Difference between revisions of "Os08g0223700"
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Revision as of 20:46, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0223700 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, LSD1-type domain containing protein |
| Version |
NM_001067807.2 GI:297608172 GeneID:4344965 |
| Length |
21509 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0223700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:7487658..7509166 |
| Sequence Coding Region |
7487658..7488266,7489359..7489424,7489558..7489731,7489820..7489950,7490073..7490149 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccggcggcggcggcggcggcggctccccctcgccggtagccgcctcggcggcccccgtgcaggtgcgctgcgccggatgccgcggcgtcctcgccgtggcccccggcatgaccgagttcatctgccccaagtgccgcatggcgcagcgcctcccccccgagctcatgcccccttccccgcccaaggcctcccctactccgccgcctcagccacagcctcatcctcagcttcagccgccgcctcctcctgctcctctccctcccccttcccgccgctccgcgccgcgagcgcagggcgtggaccccacgaagatccagctgccgtgcgcgcgctgcaaggccatcctcaatgtgccccatggcctcgctcgcttccgctgcccccagtgcgacgtcgacctcgccgtagacctctccaaactccgcaatttcctcgccacggccggtccaggcttcgcccctccgcttccgcttccgccgccgccaccaccgccgatgccgcccatcccgctgccgcacatgcccttcctcccgatgatgccacatgttccggtgccgatgccgccgatggcatcgcccgctgaattgcccgaggagattaatgaggttgcagttgatgttgagcgtgaggaagatgaaggtggtactgtcggggaaacttttatggattacaggcctcccaagctatctcttggtcttcctcatccagaccctgtggtagaaacttcatctttgtctgcagtgcaacctcctgaacctacatatgacttgactattatggatgaattggatgagaccaaggtgttatcttgcttacaaattgaaacgatagtgtatgcttctcagaggcacctttatcatctgcctactggtgctagagcaggtttctttattggcgatggagctggtgttggtaaaggccgaacgattgctggattgatctgggaaaattggaaacagggaaggcataaggcattgtggatttccattggttcagatctgaaatatgatgctcgcagagatttggatgatgttggtgcaaaatatgtggaaggccctgcttgggggagcttttggcagctgcagcttctgccagaatctcaagctcccccaaacagtccagattcttactcagatttgcatgctttaaataagctaccatattctaagatagactctaaggccgttggaatcacaactggagttatttttgtaacttatagcagcttgatagcatcctctgagaaaggccgttcccgtttgcagcaattgatagagtggtgtgggtctgagttcgatggtcttctggtgtttgatgaggtaaagaagactctgtgccacaaagcaaaaaatctgattcctgaggcagggagccagcccactcgaactggtaaagcagttcttgagatccaggaaatgttacctgaagctcgggtggtttactgctcagcaactggtgcatcagagcctcgaaatctgggttatatggttcgccttggtctctggggagatggaacatcatttcagaattttcagaaatttctaggtgctcttgagaaaggtggtgtgggtgctcttgaacttgttgctatggacatgaaagccaggggtatgtatgtttgcagaacgctaagttataagggtgctgcttttgctaccgtggaagctcctctagaggaaagaatgatgaatatgtataggaaagcagctgaattttgggccgagttgcgtgttgaactcctttcagcaattgaatattatgcagaagacaagggcaattcatctcagatttggcggttatactgggccagccatcagcgtttctttaggcatatgtgtatgtcggctaaagtacctgctgttgtgagattagtgaaagaagccttagcagaagaaaaatgtgtggtgattggtcttcaaagcactggagaagctcgaacagaggaagctatcagtaaatatggtgttgaaatggaagactttgtttctggtccaagggagttgcttcttaagctggtagatgacaattatcctttgcctccgaaacctgattgctttcaacaaggtgatgaaaaagttgcagaggttcagcgtaagcggcactatggacctgatgtatgctttaaaggacaagctaggaaactcgcaaaaatggaagatgaaagtgatgatggaactgatgaatattctctacctccaactaacgagttctcgcgactgcaccaacagcgaggactgcaacgcagcctaatctcccagtacacagtcgcaactcacaagcagcatcgcatcgttaattcatggattgatatcctcggcaaggaagaactccctgaggtcgccaaggactcgagcgtgacatcgggcaggtcccgcgtgttgagccgcgacgcgagtaggggctcacggaggagacagagaagctgcagcacaatggcggggtgcgatgtggcagcggacgcagtgaggaaggagttgagcatcagcggcgacggcggattggagagtgttgatgggaaggacaacaagcagcgagtgagggatccgacgctgctcgtcgatcgggctggctcggcgacggggagacgcgggggcggcggacttactctcatcggcaaggcggacccaggggatgggcttggcaacgatgatggatggttatcattcgagaaattctcttctagtattcacattttgatgcaatggggtttacctatcactagcatgagtatgcagagtcagaccatgaatcaacagagtctgaagaggaattcaatatgtgtcagatctgcaacactgaggaggtatgacactgcagtggaaagaaagtcgaatattttgcagattattcgttccttggatttgcctaacaatcctctagatgatatcattgatcagctaggtggtccttacaatgttgcagaaataactggacgtcgtggtatgctagtaagagcatcagatggaaaaggtgttgtttatcaaacacggaacaagaaagaagtagcattggatatgattaatattcatgaaaagcagcagttcatggatggagaaaagcttgttgcaataatatcagaagcaggatcagctggtgtttctctacatgctgatcgaagggcgaaaaatcagaggagaagagtacacataacacttgaacttccttggagtgcagaccgtgcaattcagcagtttgggagaacccatcgttccaatcaaaattctgcacctgaatatagagctggaccatcacttagtgctttcaactatgacagcacttatggaaagaaagccttgatgatgatgtacagaggaatactggaacaggatggtcttccagttttgccttcaggatgttctgaggatcaagctagcctccaaggattcatcactaaagcaaaagctgctttggtgtcagttggaattatcagggatgcgctaatgtgcaatggaaaaaatggaggaaagcttactgtcattcagaatgcacgaagtgaaggacagcttgattccggtattgttgacatcaaagcaaaaagtgttaaaatgaaagaatcaccgaagactgttcatgttgatagcttgtctggtgcttctacagtgttatttactttcacaatcgaccgtggatttacttgggagtcggcaaatgcaatacttgaagaaaggcagaaagatggagctggttattcagatgttggattttatgaatccagaagagaatggatgggtcgaaggcattacatgctagcatttgaaggctcaacagaaggaatgtacagagtaatccgtcctgctgttggagaagctttaagggaaatgcctttggttgaacttaaaagcaagtacaggaaggtttcatcaattgacaaaattggcaatggttggcaggaagagtatgatgcatcatccaagcagtgtatgcatggacccaaatgcaaacttggaagctattgtacagtaggcagaaggttacaggaaatcaatattttgggtggtctaatacttcctgtctggggcatagtagaaaaggccctagctaagcaggttcgacaaattcacaagaggatacgtgtcgctcgcttggagacaaatgataatgagcggattgttggacttatgattccaaattcagctgtggaatcagtattagaaggtctgcaatgggtgcaggatattgacgattga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGGGGGGGSPSPVAASAAPVQVRCAGCRGVLAVAPGMTEFICP KCRMAQRLPPELMPPSPPKASPTPPPQPQPHPQLQPPPPPAPLPPPSRRSAPRAQGVD PTKIQLPCARCKAILNVPHGLARFRCPQCDVDLAVDLSKLRNFLATAGPGFAPPLPLP PPPPPPMPPIPLPHMPFLPMMPHVPVPMPPMASPAELPEEINEVAVDVEREEDEGGTV GETFMDYRPPKLSLGLPHPDPVVETSSLSAVQPPEPTYDLTIMDELDETKVLSCLQIE TIVYASQRHLYHLPTGARAGFFIGDGAGVGKGRTIAGLIWENWKQGRHKALWISIGSD LKYDARRDLDDVGAKYVEGPAWGSFWQLQLLPESQAPPNSPDSYSDLHALNKLPYSKI DSKAVGITTGVIFVTYSSLIASSEKGRSRLQQLIEWCGSEFDGLLVFDEVKKTLCHKA KNLIPEAGSQPTRTGKAVLEIQEMLPEARVVYCSATGASEPRNLGYMVRLGLWGDGTS FQNFQKFLGALEKGGVGALELVAMDMKARGMYVCRTLSYKGAAFATVEAPLEERMMNM YRKAAEFWAELRVELLSAIEYYAEDKGNSSQIWRLYWASHQRFFRHMCMSAKVPAVVR LVKEALAEEKCVVIGLQSTGEARTEEAISKYGVEMEDFVSGPRELLLKLVDDNYPLPP KPDCFQQGDEKVAEVQRKRHYGPDVCFKGQARKLAKMEDESDDGTDEYSLPPTNEFSR LHQQRGLQRSLISQYTVATHKQHRIVNSWIDILGKEELPEVAKDSSVTSGRSRVLSRD ASRGSRRRQRSCSTMAGCDVAADAVRKELSISGDGGLESVDGKDNKQRVRDPTLLVDR AGSATGRRGGGGLTLIGKADPGDGLGNDDGWLSFEKFSSSIHILMQWGLPITSMSMQS QTMNQQSLKRNSICVRSATLRRYDTAVERKSNILQIIRSLDLPNNPLDDIIDQLGGPY NVAEITGRRGMLVRASDGKGVVYQTRNKKEVALDMINIHEKQQFMDGEKLVAIISEAG SAGVSLHADRRAKNQRRRVHITLELPWSADRAIQQFGRTHRSNQNSAPEYRAGPSLSA FNYDSTYGKKALMMMYRGILEQDGLPVLPSGCSEDQASLQGFITKAKAALVSVGIIRD ALMCNGKNGGKLTVIQNARSEGQLDSGIVDIKAKSVKMKESPKTVHVDSLSGASTVLF TFTIDRGFTWESANAILEERQKDGAGYSDVGFYESRREWMGRRHYMLAFEGSTEGMYR VIRPAVGEALREMPLVELKSKYRKVSSIDKIGNGWQEEYDASSKQCMHGPKCKLGSYC TVGRRLQEINILGGLILPVWGIVEKALAKQVRQIHKRIRVARLETNDNERIVGLMIPN SAVESVLEGLQWVQDIDD</aaseq> |
| Gene Sequence |
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