Difference between revisions of "Os08g0300200"

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os08g0300200

Description

C2 domain containing protein

Version

NM_001068027.1 GI:115475791 GeneID:4345217

Length

10637 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0300200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:12419551..12430187

Sequence Coding Region

12419911..12420069,12420677..12420790,12420896..12421168,12421371..12421601,12421691..12421841
,12421927..12422006,12422086..12422160,12422239..12422340,12423247..12423368
,12426214..12426334,12426490..12426540,12426633..12426659

Expression

GEO Profiles:Os08g0300200

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgggtgtctttcactcaaaagcaaaacttaaatggctgaatcaagaattggtaaaaatctggccatttgtcaatgaggctgcatcagaactgataaaaacttctgtggagcctatttttgagcagtacaagtcattcattttgtcctcactccatttctcaaagttgacacttggaacagttgcccctcagtttacaggagtttcaattttggatagtgatagttctggtatcactatggagcttgagttgcaatgggatggcaatccaaatatagtactggacattcaaacaacacttggaatctcacttcctgtgcaggtgaaaaatattggattcacaggagtacttcgcttagtttttaagcctctggttgcagaactgccttgctttggagctgtttgctgttctttgagagagaagagcaaggtcgattttaccctcaaggttattggtggtgagatgacagcaattcctggaatttctgatgcaattgagggaacgatacgtgataccattgaggatcagttgacatggcctaatcgcatagttgtacctattgtgcctggagattatagtgacttggagctgaaaccagttggactattagaagtaaaacttgtggaagctagggacttgacgaacaaggatcttgtggggaagtctgacccttttgctgtgttatacattcggccattgcaagataaaatgaagaaaagcaaaacaataaataatgatttgaaccccatctggaatgagcactacgaatttgtggtcgaggacacatctacccagcgcttgactgtgaaaatttatgatgatgaaggactccaggcatctgagcttattggctgtgctagagtggacttgtctgatcttcagcctggaaaagtcaaagaagtttggttggaccttgtcaaggacctggaaatccagcgggataagaaacgtcgcgggcaggtacacctggagctcctgtattacccttttggtaaacaggaaggggtttccaatccttttgcagatcagattcagttaacttctttggagaaggtcctcaagactgagtctaacggatttgatgttaaccagaggaaaaatgttattatgagaggagtcctatcagtaactgttatctcagcagaggacttgccaccaatggatgtgatgggcaaggctgacccatttgtagtcctgtacctgaagaagggagaaaccaaaaagaagacaagggttgtaactgagacactgaatccaatatggaatcagacgtttgattttgttgttgaagatgccttgcatgatttactcatggtggaagtatgggatcatgatacgtttggaaaggattacatagggagatgcatcttgacacttacgagagtaatactcgaaggcgagtttcaggatgagtttgttttgcaaggtgctaaatccggaaagctgaacttgcacttcaagtggacgccgcagccaatttatcgtgatcgtgatcgggaccagtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGVFHSKAKLKWLNQELVKIWPFVNEAASELIKTSVEPIFEQYK SFILSSLHFSKLTLGTVAPQFTGVSILDSDSSGITMELELQWDGNPNIVLDIQTTLGI SLPVQVKNIGFTGVLRLVFKPLVAELPCFGAVCCSLREKSKVDFTLKVIGGEMTAIPG ISDAIEGTIRDTIEDQLTWPNRIVVPIVPGDYSDLELKPVGLLEVKLVEARDLTNKDL VGKSDPFAVLYIRPLQDKMKKSKTINNDLNPIWNEHYEFVVEDTSTQRLTVKIYDDEG LQASELIGCARVDLSDLQPGKVKEVWLDLVKDLEIQRDKKRRGQVHLELLYYPFGKQE GVSNPFADQIQLTSLEKVLKTESNGFDVNQRKNVIMRGVLSVTVISAEDLPPMDVMGK ADPFVVLYLKKGETKKKTRVVTETLNPIWNQTFDFVVEDALHDLLMVEVWDHDTFGKD