILRISKLSRVSLQLLQTMSIMIQNLRNEHSIFELYMLYETQSCNRFPLYYMQDEVISFPLYVEALKFAFHEDSMIRVAIRTLTLNVYHVGDESVNRFVSRAPLSDYFSDMVNHFQKQCIDLDKLVVRSVRNADSAVPTASVEDAIVQIEDTLYYFSDVMSSGIPDLGRFITENILQLLVFRFLLPSLQRQSTDLGISVTTSMYLICCILHIFKNKDMASTVAAALFHQPDCHDRKQGTPNGYTSEHENGISDNQGTSTSDIDQSNEDKSDILSSSNTHCLPDDPASSDCCQGNTLRCVDDSVIIIIINSIKFYEITEYCMREHLLSYIISGDDFQALGSLCLFSTLLQTKELDESMLDALGILPQRKQHKKLLLQALVGEDLAERQLFSSSSGLADDSICSDFDMYVRKLQDKYGLKCHHPRQMTSKFHRYQVLDALVALFCRSNVSADVRLVGGWLFRQLLPHGEEEFTAFHLKWLKDSHKDYSIKLLDESGGCWRDLLVPIVKEAWKNCKKAIETSSPPKGSKSAILPLDSCSFGGDSSIAIAERIYEMVKEMWPQRFTSVIIVLMCCGAVWCGLSVMVPTHAASRHIWLGPSAVLRSLNLSHVESNDQGFVLQRQVILFCLGETLTDQPPIFSPTDLPVNNRATLAGFDGSVPKPGLEVNLVDAVPCRIAFERGKERHFCFLALSNGTSGWILLLEELPLKEKRGIVRVTAPLAGSDPRIDEKHAKWLHLRIRPSTVPFLDTEKYKGKTRKYLVDGRWTLAFRDEQSCKEAETMVIEEMKLQQGAVGEQLKLLLEFDMPEDGLQHPCSSHETTSDDGS</aaseq> |
| Gene Sequence |
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