Difference between revisions of "BGIOSGA016667"
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Latest revision as of 16:09, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA016667 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016667, complete gene. |
| LocusTag |
H0425E08.5 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA016667-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA016667-PA |
| Length |
14864 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:23089481..23104344 |
| Sequence Coding Region |
23089481..23089602,23090498..23090569,23090660..23090719,23090821..23090926,23091647..23091751 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:23089481..23104344 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:23089481..23104344 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGCACAGCGCGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGGCGGGGGCGGGCGGAAGGCGGCCAAGGACCACGGGGGGCAGCTCGAGGGCGACCAGGCCGCCCTCGCCGACGAGCTCACGGCACTGGGTTCAATTTTCCTTGAGGACTTCAAAGTGAGATCAGAATCACCTCAGACCCGTTTTACTATATGTATCAGGCCTTATTCTGATGGCATGGGCTTTGGAGATTCGAATGTTTCAGCGACTCTTGATGTAACGTGTTTTGCTGGTTACCCCCACAAGTGCCCAAAGTTGCGGGTTCTACCTGAAAAGACCTTATCTAGAGAAGATGCTAATCGGTTGCTTTCCCTTCTTGTTGATCAGGCAAACATTTATTCCCGAGAAGGGCGTGTTATGATATTCAATTTGGTAGAGGCTGCCCAAGAGTTCTTGTCAGAAATTGCTCCAGCTAATGATTCAACAAGCATGGCTCCTTGGTTGGGTTCAGGCAAAGTACAGCAAACAACTGATGTAGACGTGAAAGTTAAGCTTGACAATGGTTCTTACCATGGAGTTGCTTACATGCATAACTCATTTGACCTGTATAGTCAATTATATGATGGAGGTAGTTGGAGCACGCAAGGTCCAGATCCAGCAACTGATAGTGCTGGGAAAATTGTTGGTTCTCAAGTCAAATCTAATCTTAAAAGCAAGAGGAAGACAATTATTGAAAAATCCCGTGTTTCTTCTGATGAGGTTAATGTTGCAAAGGGTTTATTACCGGATAATGCTGGTCAGAAAAATATAATGAAGCATGATGTTATTCGGGAGACAGTTCCCAGTTTGCATGTCGTTGCAGAGGAAACTGAAAATGACAGCAAAACTGTTTCTACGAGCAACAGAGAAAATACATCAGGTACTCCAGAGAGGAGTTTTAGCAGTGTGCATCAACTTGAGGACTCTGATCTTTCAGACGAAGATTGGAATGATGAAGATTCTGGTTCAGGCTCTGGATTTTCAAATACCCCATCTTTTGACATGTTTGATGATGCTTCACGGAATAAGAAAAAAGATTTAATTCTGGTACACTTGCTTCGTCTAGCTTGTGCATCTAAGGACTCTCTTTCAGCTTCTTTGCCAGCAATATCATCGGAGTTATGCAACATAGGGATCCTTTCTGAATGGGCTAAAGATTTAATTTCGAAATCTCCTGCTGTCTTTGGGGAAACTTTTGGACACTTTTTTGGGCCACAAATGACCTCTTCAGAGTGCTCTCTATTTTGGAGAGCTGACAATTCATCATCCAGGCCAAATTCTCGTTATTTGAATGATTTTGAGGAGCTTCGTTCACTTGGCCAGGGTGGTTTTGGTCGTGTTGCACTGTGCAAGAACAAGTTAGATGGACGTCAATATGCTGTAAAAAAGATACGTCTGAAGGATAGAAGTCCTCAAGTGAATGAAAAGATTCTAAGAGAGGTAGCCACGCTTTCACGACTGCAACATCAGCATGTTGTTCGTTACTACCAGGCATGGGTTGAAACTGAGTATGGTCAACATCATGTTTTGAATGCTGCTGGGTCATGTACTGCTGAGAGCTCTATGTACAGTTACGACAACATCAGCTTATCAGATGCAGGTGGTGGAAATAAGCAGGAATCCACGTACTTGTACATCCAAATGGAATACTGTCCTAGAACCTTGCGACAGGATTTTGAGACATATACTTCATCTTTTAGAGTTGATGATGCATGGCGCCTATTTCGACAAATAGTGGAAGGACTAGCGCATGTTCACAGCCAAGGTATCATACACCGGGACTTGACACCTAACAACATATTTTTTGATGTTCGCAATGATATCAAAATTGGAGATTTTGGTCTTGCCAAATTTCTAAAGCTGGAGCAGTTAGATCATGACCAATATCTTCCTAGTGAAGGAATGGGTGTTTCAATGGATGGAACAGGTCAAGTTGGCACATATTTTTATACAGCGCCTGAGGTAGAACAGAAATGGCCACATATAAACGAGAAGGTTGACATGTACAGTTTAGGAGTTATATTCTTTGAGCTTTGGTATCCATTTTCAACAGCAATGGAAAGGCATCTTGTTCTTTCTGATCTCAAACAAAAAGGCGATTCTCCATTGTCATGGGCAACACAGTTCCCTGGCCAGTCAAACCTATTGAGGCGCCTACTGTCTCCAAGTCCATCTGACCGTCCGTCTGCTGTTGAACTTCTGCAAAATGATCTACCTCCTCGGATGGAAGATGAGTGGTTAACTGATGTACTTAGAATGATACAGACGCCAGAAGACACATATGTTTATGACCGAGTTATATCTACAATATTTGATGAGGAAAGGCTGATTGCCAAAACTCAATGCCAGCTTGAAGGCAGTAAAAAATCCACTTGTAAAAGTGATAACAGTGAACTTCTAGACTCTATCATTGAGGTTAGCAAGGAGGTTTTTAAGAGACATTGTGCTAAAAGATTCCAGATATCCCCCTTGCATACACTGGAAGGGAAATTCACTGAAAACAGGGGAAAGACAGTGAAGATCTTAACTCAAGGAGGAGAGATGCTAGAACTTTGCTATGAGTTGCGGACACCGTTTGTCATGTCAGTTGCTGCTAACCAGATATTATCCTTTAAGCGTTATGAAGTATCATGGGTTCATCGAAGAGCAGTTGGCCATTCAATTCCTTATCGCTTTCTTCAGGGTGATTTCGACATTATTGGAGGTGCTTCACCAATACCAGAGGCTGAAATTGTAAAGGTCACTTTGGATGTTGGGGCACACTTTTATGATCCGAAGGCAATAATTATCCGTCTGAATCATAGCAAACTTGCTGAAGCAGTTTGTTCCTGGGCAGGAGTTCCTCAAGAACGGCGACAAAATGTTGCTGAGTTTTTCTCTTCAACTCTTGTTCAGTATTGGCCAAATAAGGCTGATCGCAAGTCACAATGGAGTTTGATTCGTGGGCAACTATTACAGGATCTTCGTCTTTCGGAAGAGGTGGTTGAGAAGCTACATAAAGCTGATCAGAGATTTTGTGGTTCTGCAGATCAAGTACTTGCTAGATTAAGAGGGACCCTGTTCTATGATAAATCTGCTTGCAAGGCTCTCGATGAGATCTCAGCATTTCTCAAATGTTTGAGAATATGGTCAATCGAAGAACATATTACTATTGATGTACTCATGCCTCCTTCAGAATGTTACTACACAGATCTGTTTTTTCAGATCTATGTGAAAGAAGGAAACCCTGGATCAAGTTCCCATGAAAAGTTACTTGCCATTGGGGGGCGATATGATTGGTTGATAGAGCAAGCTTGGGATAGGACATATAAATCCAAACCCCCGGGTGCTGTTGGTGTCAGCATTGCACTTGAGAAATTTCTTCCTAATAGTCCTTCGTCTGACATTGGGTTCCCAAGGATTGAACCGAGCATCAGTGTTCTTGTTTGTTCAAAGGGAGGTGGCGGTCTTTTGAATGAGCGTATGGAACTTGTTGCAGAACTTTGGGAAGCTAATATAAAGGCCCAATTTGTCCCTCAGGAAGATCCAAGTCTTCAGGAACAATATGAATATGCCAGTGATCATGACATCAAATGCCTTGTGTTCATCACTGAAGCAGGTGTCTCACAAACAGAACTTGTGAAGGTTCGACATCTGGATGCAAAAAGGGAGAAGGAAGTTAAAAGAGAGGAACTTTCTTGGTTGCCCTTCTGTGAACCAAGATTACGCACCGTGGCTTCGGTTCAAGGTTCAAGGCAGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGHSARKKKKKKGGGGRKAAKDHGGQLEGDQAALADELTALGSIFLEDFKVRSESPQTRFTICIRPYSDGMGFGDSNVSATLDVTCFAGYPHKCPKLRVLPEKTLSREDANRLLSLLVDQANIYSREGRVMIFNLVEAAQEFLSEIAPANDSTSMAPWLGSGKVQQTTDVDVKVKLDNGSYHGVAYMHNSFDLYSQLYDGGSWSTQGPDPATDSAGKIVGSQVKSNLKSKRKTIIEKSRVSSDEVNVAKGLLPDNAGQKNIMKHDVIRETVPSLHVVAEETENDSKTVSTSNRENTSGTPERSFSSVHQLEDSDLSDEDWNDEDSGSGSGFSNTPSFDMFDDASRNKKKDLILVHLLRLACASKDSLSASLPAISSELCNIGILSEWAKDLISKSPAVFGETFGHFFGPQMTSSECSLFWRADNSSSRPNSRYLNDFEELRSLGQGGFGRVALCKNKLDGRQYAVKKIRLKDRSPQVNEKILREVATLSRLQHQHVVRYYQAWVETEYGQHHVLNAAGSCTAESSMYSYDNISLSDAGGGNKQESTYLYIQMEYCPRTLRQDFETYTSSFRVDDAWRLFRQIVEGLAHVHSQGIIHRDLTPNNIFFDVRNDIKIGDFGLAKFLKLEQLDHDQYLPSEGMGVSMDGTGQVGTYFYTAPEVEQKWPHINEKVDMYSLGVIFFELWYPFSTAMERHLVLSDLKQKGDSPLSWATQFPGQSNLLRRLLSPSPSDRPSAVELLQNDLPPRMEDEWLTDVLRMIQTPEDTYVYDRVISTIFDEERLIAKTQCQLEGSKKSTCKSDNSELLDSIIEVSKEVFKRHCAKRFQISPLHTLEGKFTENRGKTVKILTQGGEMLELCYELRTPFVMSVAANQILSFKRYEVSWVHRRAVGHSIPYRFLQGDFDIIGGASPIPEAEIVKVTLDVGAHFYDPKAIIIRLNHSKLAEAVCSWAGVPQERRQNVAEFFSSTLVQYWPNKADRKSQWSLIRGQLLQDLRLSEEVVEKLHKADQRFCGSADQVLARLRGTLFYDKSACKALDEISAFLKCLRIWSIEEHITIDVLMPPSECYYTDLFFQIYVKEGNPGSSSHEKLLAIGGRYDWLIEQAWDRTYKSKPPGAVGVSIALEKFLPNSPSSDIGFPRIEPSISVLVCSKGGGGLLNERMELVAELWEANIKAQFVPQEDPSLQEQYEYASDHDIKCLVFITEAGVSQTELVKVRHLDAKREKEVKREELSWLPFCEPRLRTVASVQGSRQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
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