Difference between revisions of "BGIOSGA021217"

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Revision as of 16:35, 22 July 2012

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA021217

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021217, complete gene.

LocusTag

OsI_23026

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA021217-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA021217-PA

Length

11893

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:17621589..17633481

Sequence Coding Region

17633275..17633481,17632707..17632758,17631791..17631849,17631623..17631722,17631484..17631553
,17630651..17630699,17628537..17628610,17627612..17627641,17627430..17627525
,17626178..17626277,17625079..17625173,17624764..17624886,17624326..17624440
,17621928..17622038,17621589..17621807

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:17621589..17633481 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:17621589..17633481 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCCGGCGGCGAGGACGGGGCCGACGGCGTCGGAGATGACACCGAGCTTCGCAGGTTCTCAGACGTGGAGCTGCTGGAGAAGTCGCGGCGCATTCAGGGGGAGCTCAGTGGGGGTATCGAGCGAAGGCTCAAGGACCGCGGGGCCAAGTTTCGCCGCTTGCTAGACGCCATCGTCCGCGAGATTGATCGCCGTAAGGCAGCAACGGATGATGACAAATGCGCAAGGGTAGTTCAATCAGGATGTGCAGAATCATCAGTTAAACAACAAGCAGTAACCATATCAGATTTTCGGTCCTCCTTTGGGATAGATGAAGAGGCAGGCGTTGATGTATCTCGTTTGGAAACAAGTGCATGCATTGGCGACCCAAAAACTTCAACAGATAATGAGGGGATCTTGTGTGAAGAGGAAGATTCCTATGCTGCTGATGATGGCAAGGATAATGGCTACAGTAGGATATGCAAAGATGCCCACACTTCTAGGAAAAGGAATGGAGAATTTTCACCTACCTTTTCAATGCGATTGCGATCAAGAAAGGTGGTTGAAGAGGTGGTTCTACTCGATGGAGATACTTGCATTTCAGACTCTGCAGAAAAAACATCCTCTGCATGTGATGCAATGAAGATACACTATCCTTCATGGGACACCCCTAATTCTATTGAGCTTTCTTATTCTGACATGAAGTGTCTTGAGCCTGAATCATTGTTGTCCTCACCTATACTGAACTTCTACATTATGTACCTAATGGGACAAATGCCATCGACAAGTAGGCTTGGAGGCAAGTATCATATTTTCAATACATACTTCTTCAGCAAACTTGAAGCCTTGACATCAAAGGTGGACAATGATGCTTATTTCTTGAATCTGAGAAGATGGTGGAAAGGTGTAGATATATTTAAAAAGGCATACATAATAATTCCTGTGCATGCAGACGCACACTGGAGCTTGGTCATTATATGTATGCCTGCAAAGGAAGACCAATCAGGGCCCACCATATTTCATTTGGATTCACTGAAGTTTCATAGCAGCAGATTTATTTTCAGCACCGTTGAGAGATTCCTTAAAGAAGAATGGAACTACCTGAATAAAACTGGTTCTTTAGAAGATTGTCATCTACATGAATCAGTGTGGAAGAACCTTCCTCGGAAAATTAAGAAGAAAGCAGTTACAGTTCCACAGCAGGACAATGAATACGATTGTGGTGTCTTTGTTCTGTACTATATGCGACGCTTTATCGAGGAAGCACCTGAAAGGCTTAACAACAAGGACTCATCTAATATGTTTGGCGAAGGGTGGTTCCAACGTGAAGAGGCTTCTGCACTGCGAAAGGAAATGCAAGCTCTGCTTCTTCAGTTGTTTGAGGAAGCTAAAGACAACAACCACATGAGAGATCCAACAACACCAGTGTCAGCAACAGCGGAGCACCCTGTTGAAGTCTTGTCAACCGAGCCAGCAGTACCAGACCACCCTCGGAATGCGGTTGGCGTCGCCACCTCATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAGGEDGADGVGDDTELRRFSDVELLEKSRRIQGELSGGIERRLKDRGAKFRRLLDAIVREIDRRKAATDDDKCARVVQSGCAESSVKQQAVTISDFRSSFGIDEEAGVDVSRLETSACIGDPKTSTDNEGILCEEEDSYAADDGKDNGYSRICKDAHTSRKRNGEFSPTFSMRLRSRKVVEEVVLLDGDTCISDSAEKTSSACDAMKIHYPSWDTPNSIELSYSDMKCLEPESLLSSPILNFYIMYLMGQMPSTSRLGGKYHIFNTYFFSKLEALTSKVDNDAYFLNLRRWWKGVDIFKKAYIIIPVHADAHWSLVIICMPAKEDQSGPTIFHLDSLKFHSSRFIFSTVERFLKEEWNYLNKTGSLEDCHLHESVWKNLPRKIKKKAVTVPQQDNEYDCGVFVLYYMRRFIEEAPERLNNKDSSNMFGEGWFQREEASALRKEMQALLLQLFEEAKDNNHMRDPTTPVSATAEHPVEVLSTEPAVPDHPRNAVGVATS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..207#724..775#1633..1691#1760..1859#1929..1998#2783..2831#4872..4945#5841..5870#5957..6052#7205..7304#8309..8403#8596..8718#9042..9156#11444..11554#11675..11893#ATGGCCGGCGGCGAGGACGGGGCCGACGGCGTCGGAGATGACACCGAGCTTCGCAGGTTCTCAGACGTGGAGCTGCTGGAGAAGTCGCGGCGCATTCAGGGGGAGCTCAGTGGGGGTATCGAGCGAAGGCTCAAGGACCGCGGGGCCAAGTTTCGCCGCTTGCTAGACGCCATCGTCCGCGAGATTGATCGCCGTAAGGCAGCAACGGTGAGATTCTTCTTCTCTTCTTTTTTTTTTTTATGCTGTAAGTTATTTTCTTGGTGTGCGGTGAGGGGATTAAAGATTCAATCCTTGCCCGGTGCGCTTCAATTAAGGCATGATTGAAGGGATGGGGAATCTTGATTTTTGTTATGCTTCTGTTCGATGATATGCCTGCCGCGCATACCCAACTGTAATAATCCAGTGTTGACAACTTCAATGTACTGTAAGGCTCTTGTTATCTTTGGTGTGAGGATGGTGATTACTGGAGAAAATGATATTATGTTATCAATGTACTCCTATATTCTAAGGGAATGCTGGCCAATGCTAATCACTTGATAAGTTGATATTGTGAATTTTCTTGTGTCTGATCTCTAAAATAGGTAACAAAAGAGCGCCTCACACAATATATGAAGTAGATGTTAGGCAACCAATCCGTTAAATGCTACAGCTATTTACATATACATTAGTTATTAAGGGTGGATAAGGTCTTTGTAAGACTGATCATCGTATGTTCTCTTGCAGGATGATGACAAATGCGCAAGGGTAGTTCAATCAGGATGTGCAGAATCATCAGGTATGGGATTGATTTGTGTTAAGATATTGGTTGATTTATGGTTGGTAGCATGGATCATTTATGACTGGGACTTATAGTACACGTGTTCTCGTTCATGACTTCAAGTATTGATTTGCTTGCTGTTCTATTGAACGCTTGTTACTCACTGCGGTGCCAGTGTTGTGTGATAGATGCTGTAACTTACCTTCTGTGAAGATAACTTAATATGTCCTTTGCTTCTGTCCTCTCTTAAGATATGGGCAGCTGTCTATTTCATTCTTCATACCTTAAACGCTTTGCTTTGTAGTAGATTTACATGCATGAAAATGCAGTATAGGTTTTCTTAGTTCAAATGATACATATAATAAAATAATGTGGAAGAGTAATACAATTTTACTACAGTTAGTTCCTGATTTGAGCTGTTGGTTCACATTTTTCTTCAATATTTGATGATCTAAGGTGAGCCACTCCTATGTCATGTGACTTCCCATTTGTTGAGTAAAATGTTGATAAAATCCAGAATTAGCTGATGCCCGAAGCTCTTTTCAAAGGAATTAATTAGTTTCAAAATTGTGTGATGCTCAGTAACAGGTCACGATGAACATGTATCTGTTAAAAGAAGAAATCACCACTTTTTAGTAATTTTACTCCAAGAGTATATTAGCACACAATTCGAGATTATATGAGCAAGCTACTGCTAGTCTGCTACTATATCAATTGGGCAGACAAAAACCTTGCTAGTTTTCAGATCATATTTCTTTGTTTCATAATAGTTGGCCATTTTTTTACCATGTGTTTCTTTTATAGTGATATCTACAATTGGTTACTATTCTATCTGAATTTTATTCCATGCCACCTGTTGGTTTTATTAATGTCAGTTAAACAACAAGCAGTAACCATATCAGATTTTCGGTCCTCCTTTGGGATAGATGAAGAGGTAACTATTTTGATCTTTGTTATATAAACCCAGTATTTTGTGCAAGTGTTTTATTTCCTTTACATTAGGCAGGCGTTGATGTATCTCGTTTGGAAACAAGTGCATGCATTGGCGACCCAAAAACTTCAACAGATAATGAGGGGATCTTGTGTGAAGAGGAAGATTCCTGTAAGTGTAAACCCTCTACGTCTCAAAAGGCATCATATGTTGATAGGTCAACTTATATGGAAAATATAGATGCTGCTGATGATGGCAAGGATAATGGCTACAGTAGGATATGCAAAGATGCCCACACTTCTAGGAAAAGGTTAGTATACACAAACTCTTGTATTGCAGAGTCTCAAGCCGAACATCCATTTTCTTTGTTATGGGAATGTTAACAGTTAACTTGTTCTAAAATCATGCATCATTTCATGAGATGCATAACCCTATCAAAATTCTTGGTGTTCATACCTTATAGATATTAAAGCATCAAGGGAAATGCAAAACATTCGTTTAGATAACTTATTTTTTTACAATTTAGAATTATGAAGCATGGAGATGTAGGTTTCCATCAAACACTGATTTTTTAATTGAATCAAACGCATCCAAGACAATGCAAAACATAGAAAAAAAAGAAGCAATCTTACAGTTGCAATGATTTATATAAAAGTTGTACTCCCTCCATTTTTTAATATATGACGCCGTTGACTTTTTTTAGATACGTTTGACCATTTATCTTATTCAAAAAAATATGTAATTATCATTTATTTTAATGTGACTTGATTTATCATCAAATGTTCTTTAAGCATGTCGTCAGTTTTTTTATATTTGCACAAAATTATATTAAAAAAACGGCGGTAGTACTTTTTATATGGTGCAAATTTAGGCTAAGCATTGTGACTGTTAGATAAAGCAAATCAGTTGACAAACAAATAGCAATACTGCTATTATATATACCATGTCTTGTGCATCTGTTAGACTGTTAGATTGTTGTATATCTCACCAGTTCTAAACTTGTAACTGCATATATGTATTGATCAATGAATATGTTTTGTTAATCTGTAACTTATTAGTTATTGTATTGAATTATGTTATCTGTCCTCTACTAGGAATGGAGAATTTTCACCTACCTTTTCAATGCGATTGCGATCAAGAAAGGTTAGTATGTACATTTTCCTTTCCAAACATCGTGACATGGTATACTAGTAGTAATTTTTATGTTGAATACTAAAGTTCTAGTAATACAGTTGGCAGAGGTCCACCACCCCTATTATTGCCAGTACATAAATTAGTTGATTTGTTTTTTGACTATCTGTTATGGTGGTCAATAACATGGAAAGATTAATTATATTTTCTAACTGGGAAAAAGGAAATATTTATTTGCAATGATATTATCATCTTCTCGCTCACTATCAAAGAATGAACCTTACTGCCCTAAAGGCTCCTCCTTTTAACTGAATTGTGATAAATTTGTGAAGTTCCGTTTGCTGATGTGTGGTTGATTCTGTTATTACCAAGCTTGATGATAAATTGTTGATTAGATGATTGTACACGCTGTGTTTTATCTTCGTGTCAAGTGAATTGTTATTTTTCATGCATGCTCATTGAGTTTTTTATACTTTGACCATTTTCGCATTCCTTCATTTCACAAATACATGCCATTTCAGATGTTACCATAGTTTCTAATCTACAGCTTTGTGTACTAATTTCAGTAGTAATATGCTGGTAAAAACTATAAGATATGTTACTACAAAATGTATTCCTTTTGAGAATCTATTAATATTATTTCCATATAAACTGATTAGATACCTTTTTTGTTATAACATTGGTGCTGATTTCTAGTATGCAACTATGCATTACTAAAATTGGAATTTATTTGTAATATGTGACATTTAGAAGGAAAGACATAGAAAACCGGTTATTTTCTAAGTAACTACGATTAGAATAAGGATTCTGCTCCAATTAGAATCAAGATGGACCCTGTACAACATGGTTCTATGGTAACAATAGAGTCCTAGGATTGTACTATTAAAAGCCTTTTTTTGAACCTTGTGGCAACAAGGGGTTCGGGGGATTATGTAAACAAAAAGGCAGGAGGGGTCTCTTAGTTGAGGAGTGGTGGCATGGGATCTCTAATTCTCCCCCATGTTCATGCATATGGGGCATTTTGAGTTTGTTCTGTGGTGTGAACGTTTTTTTGCTCTTATTTTTCTTAACAAACAACAAAATTTTCTGGGTTTTTAAATCTTGCACATATTGACTTTGCTGCTTATAAAGGCATTAATGTTTTATAGTTTATAAATATCTTTCCACAAATCGTTACACCCAAACCATGATGGATTCCAATTCCATAGCTATACTGTTAGTAGAGATATAAAAGGTGTGCTGAATGTTTCATTTGTGATGTTATTTGTCTCTGAACTTTACACTGTCTAATATCTGGTTAAATATTCATAAATTGTATTCTTATCTGATCTAATTATAACTATCCTAATTCATATTTATATCCAACTCCTGATATGTAAAAATGATATAATATGGTAAGATCACCTTTGATCTTGTTTGCATCCCTACGGTTAGAACATAAGACAACTATTGAGTATATTTGTCTACGCATCGAACATGTGAATTGCGATTTGCTACTGCTGATAAGGGGTATACCCACTTCAGCCGTCTGCATTGAAGATGGCATGAAAATTTCTTACATATCAAAATATCCAAAATTTTATGGCATATTGGTATTAGTAACATGAGTACATAATGCTTTTGTACAATTTAAAATGAAACTTCAGGTCGGCAGATATACCCATTAAAAACATATTTTGTGAACCCAGTATGACTAATAGATGGGAAGTTTTGATTTTTGATGCATATTTCATCCCTTCATTGTGATTTATATGGGAATGTGGGGGTGGGGGGTTGTTTTTTTTATGGACTGTACCAGGAAAATAGAAAAAACCTGGGCAGCTTTTGATTCTTCGGTAGTTTATGATCAGTTTTCAGTTCCCTGTCCCATACAGTAATTGCAAAGATCCACAGAATGAAAGTGAAATTAATTTGCCTCTTGTTGGGTTATTGATAAACTGCACAGTACCTGTTATTATAGATGTACTCATCACAGCTTCTAGAACTATCTATGCTAGTTAGTTT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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA021217