YIGRCILTLTRVILEGEFQDEFVLQGAKSGKLNLHFKWTPQPIYRDRDRDQ</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>10119..10277#9398..9511#9020..9292#8587..8817#8347..8497#8182..8261#8028..8102#7848..7949#6820..6941#3854..3974#3648..3698#3529..3555#ataaaaaaattggaaaaagagaaatagaaaaggaagcgcaccaccgctctcggctcgccttcccttggttcccgcaccttctcctccgcatcgaggcaaatcaatcaatccaatccatcccacacaccgcccatctccctggcgggcagcctcggcctcgcgagggaggggaggaggaggagagtggcggcggcggcggcgcgccatggcgttcctgctcggcgccttcctcgggctggtgctcggcgtcgccgttgtcatggcgttcgcgcgcctcgagaacacccgcgctgagcagcgccgcgagctggtacgtacgtgtcgcgaaatgaaatcctcccaattcatttcctgttcgtgccggggtagcgcattgattcgacccagtccgatacccgccgcgggtgggtgtcggtagtgattgggagctggtactggtggtgaattgcgaatttgcgagaggtgttggttttcggagaggagcgtggagggggaagttgctggcggtgccaaactgtgagcagactggtttggaacgccgtatgccgccgtaattgctaggatttttatcctaatcttcctccttgccaccaactgtgtatgttatgcaatacgtgggccgtgggcatgatggaatcggcagtaatgatcattagagaatttattagatagtgcttaatatggcattataccgagtaatgattgtttgcaagatgtcgttgatcttgcttccgtgtgagttgaggtgattagttttgaccaggccacccgatcatgcgggtcaatttaattactgtgatttgatattgttttagtttggtttatctgagtggagaaaggacatgatgcttaattttggaaaattattgtgtaggccaccccggattttcctaatatcatccgccatgtggcatactcaaacttgcccctttagtttgttttgggttagtttattattgaaacagttcatttgaaagtagtaagattgaaatctcatgagtaaaatgaccactgagtaagtatcacaacttataatagtcaaacacaccatcttcaaaggctgacatgttggttctgtttctcaacttcttactattctagtatttttatagagtagtttctcaatggtagtgtatctcagtgaacctcctcaattgtgctgtacatggataacaatgctgcatattgtgtgtcagtgttcaccaacctagatagttctttaaagctcaatcctcgttggtgccttcatagccatatgttctgttgcaattgcaaaacaatggaataaacctgtaattggtttaattcttatgagttctgaacctctgcaattattcatttctgaagttgctattgctatgatcaacatgcactaatagtatgtacagataaaccaggaaattaaatcatctgaatttttttaatgtatctgtcatagtgagttttgacagtatcttctgatctatttagtgtagtatctgcatgagtatatgatttttctaactgataaggtcataaaatgtgcattattctaatcatatatagttcttggatggtacatccatatggttgtttgtcatttatttgcagataagtgtcatttttggctcatgcacacatattaggtgtacttctattaataaatgtccagttggcattgtggtggattatgatagtctgatttggttcaatggcttctagacattggtgtttgaaaaactgtttctatacattggtgtttggtaaccataatattattgcattttgaaaatttggaacatccaagagagacatgacagctagatcatatatttttgtctaaccttaatttaattcataaaaaagtctataatgaatataagctctaattttcacaaaatcttaaaaacaagcactgcacagaaaaaacaaactaagcataagtccttacattcacagttcgtaaagcccaactgggtgtcaccatggtgagatcacctgtcaactggttagcatggctggcttcatgaggttttgtctgagaattccatccattccacatatttctagtattgtcctatattaccatataattgccttacactaactgcaattaagaacttcaatcatcatccattagagatccaaaataaaatttgcggataatggtcgtacacccaaaatttctttatctcaccccttgcaaaaattacattgccagcactacaagccatagttccatcccatctcatttctgagcgacatgacttggtgacaccacctccccttatctgcaattgttgctgttctctctctttctaatgcatctccactatgtgaaatcattgatgtttcccttcctattcggcttcccacgtctctattcaatatcatgcttgagtttgtcacgtcttcttgaattcctgttggtttatcacgcataatggccatacatgtgtatctgtttgagttttcaccaaatatggcaaagtagcagccgcacgaggccactacgtggaggatccatcagcatttgctggctgtgcctccaactccaagggtgtcaacggatttcatcaacagcgggtataacttgcttagttgtttgcaatcttgaccagttcctctgactagaagctgccacatggcccacatcattgagtgctccatctccatcttcctcaattcaacaaaatacagaaatgatcttacctactataattgttctctgttgcaccaatttgctcagatcaatcattacaataaatttttggcagcattgcatccgttttccactggtttttaaaatattacattgtccttaaaacatcttataagttataagcaattggttttccatgccacggaaattgtcatttgatgtaatactattttaatatcttctttcatttgtcattagatgcattttctatcatgcttctgctatctcccattttctttccactctgatttgctcgtttatttgttgatacaccaaagatggatttactgcaatgctatgttgtttgcccattcccaatacatacttctctgcttccaaacaaaatagagtatacggatgttataatccatgttttcttatgctggcttttgtcaccctttcttgccctcattaattcttcccaatcaaggaaataattaaacattataattctttcttcattaaacaattatcgtgtccagtttcagtaactgttgttataatcagataaatcattcggactagtaaaatcagctaatcgtttggactagtaaaatcaatgttctggttgattggttatcttgttctttatcttttcgctgacattatcgaacacttttttgttacaataccttcttagattacattgtaagaggatataaggacggaatgattatttttcttctcatggttgatctttccatatgtgttctatgtctcttgacacctaatttttacctgtttctgcaggctgctactgtttcatccttctcaaagttgactgtagaagatttaaggaaactaattcctcttgagttatatccatcatgggtgtctttcactcaaaagcaaaagttgagtatttctttatctttgcttatgttttgatgttgttgatgtcgaggatttgtttgtgctaacactttattaattttaattagtacagcttaaatggctgaatcaagaattggtaaaaatctggccatttgtcaatgaggtgataatatttcttccattattttagtactccgtcattgtgatgcaagatgtttacttactgttctcctcgtatgaatactagtacaatcaatgtgttgctttatccatgattagtgatggttacttaggaagacaatgttacttttgttgtaggctgcatcagaactgataaaaacttctgtggagcctatttttgagcagtacaagtcattcattttgtcctcactccatttctcaaagttgacacttggaacagttgcccctcagtttacaggtaggtcatctttagagacttctgggtgttcttatagttatattgcttgatcatgcttttcttttcagactcaagtattgctatattctctggtttccgatataagccatttttagggtacattaacaacagtagccaatgttcgcgtgtgaaattcttttccagaatgatttgcatattgagtttatataattctggaaaatgtgtacttaactcttgaagtattgtggttggtctacttaacctcttgtagtatggaactggatattctctttgtttctttgactaaaaacaacaggagagacccctaaaagttgatatattaataatatggggcaattgcaaatttactacctttcaaatcgttattgcaagcttgccattagaaaattgcaaaaatgtcaccagaattgtcattcgaatggcattgttgcaaaatataaaaaaaaactagtggaaaacttgcaaatgcccctataatatatagagtatttacaaggatggtttgggggaatttaccaagcctaaactagtgattgccaagatggtcttgtctgtttccttcattctctatatatgtagagtggtatcttcgttaaagcagtgtttccaggctgtaaagtttatctgatgttgaaaatcataccattctgttgacaccagatgccccaagtagctatgccaccacttcaataaggaaaggttgcacaaattcattcctagccgtaatgaccttgttcatgaatttcattttctcattcctagattatgccagcttgagttcacaaatggacaagtggaaaagagatgtaagttgtctccagtgaagcatagctgatctactagcaataataaccagataagcatttaagactttc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caaaaataaaattttcagatttggaaatatgcctatcaaaagtagatggagggagtataatattggttggcatttgttgaattcatgtgcattttcatagcgcctcagtcactaaacattgttctagttattgctgcatatctacataaacttcgtggttgtactaatactgtagttctaatgccaatcttctacctagtatctggtcctgtagtcctgttattcttctgatcttgtcacactaactttatttattcaaattgcaggattacatagggagatgcatcttgacacttacgagagtaatactcgaaggcgagtttcaggatgagtttgttttgcaaggtgctaaatccggaaagctgaacttgcacttcaagtggacgccgcagccaatttatcgtgatcgtgatcgggaccagtgaaatctgtgtagatacatcacgtcaagcagctgataaatatttcttcccctacggtgcctgtacattagtttttctgtacagttaattcacttatcttgtagcaacaaggtgtaatggaataaaagaatggtggtttcatgttccgacggaaatgcgatgtgctatgaatggagggttgcagaaagatggatggtaacacggggagatgggttacccaagtatggaaacattaagttcatcatgcaagcagatactttatgcatcttctactggtaaaactaaacgtgtttgtctttaaaatgcaacttgtaatataattccttgtactaacaattactacctccgtcccataataattgc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0300200, RefSeq:Os08g0300200