Difference between revisions of "BGIOSGA021428"
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Revision as of 16:36, 22 July 2012
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA021428 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021428, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_22577 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA021428-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA021428-PA |
| Length |
13515 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:11228005..11241519 |
| Sequence Coding Region |
11241427..11241519,11238583..11238786,11238286..11238467,11237408..11237534,11237048..11237266 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:11228005..11241519 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:11228005..11241519 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGGCAGCGGAGGAGCAGCTGAAGGAGCTCGGGGAGAAGCTGGAGGCGGCGCCGCCGGACCCGGCCGACGACCTCGCCAAGCTGCTCGAGCAAGCTGCAGAATGCCTACATGGAGTAGAGCAGTCACCAGGTCCCTCAGTGATGGAAACTATCCAACCATGTCTAAAGGCTGTTGCCAGAGATGAATTCTTGAAACACCACGATGAAGATGTCAAAGTACTATTGGCAACATGCTTCTGTGAAATTACAAGAATAACTGCTCCTGAAGCTCCATACAGTGATGATGTCTTAAGGGACATGTTTCATCTGATTGTGGATACATTTAGTGGACTCAATGATGTTAATGGTAAATCCTTTGGCAGGAGAGTTGCTATTCTGGAAACAGTTGCGAGATACCGAGCATGTGTTGTCATGTTAGACCTTGAATGCAATGATCTAATTGCAGACATGTTCCGATCTTTTTTAGAAATTATCAGTGACAATCATGAGCCAAATATTGTAAATTCAATGGAATCAGTAATGGCCCTAATTATAGATGAAAGCGAGGATATAGAGGAAAGCCTTCTCAATGTACTTCTATCAACTTTAGGCCGGAAAAAAACTGGTGTTTCTTTGCCTGCACGCAAGCTTGCTCGCCATGTTATAGAGCACTCTGCAGGAAAACTTGAACCATACATAAGGAAGATTCTGACATCATCCTTGGATGGGGATGGTACTTCTACCAATAATAGCATTGACCATCACGAAGTCATATTTGATTTGTACCAGTGTGCTCCAAAGGTTCTTAAAGTGGTGGTACCTTATATAACTGGGGAACTGCTGGCAGATGAAGTTGAAACTCGGTCTAAAGCAGTTGAAATACTTGGCGAACTTTTCTCTTTACCTGGAATCCCTATCTTGGAATCATTTAAATCTCTTTTCGATGAGTTCCTGAAGAGATTGACTGACCGAGCTGTAGAAATTCGTGTTTCTGTAATTGAGCATTTGAAAAAATGTCTGATGTCAAACCATTCCCGTCCTGAAGCTCAAGAGATTATCAAGGCACTTTGTGACAGATTGTTGGATTATGAGGAAAATGTGAGAAAGCAAGTGGTAGCTGCTATTTGTGATGTAGCTTGCCATTCACTTGGTGCAGTCCCAGTTGAAACTATCAAACAAGTTGCGGAGCGTGTCCGTGATAAATCAGTTTCTGTGAAGTGCTATACCATGGAGAGATTGGCTGACATCTACAAGTTCTATTGCCAGAGTGGTTCTGATAGCTCAGTAAATTCTGATGATTTTGAGTGGATTCCTGGAAAAATATTAAGATGCCTCTATGACAAAGATTTTAGACCAGAGTCAATTGAATCAATTTTATGTGGTTCATTGTTCCCACCAGAGTATCCAACAAAGGAAAGAGTGAAACATTGGGTAACTGCTGTCACACATTTCGACAAAGTTGAGATGAAAGCTCTCGAGCAAATTTTTCTGCAAAAACAGAGGCTACAACAAGAAATGCTGAAGTACATGTCCCTTCGACAGACAAGCCAGGAAGATACCCCTGATATGAAAAAAAAGATCCTGGGGTGTTTCCGGAGCATGTCTCGTTTGTTCAATGATCATACAAAGTCTGAGGAGTACTTGAACATGCTTCATCAGATAAAAGATGCCAACATCTGGAATATATTCACAAGCTTGCTTGATTGTTCAACAACATTCAACGAAGCTTGGTCTCTTCGGGTTGATTTGCTAACGAAACTTGGTGAAAAACATGCATTACATGATTTTGTGAGCACGTTGTCGATGAGATGCTCATATTTACTTGTGAACAAGGAATATGTCAAAGAGATCCTTTCTGAAGCTTCTGACCAAAAATCTACTGGGAATACAAAACTTATGTCATCATGCATGGATCTTTTAACGGCAGTATCTAGTTTCTTCCCTTCACTTTTGTCTGGACTTGAAGAAGATATCATTGAGCTCCTGAAGGAGGATAATGAACTACTTAAAGAGGGTATTGCTCATGTTCTGTCGAAGGCTGGTGGCAACATTCGTGAACAACTAGCTTCATCAAGTTCCATTACTCTTCTACTAGAGCGGCTATGTTTGGAAGGAACACGGAAGCAGGCAAAATACTCTGTTCATGCTTTGGCTGCTATAACAAAAGATGATGGCCTGATGTCTCTATCTGTTCTTTACAAGAGGCTTGTGGACTTGTTGGAGGAAAAGAAAGTGCATTTGCCATCCATCTTACAATCCTTGGGGTGTATAGCTCAGATAGCAATGCCAATTTTTGAAACAAGGGGAGAAGAGATAATAAATTTTATAACTAAAAAAATTCTTGACTGCAATGATGATTCGGGCGACGTTTCTGCTCATAAATCTGAATGGAGTGATAGTACTCAAAGTTGTTTATTGAAGATTTATGGCATTAAAACTTTGGTGAAGAGCTGTCAACCTTGCAAAGATGCTCAAGCACATCCGGGAATTGAAAAATTAATGGGCATCCTTAAGAATATCCTTACATATGGTGATATTTCTGCAAATATGATTTCAAGCACTATTGATAAGGCCCATTTGAGGCTGGCGGCAGCAAAAGCTGTTCTCCGCTTATCAAGACAATGGGACCACAAAGTGCCTGTTGATGTATTCTATTTGACTCTCAGGATTTCACAGGATGATGTTCCTCAGTTTAAGCACAACATAATTGAGGTTGCGCAGATATGCCAGCAAGTTAAGATGCGCCAACTTTCTGTCCAAGCGGAAACAAATGTGCTCACTGCTTATCCAGAATATATGATTTCCTATTTGGTTCATGCCCTCTCTCATGATCCATCATGTCCTAACATTGAAGAGCATGAGGATGTTGAAGCATTTGGTCCAATTTACTGGCGATTGCATCTGCTTCTTTTGATCCTCCTGGGGGAAGAGGGTTTGCAGCACAGTGTACCAGGCATGAAAAAGGAGAGCTTCACAACAATAGTATCTATATTTAAAAGTATCAAATATTCCCAAGATGCGGTTGATGTTAACAAGACCAAGACACTGCATGCTATTTGTGATCTTGGTATCCTTATTGGAAAGAAATTATGTCAAGAGCAGATAAATATATCAGAAGCTCAAACAGTTTCACTGCCCAGTCAACTTTATGCGCCAGTTCAGAAGGATCAGAATGAAAATTCTGTGGAGAGTGATGAGCAGATATGGCCGGGTTGCGAGAATGTGTTGGCCCATTTTGAGGCTCTTATGACAGCAAAGTCTGCTGAGGTTGAATCTCCCAAGGATAAGATGCTTATAGATGAGACTGATGAATTTGGTAATGAAGTTCCTCTAGGAAAAATTGTGAAAATTTTAAAATCTCAAGGAGCAAAAAAGGCTGGGAGAAAGCAGAAGACAAAATCTGGTTCAATAAACATGGAAAAAGATGATGATGTCTTGGGACTGGTTAGAGAAATAAACTTGGACAATCAAGAAAATTTGGGGGAATCAGAAAAGAGCAAACCAAAGAAAAAGCGGATGGATGCAAAAGAGAGTAATGACAAGCCTGTAGATTTTTCAACACCAAAACGCAAGAGATCAGTTTCTAAGAGTAGACCACATTCAACGAAAGGCAACAAAAACAGTGATGAGCTTCTACTGCAGTCTGTTGACCCAGATGAAACTATCAACTCATTTGAAAATAAGGTTGAGGGGGCCAAAAAAAGAGATGACTCGGTTGATACTGAGTTGGTAACATCGCCTGCTAGTGTTAAAACCCCTGTATCCAAAGGGAAAAAGGGTGCTAAGAAGCCCCACGCTGAAATCTTGAGTAGTAGTCCAAAGAAGTCTGATGAGGCAGGCAGTAGTAAGCGAACTGTTGATTCGGGAAGTTTAAATGGGTCGATCAAAAGGCAGAAGCCAAAATTGGTTTCTGGTCTAGCAAAGGTTGTCTCTATTGTTTTCTTTTGTTCTTGCACAACACATGACACAGGCAGTGAGGACCTGATTGGAAAGAGAATAAAAGTTTGGTGGCCGTTGGATAAGAAATTTTATGAAGGTGTTGTGGAATCTTTTGATTCATCAAAAAGAAGACACACGGTGCTATATGATGATGGAGATGTTGAAGTGCTTAACCTAGCTAAAGAAAAGTGGGAAATTGTTGCAAGTGATGACCCGCCTGTAAAGGCCCGAAAAAAGGATCATTCAGGGAGAAACCAAGGACGAGCTCAGGATAAAAGCATTACCAGCAGCAAGCAAACTCCGCCGCCTGAACAAGAGAAGTCAAAAAAGAGGCCCTCACCCCCAAAGAGGAAAGGCAAACCAAAAGGACTGCCGAAAAACAAACGCAGAAAGATAGGGGGTAAAAGTTCTGTTGATGCTGCCGGTGATGCGAATATTGATTCGGATTCAGCAAGTTCTCTCGCACACTCAGATTCTGATAATGATAAAAAATCTGATGGACGCAATGAGAAAGAAGTAGTAGTAGCCAAGAAAGCAAAAGCTGAGAAAGTGTCTGGCAAAGGTGATGAGCCAAAAGAGGAGGAACCTGATGACCATAATTTAAACAGCAAGGAGGAATCTGACAACGAGACTCTTAGTGTCTGGAAAAAACGCACAGCTAAAGCAACATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGAAEEQLKELGEKLEAAPPDPADDLAKLLEQAAECLHGVEQSPGPSVMETIQPCLKAVARDEFLKHHDEDVKVLLATCFCEITRITAPEAPYSDDVLRDMFHLIVDTFSGLNDVNGKSFGRRVAILETVARYRACVVMLDLECNDLIADMFRSFLEIISDNHEPNIVNSMESVMALIIDESEDIEESLLNVLLSTLGRKKTGVSLPARKLARHVIEHSAGKLEPYIRKILTSSLDGDGTSTNNSIDHHEVIFDLYQCAPKVLKVVVPYITGELLADEVETRSKAVEILGELFSLPGIPILESFKSLFDEFLKRLTDRAVEIRVSVIEHLKKCLMSNHSRPEAQEIIKALCDRLLDYEENVRKQVVAAICDVACHSLGAVPVETIKQVAERVRDKSVSVKCYTMERLADIYKFYCQSGSDSSVNSDDFEWIPGKILRCLYDKDFRPESIESILCGSLFPPEYPTKERVKHWVTAVTHFDKVEMKALEQIFLQKQRLQQEMLKYMSLRQTSQEDTPDMKKKILGCFRSMSRLFNDHTKSEEYLNMLHQIKDANIWNIFTSLLDCSTTFNEAWSLRVDLLTKLGEKHALHDFVSTLSMRCSYLLVNKEYVKEILSEASDQKSTGNTKLMSSCMDLLTAVSSFFPSLLSGLEEDIIELLKEDNELLKEGIAHVLSKAGGNIREQLASSSSITLLLERLCLEGTRKQAKYSVHALAAITKDDGLMSLSVLYKRLVDLLEEKKVHLPSILQSLGCIAQIAMPIFETRGEEIINFITKKILDCNDDSGDVSAHKSEWSDSTQSCLLKIYGIKTLVKSCQPCKDAQAHPGIEKLMGILKNILTYGDISANMISSTIDKAHLRLAAAKAVLRLSRQWDHKVPVDVFYLTLRISQDDVPQFKHNIIEVAQICQQVKMRQLSVQAETNVLTAYPEYMISYLVHALSHDPSCPNIEEHEDVEAFGPIYWRLHLLLLILLGEEGLQHSVPGMKKESFTTIVSIFKSIKYSQDAVDVNKTKTLHAICDLGILIGKKLCQEQINISEAQTVSLPSQLYAPVQKDQNENSVESDEQIWPGCENVLAHFEALMTAKSAEVESPKDKMLIDETDEFGNEVPLGKIVKILKSQGAKKAGRKQKTKSGSINMEKDDDVLGLVREINLDNQENLGESEKSKPKKKRMDAKESNDKPVDFSTPKRKRSVSKSRPHSTKGNKNSDELLLQSVDPDETINSFENKVEGAKKRDDSVDTELVTSPASVKTPVSKGKKGAKKPHAEILSSSPKKSDEAGSSKRTVDSGSLNGSIKRQKPKLVSGLAKVVSIVFFCSCTTHDTGSEDLIGKRIKVWWPLDKKFYEGVVESFDSSKRRHTVLYDDGDVEVLNLAKEKWEIVASDDPPVKARKKDHSGRNQGRAQDKSITSSKQTPPPEQEKSKKRPSPPKRKGKPKGLPKNKRRKIGGKSSVDAAGDANIDSDSASSLAHSDSDNDKKSDGRNEKEVVVAKKAKAEKVSGKGDEPKEEEPDDHNLNSKEESDNETLSVWKKRTAKAT</aaseq> |
| Gene Sequence |
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