Difference between revisions of "Os07g0447800"
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Revision as of 20:35, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os07g0447800 |
|---|---|
| Description |
Phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein |
| Version |
NM_001066076.1 GI:115471884 GeneID:4343118 |
| Length |
12030 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os07g0447800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:15999171..16011200 |
| Sequence Coding Region |
15999278..15999284,16000884..16000950,16002251..16002434,16003509..16003561,16003855..16003943 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcagctgctcaaggtagcagcgttgtcccatcctctgcgaaagttgactttttaaagctccagaatggcagtgatattcgtggtgttgctgttggtggggtcgaaggcgagcccgtaaatctcactgagcctgttactgaagcaatagcttctgcatttgctgcatggttattaaacaagaagaaagcggatggatggagacgtttaagaatttctgttggacatgattctcgaatttctgcacataaattgcaggatgcagttactcttggaattaccactgcagggcatgatgttttacaatttggattggcttcaacaccagcaatgttcaacagtacacttacagaagatgagataaatcattgcccagttgatggagccataatgataacagcaagtcatcttccatacaaccggaatggtctcaaattttttacaagtgccggtggtttgaataaggctgatatcaaagatatcttggagcgcgcttctagaatatatgaggactcttctcatggtagcacacaagaattagagcaagcttcgaagggagaagtgagtaatgtcgattacatgtcaatttatgcatccgatcttgtgaaagcagttcgtaaatctgctggaaacaaagaaaaaccactggagggactgcacatagtcgtggatgcagggaatggagcaggtggcttttttgtggataaggtactcaagccgttaggcgctattactactgggagccaattcctagagcctgatggcatgtttccaaatcacattccaaatcctgaggacaaaactgcaatgaaagccattacacaagctgtggccgataacaaggcagacttgggcatcatatttgatactgatgttgacaggtctgctgctgttgattcaagtggtcgtgagttaaaccgtaacagattgattgctttgatgtctgccatagttcttgaagagcacccaggcactacaattgtgacagatagcgtgacttctgatgggctgactacatttattgaaaataaacttggagggaagcatcatcgtttcaagcgagggtacaagaatgtaatagatgaggctattcgtctgaatactattggtgaggagtcacatttagctatggaaacaagtggccatggagcactgaaagagaatcactggctcgatgatggtgcatatcttatggttaaacttttgaataagcttgctgcagctagaatattgaatccaaacgttggtagtaaagttttgactgatttggtcgagggccttgaggaggcttctgtgacagtggagataagattgaagattgatcagaatcatgcagatttgaaaggggggtccttccgtgattacggagaagctgtcttgaaacatttggagaatgcaatcagtaaagatgaatatctgtgcaaagcaccgaagaactatgaaggcgtaagagtttcaggatatggtggctggttcttattgcggttatccctccatgacccagttcttccccttaacatcgaggcgccgagcaaggatgatgccattaagcttgggcttgcagtgcttactgccgtaagtgaatttccagcattggacataacggcattgaacaagtttttgcagcagtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAAQGSSVVPSSAKVDFLKLQNGSDIRGVAVGGVEGEPVNLTE PVTEAIASAFAAWLLNKKKADGWRRLRISVGHDSRISAHKLQDAVTLGITTAGHDVLQ FGLASTPAMFNSTLTEDEINHCPVDGAIMITASHLPYNRNGLKFFTSAGGLNKADIKD ILERASRIYEDSSHGSTQELEQASKGEVSNVDYMSIYASDLVKAVRKSAGNKEKPLEG LHIVVDAGNGAGGFFVDKVLKPLGAITTGSQFLEPDGMFPNHIPNPEDKTAMKAITQA VADNKADLGIIFDTDVDRSAAVDSSGRELNRNRLIALMSAIVLEEHPGTTIVTDSVTS