Difference between revisions of "BGIOSGA019557"
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Revision as of 16:26, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA019557 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA019557, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_19328 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA019557-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA019557-PA |
| Length |
14950 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:14034533..14049482 |
| Sequence Coding Region |
14034533..14034647,14035228..14035331,14035728..14035850,14036189..14036269,14036728..14036873 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:14034533..14049482 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:14034533..14049482 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCATGGCTGACGCAGTCGCTGTCGAAGTGTCGATACCGCGCGGGAAATCAGAAGCCTGCCGCCTTTGCGCCTGCTTGCCTCCAGCAGGCTCCGGTCCGCAGTCCCGACGACGGTAGTAGCTATCGTGACATAATGCATTGTAATAAGAAGCCATTTTATCTAAAAGGAGGTAGCACTGTGGATTCCAGTACAATGGACTCCTATCTTATGCATGCTTTGAATCATATTAACAGAACGAGAGAGATTGTTGTAAAAAATGATGCGAAGCTTAGGAGTGACCCTAGCAAAGATATTTTGGATGATAACTCATTCCTCGATCAGGGCTTTACACGTCCAAAGGTTCTTTTCCTGTTACCTCTAAAAAGCATTGCGAGGCGTGTTGTGAAGAGGTTGATCCAACTGTCCCCACTGTCACAAAAGGATATCATTGCAAAATTCGAAGGGAAGTTTGGCGAATCAGATGATGAAGTAGAGGAGCCTGTTCAAAGTAATAAACCTGCAGACTTTGACCTACTGTTTGCTGGAGATACTGATGATGAGTTCCTTTTTGGGATAAAATATACAAAAAAATCTATGAATCTGTTCAGCAACTTCTACTCATCTGATATCATTGTTGCATCTCCTTTGGCACTTATAAAGAAAATCAATGGAGTTGATGACAACGGAAAGGAACCTGCCAAGGAAAGGGATTTTGATTTCCTATCATCAATTGAATGGTTGACAAGCACCATTCACACATTTTATAGGGATGTGCATGCTCATTTAATATCATTTTTATCTGACCTAAAATGGAGTTGCAAGATAGATCTTGTGTCCAATATGTTAAATTTTAGCATGTGGAATTCTCTTCACGTTGCAAAATACATGGACAAGTTTACTCTGATAGTGGTGGTTGATCACGCAGATGTGATTCTTATGCAGAGTTGGTCACATCTGTATGCTGTGTTTGAACAATTAAATCAGTTGCCATCAAAGGAACATGGAACCAATGTGATGCGTATTAGGCCATGGTACTTGGATCAGCATGCACGTTACTATCGGCAAACAATACTCTTGAGCTCTTATCTTACTCCAGAGATGAATGCTTTATTCAATGGATTATGCTTGAATTATGAGGGGAAGGTTAAGCTGGTGACTGAATTTAAAGGTGTTCTTTCTAAAATACAGTTTGAAGCACCGCAGGTGTATGAAAGGTTTGATGCATCTTCTATTACTGAAGTTGATGATGCTCGCTTTGATCATTTCTGCAAGAAGGTGTACCCAAAGATTCAGGAGTCAGATGAGGGTCGGGTGTTGCTATTCGTCAGTTCATACTTTGAATATATTAGGATAAGAAACTTCTTAAAATCTCAGGAAGCATCGTTTTGTAGAATTGGGGAGACAACATCGCAACAAGATATATCACGTGCAAGACTCTGGTTTTTTGAGGGCAAGAAAAAAATCTTACTTTATAGTGAGAGATCTCATTTCTACCACAGATACAAGATCAGGGGAGCACACCATTTGATTATCTACTCTTTGCCAGGGAGAAAGGAATTTTACCCAGAGCTTGTAAACATGCTCAGTGAATCAGAAAACAGGAAATGCACCGTCTTTTTTTCACGTCTGGATCTTCTGAAGTTAGAACGAATTGTTGGGACGTTTGCTGCACAAAGGTTGGTTTCTTCAGATAAGAGCATTTTCGTGTTCCGCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSWLTQSLSKCRYRAGNQKPAAFAPACLQQAPVRSPDDGSSYRDIMHCNKKPFYLKGGSTVDSSTMDSYLMHALNHINRTREIVVKNDAKLRSDPSKDILDDNSFLDQGFTRPKVLFLLPLKSIARRVVKRLIQLSPLSQKDIIAKFEGKFGESDDEVEEPVQSNKPADFDLLFAGDTDDEFLFGIKYTKKSMNLFSNFYSSDIIVASPLALIKKINGVDDNGKEPAKERDFDFLSSIEWLTSTIHTFYRDVHAHLISFLSDLKWSCKIDLVSNMLNFSMWNSLHVAKYMDKFTLIVVVDHADVILMQSWSHLYAVFEQLNQLPSKEHGTNVMRIRPWYLDQHARYYRQTILLSSYLTPEMNALFNGLCLNYEGKVKLVTEFKGVLSKIQFEAPQVYERFDASSITEVDDARFDHFCKKVYPKIQESDEGRVLLFVSSYFEYIRIRNFLKSQEASFCRIGETTSQQDISRARLWFFEGKKKILLYSERSHFYHRYKIRGAHHLIIYSLPGRKEFYPELVNMLSESENRKCTVFFSRLDLLKLERIVGTFAAQRLVSSDKSIFVFR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..115#696..799#1196..1318#1657..1737#2196..2341#4208..4280#8116..8190#8439..8606#9675..9713#9796..9884#10051..10115#10831..10877#10961..11020#11205..11276#12180..12209#13777..13871#13981..14086#14211..14273#14373..14444#14876..14950#ATGTCATGGCTGACGCAGTCGCTGTCGAAGTGTCGATACCGCGCGGGAAATCAGAAGCCTGCCGCCTTTGCGCCTGCTTGCCTCCAGCAGGCTCCGGTCCGCAGTCCCGACGACGGTCGGCCGCGCGTGCGCCTCCCCTGCGTTGGCCTGTTATCCCCGCCGCGCCTCCCCTTCATGTCGACCCGTAGTCCCGGCGACATTCCGCGGCGCACGCACCTCCCCTTCGCGCCGCCGCCTGCTACTCCCCTGCGTCGCGTCGCCGTGCCTCCCCGTCGCCTGTTCGTGTCGCCGCCGCTTGCTCGTGCCACCGGCACGGCCAAATCCTCTAGCCCTAGGTTTTGGGATGGGGGAGGGGAATCCGTAGCTTTCCAACCCAATTCGCACAGCTACTTGAGTGATTTATTTACTCACCAGGGGTATAACAGTCATTGACAAATTACGAAATTATTTTTTTATTTTCTTCCCCCTTTGTTTAACTCGGAAATTCTAGCCCCACTAACAGCCGTCAAAATCGAGGGCAAACAGCTACTTCATTTTGAAAAAGCAAGGGTAAAAACACAAACCCTAAAAAACAGGGGTAAAATCACAATTGAATTAGAAAGTAAGGACAAGAACACAATTGCCCCTTTTTTCTCAGTAAAGTGATATGTTACTCTCTCTAAGTGTATTTACAGTCCTAATTTTTTTTATTACAGGTAGTAGCTATCGTGACATAATGCATTGTAATAAGAAGCCATTTTATCTAAAAGGAGGTAGCACTGTGGATTCCAGTACAATGGACTCCTATCTTATGCATGCTGTAAGTCTCAGGGTAGTTATTTGGGCATCATATTGCAACAAAATCTATTATGACGCTGATTACTTCCTTTGCTTCCAAATATTGCTTCATTTAGCATTCTGCTGGTCCAAATATTGCTTTATAACCTCAAGGCATTTCTCAATCTTTTCTTCTATCCTTGCCCTTGTTAAGTAATTGCTATTACTCTTATGAATCAATGGCTAGGAATTCTGCCTGCTAGTTCGCTTTCATTGAACAAAAATATTCCCTTGAATAAAATAAGAGTGCCTGTCTACATCTTTTCCAATGTGCTATACATGAAGGACATTTTATCTGTTCTGTAATCGCTGTGTTTTTGTCTAAAGGGCTTATATCTGGAATCAAAGAGAGTGATTTGCAATGACATGATATTTGCAGTTGAATCATATTAACAGAACGAGAGAGATTGTTGTAAAAAATGATGCGAAGCTTAGGAGTGACCCTAGCAAAGATATTTTGGATGATAACTCATTCCTCGATCAGGGCTTTACACGTCCAAAGGTAAATATAACTGGCACAAAAAAACTGTATTTTGGGTTGTATTTCCATTTATTTACCTTCATTGCAGCATTTGTATATACCTTTATTACAGTCCGGAAAATCTTCTGACGGAGTTAAAACGCATATATGCAAACAGTACCAAAATGACATTATACGTTAAATGGATGCGTGTGCTTTTTTATAGGTTATCACTTGACTTCTAATTGTTCCATGTATTTTATTAATTAAGATTTCCTGCCATACTGCTTTCTTGATGTTATACTTATATGCCGTTCTGCTGTGTATTATCTTTTGAACACTGAAACTTAATACTCTTTTTTCTTTGTAAATGTCCTTAGGTTCTTTTCCTGTTACCTCTAAAAAGCATTGCGAGGCGTGTTGTGAAGAGGTTGATCCAACTGTCCCCACTGTCACAAAAGGTACACTTATATATTCTTTTTTAGCTGTTATAAGTAAACATTGAGTTCTTTACTTCAAAATACAGAAGGAACTTTTTCTAGAGGGGGTGGTCTTCTTTTTTCTCAGAAATGGCATTTGAAATGTTGGTTCTGAGTGCACCAGTGGTTTTGGACTGATTAATTACTTGAGCAGTGGAAGCAGTAGAGTGGTGGAGAGCACTAAAGTAAAGATGATGAAAACCATTTTAGTTTCTCAACTAAACATGGTATTTTGAAGACTAGTTATAGTTGTTCTCCTCGAAACAAAGTTATTGATAAATCTAAAACTATAGAAGTCTAAACTAAAGCCCTGTTTCCTAAATCCTAATCCAACCATTTTTACAAGTACTCGCTCTTTGATTTATCTCATCTACGCAACTTAGTTTAGCAAATTGTTCTCTGTGGTATACTGAAAGAATATTTTGTTTCGTCTCTTTTAGGATATCATTGCAAAATTCGAAGGGAAGTTTGGCGAATCAGATGATGAAGTAGAGGAGCCTGTTCAAAGTAATAAACCTGCAGACTTTGACCTACTGTTTGCTGGAGATACTGATGATGAGTTCCTTTTTGGGATAAAATATACAAAGTAGGTGTGCTAAACTGTTTAATGTAGCAATTTTCTACTATTGCACACTTCAGCCTGTGCATTCTCAACACGCAACAATTTTTTTAAAAAGGAAAATGGTACTTAGGGCTCAGTTGATAGAGCTCCAACTTCTAAATTTAACTCCAGGAGTTGGGTCTGGATTGGAGTTGTGGAGTAGCCTAAATCCAGCTCCACCTCTCTAGTTCATTTTGTGGGAGCGCTCTAGCCAGCTCCACTCCCATTTTAGGTGGAGCTAAAACTGCTTGGCTAGGCTCCAGCTCCAGGAAAGGTGGAGTTGGACCCGTCCCAAACATGCCCTTAGCTCTCCATTGACAACCTTTTATCGACTCACTTCCCAGATTTATTAAGACTAAGTAGTACAACCTAGTGATAGTTATCCGTCTTGTTTCACTTTGTCAGTTGATAGATAACATCATACTTTATGTCAGGAAATAAATCCTGAAATTTTCATGACTTGTGAGATGCTCTGCTGTGCAGCTTTTTTGCTCTGTATTACTGTGTTGTGCATTTTTCTTTTGTCTTCAGGACTTGCACAGTTCATTGGTGTATGGGATCTTCTATTCTTATTAATACTACATGGTTTAAGGCATGCTTTAGTGCGGCATTCATGTCCTATCCAGAAACATAAAATAGTTCATATTTTATTTCGAATTAAAAGAGTGTGGAAGAACTGGGCACCTTTGAAGTGCAAATGTTTCCTTTGGCTAGTGAGCAATAACCAGTGTTGGACAGCGGACCGCTTGGCAAAGAGAGGACTGCCACACCCTGCAGCTTGTCCACTTTGTGACCAAGCAGAGTAGACATCTCTTACTGGTTGGATGTGTCTTCTCCTGACAGATTTGGTTCTTAATTTTGCAAAGACTGGGGTTGGGAGGTATAGTTCCAGTACAAGCTTCCATCAATTTCATGAAATGGTGGTCAAGGGTGACAAGAGGAAAGGACAGAGACACTAAGAAGGGGCTGAGCTCTCTGATAATTTTAGTAGTGTGGGAGTTTTGGAAACATAGAAACGACTGTTTTTAACAGTGTCAATCCATGTGTGACCACTGTTCTTCAAGCAGTGGTTAATGAGTGTATCCTTTGGTCGATGGTGGTAACTAATAAGCTCAAGGTGTTCTTAGATAGGTCGCTATAGCTCTGACGGGATAAGGTCAGTTTCAGGTTCTTTAGTTTGTAAAGGCCTAGCTAGGCCTGTGGGGTCTTGGTGAGGGGAGGAGCTCCCCTCCCAATTCCCTTGTTTTCTCTTCTTCTTAATGAAATGATACACAACTCTCTTGCATATTCAAGAAAAAAAAATTCGAATTAAAATAAGTATATATTGGCCGAATCCTTGACTCTTGTTTTTTTAAGCTTGCTGAATCAGACAGGCATACTCAAGTTTGGTGCCGGTACCCACAATCGGGTTGCAGTACCACTGTTTCTTGTAGGAGAGCACTGAATTCTGAAACATAGCTTTTGGATAGCCCTGTAATATGATACATTTTCTAACCAAGATATTTCAAAAAAATTAACAAAGATATTTCAAAAAAATTAACAAAGGAATGCTATTCCTTTCGATTATCATTCATATTCAGCTGTCTGTCCAGTCAAGTTACTATGCTATTCTTCTCTTGTAATGCAAATTTCTTATTCTAGTTACAATAATCAACTAAGAACAAAACCGTTTTAAAATGTCTATCCCTTTATATTTTATGGCTAATTTTATGTCCAACTCTGAGTAAATCCCAGGTTTTAAACAAACTTATGCCCCCAAATTTATATTTGATTGCATTTTAATATATATTTTGGATTTTGTTTTCCATGCAGATGATTTAGAAGTTAATACTGGCTCTAATGTTTGTGCAGAAAATCTATGAATCTGTTCAGCAACTTCTACTCATCTGATATCATTGTTGCATCTCCTTTGGCACTTATAAAGGTAAATTTTATTGAACCAAAGGACTCAATGACTCGTAATGTTTAGTGCATTCAGTAGCTGTTTTGTTCTTGTTGTCAGAAACATTCCATAGATCACTCTTCTATTTTAGTGCTTGATTACTGGACACTGTAGTAAAACAAAACCAGGCTGGACTGGCAGTTAAACCAGAACTGGCACCGTTACTGGGTTGGTGTGCTTCAATGATATAGATAGTTCCATGCAGTTGAACCGATGGGAACCAGGTCAATCGGACAGTTTATGGTGAAAACCGGCGAACAGGGCAAGACTGTACTGGCAGTTCCTTTTATAGTTTGGCTATCACATGGGCTGGCCTAGTAAGACTCACCTGCTTGCCAAAACACAAGTATGTTTATTCCAAATATGTGTAAAAAGATGCATGGGAGGGGGTCATACTCAGGATGGTGGGCTGGGAACTCATGCGTATTGGAGAGGTTATCTATCGCCTCAAGCT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