DGLTTFIENKLGGKHHRFKRGYKNVIDEAIRLNTIGEESHLAMETSGHGALKENHWLD DGAYLMVKLLNKLAAARILNPNVGSKVLTDLVEGLEEASVTVEIRLKIDQNHADLKGG SFRDYGEAVLKHLENAISKDEYLCKAPKNYEGVRVSGYGGWFLLRLSLHDPVLPLNIE APSKDDAIKLGLAVLTAVSEFPALDITALNKFLQQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>108..114#1714..1780#3081..3264#4339..4391#4685..4773#5837..6073#8190..8254#8341..8401#8472..8589#8660..8741#9702..9774#9843..9904#10002..10097#10512..10666#11273..11369#11493..11570#11652..11759#atagattattccgtccgttccaacaacctctccgcctcctcgtccccgtcctcaacctcaccgcctccccgccgcagtagcagagtcgcccgccgccgcgcatccgcatggcaggtcagtgcatgcctccccttccccttccccttccccttcccctccatgatcggaattgaatccaaagcctcgagctcctcaacctccccgactgcctcatgggaggccgggaggcgaccccgcccaaacccccgaagcgatacccacgaggccaccaccaccccccgccggcggcggcggcggcggcagcgccccctccccctttccgctctctggcgggtttcctgtttcgcccaccgccgactgactccctgaggggtcgatgatatccccacttgtttgcatttaggtctgatgactccttgtgtttgtagttggattggatgtagacattctgttgtgctgtgctgtgctataacttgttgctatacgttgggttgtgaatctgttgtgccagttaatttggtgaagtaattagttagtggtggttgctagtttgatttaatgtgaaatgtaaatatcggaagcatattgtgagagagggactgccctccatggttctgacaaccccatgacagtaccgtggaatatagatgttagagcattggacacttccatgatactgtcatggggttgtcagaaagaaatatatcaaagttgaactgagaagtaatctaattatttagtaagtgcaaatttgacgagtagttttgtctcaacaataaatgctggaatgaagatctaataaatcgtgaatatagatcaacaatcttgctaacgatggagcacttccatggtgactctgacagtcagatcttctgatgactaacaccttcatcctttttgtcctgatcagtatatgtagttccctgcaaccacctctgctactaggatgattagcttggcttgaatatggcttctatggaataaaatcaacccatcggttccggaatataagttgttctaacaatccaatcctgttcctgaatataaatactacacctttctaggagacttcttcatatattatctactccctgaattaatggaatggagctcgttttaagactacctgaatccttgcacctgaacaaattttgagaattgggggaatgctgatgtttaccaatttgcatcacgttgagcaaaactatgccatttggctacaatgtttgcataaaaaccaaaataaataattatccctgtaacatttataagttgacattagaagaagatctgatagatttgaaaatttgtgcagcattatcagggaagatcattcaaaatgcattcttggcacaacatcgcccacaggctagacacagcacaagatatcccagtgacttttgtgccctcgatacccgcagcgtgcattctttccaggaatgtagactaagactggctggtacttcagccaagtggttaaatacaatatcaacagcatggattagctccagcaaacaagcatatattagctgcaatggtgtgttctaggctctcattgatcaggttgcttaatgctcactagtgttacgttaggatttttttttcgctaactcattttggtgattttatgccagattatagaatcaataccttttttttttaatgtatgtatcaacaaatctgaaaagtcacttacagtaaccttcattgcagctgctcaaggtagcagcgttgtcccatcctctgcgaaagttgactttttaaagctccagaatggcaggtataacaatgttcactctttctatgatctacaccctctagtctaactatgatattgctctttctaaggtcaaattatatggctgtttttctctttaagccaatggtaatgagcatatggtttccaactatgatgttgtttgaaagcaccgtggttcttatgttaacagtcaattccatgtctagtgcttctgtgttccttttcatttaaccatctatttgctttggtgttttgacatgcatcccatgtttttgctttatgtgctgctcttaaacacctcaatagctattaaatttcaatcttacttgtgtcagagaaaaaactctttgagataaaaaaaaatgttgtaagttgaaacaacatggaaagacctataaccatacatcctcatttgagattataattacaagaatattgcttctgtaaaccgcaaatcacataattttgagcgatgctgttgcttagctttttctggttcagctgcaattgtcaaaaggtatctggatatcctgctggtgaaatgcatatgaccattgaataattattgtatgaatacaagttcaactttggctttgaccttttttagaaagtaattacatgcgttttgggctgcattgcactttatggtaaattattcggtgatctaatggataatctagtgttaaaagtctcaaacaaaaaaaatctggcaagagcttgtgagatattgctagtttccatcctatctttacctgcatggcatggattggtgcattaaaagaactttttcttcagctctacgccattaggagaatttgtctttagttatacagcacagtaaaattccaaattgctagcttgtgtgttacatgtggttcatgtcatcctgtctatggacttgtttctcttttgacatcaattgaaggagaccttgtatctgtatctaattgggcatattttctctatattcctatctcttagcatgatattttccctgatataacatcttcctcagacctaggactaaaggttaaaattcatgtttgatcaactcttgatttatgtcatgggcatatgcctatcataatttatttggaattgtgtgattatcgtgaacttatattgttcttcttgatatagctggtatgttggaattaagttatcacttttgctaaaaaaggtgaagaatcaattgatcatacagctttgggatgttctagatggggtttataacaattttagttaaagctaaagagtttcttgtgctgcatccatgatgtgttattaatcaatttgctttactctcttctatttctcacagtgatattcgtggtgttgctgttggtggggtcgaaggcgagcccgtaaatctcactgagcctgttactgaagcaatagcttctgcatttgctgcatggttattaaacaagaagaaagcggatggatggagacgtttaagaatttctgttggacatgattctcgaatttctgcacataaattgcaggtggctcctgttctccgctcttatttttattgaacctttattcaaaataatgcattgcatgctttaaggaattaagctcaccccttataattactaaaatcctgttccaactagtgatgatttggactattctcagttttaaccactaaccagtgttgttgttttttatttttgcccaattatgttgccatgttgaaatttgggattaacaaacttttatttcatatgtggatcaagaagcattctcgcagaaagaaaaaggatgtgaacaacttttctgttttgacatctcaagcatttctatgattgcggcaaatagttgtaattatatgtattttgtctaaatataaggtggtacgaaagacttatatccagatatctgctgcttatttgcatctgatgttgtactagctacaggttgtttttcttttcttgaatgcaaattgactgaaatcgttcactttatatagtgatactgctctatttccatatattttgagaattgaacttggcttttggagcatacgtcagtataatgtatgttgttgggtaaggctgttggagttgatggatggaggtcaaaattcacaccttctgtgtttgcactgtgtgagttgattgggaaatgggagtagagctccacacgtggtgtccaaataaaaactactcattcaggagggaatagaaaattgtgcaacagataattccttgaaaagttgtgccttttgcatgcagagttttcttctactacttacaatcaattgaattaccatttgtacttttttgacaaaaaatatacacacttaatgagatattaaaaggacctttgtgcatgcctaagtatttggattcgtagttctggtacatattagtcaaggatgtgttctctgctaccttttataatttttcaatgatgttatttgatttatattaggcactgcattctgttggtaactgaacaaaaaatttccagtcctgacttctgacaagtctatatgtagtttgagcaatgtgatttggtccttcaatttttctttttgcaagtattgcttattaaaaagtgataattgtcaggatgcagttactcttggaattaccactgcagggcatgatgttttacaatttgggtgagttgaatatttaattttcttacatttatcaagatcttcagtttttcctgtagccttcaatgcttagaatttaagtgtgtaattgatgaagtcctcttgctactgtgattctttttcactgagaaaatccacacatcaattcttacgtaactacaagcctagggaactaatttgaactacatcaaatggtttccacaatttcaatcagtcttttcttcacaactttcttacttctctgcttaacaagtaaagatctgccaaatattcatttatgacaattcatgatgtagattggcttcaacaccagcaatgttcaacagtacacttacagaagatgagataaatcattgcccagttgatggagccataatgataacaggtactattcccagtttaa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